Paenibacillus psychroresistens: EHS13_05995
Help
Entry
EHS13_05995 CDS
T06328
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ppsc
Paenibacillus psychroresistens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
Big_2
Laminin_G_1
NUMOD1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ94487
UniProt:
A0A6B8REX4
LinkDB
All DBs
Position
1339860..1345775
Genome browser
AA seq
1971 aa
AA seq
DB search
MKKKLSRLITCMLLLSILFPLITLEAALSSPNPESIALLNNYSSGASDVNIGQGYQRVLS
NYPQLALNINLNAGTGNKISKIEFLKYGVPINIGVVANNTQTQTISKVVSGEAKNVVSGF
GTNLNTTAKGYYSWYRYSSGPFWFADIPPTGQNSSNPSNCGPSVTCFGDPGEYDEFNGTY
FWKFPNVSSNLLTMSGTRSLDYVLEDSISSSNPTDIPIDFVSNSPAYFSGNSVADTTVTN
ILGGFGEFGNAGSVSGTPITTMTNNNHYTVKFSKSFTEAAFYKDTFTAPGAAWMDWFFAF
KTTLKSKTFVYPDQIRVTYAQVGVATLVVTPDTATVLVGSTNNYIATYTDTGGISSTVTN
SSTWSNNNNTIATINSTGLATGKVDGTVTIMADYNGLTATAELIVTSGATPTPTPTPTPI
PELNRPPYIRIAWYKHGEATESSTVNLNTNVDLRVVGDSISIPASPSDPDGDPVIISAWD
FNSSTVWVNSLPGTYNLNTGISTIQFMDMVANIPGDHTVFLTVHDPKGATYTASANLHVI
DPKPIACIDAPLNVKAGRPIPYAITSCSYSPVNAAITTETWTNKLTQYNTAGTEVVKLKV
QDSAGRWSGEVTKNINVIPDQPPIAVLNFPAQTTRGSTISIDGSLSSSPDGDTITQYYFE
YQYDAANDGYANDSWQLLYSGVNKNVNFAPIKIGKYNFRLTVTENFGQKGSTTKILDTLN
LAPTVNVQTSGQTGPPSTVTPISMSTVFNSWPVTNTIGGTAGNKANWYMNSGSLTTKIYD
TLYAIRKPDDGMWSRSSYYPFALPQKLVTPTSTTTGSNFDGAIADEKYVYAFKYTGGQIR
AYDKNLNLVWTITAPYTGDLTTYKGKLYFSNSNFISIYDRDTGTLLNSATISNGTSLKIF
DNKVIVTAYSNVYVYDINLNYIGVYPAAVTRSGSTAVHEGENELEGTSVSYYSGYVTKVR
VADQTVVWRTPLDIPSTSGDVTRNETTGNYVVTYGSQPDVASRPTKYNIAEFSQTGVLIS
NSLIALQGGLTTPIFYPYASLSTYAYIMTSKKGITYLFSVVGTGPTIYAYDSSGSLISNT
VLDMSGTYVYSDAFFGSDGTYIVRINHKQSQISGADYTYFYAFDPSGSNYYKFYAGGDPF
VLPFADQKLLVVTGATSYSLYDSSSSALLYPNSLNLGEPFSNIWTGPTYLSNQIMKLNIN
ASKSSIEGVGLAFRVQDSQNYLSAEFENGLFRFKKTVNGTSTVLNEVSYLLSLGNNYRIK
VVPNGSSFDLYVNDIPVMTVSDTSWSTGKMAIINRGYQGIGFNGMSYETGLGASGSFGGV
ALINSPITNTVTFTDPENDPRLTQSESWTYTHNPNIFLNPLGTWGSSGSSFSTAVTSFPL
PGEYTFVFKSRDDPNSAYKYPSMIFDPYRHWSNTLTGKIRAHRKPISDFSVSFNANSTIN
WIDTSYDPDRFNPSNNSYSTEATGINYQATRGVLDRQYYYISPSGVTTNVKLTKPAEYGI
YTVGMAVKDEYNAWSDWTERTIFIANPVPNNLPVANIIDPSSSSSSSPTIYATLKPLYKW
TYSDADGDPQQRYIFNVYESANNIVYTSSEVLSSALQWQQPVNLAENVVYSVQVQAHDGT
DYSLLSAKKFFKIVINTPPTAVIYDPASTDSSNPTVYSLLRPIYKWTYTDADGDSQQRFT
LNVYNSSNAIVYTSGEVLSSAFSWQQPTDLSANVVYSVQVQVHDGKVYSGLSAKKYFKIN
RPPIGNISFTIPIYQNDTPQFSITQSDPDGDALTIKVDSSFNGGGYSNVKQWTSVASGTS
KSFTLGPLAQGVYSLRLTLDDGGGGIYTQTYTFTALPLFLSGAIKHTAIWESNRLQWNVK
FPAKIRATDVFWAGEALELFATATDTGTSLTKPLNVSAKLVQTGDSVSLTSSDQIHYVGE
MVNTDFIHSLEDGLYTMQFQIQWSNGMIQKTDVPFYIRGNILDVIVVQLRN
NT seq
5916 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaaattatcacgtttaattacttgtatgcttttattgtcgatattgtttcct
ttaattactctagaagctgctttatcgagtcctaatccagaaagcattgcattattaaac
aattattcaagtggagcttccgatgtgaatataggacaaggttatcaaagagttttaagt
aattatcctcaattagcattaaatattaacttgaatgctggtactggcaataaaatatct
aaaattgaatttttaaaatatggtgttcctatcaatataggcgttgtcgcaaataatact
caaacgcaaactatttcaaaggtagtttctggagaagctaaaaatgttgtttcaggattt
ggtacgaatctaaatacaacagcaaaaggttattattcttggtatcgatattctagtggt
cctttttggtttgcagacatccctccaacaggacaaaatagctctaatccttctaattgt
gggccttctgtaacttgttttggagatcctggggaatatgatgagtttaacggtacatat
ttttggaaatttccaaatgtctcatcgaatctgttaactatgtctggaacgagatcatta
gactatgttttagaagattccatttcttcatccaatcctacagatattccaattgacttt
gtttcgaatagcccagcttatttttcagggaactcagttgctgacactacagttactaat
atcttaggtggtttcggtgagtttggaaatgcaggatcggtttcaggaacgcctatcact
acaatgacaaacaataatcattacacagttaaattcagtaaaagctttactgaggctgca
ttttataaagataccttcacagcaccgggagccgcatggatggactggttctttgctttt
aaaaccaccttaaaatcaaaaacatttgtttatcctgatcagatacgtgttacctatgca
caagtcggtgtagctacgctagttgtaacacctgatacagctacagttttagtaggcagt
acaaacaattatatagctacttacaccgataccgggggtatttctagcacggttactaat
agttctacttggtctaataacaacaatacaatagcaacgattaacagtacaggacttgca
accggtaaggtagatggtacagttactataatggctgactataacggtttaactgcaaca
gcagaactaattgttacatctggtgcaacgccaacccccactccaactccaacgccaatt
cccgaacttaacagaccaccctatataagaatagcctggtataaacatggggaggcaaca
gaatcttctactgttaacttaaatacaaacgttgatttaagggttgttggcgattcaatc
tcaattcctgcttctcctagtgatccagacggtgatcctgttattatatctgcttgggat
tttaacagcagtaccgtttgggttaattcactcccaggcacctacaacttaaatacagga
ataagtacaattcaatttatggatatggtagcaaatataccgggagatcatactgttttt
ctgaccgttcatgatcccaaaggggccacatatacggcatcggcaaatttacatgtcatc
gatcccaaacctattgcctgtattgatgcccctttgaacgtgaaagcagggaggccaata
ccctatgcgattacctcatgttcttacagtccagttaatgcggctataacaacagaaacg
tggacaaataaattaacacaatacaatacagcaggaaccgaagttgttaagttaaaagtt
caagatagtgccggtcgttggtcaggtgaagtaactaaaaatatcaatgtcatcccagat
caaccacctattgcagttcttaattttcccgctcaaacaacaagaggttcaactatatcc
atagatggaagtttatctagtagccctgatggagatacgattacacaatattactttgaa
tatcaatatgatgcagctaatgatggttatgctaacgattcttggcagctgctctactca
ggagtaaataaaaatgtaaattttgctccaataaagatagggaaatacaattttagatta
acagttaccgaaaattttggtcaaaaaggatctacgacgaaaattctagatacgctaaat
ttagcgcctaccgtgaatgtacaaacgtctggacaaactggccctccaagcacagttaca
ccaatttccatgagtactgtttttaatagttggcccgtaaccaatacaattggcggaaca
gcaggaaataaggctaattggtatatgaacagtggaagtttaactactaagatatacgat
accctctatgctattagaaagcccgatgatggcatgtggtctcgtagcagctattaccca
tttgcgttaccacaaaaactagtcacccctacttcaacgactacgggttctaattttgat
ggagctattgccgatgaaaaatatgtctatgcatttaagtacacaggagggcaaatccgg
gcttatgacaaaaatctaaatttagtatggacaataactgctccctatacaggtgattta
acaacatataaaggtaaattatatttcagtaatagtaattttattagtatttatgacaga
gacacagggaccctattaaactcagcaactatcagtaatggtacatccttgaagatcttt
gataataaagttattgtgactgcttactcaaatgtgtatgtttacgatataaacctaaac
tatattggagtataccctgcagcagttactcgttcaggatcaactgctgtacatgagggg
gaaaatgagctagagggaactagtgtctcttactatagtggttatgtaactaaagtacgt
gttgcagaccaaacagttgtgtggagaactcccttagatattccatcaacctctggagat
gtgactagaaatgagaccactggaaattatgtagtgacgtatgggagtcaaccggatgta
gctagtagacccactaagtacaacattgctgaattttcacagacgggtgtgctaatctct
aatagcctcatagcccttcaaggtggtctgactactcccatattttacccatatgcatca
ttgtcaacatacgcatatataatgacaagtaaaaaagggataacatacctttttagtgtt
gttggaacaggtccaactatttacgcttacgattcctctggatctttaatttcgaatact
gttcttgacatgagtggcacatatgtatactctgatgctttctttgggtcagatggcacc
tacattgtacgaattaaccataagcaatcacaaatatctggtgctgattatacttatttc
tatgcttttgatccttcgggttctaattattacaaattttatgctggaggtgatccattc
gttttaccttttgccgatcagaaattattagtggttacaggcgctactagttattcactc
tatgacagctccagttccgcgctcctgtacccaaattcattaaatttaggggagcctttt
agcaacatctggacaggaccgacgtacctatccaatcaaattatgaagttaaacataaat
gcgagtaaatcatcaatagagggtgtgggcttagcttttagagttcaagactcccaaaac
tacctaagtgcagagtttgagaatggattgttcagatttaaaaagactgttaacggtacg
tctacagtactaaacgaagttagttatctactctcgctaggaaataactacagaataaaa
gtagtacctaatggaagcagctttgatctctatgtcaacgatattcctgtaatgaccgta
tctgatacatcttggagtacaggcaagatggcgattattaatcggggatatcaaggaatt
ggctttaacggtatgagttatgaaacaggattaggagcttcgggaagctttggtggagtt
gcacttattaatagcccgataaccaataccgttacttttactgatcctgaaaatgaccct
agattgacacaaagtgaaagctggacctatacccataatccaaacatctttttaaatcca
ttgggtacatggggaagctcgggcagcagcttttcaaccgcagttacttcattcccttta
cctggagagtacacgtttgtatttaaatcaagagatgatccgaacagtgcgtacaaatac
ccatcaatgatttttgatccctatcgccattggtcgaatacactcacggggaaaatacga
gcacatcgcaagccaatatcagatttttcagttagttttaacgcaaatagcacgataaat
tggatagatacaagctatgatccggatcgatttaacccttccaataatagttattcaaca
gaagctactggaatcaattatcaagcgactcgtggtgtcttagatcgacaatattattat
atttcgccaagtggagtaactacgaacgtgaaattaacaaaacctgccgaatatggcata
tatactgtcggtatggcagttaaagatgaatacaatgcatggagtgattggaccgaaaga
acgatttttattgcaaaccctgtaccgaataatttaccagtagcaaatataatagatccg
tcatcgagcagttctagtagtccgaccatttatgctacactcaaaccgctttacaaatgg
acgtactcagatgcagatggagatccacaacaaaggtatattttcaacgtttacgaaagt
gctaataatatcgtgtatacttcaagcgaagtattatcgtctgctttacaatggcaacaa
cccgtgaatttagcggagaatgtcgtgtattccgttcaagtacaagctcatgatggaaca
gattacagcttattatcagcaaagaaattttttaaaatcgtcatcaatacaccgccaaca
gctgttatatatgatccagcatcaactgattccagtaatccaaccgtttatagtttactt
agaccaatctacaagtggacttatacggatgcagatggcgattcccaacagcgcttcact
ttgaatgtttataatagtagtaacgcaatagtttatacctcgggagaggtgttatcatca
gcattctcttggcaacaacctacagacttatcagctaatgttgtatattccgttcaggtg
caggttcatgatggaaaagtatacagtgggttatcagctaagaaatattttaaaattaat
cgaccgccaattggaaatataagctttacgatacctatctatcaaaatgacacaccacaa
ttttcaattactcaatcagatccggatggggatgccttaaccataaaagtagacagcagc
tttaacgggggcggatattcgaatgttaaacagtggacatcagtagcatcaggcacttca
aaatcttttactctggggccactagctcaaggcgtttattctcttagactaactctagat
gatggaggaggcgggatatacactcaaacctatacatttacagctttaccactcttctta
agcggagccataaagcatactgcgatttgggaaagtaatagattacaatggaatgttaaa
ttcccagcgaagatccgcgcaacagatgtattttgggcaggggaagcattggaattattt
gcaacagctacggatacaggaacaagcttaaccaaacccttaaatgtatctgctaaatta
gttcagacaggggattccgtcagcctgaccagttcagatcaaattcattatgtaggtgag
atggtgaatacagattttattcattcgctcgaagatggattatatacaatgcagtttcag
attcagtggtccaatggtatgatacagaaaacagatgtgccattctatatcagaggtaat
attcttgatgtaattgtggttcagctgcgtaactga
DBGET
integrated database retrieval system