Polaribacter vadi: LPB03_09645
Help
Entry
LPB03_09645 CDS
T04504
Name
(GenBank) alginate lyase
Organism
pob
Polaribacter vadi
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Chondroitinas_B
Beta_helix
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW17706
UniProt:
A0A1B8TS72
LinkDB
All DBs
Position
complement(2185843..2188152)
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MQKTFLLLSAILFFISCDKTATNTIHVSNSSELIDVAKKAKAGDHIIIKNGTYKNIALQF
IGEGTEENPINLSAETAGQVFLEGTSSLEISGNYLNVSGLFFRNGYSPKDNVIAFRTGSK
KVANNSTVSNCVILDYNSLERDQDNLWVQFYGKHNVLQNCYLAGKTNGGPTVRVDLKGNQ
SIRNYHKIVNNHFGPRPRKGGARGETIQLGSSFTSMSPSNTLIANNLFEECNGEVEIISS
KTNFNIIKNNVFYKSEGSVVTRHGNYVTIDGNYFIGDGINDQFGGIRIINTGHWVTNNLF
YKIKGKNFRSPIAIMNGIPKSPLNRYNQVTDVVVAYNTFVDSDSPFQFGVGTNITQAAVL
PKSEIRSARPLRTEVVNNVIYNSKGDANPIIEHDKADGVTFKSNIIDNNGVEIKNAHGLI
TKDLTLTDIGSNIAVPTTGFADVEVYKGFDFEVISNDLLGNSRSKSNQIGAILNVENINL
DVLDKTKYGANWFSNEVDKKEATTHKVTNADELITKLKAAESGDIIDLGLGLYQVDTSLI
IDKSITIKSSGDGKAQIVFSGMENTPLFELNPYGKLKIEKVILKGNNNNYLFATLKKKMS
NHFGLTVNYCEISNFKYALKVYKQSFAERITFEATSITNCENGLELSEETNDRGDYNTEY
LTIDGCTFNNVEQNVVDYYRGGYDESTIGGNLLITNSTFMNSGASEENSRLLNHNGIHNV
NINNNTFKNNKVEFVSILWGAKNNVESNNTIINSGKIKTEENLVQKLMY
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaaacgttcctacttttaagtgctattttattttttatttcttgtgataaaaca
gcaacaaatacaattcatgtaagtaattcatcagaattaatagatgttgcaaaaaaggca
aaagcaggagatcatattataattaagaacggaacatataaaaacatagcacttcaattt
attggagaaggtactgaggagaatcccataaacttaagtgcagaaactgctggacaagtt
tttttagagggcacatcgagtttagaaattagcggaaattacctaaatgtaagtggcttg
ttttttagaaatggttactcacctaaagataatgtaattgcatttagaacaggttctaaa
aaagtagcaaataacagtactgtaagtaattgtgttattttagattataatagtttagaa
agagatcaagacaatctttgggtgcaattttatggaaaacacaatgttttacaaaattgt
tatttagcaggtaaaacaaatggagggccaactgttagagtagatttaaaaggaaaccaa
agtattagaaattaccataaaattgtaaataatcattttggaccaagacccagaaaagga
ggtgcaagaggagaaacaattcagttaggaagtagttttacgtccatgagtccaagcaat
acgttaattgcgaataatttattcgaagaatgtaatggagaagtagaaattatatcgagc
aaaaccaattttaacatcataaaaaataatgtgttttacaaaagtgaaggttctgtagtt
acaagacatggaaattatgtgactatagatggcaattattttataggtgatggaattaac
gatcaatttggtggtattagaattataaacacaggtcattgggttacaaataacctgttt
tataagataaaaggtaagaattttagaagtccgattgcaataatgaatggaattccaaaa
tcgcccttaaacagatacaatcaagttacagatgttgtggttgcttataatacatttgta
gattcagattcgccttttcaatttggtgtaggtacaaatattacacaagctgctgttttg
ccaaaatcggaaattcgttctgcaaggcctttaagaactgaagttgttaataatgtaatc
tataattctaaaggtgatgcaaacccaattattgagcatgataaagctgatggagtaact
tttaaaagcaatattatagacaataatggtgttgaaattaaaaatgcacatggtttaatt
actaaagatttaacgttaacagatattggttccaatattgctgttccaacaactggtttt
gctgatgttgaagtatataaaggtttcgattttgaagtgatttcgaatgatttattaggg
aattctagaagcaaatcaaatcaaattggtgcgattttaaatgttgagaatatcaattta
gatgtattagataaaactaaatatggtgcgaattggttttctaatgaagttgataaaaaa
gaagcaacaactcataaagttacaaatgctgatgaattaattactaaattaaaagctgca
gaaagtggcgatattattgatttaggtttgggtctatatcaagtagatacatctttaatt
attgataaatcaattactataaaaagttcaggagatggaaaagctcaaatcgttttttca
ggaatggaaaacacacctttgttcgaattaaatccttatggaaaattaaaaattgaaaaa
gtaattttaaaaggaaacaataacaactatctttttgcaacattgaaaaagaaaatgtca
aatcactttggattaacagttaactattgtgaaatcagcaattttaagtatgctttaaaa
gtttataaacaatcttttgcagaaagaatcacattcgaagctacttcaattacaaactgt
gaaaatggtctagaattatctgaagaaacaaatgatagaggagattataacacagaatat
ttaacgatagatggttgtacgtttaataatgtagaacaaaacgtggttgattattataga
ggtggttatgatgagtctaccattggtggaaatcttttaattaccaactccacatttatg
aattctggagcatcagaagaaaacagcagactcttaaatcataatggaattcacaatgta
aatatcaataataatacttttaaaaataataaagttgagtttgtttctattctttggggt
gcaaaaaataatgtggaatctaacaacacaatcattaattctgggaaaattaaaaccgaa
gaaaatttagtgcaaaaattgatgtattaa
DBGET
integrated database retrieval system
