Providencia rettgeri: RB151_034200
Help
Entry
RB151_034200 CDS
T04571
Symbol
elfC_3
Name
(GenBank) putative outer membrane usher protein ElfC precursor
KO
K07347
outer membrane usher protein
Organism
prg
Providencia rettgeri
Pathway
prg02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
RB151_034200 (elfC_3)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
prg02000
]
RB151_034200 (elfC_3)
02044 Secretion system [BR:
prg02044
]
RB151_034200 (elfC_3)
02035 Bacterial motility proteins [BR:
prg02035
]
RB151_034200 (elfC_3)
Transporters [BR:
prg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RB151_034200 (elfC_3)
Secretion system [BR:
prg02044
]
Chaperone-usher system
Type 1 pilus assembly protein
RB151_034200 (elfC_3)
Bacterial motility proteins [BR:
prg02035
]
Pilus system
Fimbrial proteins
RB151_034200 (elfC_3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Usher
PapC_N
PapC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APC13077
UniProt:
A0A1J0EBL0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3654198..3656780)
Genome browser
AA seq
860 aa
AA seq
DB search
MRCIPRKQLLSICCANAITCSHNWVMYFRLKKVCQAVAAIIFTGMNVNYAFADDYFSPSS
LSVVDGQNIADLPNLNQFANPGGQLAGEYHVDVIVNGILMESKVVEFIKDKSSNQLIPLL
TKEELALWGVKVDAIPALKALPEKQEIVPISEYIPDAKSILELNQQKLNISIPQIAMDKQ
ALGTVPTSQWENGVPALVLNYYYSGSNNWSRNKSKDSNSHYFNLRSTGNLGPWRLKNYST
YTDNNGKREWENIETSLERGINYLKSQLTIGDTATPSEIFEGFQFRGVQLRSDESMLPSS
MRGFAPVIRGIAQSNAEVTVKQNNYVIYQSYVSPGAFEIDDLYPTGTSGDLTVLIKEADG
SERSFVVPFSSIAIMQREGQLKYSLTGGKYKSNTSGEVEPNFLQSTFIYGLPKSITGYAG
TLLSKNYQSYAAGMGINLGSFGALSADITQANSQNLLGKDNTDSGQSYRFQYSKNVTSTG
TSVTLANYRYSTEGFYTFSEANSNQPKIYRNNKKNRFQVSLNQSLNEFGNVYFSSYQQDY
WNRSGKERSLNAGYNNNIGGITYNFSYSYTDSAYQRKADNYFSFSMTIPLNDSSGNYTSI
NSSVTADNSGNTDAMMGISGTLGESNNFNYAIQQSYGNKETRASGNASASYRGSYGVANA
AYGYDKYSQRANYGLTGAVVAHPHGITLSQPINDTFAIVRAPGAKNVQVSNRANISTDSR
GYAIIPYLNPYTKNEITLNIDSLPDNVELKTNTVSVVPTKGAAILASYQTHVGYRLLFTV
THNGKPVPFGAMAQFSQSDDQNISTGIVGDNGDVYLSGMPEQGQLQIKWGKSLQEQCIAE
YQLTAEQLKQHLPILPVNCH
NT seq
2583 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgttgtattccaagaaaacaactcttatcaatttgttgtgctaatgctataacctgt
tcgcataattgggtaatgtattttcggttaaagaaagtatgtcaggcagtggctgcaatt
attttcactggtatgaatgttaattatgcatttgctgatgactattttagcccaagctca
ttaagtgtggttgatggtcaaaatattgcagatttaccgaatttaaatcaatttgctaat
ccgggtggccagcttgcaggggaataccatgttgatgtaattgtaaatggtattttaatg
gaatcgaaggtcgttgagttcattaaggataagtcgtcaaatcagctaattcccctatta
acgaaagaagaattagcactttggggtgttaaagttgatgcgattcctgcgttaaaagct
cttcctgagaaacaagaaattgttcctatcagcgaatatatacctgatgcaaaatctata
ttggaattgaatcaacaaaagttaaatatttcgatccctcaaattgcgatggacaagcaa
gcattaggtactgtgccaacaagtcagtgggaaaacggtgttcccgctttggtcttaaat
tattattatagtggttcaaataattggagccgcaataagtctaaagactccaattctcat
tactttaatttgcgaagtactggaaacctaggtccgtggcgtttaaaaaactactcaacc
tatacagataataatgggaagcgtgagtgggagaacattgaaaccagtttagaaagagga
attaattatttaaaatcacaattaacaataggtgatactgctacaccaagtgaaatattt
gaaggatttcaatttcgaggcgtacagttacgaagtgatgaatctatgctacctagttca
atgaggggatttgcacccgttattcgtggtatagcacaaagtaatgcagaagttacagtt
aaacaaaataactatgttatttaccaatcttatgtttcgcccggagcatttgaaattgat
gatttatacccaacaggaaccagcggtgatttgactgttttgattaaagaagcagatggt
tctgaacgttcatttgtagttcctttttcatcaattgccataatgcaacgtgaaggacag
ctcaaatattcactaactggagggaaatataagtctaatacttcaggtgaggttgagcca
aactttttgcaaagtacatttatttatggattacccaaaagtattacggggtatgcaggg
actttattatccaaaaactaccagtcttatgcggcaggaatggggattaacttaggaagt
tttggggcattatcggcagatataacacaagctaatagccaaaacttattagggaaagac
aatactgatagcgggcagtcatatcgttttcaatattctaaaaatgtcacgtctacaggt
acttcagtaacgttagcaaactatcgttattcaactgaagggttttatacatttagtgaa
gcaaatagcaatcagcctaaaatctatcgtaataataaaaaaaatcgttttcaggtttcg
cttaaccaatcactaaatgaattcggtaatgtctatttttcgagttatcagcaagattat
tggaaccgttcaggtaaagaacgctcattgaatgcaggttataataataatattggcggg
atcacttacaattttagctacagttatactgatagtgcttatcaacgtaaagcggataac
tatttttctttttcaatgactattcctttgaatgattcatcaggcaactacacatcgata
aacagcagcgttacagctgataacagtggtaatacggatgcaatgatggggataagtggt
actttaggtgagagtaataattttaattatgctattcaacaatcctatgggaataaagaa
acacgtgcgagcggaaatgcatcagcatcttatcggggaagctatggggttgcaaatgcg
gcttatggatatgataaatattcacaacgagcgaactatggtctaacgggggccgttgtc
gctcatccacatggaatcacattgtctcagccaatcaatgatacttttgctattgtccgt
gctcctggggcgaaaaatgtacaagtttcaaaccgagcaaatatttcaacggactctcgt
ggttatgcaattattccttatttaaacccttatacgaaaaatgaaattacgctcaacata
gattcattaccagataatgttgaattaaaaacgaataccgtgagtgtcgtaccaacgaaa
ggtgcagcgattctggcaagttatcaaacgcatgtgggttacagactattatttactgta
acgcataatggcaaacctgtgccttttggtgcaatggcacaattctctcaaagtgatgat
caaaatataagtacaggtattgtgggcgataatggtgatgtttatctcagtggaatgccg
gaacaagggcaattacagataaaatggggtaaaagtttacaagaacaatgcattgcagaa
taccaattaaccgcggaacaattaaaacagcatttacctatattgcctgttaattgccac
tga
DBGET
integrated database retrieval system
