Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI: PLF_037
Help
Entry
PLF_037 CDS
T03738
Symbol
rluC
Name
(GenBank) Ribosomal large subunit pseudouridine synthase C
KO
K06179
23S rRNA pseudouridine955/2504/2580 synthase [EC:
5.4.99.24
]
Organism
pli
Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pli00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pli03009
]
PLF_037 (rluC)
Enzymes [BR:
pli01000
]
5. Isomerases
5.4 Intramolecular transferases
5.4.99 Transferring other groups
5.4.99.24 23S rRNA pseudouridine955/2504/2580 synthase
PLF_037 (rluC)
Ribosome biogenesis [BR:
pli03009
]
Prokaryotic type
rRNA modification factors
23S rRNA modification factors
PLF_037 (rluC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PseudoU_synth_2
S4
PAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEL12297
LinkDB
All DBs
Position
I:40654..41592
Genome browser
AA seq
312 aa
AA seq
DB search
MKKLKNYKIIIFNHLNQRLDNYLIKNLKGIPKNLIYRLIRKGIIKINNKKFKAKNKLKRG
DKIRIPILYKRIVKKQININEKLKNFLINKIIYESNDWLIINKPSGFAVHGGNNITIGLI
EFLKKNIKNINFIELVHRIDKNTSGCLLIAKSRKFLIYINSAFKKKYIEKCYLALVEGNW
PINYIYIYAPINKYKININGEYYNIINKFGKHSYTFFEICKIFKGFTLIKVFPITGRMHQ
IRVHSAFLGHPLLGDSKYGSQIGKKFLKLKRLFLHSYYIKFPEFKSVKIIQLKTKIDEEL
KLVLNRAKKYII
NT seq
939 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaattaaaaaattataaaataataatttttaaccatttaaatcaaagattagat
aattatttaataaaaaatttaaaaggtataccaaaaaatttaatttatcgtctgataaga
aaaggaattataaaaataaataataaaaaatttaaagctaaaaataaattaaaaagaggt
gataaaattagaattcctattctatataaaagaatagtaaaaaaacaaataaatataaat
gaaaaattaaaaaattttttaattaacaaaattatttatgaatctaatgattggttaata
attaataaaccttctggttttgcagttcatggaggtaataatattactataggtttaatt
gaatttttaaaaaaaaatataaaaaatattaattttattgaactagttcataggatcgac
aaaaatacttcaggatgtttattaatagctaaatctagaaaatttttaatttatattaat
tcagcttttaaaaaaaaatatatagaaaaatgttatttagctttagtagaaggtaattgg
cctataaattatatatatatatatgctccaattaataaatataaaattaatataaatgga
gaatattataatataattaataaatttggtaaacattcatatactttttttgaaatatgt
aaaatttttaaaggatttacattaataaaagtttttcctattacaggtagaatgcatcaa
atacgcgtacattctgcctttttaggtcatcctttattaggagattcaaaatatggaagt
caaattgggaaaaagtttttaaaactaaaaagactgtttttacattcttattatattaaa
tttccagaatttaaaagtgtaaaaattattcaactcaaaacaaaaattgatgaagaactt
aaattagtattaaatagagcaaaaaaatatataatataa
DBGET
integrated database retrieval system
