KEGG   Candidatus Purcelliella pentastirinorum: C9I82_350
Entry
C9I82_350         CDS       T05580                                 
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase beta' subunit
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
ppet  Candidatus Purcelliella pentastirinorum
Pathway
ppet03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ppet00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    C9I82_350
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:ppet03021]
    C9I82_350
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
    C9I82_350
Enzymes [BR:ppet01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     C9I82_350
Transcription machinery [BR:ppet03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     C9I82_350
DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      C9I82_350
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 RPOC_hybrid
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXN02308
UniProt: A0A346E003
LinkDB
Position
364230..368516
AA seq 1428 aa
MYVFYIYNNLFIFLKILSYILGFLVKNLINIFKSQSKIEEFNAIKISLASPDVIRSWSYG
EVKKPETINYRTFKPERDGLFCARIFGPIKDYECLCGKYKRLKHRGVVCEKCGVEVTQSK
VRRDRMGHIELAAPIAHIWFLKSLPSRIGLLLDMPLKDIERVLYFESYVVVESGDTSLKR
YQILSEEQYLNYLEEYDDNFDAQIGAEAIQNLLKLIDIKQECINLRIILDEISSDTKRKK
ITKRIKLLESFISSGNKPEWMIFTVLPILPPDLRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVINRN
NRLKRLLDLSAPDIIVRNEKRMLQEAVDALLDNGRRGRAITGSNKRPLKSLADMIKGKQG
RFRQNLLGKRVDYSGRSVITVGPYLHLNQCGLPKKMALELFKPFIYGKLELNGFATTIKS
AKKMVEREESIVWDILDEVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPILIEGKAIQLHPLVCAA
YNADFDGDQMAVHVPLTLEAQLEARSLMMSTNNILSPANGEPIIVPSQDVVLGLYYMTKS
KINARGEGMYFKDPKEVERVYCMGIIELHAFIKVRITEYEKDSNGILIKKIILVDTTVGR
AILWIIVPKGLSYSIVNLTLGKKSISKMLNICYRILGLKYTVIFADQIMYTGFAYAAKSG
VSVGINNIVIPIEKAAIISEAEVEVAEIQEQFQSGLVTSSERYNKVIDIWASANERVAQA
MMKNLSVEFVLNINNKRVKQSSFNSIFMMADSGARGSAAQIRQLAGMRGLMAKPDGSIIE
TPITANFREGLNVLQYFISTHGARKGLADTALKTANSGYLTRRLVDVAQDLVVTELDCGT
LDGIFMTPLIEGGDIKESLRERVLGRVVAEDLLYHDMSKVLVKRNILLDEYWCNILEDHS
IDVIKVRSVVSCETNFGVCSYCYGRDLARGHIINKGEAIGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFH
IGGAASRAALSSNIQVKNNGRIKLINAKTVLNSDNMLVVISRNVELKVIDEFGRIKESYK
VPYGAVIVKGDGEYVNSGEIIANWDPHTMPVISEINGYLKFVDMIDGQTITRQTDELTGL
SSVVIMDTTERMLGGKDLRPSLKIVNDIGGDIFISGLDTPVQYFLPNRAILQLSDGIYVN
AGDILARVPQESGGTKDITGGLPRVADLFEARRPKESAILAEISGVISFGKETKGKRRLL
ITPNNNDEHVYEEMIPKWRQLNVLEGENVNKGDIISDGSEASQDILRLRGVNAVTDYIVN
EVQDVYRLQGVKINDKHIEIIVRQMLRKATILNPGDSKFLSGEQLEYSLIKIENLKLKSK
GKKLIVFMRDLLGITKASLSTESFISAASFQETTRVLTESAVAGKYDKLRGLKENVIVGR
LIPAGSGYSYHVDRIRKRTKLLKFNNIQQNITVEEASANLTELLNADI
NT seq 4287 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtatgttttttatatatataataatttatttatttttttaaaaattttatcttatatt
ttagggtttttagtgaaaaatttaattaatatttttaaatcgcaaagtaaaatagaagaa
tttaatgcaattaagatatcgttagcttctccagatgttattcgttcttggtcatatggt
gaagttaaaaaaccagaaactataaattatcgtacttttaaacctgaaagggatggttta
ttttgcgcaagaatttttggtccaataaaagattatgaatgtttgtgtggaaaatataaa
agattaaaacatcgtggggtagtttgtgaaaaatgtggtgttgaggtaactcaaagtaaa
gtacgtcgtgatcgtatgggtcatattgaattagctgctcctatagctcatatttggttt
ttaaaatctttaccttctcgtattggtttattattagatatgcctttgaaagatattgaa
cgtgttttatattttgagtcttatgttgttgttgaatctggtgacacttctttaaaaaga
tatcaaattttatctgaggaacaatatttaaattatttagaagagtatgatgataatttt
gatgcacaaataggtgctgaagctatacagaatttattaaaattaatagatattaaacaa
gaatgtataaatttacgtattatattagatgaaattagttctgataccaaacgtaaaaaa
attactaaacgtattaaattattggaatcatttatatcttctggtaataaacctgaatgg
atgattttcactgtacttccaattttaccacctgatttaagacctttagtaccattagat
ggtggcagatttgctacatctgatcttaacgatttatatagaagagttattaatcgtaat
aacagattaaaaagacttttagatttatctgctcctgatattattgttcgtaatgaaaaa
cgtatgctgcaagaagcagttgatgcattattagataatggtcgtagaggtagagctatt
actggttctaataagaggccgttaaaatctttggctgatatgataaaaggtaaacaaggt
agatttcgtcaaaacttattaggaaaacgcgttgattattctggtagatcagtaataact
gttggtccatatcttcatttaaatcaatgtggcttgcctaaaaaaatggcattagaatta
tttaagccatttatatatggtaaattagaactaaatggatttgcaacaactataaaatct
gctaaaaaaatggttgaacgcgaggaatctatagtatgggatattttagatgaagtaata
aaagaacatcctgtgttattaaatcgtgcacctactttacatcgtttaggtatacaagca
tttgaaccaattttaattgaaggaaaagcaattcaattacatccattggtttgtgctgcg
tataatgctgattttgatggtgatcaaatggctgtacatgttcctttaactttagaagcg
cagttggaagctaggtccttaatgatgtctactaataatattttatctcctgctaatggt
gaacctataattgttccatctcaagatgttgttttaggtttatattatatgacaaagagt
aaaataaatgctcgtggtgaaggtatgtattttaaagatcctaaggaagttgaacgtgtc
tattgtatgggtattattgaattacatgcttttattaaagttcgtattactgaatatgaa
aaagattcaaatggcatattgattaaaaaaataattttggtagatactacagttggtcgt
gctattttgtggataattgtacctaaaggtttgtcttattctatagttaatcttacttta
ggtaaaaaatctatatctaaaatgttaaatatttgttatagaatattaggtttaaaatat
actgttatttttgctgatcaaattatgtatactggttttgcttatgctgctaaatctggt
gtatctgtaggtattaataatattgttattcctattgaaaaagccgctatcatttctgaa
gctgaggttgaagttgcagagattcaggaacaatttcagtcaggtttagttacatcaagt
gaaaggtataataaagttatagatatttgggcttcagctaatgaacgtgttgctcaagct
atgatgaaaaatttatcagttgagttcgttttaaatattaataataaaagagtaaagcaa
tcttcttttaatagtatatttatgatggcagattctggagctagaggttcagctgctcaa
attagacaattagcgggtatgcgaggtttaatggctaaaccagatggatcaattatagaa
actcctattactgctaattttcgtgaagggttaaatgtattacaatattttatatctaca
catggtgctagaaaaggacttgcagatacagctttgaagacagctaattccggttattta
actagacgtttggttgatgtagcacaagatttggtagttactgaattagattgtggcact
cttgatggtatttttatgaccccattaattgagggtggtgatattaaagaatctttacga
gaaagagttttaggtagagttgttgccgaagatttattatatcatgatatgtcaaaggta
ttagttaaacgtaatattttattagatgagtattggtgtaatattttagaagatcattca
attgatgtaataaaagtgcgttctgttgtttcatgtgaaactaattttggtgtttgttct
tattgttatggtcgtgatttggctagaggacatattattaataaaggagaagcgattggt
gttatcgcagctcaatctataggtgaacctggaactcagttaactatgcgtacttttcat
attggtggagctgcttcaagagcagctttatcttctaatatacaagttaaaaataatggt
agaataaaattaattaatgcaaagacagtattaaattctgataatatgttagttgttatt
tctagaaatgtagaactaaaagtgatagatgaatttggacgcattaaggaaagttataag
gtaccatatggggctgttatagttaaaggtgatggtgaatatgtaaattctggtgaaatt
attgctaattgggatccacatactatgcctgttatatctgaaattaatggttatttaaaa
tttgttgatatgattgatggtcaaacaattacaagacaaactgatgaattaactggatta
tcttctgtagttattatggatactactgaacgtatgttaggtggtaaagatttacgtcct
tctttaaaaattgttaatgatattggtggtgatatatttatttcaggattagatacacct
gttcaatattttttgcctaatagagctattttacaattaagtgatggtatttatgttaat
gctggagatatcctagcacgtgtacctcaagaatctggaggtactaaggatattacaggt
ggtttacctcgtgttgctgatttatttgaagctagaagacctaaagaatctgctatttta
gctgaaataagtggtgttatatcttttggtaaagaaactaaaggtaaacgtagattatta
attactccaaataataatgatgaacatgtatatgaagagatgattcctaaatggcgtcaa
ttaaatgttttagaaggtgaaaatgttaataagggggatattatttcagatggttctgaa
gcatctcaagatatattaagattgagaggggttaatgcagttacagattatatagtaaat
gaagttcaagatgtttatcgtttacaaggggttaaaataaatgataaacatatagaaata
attgttcgtcagatgttacgtaaagctactatattgaatccaggtgattcaaaattttta
agtggtgaacaattagaatattcgcttattaagattgaaaatcttaaattaaaatctaaa
ggtaaaaagcttatagtttttatgagagatttattgggtattactaaggcttctttatca
actgaatcttttatttctgcagcttctttccaagaaactactagagttttgacagaatca
gcagtagctggtaaatatgataaattacgtggattaaaagaaaatgttattgttggtcgt
ttaattccagcaggtagtggttattcgtatcatgttgatcgtatacgtaaacgtactaaa
ttacttaaatttaataatatacaacagaatataactgttgaagaggcatcagctaattta
acagaattattgaatgcagatatttaa

DBGET integrated database retrieval system