Paludibacter propionicigenes: Palpr_0439
Help
Entry
Palpr_0439 CDS
T01362
Name
(GenBank) RagB/SusD domain protein
KO
K21572
starch-binding outer membrane protein, SusD/RagB family
Organism
ppn
Paludibacter propionicigenes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ppn02000
]
Palpr_0439
Transporters [BR:
ppn02000
]
Other transporters
Accessory factors involved in transport [TC:
8
]
Palpr_0439
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SusD_RagB
SusD-like_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ78599
UniProt:
E4T1K5
LinkDB
All DBs
Position
536290..538101
Genome browser
AA seq
603 aa
AA seq
DB search
MNRNIFVILILAVLFVSCSDVLDPSLENNQGKNTTYVNPNFGYSLIVNGYDRVPLNNWSF
NDVATDDAVTNDPSNNYLKMATGQLTSSNNAVDMWTNCNTGIQYMNIFISEVNKMKFTED
AQGDMMYKDRMRGEAYGLRALLMYHLLRAHAGWVNGKLLGFPIFLTEQASGSNFNLPRAD
FNTCMTQIYQDLDSAKSLLPTTYTDITSTGIPAKYVSAGITDYTKYNRVFGVKFLGLMSG
LISQAVRAQAALLAASPAFNDGSANGSNGTWETAAVAAAQIINLKGGIAGFPAYPAAWFT
NGTSWYNNSAEISSLNNGTNPPEMLWREGIQGANNTLETNNFPPSLNGNGRINPTENLVE
AFPDKNGYPITNTASVYSSANPYANRDPRLLNYIVVHGSKAGVPNVPINIASGNDAVNNI
ATSTRTGYYMRKLLRQDVNKAPNINSTQIHYVPKIRYTEIYLIYAEAANEAWGPLADPKG
YGYSAYDVIKAIRKRALGIATDPYLESIKSDPAAMRQLIHNERRLELCFEGFRFWDLRRW
KVTLPELSAPALGITVTGTTSAYTISTPATVETRQYNDKKYYYGPVPYGETVKWSNLLQN
DGW
NT seq
1812 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagaaatatatttgtaatcttaattcttgctgtgttatttgtcagctgttcggat
gtattagatccatccttagaaaataatcaaggtaagaatacgacttatgttaatccaaat
tttggatatagtctaattgtaaatggatatgatagagtacctctgaataactggtccttt
aacgatgttgcaacggatgatgctgtgactaatgatccttcaaataattatttgaaaatg
gcaacaggtcaattgacttcgagtaataatgctgtagatatgtggactaattgtaataca
ggtattcaatatatgaatatctttatttctgaagtaaacaaaatgaagtttacagaagat
gctcagggtgatatgatgtataaagatcgtatgagaggcgaagcttatggcttacgtgca
ctcttaatgtatcatttgctacgtgctcatgcgggttgggtaaatggcaaattgctcggt
ttcccgatttttttgactgaacaggcttcaggttctaattttaatctgccacgtgctgat
ttcaatacctgtatgacgcaaatttatcaggatttagatagtgcaaaatctcttttaccc
acaacttatactgatattaccagtacaggtattcctgctaaatatgtaagtgcaggtata
actgattatacaaagtacaatcgtgtatttggtgtaaagtttttaggtcttatgagcggt
ctgatttcgcaagcagttcgtgcgcaggcggcattattagctgcaagtcctgcgtttaat
gatggatctgctaacggttctaatggaacttgggaaactgctgctgtagcggcggctcag
atcattaatttgaagggcggaattgctggatttccagcatatccagctgcatggtttact
aatggaacgtcctggtataataatagtgctgaaatttcttcattaaataatggaactaat
cctccggaaatgttgtggagagagggaattcaaggtgctaacaatacgttggaaaccaac
aattttccaccatctttaaatggaaatggacgtattaatcctacagaaaacttagtcgaa
gcatttccagataaaaatggttatcctattactaatacagcttctgtatactcgagcgcg
aatccatatgcaaatagagatcctcgtttgttaaattacatcgtagttcatggaagtaaa
gctggcgttcctaacgtaccaattaatattgcgtcaggtaatgatgctgtgaataatatt
gcgacttcaactcgtactggatattacatgcgtaagttgcttaggcaagatgtaaataaa
gcgccaaatattaatagtacgcaaatacattatgtcccaaaaattcgttatacagaaatt
tatcttatttatgctgaagctgctaatgaagcctggggaccattggctgatcccaaaggg
tatggttattctgcttacgatgttattaaagctattagaaaaagagctttaggtatagct
acagacccatacttagaatctattaaaagtgatccggctgctatgagacaattaattcat
aatgaacgtcgtttagaactatgttttgagggttttcgattctgggatttacgtcgttgg
aaagtaactcttccagaattaagtgctccagctcttggtattactgttacgggtactact
tcagcttatacaattagtactcctgcaactgttgaaactagacaatataatgataaaaaa
tattattatggtcctgttccttacggagaaacagtaaaatggagcaatttacttcagaat
gatggctggtaa
DBGET
integrated database retrieval system