Peredibacter starrii: SOO65_20375
Help
Entry
SOO65_20375 CDS
T09598
Name
(GenBank) putative Ig domain-containing protein
Organism
psti
Peredibacter starrii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
He_PIG
FGE-sulfatase
fn3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPU65056
LinkDB
All DBs
Position
4074761..4084207
Genome browser
AA seq
3148 aa
AA seq
DB search
MKILILLTFLFSLAGCMPNPVGGSGSEGNFDSEFQPYNSSPRNFSITALTPGDASATVSW
SSSQNADSYEIHYRSASVLTFTTIDNVTSPYTITGLTNSQTYLVIVTAKNERGSTNSQSL
TVTPTDNIVVVPGSPVVSYATSAGKTMDFGNTMTVVPSLLNNNGASITNCTSTPALPAWA
TLNPNTCVISGTPTAPMAATYSIRATNAAGTSSPTSITLTVSALVPAISYLGALNTSGAI
DVPMVVNPTLLNSNGSAITSCTSFPALPTWASLHPSTCVISGTPDAPLTLTSYLITATNS
IGPSIGATVSLEVSAGIPVLSYAAALGTMNFVDSPMTVTPTLLKLNGSAITNCVSSPTLP
TWATLDPNTCVITGTPDSTLSPTTYSIVATNSIGDSVGANVTLTAIAFNCPVGYAEVPAD
AALGVNRFCVMMFEARNNSGAVSEAAGTPWTNISLANAKTACTALGSDDDLISNPEWMAI
ARNAETVAGNWSTGSVGTGLMPRGHSDNNPSSVLTLSNTGDDYSDTLDTSGSAWEQKRKI
TLSNGAVIWDLSGNVSEWVDWRTTSGLQTGPTNCSASTQELASVSCAGLASNDYLPSNGS
LNSSNGIGRFIGGTSGAPVRGGSWNDSDISGLYSINLGLASIAHSNVGFRCVNRPKAADA
PGLSFAGATGTTVLVGEMMSILPTTLDANGAAITNCTTTPTLPSWASINPSNCEITGTPT
GVMAPTSFDVVATNSVGDSNIATITLTVNGAVPVLSYVGSLGGNGAVGIPMTVSPTVLSG
NTLAITNCTSSPALPAWATLNPTTCTISGTPDSFLLSTVYDISAHNSAGASVPASITLSV
AAAAPVLSYSGATGVIGSVGVAMSISPTTLVDNGAAITNCTASPALPVWASINTSTCVIS
GTPTGILPATTYTITATNSVGSSSSNVTFRSNPSAPALSFVGSTGTTINYGSPLSVSPSL
LNANGAAITSCSISPALPAWATINSSTCIISGTPTQALAATTYTVRATNSAGQSAPASVI
LTVNALVPTISYAGATGTTRSINSPMSVAPTTLQSNGATITNCSASPALPAWATLNPITC
VISGTPNVMMATTTFTITAGNSAGTSDATVDLTVIAAVPTISYAGATGTIGSIGTAMSVS
PTTLNNNGAAITNCSITPALPGWATIDPTTCVIAGTPNASLTSTTYSIIATNSTGNSTGA
TVTLRANAAVPTLSYVGSTGTTINYNTLANIAPTTLNTNGAAISSCTSTPSLPAWAILNP
TTCAITGIATSVLPATTYTIVARNSVGYSAGATLTLQVNATPPTLSFVGSLGTSGAVGVA
MSVFPTSLITNGAAVTNCTSTPTLPTWATLNPITCRITGTPDAVLPATIFNIVATNSAGD
SASAAVTLTVDASAPSLSYSGATGTNGIFGALMTVAPTLISDNGSTITACTSTPALPAWA
TLDPVTCVITGTPNAFQAATSYSIQATNSVGNSATATVTLSVNAAPPTVSYAGATGTTVN
FGTAMSVSPTTLITNGAGITNCSTTPALPTWASINPTTCVISGTPNATLTGVTYAVTATN
SAGSSTAANVTLTVNAIAPNLSFAGATGTIGYVTLPMTVNPTTLNPNGSPITNCSVSPAL
PAWATLNTTNCVISGTPDATMSAVTYTLTATNAIGSSAGANVTLSVETVSVPELSFAGST
GTTGMVGSPMTVAPTNLDDNGSPVTSCSISPALSGGLVINNSTCIISGTPTALLAATTYT
VTVTTAIGNASDTVTLTVNAGIPTLSYSGATGTTVNINTAMTVAPTLLSNNQSAITACAA
TPALPAWATLNPTTCVISGTANTVLPATTYSIIATNAIGNSIAASVSLTVNALVPTISYA
GATGTSGSVGTAMNVVPTTLLSNGSAISNCTTSPALPAWATLNTSTCVISGTPTAPIGST
TYNITATNAIGNSTAASVSLSATSAPPLISYSGATGTTVNFGSAMTVTPTTLQNNGSTIT
SCNSAPALPAGLIIDPSTCVISGTATVAVSGANYSITAANSAGSSVGATVTLTVNPLAPT
LSYATSAGKITNIHSVMTVTPSTLSTNGASITGCTVTPALPSWATLNTTTCVISGTPDAI
LSATTYSVTAVNSVGPSASASVTLQVNATAPSISYLASVVKFGDVVSIVPTLDNNGSAIT
NCTGAGLPAWATINTSTCEITGTPNAVAPLTVYGITVTNGIGSTSTNLSLTVTENVPTLA
YAAGIKTGVYGQAITDIIPSTLLANGATVTSCTSDTALPTGLTINPTTCVISGTPTEVAD
NKIYKIVAHNSGGDSPEVSITIDINPGLPTLVYPSTMGKLNEAITITPTTFLSNGDTISC
LAPGLPAWATIDSNTCVITGTPTAIMPLSDFTVTASNAAGSNNITLQFGVGAGKPVIGYV
DLSGAVGVPYLLTPTTLNDNGGPITACLVSPSLPAWATINQNTCEISGIPNAVIGLPGAT
YSVVARNSGGDSEPVNITLFIDASAPQLAYASNVNGLFGDTITISPTILEENGAATTCSV
APLPATQLPLWATLDVNTCVITGTPDATFTAQISIIATNTKGSVTANFDLNISPKVPVIS
YSPTTYSINFGESLNITPNSIITNGSNVTACNVSPALPDGLIIDANTCIISGTPIVSQPA
TNHSIIATNAGGDSLAVTISIRIIPQPPSLSYVSPSNGKIGTSMTINPASLVTNGAAITA
CTSNPVLPAGLSIDPTTCVISGIPQVEVNGYYDITAANSGGISSAASLNLIIDPDAPQIS
YLNSPGLPAYLDSPAKISPTIFEDNGDLATCSISPALPIWATLDPNSCIITGSPTAVDIT
GTSYTVTATNNFGSTSTTFELFIQVCPTNYAEVPADLTLGTERFCVMKYEARNDGGKPSA
QPNLSPWVNITVGDAKAACRSLGYDKHYDLISNAEWMAIARNIEARAANWFTGIVGGANN
MLPVGHTSVVEPEDENDPYDPMILNVLSTDPYDQTTAAIVSNMQRGWEQKRTLTINTPGG
TDEIWDLSGNVWEWVDWDRKTGLQKSPMCKFEEEFTDVDPNLCESGPGIATLNNEDFMPL
DPGLTSDHGVGLFMGNTEPGVVSDDAFVVRGGDSAMGFVYIGNNPSAGAIDEPPTAGVYT
IGMEEDALMTEDIIGFRCVFRPVEFVDP
NT seq
9447 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatattaattcttcttacgtttttattttcgttggccggttgtatgccaaatccg
gtcgggggctcaggctccgaggggaactttgactctgaattccagccttataactcttca
ccaagaaattttagtattactgcccttacacccggagacgcgagcgcgactgtttcatgg
tcaagcagtcagaacgccgactcttatgagatccattaccgttcagcatctgttctcaca
tttacaaccattgataatgtaacctctccctacactattacaggcctaacaaatagtcag
acctatctggttattgtgactgcgaagaatgaacgtggttcaactaactcacaaagttta
actgttaccccgacagataatatcgtggttgttccgggctcacctgtcgtgagttatgca
acttcggccggtaagacgatggattttggcaacaccatgaccgtggtgccttcgcttctt
aataacaatggtgcttcaattacaaattgtacaagcactcccgcccttccggcctgggca
actcttaatccgaacacttgtgtgatttctggtacgcctacagctccgatggcggcaact
tatagcattcgtgcgacaaacgcagcaggaacatcatctcctacatcgatcacactgaca
gtaagtgcacttgttccggccatcagttatcttggggctctcaacacatcaggtgctatt
gatgtgccaatggttgttaatccaacgcttttaaactctaatggttcagcgattacaagt
tgtacgagttttccggccttgccaacttgggcaagtcttcatccttcaacttgtgtgatt
tctggaactcctgatgcacctcttactcttacttcatatttaatcacggccaccaactcg
attggtccttcaattggtgccacggtatcactggaagtttcggccggaattcctgtgtta
agttacgcagctgcattaggaacaatgaactttgtagattcaccgatgacggtgactcca
actctcctaaaactaaacggctcagcgattacaaattgtgtgagttcaccaacacttccg
acttgggcgacacttgatcctaatacatgcgtgattacaggaacgcctgattcgacactg
tctccaaccacttattcaatcgttgctacaaactctataggtgactcggttggagcaaat
gtaacgttaactgcgattgcttttaattgtccggttggatacgccgaagtacctgcggat
gcagctcttggcgtgaatcgtttttgtgtcatgatgtttgaagcgagaaataattccggt
gcagtttcagaggcggccggaactccatggacaaatatttcgttagctaatgctaagacg
gcctgtacggcgttaggttcagatgatgatctcatctcaaatcctgaatggatggccatt
gctagaaacgctgaaacagtggcaggtaactggtcaacaggttctgttggaaccggtctt
atgccaagaggtcactcggacaacaatccttcaagcgttttaactttaagtaatactggt
gatgattattcagatactttggatacatctggatcagcttgggagcaaaaaagaaaaatc
acgctttcaaatggcgcagtcatttgggacttgagtggtaacgtttcagaatgggtcgac
tggagaactacttctggtctacaaacaggaccaacaaattgttcagcttctactcaggaa
ctcgcttcagtatcctgtgcaggacttgcatcaaatgattatcttccaagcaatggttcc
ctgaactcttcaaatggaattggtagatttattggtgggacaagtggtgcccctgttcgc
ggtggttcatggaatgactcggatatctcaggtctttattcaatcaatttaggtctggct
tcaattgcacattcaaatgtgggctttcgttgtgtgaatcgtccaaaggccgcagatgct
ccagggcttagctttgctggtgcaacgggaactacagtcttagtgggcgaaatgatgtct
attctcccaaccacacttgatgcaaatggtgccgccattacaaattgtacaacgacgccg
acactgccttcgtgggcatcgattaatccatcgaattgtgaaatcacaggtacaccgacg
ggagtaatggcacctacaagttttgatgtcgttgccactaactcagttggtgattcaaat
attgctacaattacattaacggtaaacggagcagttcctgttttaagttacgttggttct
cttggtggaaacggggcggtcggaattccaatgacagtttcgccaactgttctaagcgga
aatactctcgccattacaaactgtacaagttctccagcgctcccagcttgggcaacattg
aatcctacaacttgtacaatttcaggtactcctgattcattcttactttcaactgtctat
gatatttccgctcataactcagctggagcttcagttccggccagcatcactcttagtgtt
gcggcagcggccccagtattaagttacagtggtgcaaccggtgtcattggaagtgttggt
gtggcgatgagcatttcacctacgacgttagtagataatggagccgccattactaattgt
acggcgtcgccagcattgcctgtttgggcgagcattaatacttcaacttgtgtgatctcg
ggaacgccaacgggaattttgccggccacgacgtatacgatcactgccacaaactcggtt
ggctcaagtagtagtaacgtgacatttagatctaacccatcagctccagcacttagtttt
gtgggatcaactggaacaacaatcaattatggaagtccactaagcgtatcaccttcacta
ttaaatgcgaacggagccgccatcacaagttgtagcatttctccggcacttccagcgtgg
gcaacgatcaactcttcaacttgtattatttcaggaacgccaactcaagcactcgcggcc
acaacatatacggtaagggccacaaactctgcgggacaatcagctccagcgtctgtcatt
ctaactgtgaatgcacttgttccaaccatcagttacgccggagcaactggaacaacaaga
tcaattaactctccaatgagtgtggcaccaacaaccttacaatcaaatggtgcgaccatt
actaactgttcggcctcacctgcgcttccagcttgggcgactttgaacccaattacttgt
gttatctcgggtacaccgaatgtcatgatggcaactacaactttcacaattacggccggt
aactccgcggggacatccgatgcaacagtagacctaactgtaatcgcagcagtgccaact
atcagttacgcgggagcaacaggaacaattggatcaattggaactgcaatgtctgtttct
ccaacgacattgaataataacggcgccgcaattaccaattgttcgatcacgccagcactt
ccaggttgggcaactattgatccaacgacttgtgtgatagcaggtaccccaaatgcttct
ctgacatcaaccacatattcaattattgcgacgaactcaactggtaactcaactggggca
actgtcactcttcgtgccaatgcggccgtaccaactttaagttatgtgggctcgacagga
accaccattaactacaatactttggcaaatattgcgccaacgacactgaacactaatggt
gcggcgattagtagctgtacaagtactccttcacttcccgcttgggcaattttaaatcct
acaacatgtgccattaccggtattgccacttcagttcttccggcaacaacttatacaatc
gtggccagaaactctgttggttattcggcaggtgcaactcttactcttcaagtaaatgcc
actccaccaactttaagtttcgtaggatctcttggaacaagtggtgcagttggtgttgcg
atgagtgtattcccaacatcactcattacaaatggtgcggcggtcacaaattgtaccagc
actcctacgctaccaacttgggcaactcttaacccgatcacttgtcgaatcacgggtact
ccggatgccgtactaccggcaactatttttaatattgttgcgactaattctgcaggtgat
tctgcaagtgcagcagttacattgacggttgatgcttcagcaccttcattaagttattca
ggagcaacaggaacgaatggaatttttggggcgctaatgaccgtggccccaactcttatt
tccgataatggttcgaccattacagcttgtaccagcactccggcgcttccggcctgggca
acacttgatccagtgacttgtgttattacaggtacgccaaatgcttttcaagctgcgacg
tcatattcaatccaagcaacaaactcagttggcaattcagctacggctacagtaactctt
tctgtaaatgcggcacctccgacggttagttacgcgggtgcgactgggacaactgttaat
ttcggtactgctatgagtgtttcacctaccacacttattaccaatggtgcagggataaca
aattgttcaaccactcctgctcttcctacatgggcaagtatcaatccaacaacatgtgtg
atttcaggaacaccaaacgcaactctgacaggagttacatatgcggtgacggcgaccaac
tccgcaggcagttcaaccgctgccaacgtaacattaacggtgaacgccatcgctcctaat
ttaagttttgcaggtgccactggaactattggttatgtcacactaccgatgacagtaaac
ccgacgactttaaatcctaatggttctccaattacaaattgttccgtctcccctgctctt
ccggcctgggcaacacttaacacaacaaattgtgtgatctcaggtacgccggacgcaacc
atgtcagcagtaacatatactctgacagcgaccaatgctatcggttcatcggccggagcg
aatgtcactctatcagttgaaacagtttcagttcctgaattaagttttgcaggatcaaca
ggcacaaccgggatggttggatctccaatgacagttgccccaacaaatctcgatgacaac
ggttctccagttacaagttgtagtatctcgccagcactaagcggcgggcttgttatcaac
aattcaacttgtattatctcggggacaccaactgctctcctggccgccacaacttatact
gtaactgtaacaacagctatagggaatgcctcagataccgtcactttaacagtgaatgca
ggtataccaactctgagctattcaggtgcaactggtaccactgttaatatcaatactgcg
atgacagtagctccaactctgttgagcaataaccaatcggccattacagcttgtgcggcg
actcctgctttacctgcatgggcaactcttaaccctactacttgtgtaatttcaggaacg
gccaatactgttcttccggcaacgacatattcaattattgcaactaatgctattggcaat
tcaattgctgcctcagtttctttaactgtaaatgctttggtaccaaccattagttatgcg
ggggcgactggaacttcgggatctgtaggtacggcaatgaatgttgttcctacgacgtta
ctttcgaacggttcggcaatttcaaactgcacgacttccccagcgcttccagcatgggca
acacttaacacatctacctgtgtgatctctggaacaccaacggcccctataggttcgact
acatataatatcaccgcaaccaatgcgattgggaactcaacagccgcttcagtaagttta
agtgcaacttctgccccaccacttatcagttattcaggagcgacagggacgactgttaac
tttggctctgctatgacagttacgccaacaactttacagaacaatggttcaaccatcact
agctgtaatagtgcaccggcacttccagctggactcataattgatccttcaacatgtgtt
atttctggaaccgccactgttgccgtttctggagcgaattattctattacggccgctaac
tctgctggtagttcagtcggagccacagtcactttaacagtgaacccattagcaccaact
ttaagttatgcaacttctgcagggaagataacaaatattcactccgtgatgacagtgacg
ccttcaactctaagtactaatggtgcttcaattactggatgcacagttactccggcactt
ccgtcttgggcaacactcaacactacaacctgtgttatctcaggaacacctgatgctatt
ttaagtgcaacaacttattcagtgaccgcagttaacagcgtaggaccttctgcatctgct
tccgttactctacaagtaaacgcaactgctccaagtattagctaccttgcttcagttgta
aaatttggtgatgtcgtgagtattgttccaactttggataacaatggctcggccatcact
aactgtacaggagctggccttccagcgtgggcaactatcaatacatcgacctgtgaaatt
actggcaccccgaatgctgttgctcctctaaccgtttacggaataactgtgactaatggt
attggtagcacttctactaatctttctttaactgttacagagaatgttccaactcttgct
tatgcagcaggaattaaaacgggagtttatggacaggccattacggatatcattccgtct
actctattggccaatggtgccacggttacaagttgtacaagtgatactgctctaccaact
ggcttaacgattaatccaacgacttgtgtaatttcaggaacacctactgaagttgctgac
aacaaaatttacaaaattgtcgcccataactctggtggtgactctccagaagtcagtatc
acgattgatattaatccgggtttgccaactttagtttacccttcaacaatgggaaaacta
aacgaagcaattactataactccgactactttcttatcaaacggtgataccatcagctgt
ttggcaccagggcttcctgcttgggcaacgattgatagcaatacgtgtgtcattaccggc
acaccaactgccatcatgcctttgagcgatttcacggtaacagcctcgaatgcagcaggt
tcaaataacattactcttcaatttggagtcggtgcaggtaaaccagttattggttatgtt
gatttaagtggtgctgttggcgttccttatttactgacgcccacaacattgaatgataac
ggtggtccaataacagcttgccttgtaagcccttcacttccagcatgggcaactatcaat
caaaacacctgtgaaattagcggtattcctaacgctgtgattgggcttccaggagcaacc
tacagtgttgttgctcgtaacagtggtggtgactcggaaccagttaacatcactctattc
attgatgcttcagcaccacagttagcttatgcatctaacgtgaatggattgttcggagat
acaataactatttcacctactattctcgaagaaaatggtgctgccacaacctgttcagtt
gcgcctctacctgcgactcagcttcctttatgggcgaccttggacgtcaatacttgtgtg
attactggaacaccagacgccacgtttacagctcagatatcaattatcgcgaccaacaca
aaaggatcagtgaccgccaactttgatcttaatatttcgcccaaagttccggtcattagc
tatagcccaaccacatactcaattaactttggagaaagtttaaatattactccaaacagt
ataataactaatggatcgaacgttactgcgtgtaatgtttcgccagctcttcctgatgga
ttaattattgatgccaatacttgtatcatctcagggacgccaatagttagccaacctgcc
accaatcattcaattatagcaacaaatgccggtggagattctcttgctgtcacaatttcc
attcgaattattcctcagcctccaagtttgagttatgtctcaccgagtaatggtaaaatt
ggaacgagcatgacaatcaatcctgcaagtctagttactaacggagctgcaattactgct
tgtactagtaaccctgtattacctgctggtctatctattgatcctaccacttgcgtaatc
tctggtatccctcaagtagaagttaatggttattatgatataacggccgccaattcgggt
ggaatttcttctgccgctagtctaaatcttattattgatccagatgctcctcaaattagt
tatctaaattctccaggacttcctgcttatctggactctccagcgaaaatatctccaacg
atttttgaagataacggtgatctcgcgacgtgttctatttctccagcgcttccgatctgg
gcaacgctcgaccctaattcttgtatcattacaggttctccaactgcggtagatattacg
ggaacatcttatacagtgaccgctacgaataattttggttcgacttcaacaacattcgaa
ctctttattcaagtttgtccgacaaactatgcagaagttccggccgatttaacactaggt
acagaacgtttttgcgtgatgaaatatgaggcaagaaacgatggtggaaaaccatccgca
caaccgaatctaagtccttgggtcaatatcacggttggagatgcgaaggccgcatgtcgc
tctctagggtatgataagcactatgacttaatctcgaacgcagaatggatggccatagca
agaaatatcgaggcgcgagcagcaaactggtttaccggcattgtaggtggggccaataat
atgcttccagtaggacacactagcgtagttgagcctgaggatgaaaatgatccgtacgat
ccgatgatccttaatgtcttaagcactgacccgtacgaccaaactacagcggcaatcgtt
agtaacatgcaaagaggttgggagcaaaagcgaacgctaacgatcaatacaccagggggc
acagatgaaatctgggacctcagtggtaatgtgtgggaatgggttgactgggatcgtaaa
acgggactacagaaatcacctatgtgtaaatttgaagaagaattcactgatgtagatcct
aatctctgcgaaagtgggccaggcattgcaactcttaacaatgaggacttcatgcccctt
gaccctggtcttacatctgatcacggagtgggtttatttatgggtaacaccgaaccagga
gttgtatctgacgatgcctttgttgtgcggggtggagactctgccatgggcttcgtttac
attggtaacaacccaagtgctggggccattgatgagccacctactgccggtgtttacaca
attggtatggaggaggacgctttgatgaccgaagacataatcgggttccgctgcgtcttc
cgtccggttgaatttgttgatccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
