Pedobacter gandavensis: QG516_13275
Help
Entry
QG516_13275 CDS
T09013
Name
(GenBank) MBG domain-containing protein
Organism
pgj
Pedobacter gandavensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG_2
CHU_C
Cadherin
Big_12
Big_5
BiPBP_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGQ07539
LinkDB
All DBs
Position
3180551..3189463
Genome browser
AA seq
2970 aa
AA seq
DB search
MKKINFLNALIFMIICFCCLSAKTSHAQLTPGDIAIVGVNGDTRPAPATPFTGTIALVAL
VDIPSGTIIKITDYTYNGTVFGASSSDGLLTWTISQIVPKGTVFSISFTNSVATPVIQPS
TYGTVTKIGWTNAGIRPISSTSGDSWLVYTTNPDNSFNFIYGFLNTNYTSPAIPGVDTST
GWTLPGNTPSNQSSVLPTQLIGTNAYNTLVTYLGGPDLSRHFNSYNFTFTGSKDDLLNNI
KTPANWASTDTQTSAKDLIPGTSGGAFSGSQPIYTITEGPTVASVTSTASGIKKIGDIIP
IVINFSENVTVNTTGGIPQLTLNTTPTSYANYVSGSSTSSLTFNYTVGTGQTSPDLNYAA
TNALSLQAGTIKNVTNFDAILDLPATSSPNSLGGSSNIIVDGIVPTVSSVTGVTSNGSYR
AGQTIDINVNFSEAITVTGTPTLTLNTTTAGTASYISGTGTSSLTFRYTVGANQNSADLD
YASTSSLALAGGTLKDAAGNNATLSLATPGAAGSLGANSNIIIDTTIPTVTGVSSTNGTY
NIGSTIPIQIAFTENIIVTGTPQLALNVGLPAGNATYASGSGTSTLTFNYLVAEGQSTAD
LDYTGTTALSLNGGTLKDAAGNDATLTLASPGSAGSLAANSNLVVNGTRPTVASIVRTGG
AAALTKANTVNFTVTFSEAVTGVDLGDFGIISTGSLVAPGLSGLTGSGTTYTVTVTTGIT
NGTGTLRLDLSSSGTGITGASGNTILVGYTSGETYNVDRTTPTISTRTIASNNSNTQIAK
TGDVVTLSLTASEVLNLPVVTINGNPATVTNPSGSIYNATYTVTATDPEGQMTFTVNFSD
LAGNIGTQVTTTTNSSKVVVDNIPTTITSVSSSATDGPHGLGAILPISVTFSEPVTVTGT
PILALNSGGSANYIGGTGSTTLGFSYTVSSGQNSTQLDYSSSAALTLNGGTISDQNAIAA
PLTLPAPGGVGSLANGRSIVVNGRTPTALSINRKTPTTQSTNASSVEYEITFSESVTGVD
VSDFQMAPGSAAGTAISSVVGSGATYTITLTTGVNNGPFAINLRNSGTGIANLVSNPILT
GFGPSQIYTIDRTSPTINTATIQSNHAGSGAIAKPGDIITLNFTASEVINTPVVTISGNS
ATVQNTTGNTWVATYTMLSTDNNGVIPFNISYSDIAGNAGTARTTTSNASAVTYDKTPPT
LSAVTIVSDNITNPAIAKPGDVVTLRFTASETVLTPVVVIAGATLTVLPTASPNSYMAFY
TIDSSLPEGEIPFTINFRDQVGNMGTTVTTVTTGSMVTLDKTVPTISNVSISSNNPNPAL
AKPNDQVTLTFTASEAIQAGVLIDGLAATSLSNVGNVYTATKILTTANTEGLVSFSIGFT
DLAGNAGVSLSTTNDASTVTFDKTLPVAPNFLGVTPGDKENNVLWFLNADYAKYELIGGT
PLALGNNVLTTVLAANATNPMSFTHTGLTNLTTYYYALRVTDAAGNVNTSYTATGTPLNA
QTITFDQPAAAEYGSSFTINATSSSGLPVTFTSNEPALATISGNTVTVVGVNNLQSVSII
ATQAGNGTYSYAPPVIRLLQIKPKPVTVTATAQTKVFGDLDPAIAAPIISPALVGTDVST
GTLKRVVGENAGNYEIQQNTFSLDQYKYAITYAPADFTISKKPVTITPQLAYAKTYGQAD
PSFAYNFTPLVSPDVITGDLARVAGENVGTYNFDLGTLSAGANYNLVLSPLPQFTINKSV
ITVTPITASIQYGDAEPVINYNHTPALKTGDVFTGALARVAGNTPNNYLITQGTLALSNN
YTLNFSPTPVNFVVLKKDISITPTAGQSKIYGDADGTINYTASPALLNGDTFSGALNRAP
GTAVNNYLIGLGTLTTSNPQNYNLQLGTENYAITKKAIQVTATAVSQVYGDADPVSLPYT
LSAPLPNGDVFSGKLDRTAGTDVGTYPINLGNLALSTVNYDLSFVPANLSITPKEITITA
VSGTKTYGDADPIFGYTGSSALVSGNSYSGKLGRAAGENVGSYALSLGDLTVNNNYTLTL
NPGATLQINKKDIDVLADAKSKIYGGTDPELTYTSNPALVSGDTFTGALSRAPGENVNTY
VIGKGNLALSSNYNLNYTPANFNIGLQTINVTAIAKNKVYGEADPALEYSFTPALESGDA
FTGALSRAPGENVNTYVIGKGDLALSSNYTLNYTPANLTIGLKTIEVTAKAKSKVYGEAD
PALDYDFSPALKSGDTFTGALSRAPGENVNTYVIGKGDLALNANYTLNYTPANLTIGLKT
INVTAKAKNKVYGESDPALDYDFSPALRLGDTFTGALSRAAGEAVNTYAIGKGNLALNSN
YILNYTPANLTIGKKTINVTAQAKTKVYGQADPAFDYDVVPALQTGDLISGALSRTAGTH
VGNYEIGQGNLSLNANYTLAYTPANLSITAKPIAIQINSNSKTYGASDPQLSYTAPPLES
GDVVTGTPTRAPGENKGNYVISKGSLALSTDYIPTYNEGVFSINPAPLTITADAQTKFVG
TANPTFTGTYTGFVNGDDVSALTNKGTFTSVATINSPIGTYPIVPSGAVGSNYVITNVNG
VLTVKAGAPTNVLLAATTLYENQAAGAKAGTLSSTADDPNATFTYSLVSGTGDTDNAVFR
IAGDQLLTAASLDYENKKVYSVKVRSTTQHGFSLDKTFSINLSDVNEIPTLDAIASKTIC
YTTTGQTIDLTGISAGPESGQNTTVTASGSNAALLQSLTITPGSGGKAILSYRVKAGASG
TSTITVTVKDDGGTDNGGVDTYSRTFVLTVNPLPVIAINANIGSNNNNSSTDVSKGETVV
LTASGGSTYVWAVHNSIISGQTSANLRVRPRETTTYTVTVTNASGCSEQKSFTVNVLDDL
VKIKATNILTPNGDGYNDKWIIENIDFYPNNEVKIFDKAGRMVYGKRSYDNSWDGMLNGM
PLAEGTYYYVIDFGKDRPKFKGFITIVREN
NT seq
8913 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaataaatttccttaacgcgctcatctttatgatcatttgtttttgctgcctt
tcagcaaaaacaagtcatgcacaattgacacctggtgatatcgccattgttggtgtgaac
ggcgatacccgaccagctcctgcaacacctttcacaggaacaatcgctttggttgctctg
gtggatattccttccggaaccatcatcaaaattaccgattacacctacaacggaactgtc
tttggagcaagcagctcagatggactcctcacctggaccatcagtcagatcgttccgaag
ggcacagttttttcgatttcctttaccaatagcgtagccaccccagtaattcaaccttcg
acgtacggaacagtaaccaaaattggttggacaaatgcaggtattcgacctattagtagc
accagcggagatagctggttagtttataccacaaatccagacaacagctttaatttcatt
tatgggtttttaaatacgaattacacatcacctgccatacccggcgttgatacttcaacc
ggctggacattacctgggaataccccatcaaaccaatcttctgtgcttccaacacaattg
atcggaacaaacgcctataacacattggtcacttatttaggtgggcctgatttaagcaga
catttcaattcttataattttacttttacaggatcaaaagatgacctgctgaataacata
aaaacacctgcaaactgggccagtacggatactcagactagtgcaaaagatcttattcca
ggaacctctggtggtgcattttctggttcacaaccgatttataccattactgaaggacca
acagtagccagcgtaacttcaactgcaagcggcattaagaaaatcggagacattattcct
atcgtcatcaatttcagtgaaaatgttacggtgaacaccacgggaggaataccacaattg
acactcaataccactcctacttcttatgctaactatgtttcaggaagctcaaccagcagc
ttaacatttaactataccgtgggaactggacaaacaagtccggatctcaattatgcagct
accaatgctctaagcctgcaagccggaaccataaaaaatgtaaccaattttgacgccata
ctagacctacccgcaacctcctctccgaattcgcttggtggaagttccaatattattgtg
gatggaattgttccaactgtctcctccgtaacaggagtaacatcaaacggcagttatcgc
gccggacaaaccattgacatcaatgtaaatttctctgaagccatcacagtaacaggtacg
ccaacacttaccctcaacacgacaacagcaggaacagccagctacatttctggaactggc
acttccagcttaacattccgatatacggttggggcaaatcagaatagcgccgacctagac
tatgcctcaacaagctcgcttgctttagcaggaggaacgctcaaagacgctgcaggtaat
aatgcaacactcagcctcgctacaccaggggcagcaggatctttaggtgctaattccaac
attatcatagacacaaccatcccaacggttactggcgtaagcagtacaaatgggacttat
aatataggatcaacgatcccaatacaaattgcttttacagaaaacataattgttactggt
acgccacaactggctttaaatgttggcctccctgctgggaatgccacttatgccagcgga
agcggaacatcaacactaacctttaattacctggtcgctgaaggtcaaagcactgctgat
ctcgactatactggcacaacggcactttctttaaatggaggaacccttaaagatgccgca
ggaaatgatgccactttaacattagcaagtcctggcagcgctggctccctggctgcaaat
tcaaacctggtagtgaatgggactcgcccaacggtagctagcattgttagaacaggcgga
gccgcagcacttactaaggctaatacagtgaattttacggttaccttttctgaagcagta
actggtgtggatttaggagatttcggcataatttctacaggcagtttagtcgctcctggc
ctatcgggccttactggatcaggaactacttataccgtaaccgttaccacaggaattaca
aatggaactggcaccctacgcctggacttaagtagttcaggtactggaatcactggagct
tcaggcaataccattttagtcggatataccagtggtgaaacctataatgtggataggacc
actcctacaatttcgacgcgtaccattgcttcgaacaatagcaatactcaaatcgcaaaa
acaggagatgtggtgacactttccctgactgcatccgaagtactcaaccttccagtagtg
accatcaacggaaaccctgcgacagtcactaacccatccggttctatttataacgcaacc
tacaccgtaactgctactgatccggaaggccagatgacatttacagttaattttagcgat
ctggctggaaatataggtacacaagttactacaaccactaactccagtaaggttgtggtg
gataatattccaaccacgattacctcagtaagtagttcagcaactgatggacctcatggt
cttggcgcaatccttcccatctcggtcactttctcagagcctgtaactgtaacaggtaca
ccaattcttgccttaaattcaggtggctctgcaaattatataggtggtaccggatcaact
accctaggcttcagttataccgtgtcttccggtcaaaacagtacacagctggattattcc
agcagcgctgcattaactttaaacggaggtacaattagtgatcagaatgccattgccgct
ccacttacccttcctgctccaggaggagtaggctctttggcaaatggcagaagcattgtt
gtcaacggtcgaacgccaactgcactaagcatcaatagaaaaacgccaacaacgcaatca
accaatgccagttcagtagaatacgagatcaccttttctgagtccgtaaccggagtagat
gtctcagattttcaaatggctcccggctccgccgcaggaactgccattagctcagttgtc
ggatcaggagcaacctataccattacattaaccacaggcgtaaataatggtccatttgct
attaatttaagaaactctggtactggaattgccaacctggtttcaaatcccattctaaca
ggatttggaccaagtcaaatctataccattgacagaacatcaccaactattaatacggca
acgatacagtccaatcatgcaggcagtggagctatcgccaaacctggggatatcattacg
ctcaactttaccgcttctgaagtgattaatactcctgtagttaccatcagtggaaattct
gctacggttcaaaatacaaccggaaatacttgggtagctacttataccatgctatctaca
gacaacaatggtgtaattcctttcaacatcagttattctgatattgccggaaatgcgggt
acagccagaacgacaacaagcaatgcttctgcggtaacttacgacaaaactccaccaaca
ttaagcgcagtaactattgtatccgataatattaccaatcctgcaattgcaaaacctggc
gatgtagttaccttgagatttactgcttcagagaccgttttaacgccagttgtagttata
gcaggcgctactttaacagtgctgccaactgcgtcgcctaacagctacatggccttttat
accatcgattccagtctgccggaaggagaaattccttttaccatcaatttcagagatcag
gtaggaaatatgggaaccacagtgactaccgtaaccactggatcaatggtgacgctggat
aaaactgttcctaccattagcaatgtgagcatcagcagtaacaacccaaatccagcattg
gcgaaacctaatgaccaggtgactttaacttttaccgcctccgaagccattcaggctgga
gttctgattgatggtttggccgcaaccagcctatcaaacgtcgggaacgtatatactgcc
acaaaaatcctgaccactgcgaacacagaagggttagtgagctttagtatcggatttaca
gatttagctggaaatgcaggtgttagcttgagcacaaccaatgatgcttctacggttaca
tttgataaaacacttccagttgcgccgaattttctgggggtaacacctggagataaagaa
aacaacgtgttgtggtttttaaatgctgactatgcgaagtatgaattgattggcggaact
cctttagctttgggtaataatgtcctgactaccgttcttgcggcgaatgccacgaatcca
atgagcttcacacatactgggctgacgaatttaactacttattactatgcgcttcgggta
actgatgctgcagggaatgtaaacaccagttatacggcgactggaacaccactaaatgca
caaaccattacttttgatcagccggcagccgcagaatatggcagttcatttaccatcaat
gccaccagcagttcaggtttacctgttacttttacctccaatgagcctgctcttgctaca
atttcaggcaatacagttaccgttgtaggtgtaaacaacctgcaatcggtttctattatt
gccactcaagctggtaatgggacttattcttatgctccgccggtcatccgattattgcag
atcaaaccaaaaccggttacggtaacagctacagcacagacaaaagtgtttggcgatcta
gacccagccatagctgccccaatcattagtccagcgcttgtaggcactgatgtcagtaca
ggaaccctaaaaagagtagttggcgagaatgcaggaaactatgaaatccagcaaaacacc
ttcagtttagatcagtataaatatgcgattacctatgctcctgccgattttaccatcagc
aagaaaccagtaaccatcacaccgcagcttgcttatgctaagacctatggacaggctgat
ccatcatttgcatacaactttacaccattggtatccccagatgtcatcacaggagatttg
gcaagagtagcaggtgaaaatgtgggtacttataatttcgatttaggaacgcttagtgca
ggtgccaattacaatctggtattaagtccacttccccaatttacgatcaataagtcggtg
attaccgttacaccaatcaccgcgagtatccaatatggcgatgcggaacctgtgattaat
tacaaccatacccctgcacttaaaaccggggatgttttcactggagccttagccagagta
gctggaaatacgccaaacaattacctgatcactcaaggtaccctggcgctaagtaacaat
tacaccctgaatttcagtccgactccagtaaactttgtggtactgaagaaagacatcagc
attacccctactgctggtcagagcaaaatatatggagatgcagatggcacaatcaattat
acggcaagtccggctttattaaatggtgatacttttagcggtgctttaaacagagctcca
ggtacagcggtgaacaattatctcattggacttggaacgctgaccaccagcaatccacaa
aactataacctgcagctaggtactgaaaattatgccattaccaagaaagcgatccaggta
actgctacagcagtaagccaggtttacggtgatgcagatccagtgtctttaccttatacg
ttatctgctccactaccaaatggtgatgtgtttagcggaaaattggatagaacagcggga
actgatgttggaacttatccgattaatttaggaaacctggcattaagtactgttaattac
gacttgtcatttgtcccggcaaacctgagcattacgccgaaagaaattacgattactgcg
gtaagcggaactaaaacttatggtgatgctgatcctatatttggatatactggcagttcg
gcattagttagcggaaactcgtatagcggtaaactcggcagagctgccggagaaaatgtt
ggcagctatgctttgtcgctgggagatctgacagtaaataacaattacaccttgacctta
aatcctggtgcgacgcttcagattaataaaaaagacatcgacgtgcttgccgatgcgaaa
tctaagatttacggtggtaccgatccagagctgacttatacttccaatccagcattggtt
agcggtgatacttttacgggtgcactttcccgtgccccaggtgaaaatgtaaacacctat
gtgattggaaaaggaaatcttgctttaagttcaaactataacctgaattatacccctgca
aatttcaatattggcttgcaaaccatcaatgtaaccgctattgctaaaaacaaagtgtat
ggcgaagctgacccagcattggaatattcatttactccggcattagaatctggtgatgct
tttactggcgccctatcccgtgccccaggtgaaaatgtaaacacctatgtcattggaaaa
ggagatcttgctttaagttcaaactataccctgaactatacacctgccaatttaacgatc
ggtttgaaaaccatcgaagtaacggcgaaagctaaaagcaaagtgtatggcgaagcagac
ccagctttggattacgactttagtccggcattaaaatctggtgatacctttacaggcgca
ttgtcacgtgccccaggtgaaaatgtaaatacctatgtcattggaaaaggagatcttgct
ttaaatgcaaactataccttgaattatacccctgctaatttaaccattggcctgaaaact
attaatgttaccgcgaaggcgaaaaacaaagtttatggtgaatcagatccggcactggat
tacgactttagtccggcgttaagacttggtgataccttcactggcgcactatcccgcgca
gctggcgaagcagtaaacacttacgccatcggaaaaggaaacctggctttaaattcaaac
tatatcctgaattatacacctgccaatttaacgatcggcaaaaaaaccattaatgtaacc
gcgcaggcgaaaactaaagtttatggtcaggcagatcctgcattcgactacgatgtggtt
cctgcattgcaaactggcgatctcatcagcggtgcattatccagaaccgcgggaacgcat
gtgggtaactatgaaatcggacaaggaaacctgagccttaatgcaaattacacgcttgct
tataccccggcaaatctgtcgattacagctaaaccaatagccattcagattaattcgaat
agcaaaacttatggcgcctcagatccgcagctcagttatactgctccgccattggaaagt
ggtgatgtagttaccggtacacctaccagagctccaggggaaaacaaaggaaattatgtg
atttctaaaggcagccttgctttaagtacagattatattccgacttataatgaaggtgtt
ttctccattaacccagctccattaaccattaccgcagatgcacaaacgaaatttgtgggt
actgcaaatccaacgtttactggaacctatactggttttgtaaatggagatgatgtgtcg
gcgctgacaaacaaaggaacatttacttcagtggctacaatcaacagtccgattggaact
tacccgattgtgccttcaggtgcagtaggctcgaactacgtgattacaaatgtaaatggt
gtactgactgtaaaagcaggagcaccaacaaatgtattgctggcagcaaccacgctttat
gaaaaccaagctgcaggagctaaagccggtactttaagcagtactgctgatgatccaaat
gccacctttacttatagtttagtgagcggaaccggcgatactgataatgctgtattccgc
attgccggtgatcagctgttaaccgcagcaagcctggattatgaaaacaaaaaagtatac
agtgtaaaagttagaagtactacccaacatggtttctctcttgacaaaacattcagcatt
aacctgagcgatgtcaatgaaatcccgacattggatgcgattgccagcaaaactatttgc
tatacaacaactggtcagactattgatttgacaggtatcagtgctggtccggaatccgga
caaaacactaccgttaccgcatccggcagcaacgctgcattgttacaaagcttaacaata
acacctggctctggcggcaaagcaatcctcagctaccgtgttaaagccggtgcttcaggc
accagtacgatcaccgttaccgtaaaagacgatggcggaaccgacaatggtggtgtagat
acctatagcagaacgtttgtattgaccgtaaatccgcttcctgtaattgcgattaacgcg
aacattggcagcaacaacaataacagcagcacagatgtgagtaaaggcgaaacggtagtc
ttgactgccagcggaggcagcacttatgtttgggcagttcacaacagcattattagcggt
cagaccagtgcgaaccttagggttagacctagagaaacgactacttatacggttaccgta
accaatgccagtggctgttctgagcagaaaagctttaccgtgaatgtattggacgacttg
gtgaagatcaaagccaccaatattttaacgcctaacggtgatggttataacgacaaatgg
atcattgaaaacattgacttctaccctaataatgaagtgaaaatcttcgataaagcaggt
agaatggtctatggtaagcggagctatgacaacagctgggacggaatgctgaatggcatg
ccgctggctgaaggtacctattactatgtcatcgacttcggtaaagacagaccgaaattc
aaaggatttatcaccattgtaagagagaactaa
DBGET
integrated database retrieval system