Paramecium tetraurelia: GSPATT00003526001
Help
Entry
GSPATT00003526001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14792
rRNA biogenesis protein RRP5
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
GSPATT00003526001
Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Other 90S particles
GSPATT00003526001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
S1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5043846
NCBI-ProteinID:
XP_001458061
Genoscope:
GSPATT00003526001
UniProt:
A0E5U7
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1495 aa
AA seq
DB search
MKKKVIDALKDDKYMFNPAPTYKNEKGTEDKLKKKKLREKKQLQRRAQLAEYISSDDDGP
QKKQPILDQDDYGALGDLDQDILGYFQMKSQKILNMTQKIPDQIFDVGSLHLGCISSIGP
NGAYLIINFTRNKKGFVDQHNLRDRKGVNGGDYKVGEYVITKVIEEQKSNKVQLSLHPNV
INDQLSVNQLVVGMQIPGIAQTWNEFGTTINFGSQQFSGFINEKKLKCGRVYLFNIKEVD
QKEKIAICDFEQRDVQLQNKKQISKHLLTPGNIWKCNTAKSITGGQIVKLNKFGVLGYIF
QDYQVEQEKNILCRIIGFDEPSRQIYLSSKQEHIDNTTYIPPYEVGQQYQGVVINQQLYS
GAYLVNAILNDDQAQTKKSKKAVKAKQPNLGPICMLNKTQIPADQEIVDHIQRTCIIKEI
NYFDHVGFVSFEVNSKPKLSDLNVGAIVKGVVKQVLLKEDSYNVLLNINDNFHAILPSLQ
MSDYPLANPPKFRVGSKLRVRILQIDEQHNNIIVTMKPTLLTDIKVFKTLDDVNVGDTLY
GFTIKKLENGILVKFFQNIVGFLSNLSLDGQNPDDIKDGQIIKVYVKYVNQSENKLLLSL
KKIDPKQKQVNEGQTQNVVLTKHIKTKLNLGEKVQCVVSAIKNNVVYVNLKDGKFGRIHK
AFFECYRNEDRLFKLQSEFENLNVGSQLNAQIIGENKENNKQIFDLTCLSDHVELEKDVQ
KDNNKIVYGIIKHIKSDSKSPLVVQIYYNYNVFIDGWDVNVEQPEILNSLEQYIQQGHPV
KVKLYEFDKQLKGIIITDEEQLQQQQQNINEILYTKQIYRILSHHDSYIRVQLKNRQFAS
IDITELQELWELNLFEQFPVGRWGVCRVIAKDKAYWASARETFLNDKLWNKCLHPVKSNT
ISYQKMILSLKYDVRTQLYKKTPLSVGQVAMGYVTGSTYNGTFVKLNYETTCLIRGFKTD
IKYRPIVLMITQLSKLQGTVDLNLLKYKLDDKQIRIGDVVQGLIVNIRNEKAAVKILGTL
QQGELDKKDAEGLEGEDGWWANKLFKIGQQIECLVIGQRQNKNNQTVLRLSNIQELINTE
GKRKIELGDIQQDVIDLHQSFEEMVKEHQIKNNVIVEQQNQNREIEEEIEQEVNEGEANG
ELEEQEDEEEQEDHKDQEIEEENDQEEIREEVQNLESRAEYEKKILTNPNSSVIWIEFVA
YAAENEGIESARNVIERALRVINFSNELERLNLWTAYLNLEFNFGSEDNLINIFKRGCQN
CDGKKLHIKLINIYRKAEKVDLTVELSRSFVQKYKQSCKSWMEFLQSLMEWQKVHDDENP
QYSFKDTLNRAMQCLKKSKQVKLLSFYGRLQFQNNQIEEGKTTYETILDKNSTRTDIWSQ
YLDLVIKYCQPDVVRSIFQKAIHNNKKPRKIKFLFKKQLEYEKLIWRQCNHYRKVKEQAE
HWGFIIYVKGCITRRRRGFRFDLVMYVYNSYYIKFNNFFELNTYVFMFFYYNSSQ
NT seq
4488 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaagtgattgatgcactgaaagatgataaatacatgtttaacccagctcct
acatataaaaatgaaaagggtacagaagacaagctaaagaagaagaaactaagagaaaaa
aaacaactctaaagaagagcttaattagctgagtatatatctagtgatgatgatggacct
taaaagaagtagccaatcctagatcaagatgattatggtgcattaggagatttagattaa
gatatattgggttatttttaaatgaaaagctaaaaaatacttaatatgacataaaaaata
cctgattaaatttttgatgtaggatctttgcatctagggtgtatttcatccattggtccc
aacggagcttatttgataatcaattttacaagaaataagaaaggatttgtggattagcat
aatctcagagatagaaagggtgtgaacggaggggattacaaggtaggagaatatgtaatc
actaaagtgatagaagaacagaagagcaacaaagtttaattgagtttgcatccaaatgtc
ataaacgatcaattaagtgtaaattaattagtggttggtatgtaaatacctggtatagcc
taaacttggaatgagtttggaaccacaattaatttcggatcttaataatttagtgggttt
attaatgagaagaaactcaagtgtggaagggtttatctctttaacattaaagaagtagat
taaaaagagaaaattgcaatttgtgattttgaatagagggatgtttaactataaaataaa
aaacagatctcgaagcatctgctcactcctggaaatatttggaaatgcaatactgctaaa
tccattacaggcggataaattgttaagctcaataaatttggtgtcttaggatatatattt
taagattattaggttgaataagaaaaaaatatattatgtagaataattggatttgatgag
ccatcaagataaatctacttatcaagcaaataagagcacattgataatactacctacatt
cctccttatgaagtaggttaataatattaaggtgttgtgattaatcaataattatattct
ggggcttaccttgtgaatgccatcttaaatgacgattaagcacaaactaaaaaaagcaag
aaagctgtaaaggctaaataacctaatttgggaccgatttgcatgttaaacaaaacttag
attcctgctgattaggaaattgttgatcacatttagagaacttgcattatcaaagagata
aattattttgatcatgttggctttgtatcatttgaagtaaattcaaaacctaaattaagt
gatttgaatgttggtgctattgttaaaggagtcgttaagtaagttctacttaaagaagat
tcatacaatgttttattgaacattaatgacaattttcatgctatattaccatcgctctag
atgtcagattatccattggccaatccacctaaatttagagtaggcagcaaattaagagtc
agaattttataaattgatgaataacataacaatatcatagtaactatgaaacccacttta
ttaactgacattaaagtatttaaaacattagatgatgttaatgtgggtgacacattatat
ggatttacaattaaaaaattagaaaatggaatcctagtcaaattcttttagaatattgtt
gggtttctgtctaatttgagtcttgatggataaaaccctgatgatattaaagatggtcaa
atcattaaagtatatgttaagtatgtaaattaaagtgaaaataaattgctactttcatta
aaaaaaatagatccaaaataaaagcaagttaatgagggataaactcaaaatgttgtatta
acaaagcatattaagactaaattaaatttaggtgaaaaggtgcaatgtgttgtgagtgca
ataaagaataatgtagtttatgtgaatctcaaggatggaaaatttggtcgaattcataaa
gccttttttgagtgttacagaaatgaggataggttgttcaaattacaaagtgaatttgaa
aatctcaatgtaggttctcaattaaatgcttaaatcataggagaaaacaaagaaaataac
aaataaatctttgatttgacatgtttatccgatcatgttgaattagaaaaagatgtatag
aaagataacaacaaaattgtttatggtatcataaagcatattaagagtgactcaaaatca
cccttagttgtccaaatctattacaattataatgtatttattgatggttgggatgtaaat
gttgaacaacctgaaattttgaatagtttagaatagtatatccagtaagggcatccagta
aaagttaaattatatgaatttgataaatagttgaaaggtattatcattacagatgaggaa
caactacagtaataataataaaatattaatgaaattctatatacaaaacaaatctataga
attctaagtcatcatgattcatatataagagtgcaattaaaaaatagatagtttgcgtcc
attgatataacggaattgtaagaattatgggaattgaatttgtttgaatagttcccagta
ggaagatggggagtgtgtagagtaatagcaaaagataaggcttattgggctagtgccaga
gaaacatttctaaatgataaattatggaataaatgtttgcatcctgttaaaagtaacacc
atttcttatcaaaaaatgatactctctctgaaatacgatgtcagaacttagttatacaaa
aagactcctttgtctgtaggctaagtggctatggggtatgttacaggaagtacatataat
ggcacttttgttaagttaaattatgaaacaacttgtttaattagagggttcaagactgat
attaagtatagacctatagttttaatgattactcaattaagcaaattataaggaaccgta
gatttgaacttgcttaaatataaattagatgataaataaattagaattggagatgtagta
tagggtttgattgtaaacattagaaatgagaaggcagcagtgaagattttgggtactctt
taatagggagaattagataagaaagatgctgaaggattggaaggtgaagatggttggtgg
gcaaataaattatttaagatcggataataaatagaatgtctggtgattggacaaagatag
aataaaaataattagacagttcttagattaagcaatattcaagagttgattaatactgaa
ggaaagagaaaaattgagttaggggacattcaataggatgttatagatttgcattagagt
tttgaagaaatggtcaaggaacactaaattaaaaacaatgtaatagtagaataacagaat
taaaatagagaaatagaggaggaaatcgaataagaagttaatgaaggagaagctaatgga
gagttagaagagtaggaggatgaagaagagtaagaagatcataaggactaagagattgaa
gaagaaaatgattaagaagaaattagagaggaagtttaaaatttagaatcaagagctgaa
tatgagaagaaaatattaacaaatcctaattcctctgttatttggattgaatttgtggct
tatgcagctgaaaatgaaggaattgagagtgctagaaatgtcattgaaagagccttaaga
gttatcaatttcagcaatgaattagaacgattaaatttatggacagcatacttaaatttg
gaattcaattttggatcagaagataatttaattaatatctttaagagaggctgttaaaat
tgtgatggaaagaaactacatataaagttgataaatatctacagaaaggctgaaaaagtc
gatctaacagttgaattatcaagatcttttgtccaaaagtacaaataaagttgcaagagt
tggatggaatttctgtagagtctgatggaatggtaaaaagtacacgatgatgaaaatcct
taatattcctttaaggatacattaaatagagctatgtagtgtttgaaaaaatcaaaataa
gtaaaactcttatccttttatggtcgattgcaattttagaataattaaattgaagaagga
aaaactacatatgaaactattttggataaaaattctacaaggactgacatatggtcataa
tacttggatttagtgattaaatattgttaacctgatgtggttcgatcaatattttaaaaa
gctattcacaataacaagaaaccaagaaagatcaaatttttatttaagaaataattagaa
tatgaaaaactaatatggagatagtgcaaccattataggaaagtaaaggagtaagcagaa
cactggggtttcataatttatgtaaaaggatgtataacaagaagaagaagaggattcaga
tttgatttagtaatgtatgtttataattcatattatataaaatttaataacttttttgaa
ttgaacacttatgtgtttatgttcttttattataattcaagttaatga
DBGET
integrated database retrieval system