Photorhabdus laumondii subsp. laumondii DSPV002N: A4R40_03175
Help
Entry
A4R40_03175 CDS
T05478
Name
(GenBank) serine protease
Organism
plum
Photorhabdus laumondii subsp. laumondii DSPV002N
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
P_proprotein
HemolysinCabind
Cadherin_5
Big_9
HCBP_related
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWK40593
LinkDB
All DBs
Position
734216..740587
Genome browser
AA seq
2123 aa
AA seq
DB search
MEKKYTVTYKVAPMGAKYVYQEDKNEHKAGDVHSSAGGHMWYVLNDGSGSEISYGFESRY
DEPWGEGRVTNNDNAAYQQTSYETTVELTEFQYNRLKAFSEGPSLVGFDAKHYNVAKNSC
VDFVFASLKAVGYNEKGFEGELFPNHNPMHLRDMLQNNGSRIIRDNLSRYIRYSDFYYLD
DESGRACLWLRPEDTKITLPMKPLINIDIVSTPKPLRHIQGENKAQQDVANGFIQNSATH
KISAVGDMLNKTDFASTQMAGLATGGIRPGEMQLDPNVKPNSYLSEFYKPFYQPGDTSKL
DFGLRNAVTLNGLSAMTTFNTYVDPLLLDLSGNGVHMTDIRDGVLFDMDNSGTLKRSGWA
DRNTGILVIDDGSGQIKNAGQMFSEYYGGKAGINGAAGEKKFKEGFGALASEDANKDGVI
DERDPIWSKLRVWVDGTHDAKVDAGELKTLAEWGITQINVRASNKTDVRDGNKVVASGSF
TINGKTQEVLAVDFLGDPVSNTLSTQGAGTRVTSTHNDIITTAYASQSETDETLNAEQLG
VSNLYGGSGNDTLIAAKTGSWLVGGAGSNTYVGGAGDDVFVISASDDTKNIHGNGGHDTA
IIVGNQGVELNMGQASLTIAEGGSGNDTIISGSVNGVFIKGGSGNSTLIGGMGNDVLVGG
SGHNTIVGGTGKSVIYAGPQGDTIYASKDGSIIHAGGGDDKIFGGVGDDVIEVGHGNATI
DGDGGVNIVSLHGNHGDYQITRTDSGYVVADKVAGRDGTVTLKNIQKLNFSDISAVDLQT
PNAMPVEDVLTHDKDGKVFDRTQPHLIAAESLLANDQHLNSQGALRIANVGDAIGGTVSL
TAQGDVLFTPDADYTGVISFKYGVTDAAGNPSASVVDLSSGETAPMRAVATLLTPEVPLD
PLAAQQWYLSDANILPVWKDYTGKGVRIGQFEPGGKFATAPEIFDINHPDLAANVDKAWL
QTQQTNGTLPNVVSNHATMVAGVMVAAKNNTGGVGVAHDATLGGYYLANDGADLAGLGHM
VSFDIANNSWGFANDFALSSFQGGSINTAASLSLNAQYAAANGRGGLGTVIVAAGGNHRA
EGGNAQGSLTNNNRFSVEVGAINAQGDLSTLQIGSSPFSNPGASLLVSAPGSNVVSTSYM
LKTERGSTFGNDYTSMQGTSFAAPIVSGVVALMLEANPNLGYRDVQQILALSARKINDPS
TAWSDNSSHSWNGGGMHASNDYGFGQIDARAAVRLAESWMTQSTAANEFVYSASSGPLGK
TLAAGETLTSSIAMNAGLNVEHVEIDFDAQAGRLGDLTLKLISPDGTQSILLNRQGKVPD
GMPGASATDLGSSQSGTFKYSFMSTHDLGERSAGNWTLQVSDAHSGLPVTLNAWSLRLYG
SKSISDDTYFYTDEYIQSVVGQANRAVLDDAVNGVAGGRNTLNAAAVSRDTSVNLLTGVA
SIGGTALTIKNPSGIQNIVTGDGNDTLVAGNADALLDGGRGNNTLAGGAGKDFFVVHHRE
AGSDVISNFEAARGEIIDLVGFRGKTFADLLLTQQGADVKVDLGKGQSIVLKNQPLAGIG
AANFKFQDTFIAPVAYTNSDAATLQPQEGLGTVILKGGGKGVMLTSDAQGQMKFSLNGTI
YSHDSAASDVFVVAAQPGARDYKNALRGFRHGIDKIDLRQAGVTDFSQLTIAKSHRGTIN
GLSQIHGVEVVFNGVSGTDSNVKLLYLDTLDTSQVDAADFLFAELTPDLVPTVKPVVTQS
LDKPTVTVPGSLTPIVDPLGVDKPLPLSPIDLKPISIPPRKPVSIPLIDWSLTKISSIDI
DRDMIKVTPVELNPTRINTGLVDLRSRFDQNVDRMSLIDRKPISTPPVEPRTTLNVPKIE
PAVESTPVTTDPDSITVKNPFSEVTLGDESKTINVKAMDSKIVAGNGDNKVNVMDRFADI
TLGNGKNVIVGNIDKLTVGHGNNTIKASGTFTKVNVGDGNNHIVTRGEMSTVEVGNGDNH
IMTSGIMSKVKVGEGNNHIVTSGTMSTVEVGHGDNDLEFSGDMGNLVFGKDISPERLWFQ
HEGQDLQISVIGSKQEVTLHNWYANSTERPRNIMAGDGHRLMESDVENLVQAMAAFAPPT
PATTMLGDVEQQRLQPVLAANWH
NT seq
6372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaagaaatatactgtaacctataaagttgctccgatgggggctaagtatgtttat
caggaagataagaacgaacataaagcgggagacgtacactcttcagccggcggtcatatg
tggtatgttttgaatgacgggagcggaagtgaaataagttacggttttgagtcaaggtat
gatgaaccgtggggagaggggcgagtaacgaataatgataatgccgcctatcaacagacc
tcttacgaaaccaccgtagaattgactgaatttcagtacaacaggttaaaagctttttca
gaaggcccatcgttagttggatttgatgctaagcattacaacgtggctaaaaacagttgc
gtggatttcgtatttgcatcattaaaagccgttggctataacgaaaaaggtttcgaggga
gaactgttccctaatcataatcctatgcatttgcgtgatatgttgcaaaataatggaagt
cgaattatccgtgacaacttgagtcgttatattcgttatagtgacttttattatctggac
gatgaaagtggtcgagcgtgtttatggcttaggccagaggatacgaaaatcactctaccg
atgaagccattgattaacatcgatatcgtgtccacgccaaaacctctgcggcatattcag
ggcgaaaacaaagcgcagcaggatgttgctaacgggtttatacaaaattctgcaacacat
aaaatatctgccgtcggggatatgctcaataaaacagactttgcctccacccagatggca
ggtcttgccaccggtggcattcgtcccggtgaaatgcagctcgaccccaatgtcaagccc
aacagctatctgtcggagttctacaagcctttctaccaacccggagacactagcaagctg
gacttcggcctgcgcaacgctgtgacgttgaacggtttatcggcgatgacaacgtttaac
acttatgttgacccgctgttattggatctgagcggcaatggtgtgcacatgactgacatt
cgtgacggcgtgttgttcgacatggataacagtggcacgcttaagcgcagcggctgggcg
gatcgcaataccgggatattggtgatcgacgatggtagcggtcagataaaaaatgccggc
cagatgttctccgaatactacggtggtaaggccggaataaacggtgccgcgggcgaaaaa
aaattcaaggagggtttcggtgccttagccagtgaagatgccaacaaagacggcgtgatt
gatgaacgtgatccgatctggagtaaattacgggtctgggttgatggcacccacgatgca
aaagtcgatgcgggcgaactcaaaacactggcggaatggggtattactcagataaacgtc
cgggcttcgaacaaaacagacgtccgtgatgggaataaggtcgttgccagtgggtcgttt
actatcaatggtaaaactcaggaagtgctggccgtcgactttcttggtgaccccgtcagt
aataccttgagtactcagggagctggcacacgagtgacctccactcacaacgatatcata
accacggcttacgccagccagagtgaaacagatgaaaccttaaatgcggagcaactggga
gtcagcaatctgtatggtggcagcggcaatgatacgttgattgcggcaaaaaccggcagc
tggctggttggaggcgcagggagcaatacctatgtcggtggtgccggcgatgacgtgttt
gtcatcagcgcttctgacgatacgaaaaacattcacggcaatggcgggcacgatacggcg
atcattgtcggtaaccaaggcgtggagctgaacatgggtcaagccagtttaaccatcgcc
gaaggcggaagcggcaacgatactatcataagcggtagtgtcaacggtgtctttatcaag
ggcggttccggcaattcgactctgataggtggcatgggtaacgacgtcctggtcggcggc
agtgggcacaacaccatcgttggtggcacgggtaagtcggttatctatgccggtcctcag
ggcgacacaatttacgcctccaaagacggcagcatcattcacgctggcggcggcgatgat
aagattttcggtggtgtgggtgacgatgtgatcgaagtgggtcacggcaatgctacgatt
gatggggacggaggggtcaacatcgtcagcctgcacggtaaccacggcgattatcaaatt
acccgtaccgacagtgggtatgtggtggccgataaggtcgccgggcgtgacggcacggtt
acgctgaaaaatatccaaaaactcaatttttcagatatttcggcggttgatttacaaaca
cccaatgcgatgcctgtcgaggatgtcctcactcacgacaaggacggcaaggtttttgat
cgtactcagcctcatctgattgccgcagaaagtctgctggctaacgatcaacaccttaac
agtcagggtgccctgcgcattgccaatgttggggatgcgataggcggtacggtcagcctc
acagctcagggcgatgtcttgtttacgccggatgcagattacaccggtgtcattagcttt
aaatatggggtaactgacgcagccgggaatccgtcagcatcggtagtcgatctcagcagt
ggggaaaccgcgccgatgcgcgccgttgcgacattattgaccccggaagtcccgctcgat
ccattagctgctcaacaatggtatttgagcgatgccaacattctgccggtctggaaggac
tacaccggcaagggcgtacgcattggtcagttcgagccgggcggtaagtttgccaccgcg
cctgaaatatttgatatcaatcaccccgaccttgcggcgaatgtcgacaaagcctggttg
cagactcaacaaaccaatggcaccttgccgaacgtggtctccaaccacgcgacaatggtg
gcgggtgtgatggtcgcggcgaagaataatacgggtggcgtcggggttgcccatgatgcg
acgttgggcggctattatctggccaatgacggtgccgatcttgcgggactggggcatatg
gtcagttttgatattgccaacaatagctggggatttgccaacgatttcgcgctcagcagc
tttcagggcggctccatcaatactgccgcgtcgctgagcctgaatgcgcagtatgcggcg
gctaatggtcgtggcggattgggtaccgtcatcgtggcggcgggcggcaaccatcgtgca
gaaggcggcaatgctcaggggtcgctgaccaataacaaccgcttttcggtggaagtcggt
gcaatcaacgcacagggcgatttgtcgacgttgcagattggctcctcacccttctccaat
ccgggagccagcctgttggtttcggcaccgggcagcaatgtcgtgtctaccagctatatg
ctgaaaaccgaacgtggctcaactttcggcaatgactacaccagcatgcaaggcaccagc
tttgccgctccgatagtctccggtgttgttgcgttgatgcttgaggccaacccgaactta
ggctatcgggatgtgcagcagatccttgctctatccgctcgcaagatcaatgacccctct
accgcatggagcgataatagtagccatagctggaatggcggtggcatgcatgccagcaac
gattacggttttggtcaaatcgatgcgcgagccgctgttcgcctggctgagtcttggatg
actcaaagcaccgctgccaacgagttcgtctatagcgcatccagcggccctctggggaaa
accttggcagcaggtgaaacgctgacgtcgtccatcgccatgaatgccggtctgaatgtc
gagcatgtcgagatcgattttgacgcccaggcaggccgtcttggtgatctgacgctcaaa
ctgatctctcccgatggcactcagagcatcttgctcaatcgtcagggtaaggttccagac
ggcatgccgggcgcgagtgcgaccgatctgggtagtagccagtcggggacgttcaaatac
agctttatgtcgacccatgatttgggtgaacgctcggctggcaactggaccctacaggtg
agcgatgcgcattccggcctgccggtcacattaaatgcctggtcgctacgtttgtacggc
agcaagagcatctcggatgacacttacttttacaccgacgaatatatccaatcggtggtc
gggcaggccaaccgcgcagtgttggatgatgcggtcaatggcgtggcgggagggcgtaat
accctcaatgcggcggctgtttcgcgggatacctcagtcaacttgctgaccggtgttgcc
agcattggcggcacagcgttgacgataaagaatccgtcgggcattcagaacatcgtcacc
ggtgatggcaacgatacgctggttgcgggtaatgccgatgcattgcttgatggcgggcgt
ggaaacaacacactggcaggtggtgcgggtaaggacttctttgtggtccaccaccgtgag
gcaggcagcgatgttatcagcaacttcgaggcggctcgtggcgaaatcatcgatctggtc
ggatttcgtggaaaaacgtttgccgatctgttgctgacgcagcagggggcggatgttaag
gtcgatctgggtaaggggcagagcattgtcctgaaaaatcagccactcgccgggatcggt
gcggcgaacttcaagttccaggatacttttatcgccccggtggcttacacgaatagcgac
gccgcaacgctccagccacaagaaggcttgggaaccgtgatccttaagggcggcggcaag
ggcgtcatgctcaccagcgatgctcaggggcagatgaaatttagcttgaatgggacgatc
tatagtcatgacagtgcggcgtcagacgtttttgtggtggccgcccaaccgggtgccagg
gactacaagaatgcattacgtgggttccgtcacggcattgataaaattgatttgcgtcaa
gccggcgtcactgatttcagccaactcacaattgctaagagtcatcgtggcacgatcaac
ggtctgtcacaaattcatggcgttgaggtggtctttaatggggtcagcggtactgattca
aacgtgaagttgctgtatctcgatactctggatacttcgcaggtcgatgcggccgacttc
ctttttgcggagcttacaccagatttggtcccaacggtcaagccagtggtgacgcaatct
cttgataaaccgacggtgactgtaccgggttcattgacaccaattgtcgacccccttggc
gttgataagcctttaccactttcccctatcgacttgaagccgattagtattcccccaagg
aagccggttagcattccccttattgactggagtctgactaaaatttcttctattgatatt
gaccgggatatgattaaagttacccctgttgagctgaatccgaccagaattaacactggc
cttgtcgacctgaggtcgcgttttgaccagaatgttgaccggatgtcactgattgaccgg
aagccgattagcactcctcctgttgagccgcgcacaacacttaacgttccgaaaattgag
ccagcagtggaatctacaccggtgaccactgaccctgattccattacggtcaaaaatccc
ttttccgaggttacgttgggggacgagagcaagactatcaatgtgaaagctatggatagc
aaaatagttgccggtaacggtgacaataaggttaatgtgatggaccgctttgccgatatc
acgttaggtaatggtaaaaacgtcattgttggcaatatcgacaaactaacagttggacat
ggcaacaacaccattaaagcgtcgggaaccttcacgaaagtaaacgtcggggatggcaat
aaccatatcgtgacccgcggtgagatgtcgacggtagaagtcgggaatggtgataaccat
atcatgaccagcggtattatgtcgaaagtaaaagtcggggagggtaataaccatattgtg
accagtggtactatgtcgacggtagaagtcgggcatggggacaacgatttggaatttagt
ggtgatatggggaacttggtgtttggaaaggacatcagccctgagcgtctgtggttccag
catgaagggcaggatctgcaaatttcggtcattggcagcaagcaggaggtaacgctgcat
aattggtatgccaattccaccgaacgaccacgtaacatcatggccggtgatggtcatcgg
ttgatggaaagtgatgtcgaaaatcttgtccaggcgatggctgccttcgcgccgccgaca
cctgcgaccacaatgctcggcgatgtcgagcaacagcggctgcaacctgtgctggcagcc
aactggcactga
DBGET
integrated database retrieval system
