Pedobacter roseus: H9L23_23990
Help
Entry
H9L23_23990 CDS
T06980
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
proe
Pedobacter roseus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Ig_7
Y_Y_Y
PKD_6
B3R
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNN42116
UniProt:
A0A7G9QFJ1
LinkDB
All DBs
Position
complement(5797259..5800792)
Genome browser
AA seq
1177 aa
AA seq
DB search
MRLSKLLALFVGLFFFNNIYAQTYVVTSNADSGPGTLREGLMQAAAANRTTTFTINFNLP
GTPSDNANRTIRLRSALPVVSSNVIIDGSSQTAWPALGVSGAKVILEPEYPNSTFSGLTI
GQSLDTQIQTTGVEVYGLYIRNFATITNLQNVNTAQGSGIVIDYRANNITIGAPGKGNVI
GGNINGIAIRNNYIYSNITATKIKIQSNLIGVIYDGITPNTNVFGISANLYDSALDIGGD
NGGEGNVIAANRINLDITRSSYSTTARFDINIINNKIGVDYTGKKDFHELPIFLSSSSLE
IAGLKVNAINTALYVRNNIIGGNRTTGVSITNSDFILTGNAIGTDAAGAVVMGNGIGVKI
EAGAGGTIGGATPAEVNLIANNSFGVETVSSKPVKITRNSFFCNRTFGIGKTLTILQPYI
QVLKKRNDYVSGRATPNSEVELFYTVNCQGICEGKIYIATVQTGSDGRWEYNGTLTGMVT
ATASLLNATTSPFSTAELLPNEAIVEPVTCNANGSITIPEPREGFTFSWVKIETDGSRVP
KGNTQSITNLEVGTYEVTVDDGCKAFPSVFIIKDQKLTKPNIQPISPACGQTSFTYTAEV
LRGKGVLKYKWTNTATNVVVSTANPANLPEGTYFVTVSDEANCSLDSDPITVKRKPKIII
TSTTAPKHATCGSQNGAIKDLKFTDFTGTMTYKWYKPDLLTGALGDVIATTADLQNVEGG
NYTIVVTDQGECGSTSASYFIITDNTIQISDASIRKNETCNSSNGTIGGITLTDADGYEW
IGPDGITIKKGTYSVGTSLLIENLKAGSYRLWASNSKSTCPRVPRDFVVTATPLPVYNFS
HRESPTTCGLINGTIDLDFSSALPYRYEWKDQAGNIVLSTKTTTSISLKNLPGGTYTMYA
YDINNCSPVIMGPYTIEVTPLLTIVPKTGTTVKDGCTLQRGAVTGVEVIGGVPGYTFKWL
NETGEAVQFTQDLTKIGAGIYRLEVKDKTACGYAISEPFTIVDEPFKILAPIINDLRVCY
VSDIVLPVIAPEEGTYQLFEKLDDTKPFLESTTGIFKFKVAKTADYYIRRKLGSCTSEFT
KVHVEVTHDNLEITNTMTPNGDGMNDVWQVRGLPDFKGTNIKIYTRGGQLVYESIGNYNK
PFDGRFRDKELPAGVYYYVIDLRAECKPLGGSITLLR
NT seq
3534 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtctctcaaaactgctggccctgtttgtgggcttatttttctttaataatatttac
gctcaaacttatgtggttaccagtaatgccgatagcggccctggaacattaagggaaggc
ttaatgcaagctgctgcagccaacagaacaactacttttaccatcaattttaatttaccg
ggcacccctagcgataatgccaaccgcaccatcaggttgcgttctgccctacctgtggtc
tcatccaatgtaataatcgacggaagctcacaaacggcatggccagcacttggcgtttcg
ggagcaaaagtaattttagaacccgaatatcccaacagcaccttttcagggttaacaatc
gggcagtctttggatactcaaattcaaaccactggtgtggaagtatatggtttgtacatc
agaaatttcgctaccatcaccaatttacaaaatgttaacacagcccagggatcgggtatt
gtgatcgactaccgtgcaaataacatcaccattggcgcccccggaaaaggaaatgtaatt
ggtggaaatattaacggtattgccattcggaataactacatctatagtaacatcaccgcc
actaaaattaagatccaatcgaatttaatcggggtaatatacgatgggattacccccaac
accaatgtttttggtatatctgccaatttatacgacagtgctttggatattggtggtgac
aatggtggcgaaggcaacgtaattgccgcaaaccggatcaatttagacattacccgctca
tcttactccaccactgcaagatttgacatcaatatcatcaataacaaaatcggtgtcgac
tacacaggcaagaaagattttcatgagttacctatttttctttcgtcctcctctttagaa
attgcaggtttaaaggttaatgccatcaatacagcactttatgtgcgcaacaatattatt
ggtggaaatagaaccactggtgtttcgattaccaattcagattttattctaacgggcaac
gcaatcggaacagatgccgccggagctgtggtgatgggcaatggcatcggcgttaaaata
gaagcaggcgcaggtggaacaatcggtggggcaactccggcagaagttaacttaattgcc
aataacagcttcggggttgaaaccgtatcttctaaacctgtaaaaattacaaggaacagt
ttcttttgtaacaggacatttggaattggaaaaacattaactattcttcaaccctatatc
caggtcctcaaaaaaaggaatgactacgtttctggcagggctacacctaactcagaagta
gaactgttttataccgtaaactgtcagggtatctgcgagggtaaaatctatattgccact
gtacaaactggtagtgatggccgctgggagtacaatggaacccttaccggaatggttacc
gcaactgccagtttgttaaatgcaactacctcaccattttctaccgccgagcttttgcct
aatgaagcgatagttgaacccgtaacctgcaatgcaaatggatcaatcaccataccagag
ccccgcgaaggttttacttttagctgggtaaaaatagaaactgatggcagccgggtacct
aaaggaaatacacaaagtatcactaatttagaggttggcacttatgaagtaactgttgat
gatggctgtaaagcttttccttcagtattcatcattaaagatcaaaaattaaccaaaccc
aatatccaaccgatttctcctgcctgcggacaaacttcttttacttatacggctgaggtt
ttaaggggaaaaggagtattaaaatacaagtggaccaatacggcaacaaatgttgtagta
agtactgctaaccctgccaacttacctgaaggtacttattttgtaactgtatcggatgaa
gcaaactgctcactcgattcagatccgattacggttaaaagaaaaccaaaaattatcatc
accagtaccacagcaccaaaacacgcaacttgtggcagccaaaatggagcaatcaaggat
ttaaaatttaccgatttcaccggaacaatgacttataaatggtataaaccagatcttctt
accggcgctctaggtgatgtaattgcaaccaccgccgacctccaaaatgttgaaggtggt
aattataccattgtggtaaccgatcagggagagtgcggatctacttctgcttcttatttt
attattaccgataataccatccagatcagcgatgcttcgatcagaaaaaatgaaacctgt
aacagcagcaatggcaccataggtgggattactttaacagatgcagatggttacgagtgg
atagggccagatgggattaccattaaaaaaggtacttattctgtaggaacatctttatta
atcgaaaacctaaaagctggttcttacaggctttgggcaagcaacagcaagtctacctgt
ccaagggttccaagagattttgtggtaactgcaacaccacttccggtttacaacttttcg
caccgcgaatcgccaacaacctgtggtttaattaatggaaccattgatcttgattttagc
tcggcccttccataccgatatgagtggaaagatcaggcaggcaacattgttttaagtacc
aaaaccactacttccatttctcttaaaaatttacctggtggtacttataccatgtatgct
tacgatattaataactgtagcccggttattatgggcccttataccatagaggtaactcca
ctgcttactattgtgcctaaaaccggaacaacggtaaaagatgggtgtaccctgcaaagg
ggggcggttactggcgttgaggtaatcggcggtgtacctggttatacttttaaatggtta
aacgagactggcgaagccgttcagtttacccaggatttaaccaaaattggtgcgggaata
taccgtttagaagttaaagacaaaacagcctgcggttacgccatcagtgagccgtttacc
atcgttgatgagccatttaaaatcctcgctccgattatcaatgatctccgcgtttgttat
gtttctgatattgtattgcccgtaattgctccggaagaaggcacctatcagttattcgaa
aaacttgatgataccaagccatttttagaaagcactacaggcattttcaaatttaaagtg
gctaaaactgctgattattatatacgtagaaaactgggatcctgtaccagcgaatttacc
aaagtacatgtagaagtaacccacgataacctggaaatcaccaatactatgacgccaaac
ggcgatggtatgaatgatgtttggcaggtaagaggattacccgattttaaaggcaccaac
attaagatttatacccgtggtggtcagctggtgtacgaatctatcggcaattacaacaaa
ccctttgatggccgtttcagggataaagaattacctgcaggggtttattattatgtgatt
gatctccgggccgaatgcaaaccattgggcggcagtattacactgttacgttaa
DBGET
integrated database retrieval system