Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum: DSAG12_00559
Help
Entry
DSAG12_00559 CDS
T06555
Name
(GenBank) outer membrane biogenesis protein BamB
Organism
psyt
Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TSP3_bac
PQQ
Binary_toxB
PQQ_3
PQQ_2
FG-GAP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEE14744
UniProt:
A0A5B9D6L9
LinkDB
All DBs
Position
complement(613758..620282)
Genome browser
AA seq
2174 aa
AA seq
DB search
MIYRQFDNWVNKLIISNINEESKLTKYRKFKHNKLSSISLGRNKMAGISVNRVMRKNIII
GIAILLTFLIFPLMISEDAEYSTGFTGTTGSLAWTFTTGDSVSSNPAIGDTDGDGNMEVV
VGSQDHKVYCLDGDTGEEKWSFTTGDVVYSSPTIGDVDGDGNLEVLIGSNDRKIYCLDGT
TGGEEWNFTTGDVVNSGLALGDVDGDGNMEVLGGHDKIYCLDGTTGEEKWTVDSYLASFY
SIPAIGDVDGDGDMEVLVSCSRHYIFCVDGTTGLSEWSFSLGNSPSTIALGDVDRDGDIE
IVFICYRNIYCLDGTTGVEEWNFLAGSTVYSGPALGDVDGDGDIEILFGSYDHKMYCLDG
TTGLQEWSFTAGDRVYSSSPTIGDVDGDGDIEILFGSLDHKMYCIDGTTGGEEWNFTTGN
TISSSPALGDVDGDGNMEVLFGSDDGKIYCLIGNGDPWAIPGPWPCWGGSALHHANAMDS
DGDSMPDILEISLRLNENKSDTDDDGIHDGWEIGFGLNPNNPSDASLDSDSDGLTNLEEF
IYQTNPNDADTDDDGLYDQEELITYDTDPNDADTDDDGMLDGWEITYGLDPNNPSDAVGD
LDGDGLTNLEEFNYQTDPTDSDSDDDGLSDGDEVNTHNTDPTDSDSDDDGLLDGLEIILY
STDPSDSDSDDDGLSDGEEINTYSTDPNDIDSDDDGLSDGDEVNTHSTDPNDTDSDDDGM
PDGWEILYSFNPNNPSDAGLDQEVDGLTNLEEYTYNTDPYDSDTDDDGLTDGEEIHTYGT
DPNDIDSDDDGLDDWDEVSIYSTDPNDADSDDDGLSDGEEINTHATDPNDADTDDDGLSD
GEEISTHSTDPSDVDTDDDGLSDGEEILTYGTDPNLLDTDEDGLFDGEEILTHSTDPLDS
DSDDDGMSDGYEIYYGLDPNNPSDADVDSDGDGLTNLEESVHYTDPYDVDSDDDGLSDYE
EIITYGTEPHLEDTDEDGLLDGEEINTYGTDPNDTDSDDDGLSDQEEVITYSTDPTDPDS
DDDGLSDGQEINTYSTDPNDTDSDDDGLSDGQEINTYSTDPNDTDSDDDGLTDGQEVNTF
STDPNDTDSDDDGLSDQEEVITYSTDPNDSDCDDDGLTDQEEVITYSTDPNDSDSDGDGM
SDGWEIMYGFNPNSASDAGIDSDSDGLTNLEEFNYQTDPNDNDSDDDALSDGDEINTHNT
DPNDTDTDDDGLLDGLEILLYSTDPTDSDSDDDGLSDGLEINTYSTDPNDADSDDDGLSD
QEEVITYGTDPNDADSDGDGLSDQEEIIMYGTDPNNTDTDDDGLSDGQEINTYFTDPNDA
DTDDDGLTDGEEINTHSTDPNDTDTDDDGMLDGWETVYGLDPNSASDAGIDSDTDGLTNL
EEYNLHTDPTDPDSDDDGLSDGEEIITNNTDPNDTDSDDDGLTDGQEINTYSTDPNDPDS
DDDELSDQEELFMWGTDPNDADSDDDGMPDGWEIFYFFSNNATASYDEDGDDLTNLNEYI
YNTHPFDSDTDDDGLSDGEEINTYSTDPNDVDSDDDGLSDGEEIFTYSTDPNDADSDGDG
LSDGEEIITYNTGPNDTDTDDDGMSDGWEIMNGLNPNNISDAGGDLDGDGLTNLEEYINQ
TDPNDTDSDDDGLSDGEEITTYNTDPNDTDSDDDGLSDGEEVNTYSTDPNDTDSDDDGLS
DGEEINTYNTDPNDTDSDDDGLSDGEEINTYNTDPNDADCDDDGMPDGWETTYSLDPNSA
SDAGTDDDSDGLTNLEEYSYQTDPTDSDSDDDWLSDGDEINTYGTDPNDADSDDDGLGDQ
EEINTYFTDPNDTDTDDDGLSDGEEINTHFTNPNDTDTDDDGLSDGEEINTHFTDPNDTD
TDDDGLSDGEEINTYFTDPNELDSDDDGLFDGEEILTYNTDPNDEDSDDDGMSDGYEVYY
GLDPNNPSDADTDDDGDGLTNLEESVYYTDPNDIDSDDDGLSDYEEIITYCTEPHLEDTD
EDGLLDGEEINTYNTDPNDIDSDDDGLSDQEEVITYGTDPNDVDTDDDGLSDQEELITNN
TDPIDADSDDDGLSDGEEINTYSTDPNDSDSDDDELSDGEEINTYSTDPNDTDSDDDDLS
DEVEINTHSTDPNNADTDDDGFTDGVEIVAGTDPNDPDDFPSSGIPGFSIIFLGLFSTFT
LGLMILLIKRQRNC
NT seq
6525 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatttatagacaatttgataattgggttaacaaattaataatttcaaacataaatgag
gaatcaaaattgacaaaatacagaaaatttaaacataacaagttaagttcaatttcttta
gggcgaaataagatggccggaatatcggtcaatcgagtaatgaggaaaaatatcataata
ggtatagcgattttactgacatttcttatttttccgttaatgatttccgaagatgcggaa
tattccacaggctttacgggaacaacagggtctctagcatggacatttacaaccggagac
agtgttagttctaatcctgcaataggtgatacagatggggatggaaatatggaagttgta
gtaggttcccaagatcacaaagtctattgtctggacggggacacgggagaagaaaaatgg
tcgtttacaaccggagatgttgtttattctagccccacaatcggtgatgtggacggtgac
ggaaacttggaagttctgattggttccaatgatcgcaaaatctactgtcttgatggtaca
actggaggagaagaatggaattttacaaccggagatgttgttaattccggtcttgcactt
ggtgatgtagatggagacgggaatatggaagttctgggaggtcatgacaaaatttactgt
ctggacggaaccacgggagaagaaaaatggacggttgattcttatttagctagtttttat
tccattcctgccatcggtgatgtggacggggacggggacatggaagttcttgtaagttgc
tctagacactatattttttgtgtagacggaaccacgggattgtcagaatggtctttttca
ctcggaaatagcccttcaaccatcgccctcggtgatgtggacagagacggggatatagaa
atcgtatttatttgctatcgcaatatttactgtctggacggaaccactggagtagaagaa
tggaattttttagctggaagtactgtttattctggccctgcactcggtgatgtggacggg
gatggggatatagaaatcttatttggttcctatgatcacaaaatgtactgccttgacggg
acaacaggattacaagaatggtcgtttacagctggagatcgtgtttattctagtagcccc
acaatcggtgatgtggacggggatggggatatagaaatcttatttggttcccttgatcac
aaaatgtactgtattgacgggacaactggaggagaagaatggaattttacaaccggaaat
acgattagttccagtcccgcgctcggtgatgtggacggggatgggaatatggaagtcctg
tttggctccgatgatggtaaaatatactgcttaattggaaatggtgatccgtgggcgata
cccggaccttggccatgctgggggggatcagcactccatcatgccaatgcgatggatagt
gatggtgacagtatgccagatattcttgagatttcacttaggttaaatgaaaataaaagc
gatacggatgatgatgggatacatgacggatgggaaataggattcggtttgaatccaaat
aatccttctgatgcaagtttagattctgatagtgatggattaacaaatcttgaagaattt
atttatcaaacaaatcctaatgatgcagatacagatgatgatggattgtatgatcaagaa
gaattaatcacatatgacacagatcctaacgatgcagatacagatgatgatggaatgtta
gatggatgggaaattacgtatggtttagatccgaacaatccttccgatgcggttggagat
ttggatggagatggattgacaaatctcgaagaatttaactatcaaactgatcccacagac
tcagatagtgatgatgatggattatccgatggtgacgaagttaatacacataacacagat
ccgacagactcagatagtgatgatgatgggttattggatggattagaaataatcttatac
agcacagatccgtcagactcagatagtgatgatgatgggttatccgacggagaagaaatc
aacacgtatagcacagatccgaacgatatagatagtgatgatgatggattatccgatgga
gacgaagttaacacacacagcacagatccaaacgatacagatagtgatgacgatggtatg
cctgatggatgggaaattttatacagttttaatccaaataatccttctgatgcgggtttg
gatcaagaggtcgatggattaacaaatcttgaagaatatacatacaacaccgatccctat
gatagtgatacggatgatgatggattaaccgatggagaagaaatacacacatatggaaca
gatccgaacgatatagatagcgatgatgatggattagatgactgggacgaagtttccata
tatagcacagatccgaatgatgcagatagcgatgatgatggattatcagatggagaagaa
attaacacgcatgctacagatccgaacgatgccgataccgatgatgatgggttatccgac
ggagaagaaattagcactcacagcaccgatcctagcgatgtagatacggacgatgatggg
ttatccgatggagaagaaattttaacctatggtacagatccgaaccttttagatacggac
gaagatggtttgtttgatggggaagaaattttaacccatagcacagatccattagactca
gatagtgatgatgatgggatgtctgacggatatgaaatttattatgggttagatcctaac
aatccttctgatgctgatgtagattcggatggagatggattaacaaatctcgaagaaagt
gttcattacacagatccttatgatgtagatagcgatgatgatgggttatccgattatgaa
gaaataataacatatggtacagaacctcatcttgaagatacggatgaagatgggttatta
gacggagaagaaattaatacgtacggaacagatcccaatgatacagattcggatgatgac
ggattatcagaccaagaagaagtaatcacatacagtacagatccaacagacccagatagt
gatgatgatggattatctgatggacaagaaattaacacatatagcacagatccgaacgac
acagattcggatgatgatggattatctgatggacaagaaattaatacatatagcacagat
ccaaacgacacagattcggatgatgatggattaactgatggacaagaagttaacacattt
agcacagatccaaacgacacagattcggatgatgatggattatcagaccaagaggaagtt
atcacgtatagcacagatccgaacgactcagattgtgatgatgatggattaaccgaccaa
gaggaagttatcacgtatagtacagatcctaacgactcagatagtgatggtgatggaatg
tctgatggatgggaaattatgtatggttttaatccaaatagtgcttctgatgccggtata
gattctgatagcgatggattaacaaatcttgaagagtttaattatcaaacagatccaaac
gataacgatagtgatgatgacgctttatcagatggagatgaaattaacacacataacaca
gatccgaacgatacagatactgatgatgatggactattagatggattagaaatactctta
tacagcacagatcccacagattcagattcggatgatgatggattatctgatggattagaa
attaacacgtatagcacagatcctaatgatgcagattcggatgatgatggattatcagat
caagaagaagttatcacgtatggaacagatccaaacgatgcagatagcgatggagatgga
ttatcagatcaagaagaaataatcatgtatggaacagatcctaacaatacagatacagat
gatgatggattatcagatggacaagaaattaatacctatttcacagatcctaatgatgca
gacactgatgatgatgggttaaccgatggagaagagattaacacccacagcacagatcct
aatgatacagacacagatgatgatgggatgcttgatggatgggaaacagtatacggttta
gatccaaatagtgcttctgatgcaggcatagattctgataccgacggattgacaaatctc
gaagaatataaccttcatacagatccgacagacccagacagtgatgatgatgggttatcc
gatggagaagaaattatcacgaataacacagatccgaatgatacagattctgatgatgat
gggttaaccgatggacaagagattaatacatatagtacagatcctaacgatccagattcg
gatgatgatgaattatcagatcaagaagaattattcatgtggggcacagatccgaatgat
gcagattcggatgatgatgggatgcctgatggatgggaaatattttacttctttagtaat
aatgctactgcaagttatgatgaggatggggacgacttaacaaatctcaatgaatatata
tacaacacacatccctttgatagtgatacggatgatgatggattatccgatggagaagaa
attaacacatatagcacagatcctaatgatgttgattcggatgatgatggattatctgat
ggagaagaaattttcacttatagcacagatcctaatgatgcagattcagatggagatgga
ttatccgatggagaagaaatcatcacttataacactggtccaaatgatacagatacggat
gatgacggaatgtctgatggatgggaaattatgaatggtttaaatccgaacaatatttcc
gatgcaggtggagatttggatggagatggattaactaatctcgaagaatacatcaatcaa
acagatcctaatgatacagattcggatgatgatggattatctgatggagaagaaattacc
acgtataacacagatcctaatgatacagattcggatgatgatggattatctgatggagaa
gaagttaacacgtatagcacagatcctaatgatacagattcggatgatgatgggctgtcc
gatggagaagaaattaatacgtataacacagatcctaatgatacagattcggatgatgat
gggctttccgatggagaagaaattaatacatataacacagatccaaacgatgcagattgt
gatgatgatgggatgcctgatggatgggaaacaacatacagtttagatccgaatagtgct
tctgatgcaggtactgatgatgatagcgatggtttaacaaatcttgaagaatattcttat
caaacagatccaacagactcagacagtgatgatgattggctttccgatggagatgaaatt
aacacgtatggcacagatcctaatgatgcagatagtgatgatgatgggttaggcgatcaa
gaagaaattaacacatattttacagatccgaatgatacagataccgatgatgatggatta
tccgatggagaagaaattaacacacattttacaaatccaaatgatacagataccgatgat
gatggattatccgatggagaagaaattaacacacatttcacagatccgaatgatacggat
accgatgatgatggattatccgatggagaagaaattaacacatatttcacagatcctaat
gaattagatagtgatgatgacgggttatttgatggagaagagattttaacgtataataca
gatccaaacgatgaagatagtgatgatgatggaatgtctgatggatatgaagtttattat
ggattagatccgaacaatccttccgatgcagatactgatgatgatggagatggattaaca
aatcttgaagaaagtgtttattacacagatcctaatgatatagatagtgatgatgatggg
ttatcagattatgaagagataatcacctattgtacagaacctcaccttgaagatacggat
gaagatgggttattagacggagaagaaattaacacatacaacacagatcctaatgatata
gatagtgatgatgatgggttatcagatcaagaagaggtaatcacatatggaacagatccg
aatgatgtagacacggatgatgatggattatcagatcaagaagaactaattacaaacaac
acagatccgatcgatgcagatagcgatgatgatggattatccgatggagaagagattaac
acatacagcacagatccgaatgattcagatagcgatgatgatgaattatccgatggagaa
gaaattaacacatacagcacagatccgaacgatactgatagtgatgatgatgatttatct
gatgaagtagaaattaacacacacagcacagatcctaataatgcagacacagatgatgat
gggtttacagatggagtagagattgtagcaggtacagatcctaatgatcctgatgatttt
ccaagctcaggaattccgggtttttcgataatattcctgggattattttcaacatttact
ttaggtttaatgattttattaattaaacggcaaagaaattgttaa
DBGET
integrated database retrieval system