Candidatus Protochlamydia naegleriophila: PNK_1914
Help
Entry
PNK_1914 CDS
T04212
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat-containing protein
Organism
pnl
Candidatus Protochlamydia naegleriophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUI17519
UniProt:
A0A0U5JGI6
LinkDB
All DBs
Position
cPNK:complement(2245173..2247515)
Genome browser
AA seq
780 aa
AA seq
DB search
MMYKFLFIFFLSLCFFSKVFAESEPVFTELNFGALIDRSCCKKIKRGPPGPRGPRGYPGP
PGPAGVPGSMGLPGATGATGPTGATGVDGATGATGPTGATGATGITGATGATGATGPTGA
TGATGVDGAIGATGPTGATGATGVDGAIGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGV
DGAIGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGVDGATGATGPTGATGATGITGATGATGP
TGATGATGVDGAIGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGVAGVTGATGPTGATGA
TGITGATGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGITGA
TGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGVAGVTGATGPTGATGATGITGATGATGP
TGATGATGVTGVTGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGA
TGVAGVTGATGPTGATGATGITGATGTTGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGVTGV
TGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGITGATGATGPTGATGATGVAGVTGATGP
TGTGGSTNAAFLYIQGTPNPPAVQGYRILSVTSSPPAAPSDATLQFISGTYASPSSGITI
GTLTSSGATYNPAIANQITLAPGKYLFTYAVSLSGQSNFALTTDISSATAAINNIIPGSH
LGTNQNLSFAPLSILIQVVSTTNVYLVNYNLNPVLLGTGGNNTPAGVPFSMAYMNIVSVN
NT seq
2343 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtataaatttctttttattttttttctcagtttatgttttttttctaaagtattc
gctgaatcggagcctgtgttcactgagttgaattttggcgcgcttatcgatcgcagctgc
tgcaaaaaaataaaaagagggccgcctggaccaagaggaccaagaggatacccaggtcct
ccaggccctgctggtgtgccaggatctatggggttacccggagcaacaggagctactggc
ccaacgggtgcgacaggtgttgatggagcaacaggcgctactggtcccacgggcgcgaca
ggggctacgggtattacaggagcaacaggagcaacaggagctactggccccacgggcgct
acaggagcgacaggtgttgatggagcaataggagctactggtcccacgggcgctacagga
gcgacaggtgttgatggagcaataggagctactggtcccacaggcgcgacgggggcaaca
ggtattacaggagcaacaggagctactggcccaacgggcgctacaggagcgacaggtgtt
gatggagcaataggagctactggtcccacaggcgcgacgggggcaacaggtattacagga
gcaacaggagctactggcccaacgggtgcgacaggtgttgatggagcaacaggcgctact
ggtcccacgggcgcgacaggggctacgggtattacaggagcaacaggagctactggcccc
acgggcgctacaggagcgacaggtgttgatggagcaataggagctactggtcccacaggc
gcgacgggggcaacaggtattacaggagcaacaggagctactggcccaacgggcgctaca
ggagcgacgggtgttgcgggagtgacaggtgctactggcccaacgggcgcgacaggggca
acaggtattacaggagcaacaggtgctactggtccaactggcgcgacaggggctacaggt
attacaggagcaacaggtgctactggtccaacgggcgcgacaggggctacaggtattaca
ggagcaacaggcgctactggtccaacgggcgcgacaggggctacaggtattacaggagca
acaggcgctactggtccaacgggcgcgacaggggctacgggtattacaggagcaacaggc
gctactggtccaacgggcgcgacaggagcgacaggtgttgcgggagtgacaggtgctact
ggccccacgggcgcgacaggtgcgacgggtattacaggagcaacaggcgctactggtccc
acgggcgctacaggagcgacaggtgttacgggagtgacaggtgctactggcccaacgggc
gcgacaggggctacgggtattacaggagcaacaggcgctactggcccaacgggcgcgaca
ggggctacgggtattacaggagcaacaggcgctactggtccaacgggcgcgacaggagcg
acaggtgttgcgggagtgacaggtgctactggccccacgggcgcgacaggtgcgacgggt
attacaggagccacaggaactactggtcccacaggcgcgacaggggctacgggtattaca
ggagcaacaggcgctactggtcccacgggcgctacaggagcgacaggtgttacgggagtg
acaggtgctactggcccaacgggcgcgacaggggctacgggtattacaggagcaacaggc
gctactggtcccacgggcgcgacaggggctacgggtattacaggagcaacaggcgctact
ggtccaacgggcgctacaggagcgacaggtgttgcgggagtgacaggtgcaactggtcca
acaggaacaggtggttctacgaatgctgcgtttttgtatatacaaggtacgcctaatcct
ccagctgtgcaaggttataggatactatcagtgacctcatcacctccagctgcaccatca
gatgcgacacttcagtttatctcaggaacttatgcatctccaagctctggtataacaatt
ggcactctcacttcctcgggggcaacttataacccggctattgctaatcaaatcactcta
gcaccgggaaagtatttatttacttatgcggtttcattaagtggacaaagtaattttgct
ttaacgactgacatttccagtgcgactgctgctataaataatattattccgggaagtcat
ttgggaactaatcaaaatctaagctttgctccactctctatattgatacaagtagtctcg
acaacaaatgtttatcttgttaattataatttgaatcccgttcttttgggaacggggggt
aataacaccccagccggtgttccattttcgatggcttacatgaatattgtgtccgtgaat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
