Pedobacter mucosus: LOK61_14875
Help
Entry
LOK61_14875 CDS
T08291
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
pmuo
Pedobacter mucosus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OMP_b-brl_3
CarbopepD_reg_2
STN
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKT63048
LinkDB
All DBs
Position
complement(3559859..3562492)
Genome browser
AA seq
877 aa
AA seq
DB search
MNKIILMAAFCCLAFLTVLGQDRRLSLHQENISLKSVFKEIEKQCGYTFVYSDEVISDSM
FVSLNVNKIPVFKVLKNILTEKNLFYQIISDRLIAIGVKKQEQKFDVSHPLLTGVIVDQK
GKEIPFVSVSLFESNALLEGTVSTVMGKYQLSCLFQASHHYRLKLSSIGYEAIELNFSYR
DTAEMKRLVMNEDRQILKSVNVVGRRPLIDRRTDRYIVNVEGSILEAGNNGLEVLKKSPG
IWVDNEGSIKIKGNQSVMVMINNVVQRMAEGELAEYLRTLRSEDISKIEIISSPPSEFEA
AGSGGIIHIILKRSRKDGLVGSISGQYTQQEKQPAYRGGITLSYKLKNLYLSGNLSAGKD
KSDYIASNIIHYPNQDLYSSSTNRFNNNDRLVYRISAAYELGKNQTLSIQSMQNENRMNQ
YFDTHISFLGAQPLIGQAYSEWFRKPSVHSTTANYVLKLDSLGSEFKIIGDYVYSSKAEL
NNFRSAYSFTPKNSIYRNNTPNQTSLYSLQTDYTKAFNNTLSFKTGLKFVSTKRDNEVIN
ENFTGGNWQLNPGLSNRFIYTERLSMAYASLEKKWGKLSAKLGLRAELTDMKGDLITGNE
QFTRDYLGLFPSFFINQQLDEQKGSAIYFSYSRRLQRPGFADLNPYRLQFDDYLTQLGNP
DLTPEYTHKIEVGSIFWKNFSADIYYAVTLDKIAELANPVGSVIEYQTRNFNNSNEYGFS
FNAPITLFKWWTSNSSIAVYNLSYELYNYRISQTTFYARTSHNFIIKNFLDIDAGIDYRS
PFVRANTKIAYQLYTDFGMSKRLLDKSLTLQFRIADVFNTAREKDRTEFEGTRIDFYQKR
PTRTFSLSVSYSFSSGKKFDAKRIEQSNDDEKRRIGN
NT seq
2634 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaatcatattaatggccgcattttgctgtctggctttccttaccgtacttgga
caagaccgtagattgagtttacatcaggaaaatatatcactgaaatcggtgtttaaagag
atcgaaaagcagtgtggttatacttttgtgtatagcgatgaagtcatctcagatagcatg
ttcgtcagtttgaatgtaaataagatacccgtttttaaggtattaaaaaatatattaaca
gaaaaaaatcttttttaccaaataatttctgatcggttaattgccataggagtaaaaaag
caggagcaaaaatttgatgtatcgcatccgttattaacgggtgttattgtagaccagaag
gggaaagagatcccatttgtgtctgtaagtcttttcgaatcaaatgcacttctagaagga
acggtgagtactgtaatgggaaaataccagctttcatgtctattccaggcctcccatcat
tatcggttgaaactttcttctataggttacgaggcgatagagctcaatttcagttatcgg
gatactgccgaaatgaaacgtttggtgatgaatgaagacaggcagatattaaagtccgtg
aatgtggtaggcaggagacccttgatagataggagaaccgatagatatattgtgaatgtg
gaaggcagtattttagaagcaggcaataatggattggaggttttaaagaaatctccggga
atttgggttgacaacgagggttcgataaaaattaagggtaaccagtcggtgatggtaatg
atcaacaatgtagtgcaaagaatggctgaaggcgagctcgctgagtatttacgaacccta
agatctgaagatatcagtaaaattgaaatcatttccagtccaccttcagagttcgaagcg
gctggttccggtggaattattcatattatattgaaaagatcccgaaaagatggattggta
ggttcaatttctggacaatatacgcagcaggaaaagcagccagcctacaggggtggtatt
acgcttagttataagcttaagaatctctacttatcaggtaacctatctgccggaaaagat
aaaagcgattacatcgcaagcaatataattcactatcccaaccaagatttgtactccagt
agcaccaatagattcaacaacaatgataggttagtgtataggatcagtgcagcctatgag
cttggaaaaaatcaaaccttaagtatccaatcgatgcaaaatgaaaatagaatgaatcag
tattttgatacccacatttcattcttgggtgctcagcctcttattggacaggcttactct
gaatggtttagaaaaccttcagttcattctactactgcaaattacgtcttaaaattggat
agtctaggttcggaatttaagattattggggattacgtgtatagcagtaaggcggagctg
aacaactttaggtcagcatacagctttacacctaaaaactcaatttatcgtaataataca
ccaaaccagaccagtctatacagcttacaaaccgattatacaaaagcgtttaacaatacc
ctatcttttaaaacagggcttaaatttgtgtccaccaaaagagataacgaagttatcaat
gagaattttaccggaggtaactggcagctcaatccgggtttgagcaatcgctttatctat
actgaaaggttatctatggcttatgcttctctagaaaaaaaatggggaaaattaagcgcc
aagttgggcttaagggcagagctcactgatatgaagggcgatttgattacaggaaatgaa
caatttaccagagattacctcggtctttttccttctttttttatcaatcagcaattggat
gagcaaaagggtagtgccatttattttagttattcacgaaggttgcaacgtcctggcttt
gccgaccttaatccttatcggctacagtttgacgattacttaactcaactgggcaatccg
gatttaacgccagaatacacacacaaaattgaagttggctctattttttggaaaaacttt
tcagcagatatttattatgcagtaacgctcgacaaaattgcagagttggcaaacccagtg
ggaagtgttatcgagtaccagaccagaaattttaacaacagtaatgaatacggtttttct
tttaatgctcccataacacttttcaaatggtggacatcaaacagttcgatagcagtttat
aatcttagctacgaattatacaattatcgcattagccaaactacgttttatgcaagaact
tcccataattttatcatcaaaaactttttagatatagatgctggaatagactatcgttcg
ccgtttgtacgcgccaacacaaagattgcctatcaactgtatacggattttggaatgagt
aaaagacttttagataaaagtttaacattacaattccgtatagcagatgtatttaatacc
gctcgagaaaaagataggacggaatttgagggaacgaggattgatttttaccagaagaga
cctaccaggactttcagtttatcagtaagctattcttttagctcaggcaaaaagtttgat
gctaagagaattgagcagagtaatgatgatgaaaaaaggagaattggaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
