Pedobacter mucosus: LOK61_14950
Help
Entry
LOK61_14950 CDS
T08291
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor family protein
Organism
pmuo
Pedobacter mucosus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OMP_b-brl_3
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
SpaA
EMC7_beta-sandw
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKT63062
LinkDB
All DBs
Position
complement(3572537..3574987)
Genome browser
AA seq
816 aa
AA seq
DB search
MKILFTLIACLMVCGVSFAQKFYKITGKIIDEKAVAVPFSIVKILNYPDTTLVKSVSTDI
DGAFVIDQLQKGDYVLSISMVGFKIKKTAKISLTADLTLPAISIESLVKQLNEVSVQGKR
PFIEHQIDKTVLNVENSIVSTGGTALEILEKAPGVQIDRQNDQILLNNKAGVMVMVDGKN
NFLSRADLTTYLNTLSSTQIATIEIITNPSAKYDAAGNAGIIDIKLKRNKAFGTNGSVSS
TYRNAIKANLPTNIYGSEFNLNLNNRNKKWNFYSNANASKNNNFSTMLLERTTNANGLQS
AFNQNFNKLYNGSRLAGKLGADYYASEKTTIGVMLDGGSSTRKLDNFSQTFINETQAGVT
NNNSLIQYSDANTPNKNYSANFNVKHEFKKDGASLNFDADYSGFNYSGLENFSTNFFDKS
SVIYNNTMIKNDSKTDINIYAVKTDFTWPVSKTVKLETGLKSSYVKTDNNFLSSAFLNNE
WQNIVGQSNNFIYKENVNAAYGNLSKDFGKWQIQTGLRAELTQSTGESVTNNTQVKQHYL
SLFPTIFVSQKISENSSLRYSYGRRIDRPNYQQLNPFNFYLDPYTIQQGNPYLKPQFTSN
FEVSYNYKSGLSFSLGYSKTKDLILDSKTAQNDSTRIVTVGQGNIGSGEYYTANLYFPLT
ITKWWSMQNNFSLFYNTFNDDNLEGAPFVLSKVAYNFNVSSSIVLGSNWSLETNFWLNSP
KVRGLEKTIIYQYALNSGVQKSFFKKSLKVRLNVDDIFATNYWKGTLEYQNVNLKVQNNY
ISRRASFNISYNFGNQNVKSARDRKTATDDLKNRAN
NT seq
2451 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatattatttacgctaattgcatgccttatggtatgtggggtttcctttgcccaa
aaattttataaaattaccgggaaaataattgatgaaaaagctgtagcggtgccattttca
attgttaagattttgaattatccagacactacactagttaaaagtgtttcaacagatatt
gatggtgcatttgttatcgatcagttgcaaaaaggagattatgttttatcaatttcgatg
gttggttttaaaattaaaaaaacagccaaaatttcgcttacagctgatttaactttaccc
gccatctcgatagaaagtttagttaagcaattaaacgaggttagtgttcaaggcaagcgt
ccgtttatagagcatcagattgataaaaccgttctgaatgttgaaaacagcattgtttct
actggcggaacagctttggaaattttggaaaaagcaccaggtgtacaaatagatcggcaa
aatgatcaaattctattgaacaataaagctggtgtgatggtaatggttgatggtaaaaat
aattttttatcacgagcagacttaaccacttacttaaatactttaagcagtactcaaatt
gcaacaatagagattattaccaatccatcggccaaatatgatgctgcgggaaatgcaggt
attatcgacataaaattgaaaagaaataaggcttttggtacaaatggaagcgtttcatca
acttatcgcaatgcgataaaggcaaatttacctacaaatatttacggttctgagttcaat
ttgaatctaaacaatcgcaacaagaaatggaatttctatagcaatgcaaatgcatcaaag
aataataattttagtacgatgttattagaaaggacgacaaatgctaatggcttgcaaagt
gccttcaatcaaaattttaataaattatataacggttccagacttgcaggaaaacttggt
gcagattattatgcgagcgagaaaaccactattggtgtgatgttggatgggggctcgagt
accagaaagcttgataatttttcgcaaacttttattaatgaaacgcaagctggagtaacc
aataacaattcattaatacaatattcagatgctaacacgccaaacaagaactatagcgca
aattttaatgttaaacatgaatttaaaaaggatggtgcaagtctgaattttgatgccgat
tattcgggatttaattatagtggactggaaaattttagcacaaattttttcgataagagt
tcagttatttataataatacaatgattaaaaatgatagtaaaactgatattaacatttac
gcagttaaaacagattttacctggccagtgtcaaaaacagttaagctagaaactggtctg
aaaagtagctatgtaaaaacagataataactttttatcatcagcatttttaaataatgag
tggcaaaatattgtcgggcagagcaataatttcatttacaaagaaaatgtaaatgcagct
tatggcaacctatcaaaagattttggtaaatggcaaattcaaactggtttgcgagcagag
ttgactcaatctacgggagaatcagtaaccaataatacacaggtaaaacagcattattta
tccttgttcccaactatttttgtaagtcagaaaatttcggaaaacagcagtttacgttat
tcatatggaaggcggatagatagaccgaattatcagcaattaaatcctttcaatttttat
ttggatccatatactatacaacagggaaacccatatttaaaacctcagtttacaagtaat
tttgaggttagttacaattataaaagcgggttgtcattttctctaggctactcaaaaacg
aaggatttgattttagatagcaagactgcccaaaatgatagtacccgaatagttaccgtt
ggacaaggaaatattggaagtggcgaatactacacggcaaatttatactttcctttaaca
attacgaaatggtggagcatgcaaaataattttagccttttttacaatacatttaatgat
gataatttggagggagcaccttttgttttgagcaaagttgcctacaattttaacgtttca
agcagtatagttctaggtagtaattggtcgttagaaactaacttttggcttaattcccct
aaggtaagaggtttggagaagactattatttatcaatatgctttgaacagtggagtgcag
aaaagtttctttaaaaaatccttgaaagttaggctaaatgttgatgatatttttgcaact
aattattggaaaggaacgctcgaatatcaaaatgtaaatttgaaagtgcagaataattac
attagtagaagggcttcatttaacatcagttataattttggaaatcagaatgtaaaatcg
gctagagatagaaaaaccgctacagatgaccttaagaatagggctaattaa
DBGET
integrated database retrieval system