Plasmodium reichenowi: PRSY57_1243600
Help
Entry
PRSY57_1243600 CDS
T08079
Name
(RefSeq) transcription factor Tfb2, putative
KO
K03144
transcription initiation factor TFIIH subunit 4
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03022
Basal transcription factors
prei03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03022 Basal transcription factors
PRSY57_1243600
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PRSY57_1243600
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
prei03021
]
PRSY57_1243600
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
prei03400
]
PRSY57_1243600
Transcription machinery [BR:
prei03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Basal transcription factors
TFIIH
PRSY57_1243600
DNA repair and recombination proteins [BR:
prei03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TFIIH complex
PRSY57_1243600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tfb2
Tfb2_C
Helicase_C_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24532488
NCBI-ProteinID:
XP_012764303
UniProt:
A0A151L9E0
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(1665481..1668240)
Genome browser
AA seq
919 aa
AA seq
DB search
MVKIRKNVENMELYDYMKELNENVWCYFFDDSLAHETIYHSLNELEQIIISRLLFIQQVV
SERAMRLWINPNYLKKLSESIKNLVEAKILVESDMKKDNYNQYKINESFRITLLNKIYKT
NTNNIFIFNNNIKEQLEREKNLYEQNLFPHKEEIFGYAQTKWNNLLHFIASPNFNSVNNY
FNSNINNDDANKYTSYDMARRKRVGKDGGPDMGRKSLDKMASRRSYNRRRKKKKYSDDED
EFDEEEYEGEDDDNFVDGDDSNDNSNDDSGDDDDDDYDDYTNDDNNIYFNDKANSHLLVK
HQYDNHQLNNSTAYVENPSDDYTYKKEDDNKIEQRKSVHFNSDIYEKAYNNLYTQQGDSN
NINEMEYYMADTKTNNNKKKKKKNKHIYAYKQNELYYKSLLNMEHSYIEEENYNNNESTF
FLSNINERFMTKPSESVIEVLRRKNFLLDDPNNTKTINMSREAFSWFLKDLRSRIISLVL
EYLIIIDNGYVTNIAKDVYTKYQKKKNNAINNINNNSSSGINNNINFDENIKSNHCEESK
KSYDNNNNNNNNNNNNNNSSSSSSCAYITRTNKDPKKSEIYVKETLLLILSLSQCDISHP
IFLENLTKAQKEFIDFGSHIGLFLKPNDSYIFITPYALLLTINNFNSQYYLSLLSNITIE
GLCEEDVRKRLSKRYFHFYLLKQDEKEEKYMNKDLSLDIKNKDEKSLILDKRKNITKKLI
NDSLYSDIKMNGSNNLEIGLIVQSNFKVYLYTSSLLKINILSHLCELQARTPNMVVGILT
RRSVLNAYNSDITANQIIKFLESYSHPGKNNFKSSIPMNVITQLKLWESERHRLTLEDAI
VFKSFEKDFMPHLYQQIVIWANSKNYLLHYTPWPKNNTKEFDLWIKAEKYLCCIYESKNE
IIDKIKEIREKLMKKRQNG
NT seq
2760 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaaaataagaaaaaatgttgaaaatatggaattatacgattacatgaaggagctt
aatgaaaatgtgtggtgttatttttttgatgattctttagcacatgaaacaatatatcat
tcccttaacgaattagaacaaataattatttcaagattattatttattcaacaagtagtt
tcagaaagagctatgagattatggataaatccaaattatttaaaaaagttaagtgaaagt
ataaaaaatttagtagaagcaaaaatattagttgaaagtgatatgaaaaaagataattat
aatcaatataaaattaatgaaagttttagaataaccttattaaataaaatttataaaaca
aataccaataatatttttatttttaataataatattaaagaacaattagaaagagaaaaa
aatttatacgaacaaaatttatttcctcataaagaagaaatatttggttatgctcaaaca
aagtggaataatttattacattttatagcatctccaaattttaattctgttaataattat
tttaattcaaatattaataatgacgatgcaaataaatacacctcttatgatatggcaagg
cgtaaaagagtaggtaaagatgggggtccagatatgggaaggaagtcgttggacaaaatg
gcaagtcgtcgatcttataataggagacgaaaaaagaaaaaatatagtgatgacgaagat
gaatttgatgaggaagaatatgaaggtgaagatgatgataattttgttgatggtgatgat
agtaatgataatagtaatgatgatagtggtgatgatgatgatgatgattatgatgattat
actaatgatgataataatatttactttaacgataaagcaaattctcacctacttgtaaaa
catcaatatgataatcatcaacttaataactctactgcgtatgtagaaaatccatcagat
gattatacttacaaaaaagaagatgataacaaaatagaacaaagaaaaagtgtacatttt
aattctgacatttatgaaaaagcatataacaatttatatacacaacagggggatagtaat
aatataaatgaaatggagtattatatggctgatactaaaacaaataataataaaaaaaag
aaaaagaaaaacaaacatatatatgcatataaacaaaatgaactatattataagagccta
ttaaacatggaacatagttatattgaagaagaaaattataataataatgaaagtaccttt
ttcttatcaaacataaatgaaaggtttatgactaaacctagcgaaagtgttattgaagtg
ttaaggagaaaaaatttccttttagatgatcctaataatacaaaaactataaatatgagt
agagaagctttttcgtggtttttaaaagatttaagaagtagaataatatccttagtgctt
gaatatttaataataatagataatggatatgtaacaaatatagctaaagatgtatatacc
aagtatcagaagaagaaaaataacgctataaataatattaataataatagtagtagtggt
ataaataataatataaattttgatgaaaatattaaaagtaaccattgtgaagaatctaag
aaaagttatgataataacaataataataataataataataataataataataatagtagt
agtagtagtagctgtgcatatataacaagaactaataaagatccaaagaaatcagaaata
tatgtaaaagaaacattattattaattttatcattatcacaatgtgatataagtcatcca
atatttttagaaaatttaacaaaagctcaaaaagaattcatagatttcggtagtcatatc
ggcttattcttaaaacctaatgattcatatatatttataacaccatatgccttactatta
acaattaataattttaattcacaatattatctttctttattaagtaatataactattgaa
gggttatgtgaagaagatgttaggaagagattaagtaagagatattttcatttttattta
ttaaaacaggatgaaaaagaggaaaaatatatgaataaagatttatcattagatataaaa
aataaggatgagaaatcattaatattagataaaagaaaaaatattacgaaaaaattaatt
aatgatagtttatattctgatataaaaatgaatggtagtaataaccttgaaattggatta
attgttcagagtaattttaaagtatatttatatacatcttctttattaaaaattaatata
ttaagtcatttatgtgagttacaagcacgtacaccaaatatggtcgtaggaattttaaca
agaagaagtgtattgaatgcatataattcggatattacagcaaaccaaattattaaattt
ctagaatcttattcacatccaggaaaaaataattttaaaagttctatacctatgaatgtt
attacacagttaaaattgtgggaatcagaaagacatagattaacattggaagatgctata
gtttttaaatcatttgaaaaagattttatgccacacttatatcaacaaattgttatatgg
gctaatagtaaaaattatttgctccactatacaccatggcctaaaaataatacaaaagaa
tttgatctatggataaaagcagaaaaatatctctgctgtatttatgaatcaaaaaatgaa
attatagataaaattaaggaaatacgagaaaaacttatgaaaaaaagacaaaacgggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
