Prochlorococcus marinus MIT 9312: PMT9312_0961
Help
Entry
PMT9312_0961 CDS
T00297
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
pmi
Prochlorococcus marinus MIT 9312
Pathway
pmi03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PMT9312_0961
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pmi03400
]
PMT9312_0961
Enzymes [BR:
pmi01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
PMT9312_0961
DNA repair and recombination proteins [BR:
pmi03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
PMT9312_0961
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
UvrB_inter
TRCF
ResIII
CarD_TRCF_RID
UB2H
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB50021
UniProt:
Q31AS4
LinkDB
All DBs
Position
892268..895792
Genome browser
AA seq
1174 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3525 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
