Paenibacillus marchantiae: PTQ21_25700
Help
Entry
PTQ21_25700 CDS
T08974
Name
(GenBank) collagen-like repeat preface domain-containing protein
Organism
pmah
Paenibacillus marchantiae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
BclA_C
CBM_5_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WDQ31753
LinkDB
All DBs
Position
complement(5712419..5717026)
Genome browser
AA seq
1535 aa
AA seq
DB search
MSDERKRVNIKAFIEGRSFRAGSPFIPITSSEVEQFESILKALAVTIPAAVSQPTASNIL
ALQNSLRSLLTFVNTSGFRAGVKAELQSVLELTIAGSEVVPVAVINLAGNLQNLLDDLLS
VTLLLEVPPAEKDKLVGLIRSISVSLTRATSSFGTSGTPGPPGPPGVPGVPGVPGVPGPA
GPGGSVGPVGPVGPLGPLGPQGVPGPQGAPGVGLNDISVFDPAQAPGYVQGEVVSYNGSL
YVVNVNGPTGVPGSSPDYTLFLSGGTTGATGAGLTGSIPFDPALAPGYPAGQIVTFGGST
YITNVASPTGTPGSSPDYTLLASAGATGATGTTGVGLGGSVPFDPAVAPTYPAGQVVTFD
GSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGPTGVTGATGVGLSGILAFDPAVAPTYPAGQIV
TFDGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGATGATGVGLNGAVPFNPAVAPTYPAG
QVVTFDGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLIAGAGPTGPTGVTGATGVGLSGIVPFDPAVA
PTYPAGQVVTFDGSTYIANVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGATGATGVGLNGAVPFDP
AVAPTYPAGQVVTFNGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLIAGAGSTGPTGVTGATGVGLSG
IVPFDPAVAPTYPAGQVLTFDGSTYIANVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGATGATGVG
VTGATGDTGATGATGAGLTGVVPFDPAVAPTYPAGQVVTFDGSTYIANVASPTGTPGTSP
DYTLLAGAGATGATGATGVGVTGSNGATGDTGVTGVTGDTGVTGATGVSVTGSTGATGDT
GVTGATGVTGDTGAAGVTGATGVSVTGSTGATGDTGVTGVTGVTGDTGAAGVTGATGVSV
TGSTGATGDTGVTGVTGVTGDTGAAGVTGATGVSVTGSTGATGDTGVTGVTGVTGDTGAA
GVTGATGVSVTGSTGATGDTGVTGVTGVTGDTGAAGVTGATGVSVTGSTGATGDTGVTGA
TGVTGDTGAAGVTGATGVSVTGSTGATGDTGVTGVTGVTGDTGAAGVTGATGVSVTGSTG
ATGDTGVTGVTGVTGDTGAAGVTGATGVSVTGSTGATGDTGATGVTGVTGDTGAAGVTGA
TGVSVTGSTGATGDTGATGVTGVTGDTGAAGVTGATGVSVTGSTGATGDTGVTGVTGVTG
VTGATGVSVTGATGATGVTGLTGATGITGSTGVTGITGATGVGLTGVTGATGIGVTGATG
STGITGVTGATGLTGATGVGVTGSTGATGITGATGVAIGITGATGVTGITGTTGASGTTG
VTGATGVSVTGGTGATGVTGASGATGATGATGASVTGSTGSTGVTGATGATGATGVSVTG
ATGVTGVTGGTGATGATGATGTSVTSNSAYGENTSGTIVVILGGTLIPLPNNQNIGTGIT
INGTNDTFTLANAGRYYISYKINLTAALAIQSRILLNGTAIPASVVSPLLSLSQLQSDFI
VTVTAGSTIQFQLFGLVGTAVLSPPGATLNIIQLA
NT seq
4608 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgatgaaagaaaaagggtgaatattaaagctttcatagaaggaagatcgtttcga
gcgggatcaccgtttattccaataacatcgagtgaagtggagcagtttgagtccattttg
aaagcattggcagtgactattcctgcagctgttagtcagcctacagcgtctaatattctc
gcattgcaaaacagtttacggagtttgctcacctttgttaatacctctggttttcgagct
ggggtgaaagctgagttacaatccgttctggaattaaccatagcaggttctgaagttgta
cctgtagccgttatcaatctggctggcaacttgcaaaacttgcttgatgatttattaagt
gtaacgttgcttctggaagttccgcctgcggaaaaagataaattggtcggtttgatccgc
tccatatccgtatcattgactcgtgctaccagttcatttggaacatcgggaactccaggt
cctccaggtcccccgggagttccaggggttccgggtgttcccggagtgccaggtccagcc
gggccaggaggctcagtaggaccagtaggtccggtaggtcctctaggtcctctaggaccc
caaggcgtaccaggtccgcagggggctcctggagttggattgaatgatatttccgttttt
gatccagctcaggcacctggctatgtgcaaggtgaagtggtttcgtataacggcagtctt
tatgttgttaacgtgaatggtcctaccggagtaccgggaagttctccagactacacgttg
tttttgtcaggcggaacgactggagcaacaggggcaggcttaacaggctctattccattc
gatccggcgctcgcaccaggttatccggcaggacaaattgtaacgtttggcggtagtacc
tatattactaatgtggcatcgccaacgggaacaccgggtagttcaccggattatactttg
ctggcatcggccggagctactggggctactgggacaacaggagtgggactcggtggttct
gttccgtttgatcccgcagtagcacctacgtatccagcgggtcaggtcgtaacatttgac
ggcagcacttatattacaaatgtggcatcgccaacgggaactcccggtacttcaccggac
tatacactcttggcaggtgcaggacctactggggttacgggagccacaggagtaggttta
agtggaatattagcgtttgatccagcggtagcaccaacctatccagcgggtcaaatagtg
acatttgacggtagtacctatattactaatgtagcttcaccaactggaaccccaggtaca
tcaccagactacacattgcttgctggcgcaggagccaccggagcaaccggagcaacaggc
gtgggcttgaatggagcagttccgtttaacccagcagtggcaccaacatacccggccggt
caagttgtaacttttgatggcagcacctatattacaaatgtggcatcaccaacgggaacg
ccaggtacatcccctgactatacattgattgcaggcgcaggccctacagggccaacgggt
gtaacgggagcaactggagtaggtttgagtgggattgtaccgttcgatccggcggtagca
ccaacgtatccagcgggtcaagtggtgacgtttgacggcagtacgtacattgctaatgtc
gcgtcgccaacgggaacgccgggaacttcaccagactacaccttgcttgcaggtgcaggt
gctacaggtgcaaccggagcaacaggtgtgggtttgaatggagcagttccgtttgaccca
gcagttgccccaacgtatccggcaggacaggtcgtgacatttaacggcagtacgtatatt
acaaatgtggcatcgccaacgggaacgccaggaacttccccggactatacattaattgca
ggtgcaggctctacagggccaacgggtgtaacaggagcaactggagtaggtttgagtggg
attgtaccgtttgatccggcggtagcaccaacgtatccagcgggtcaagtgttgacgttt
gatggcagcacgtatattgcaaatgtggcatcaccaacaggcactccaggaacgtccccg
gattacacattgttggctggcgcgggagccacgggtgcgacaggggcaaccggagttggt
gtaacgggcgcaacgggagataccggtgcaacgggagccacaggcgcaggcttgacgggt
gttgttccattcgatccagcagtagcgccaacgtatccagccggtcaggtggtgacgttt
gacggcagtacgtatattgcaaatgtggcatcgccaacaggaacaccaggaacgtccccg
gattatacgttgttggctggcgcgggggccacgggtgcgacaggggcaaccggagttggt
gtaactggaagtaacggagccaccggagacacaggagttaccggcgtcactggagataca
ggagttaccggtgccacgggtgtcagtgtaacgggaagtacaggagcaacgggggatacg
ggtgtaaccggagccaccggcgttaccggcgatacaggagcagcgggtgtaactggagcc
acgggtgtcagtgtaacgggaagtaccggagcgacaggcgatacgggagtaacgggtgtc
actggggttactggcgatacaggagcagcgggtgtaactggagccacgggtgtcagtgta
acgggaagtactggagcgacaggcgatacgggtgtaacgggtgtcactggggttactggc
gatacaggagcagcgggtgtaactggagccacgggtgtcagtgtaacgggaagtaccgga
gcgacaggcgatacgggagtaacgggtgtcactggggttactggcgatacaggagcagcg
ggtgtaactggagccacgggtgtcagtgtaacgggaagtaccggagcgacaggcgatacg
ggtgtaacgggtgtcactggcgttaccggcgatacaggagcagcgggtgtaactggagcc
acgggtgtcagtgtaacgggaagtacaggagcaacgggggatacgggtgtaaccggagcc
accggcgttaccggcgatacaggagcagcgggtgtaactggagccacgggtgtcagtgta
acgggaagtaccggagcgacaggcgatacgggtgtaacgggtgtcactggggttaccggc
gatacaggagcagcgggtgtaactggagccacgggtgtcagtgtaacgggaagtactgga
gcgacaggcgatacgggtgtaacgggtgtcactggggttaccggcgatacaggagcagcg
ggtgtaactggagccacgggtgtcagtgtaacgggaagtacaggagcgacaggcgatacg
ggtgcaacgggtgtcactggggttaccggcgatacaggagcagcgggtgtaactggagcc
acgggtgtcagtgtaacgggaagtacaggagcgacaggcgatacgggtgcaacgggtgtc
actggggttaccggcgatacaggagcagcgggtgtaactggagccacgggtgtcagtgta
acgggaagtaccggagcgacaggtgatacgggtgtaacgggagtcactggggttaccggc
gtcaccggtgccacgggtgttagtgtcactggtgcaacaggggccaccggagtaacggga
ttaacgggtgcaaccggaataactggaagcaccggggttacaggaataacaggtgccaca
ggagtcggtctcactggagtaacgggtgcaacaggaatcggagtcactggtgcaacaggg
tccaccggaataacgggagtcaccggagcgacgggattaacaggtgccacaggagtcggt
gtcactggatcaacaggagctaccggaatcacgggtgcaacgggcgttgcaattggaatc
accggagccacgggtgtgacgggaattacagggactacgggagcaagcggaacaactggg
gttaccggggcaacaggggttagtgtaaccggaggtacgggcgcaactggagttactgga
gcaagcggggcaacaggagctaccggagcaacaggagccagtgtaactggaagcacagga
tcgacaggagttactggagctactggagcaacgggtgccactggagtgagcgtcacagga
gcaacaggcgtgacaggagtcaccgggggtacaggtgcaacgggtgcaaccggagccaca
ggaacttctgtaacatctaactcggcttacggtgagaacacaagtggaaccatcgttgtt
attttgggtggaacactaattccactgccgaataaccaaaatattggcactggcataacc
attaatggaacgaatgacaccttcactcttgccaatgcagggcgttactatatctcttac
aaaataaatcttacagctgcacttgctattcaatcccgtattttacttaacggaacagca
attccggcgagtgtagtttcaccattactttccctcagtcagttgcagtctgactttatt
gtgacggtaactgctggatcaacaatccagttccaattatttgggcttgttggtacagct
gtcctctctccaccaggcgctacattaaacattattcaattagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
