Pseudomonas umsongensis: HGP31_02015
Help
Entry
HGP31_02015 CDS
T06842
Name
(GenBank) DUF2339 domain-containing protein
Organism
pum
Pseudomonas umsongensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF2339
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJC77116
LinkDB
All DBs
Position
447580..450783
Genome browser
AA seq
1067 aa
AA seq
DB search
MQWMFMLVGLVLGWILDESFSDALLGALLGLGIGQAVHIGRLGSQAIEQRRLLEQAQLAL
RAVEQRLALLEGPGIKVPEASAAAPVADIAVTQAPVETPELIWELPPDLETATAAATQSS
YTQPFDAWKPAPADRERANPPEPSLFERAINAARAWLLGGNTVLRVGVMLLFLGLAFLLR
YATEGMVVPIELRYAGVAAVAMGLLGLGWWLRTRNSAYALMLQGAAIAVLYLTVFAAMRL
HPLLDPTAAFGLLVAVTVFSAILAITQDALGLAAAAALGGFAAPLLASTGAGSHVALFSY
FALLNAGILVIAWFKAWRLLNVIGFTGTFGIGFAWGLRSYTPELLWSTEPFLILFFVMYL
AIGLLFSRRKLLHLGGAPEDDSREALLRWSARKGDYVDGTLLFGPPLVGFGLQFAVVQHL
EFAAAFSALALGMIYMGLARMLMGRALLLGETCLALGVIFASLAIPLGLDARWTSGAWAV
EGAGIFWLGLRQQRSLARAFALLLQAGAALVFLSELRSGENSLLDGTPLGALLLGGALLF
SFHQLHKALPGQVSSWERHVLPVLAALGLAFVYLLAPMFFFAHGTSISWAMAGLLTLFVG
LHLRSATFLLSAFVVQLLGAVLFLVAEPLVSEGVRPLAHAGFWSPLMLGLVALIGAWRLQ
VGFAVTVIDGVNLQRLSRVLLAWGAGWWALAWVSEVLLFAPLPLQATLLLAAAATSVALW
AMLALRLAWPALGVLCTLLIPAAGLVLLAAWHPRFHPAANAGWLLWAVVFIVHFLSLRRL
APILPSAALSSAHVLGCWLLIGVLALELRYGLLLLSEHYNAWRWLGWALLPSLYLVLMAA
PRAWPWPVSVYAREYRVYAAAPLALLMLGWFWLANTVSDGKADPLPYLPLVNPLELGLLF
ALFGVYAWSRSEAAQQVIPGSYSAAVAAAVQAIVGASLFTFFTALVMRTAHHWGGVPFEL
PALLESMRVQAGLSIVWTLMALGLMIGGHLRHRREVWLIGAALIGVVVAKLFFVELSNRG
GLARIVSFIGVGVLLLVVGYFAPLPPRRVETAGAPEKPAPQTEGVSS
NT seq
3204 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatggatgttcatgcttgtgggcctggtgctgggctggatactcgacgagtcgttc
agcgatgcgttgctgggcgcgttactcgggttgggtatcgggcaggccgttcacattggc
aggctgggatcgcaggccattgagcagcgtcgcctgctcgaacaggcgcaacttgcactg
cgcgcggtcgagcaacgcttggctttgcttgaggggcccgggatcaaggtgcctgaagcc
agcgctgccgctccagttgctgacatcgcggtcactcaagcccccgtcgaaacccctgag
ctgatctgggaactgccgcccgatctggagacggccaccgctgcggctacccagtccagc
tatacacagcccttcgatgcatggaaacccgcgccagccgaccgcgaacgcgccaatccc
cccgaaccaagcctcttcgagcgcgccatcaacgcggcgcgtgcgtggttattgggtggc
aacaccgtgctgcgggtcggtgtgatgctgttgttcctcggtctggccttcctgctgcgc
tacgccaccgagggcatggtggtgccgatcgaattgcgctatgccggtgtcgcggcggta
gcaatgggcctgctgggcctgggctggtggctgcgaacgcgtaacagtgcttacgccttg
atgctgcaaggcgccgccattgccgtactgtacctgacggtgtttgccgcgatgcgcctg
catccgttgctcgatcccacagcggcatttggcctgttggtggcggtgacggtgttttcg
gcgatcctggccattacgcaggacgcactgggcctggccgccgccgccgcgctgggcgga
tttgccgcgcctctgctggcttccacgggggctggcagtcacgtcgcgttgttcagttac
ttcgccttgctcaacgccggcatcctcgttatcgcctggttcaaggcctggcgcttgctc
aacgtgatcggcttcaccggcaccttcggtatcgggttcgcctggggtttgcgctcctat
acgccagagttgctgtggagcaccgagccgttcctgattcttttcttcgtgatgtacttg
gccattggcttgttgttctcccgacgtaaattgctgcatttggggggcgcgcccgaggat
gacagccgtgaggcgctgttgcgctggtccgcgcgcaagggtgattacgtcgacggcaca
ctgctgttcggtccgcctctggttggctttggattgcagttcgccgtggttcagcatctg
gagttcgctgccgcgttcagcgccctggcgctcggcatgatctacatgggcttggctcgg
atgctgatgggacgagcattgctgttgggggaaacctgcctggcgctgggcgttattttc
gccagcctggcgattcccttggggctggatgcgcggtggacgagtggcgcctgggcggtg
gaaggcgcggggattttctggctgggcctgcgtcagcagcgctcgctcgctcgtgcattt
gccttgttgttgcaagcgggcgcggcgctggtgtttctcagtgaattgcgcagcggtgag
aatagcctgcttgatggcacgccgctgggagcgttgttgctcggcggcgcactgctgttc
agtttccatcagttgcacaaggccttgcctgggcaggtgtcgtcctgggagcgtcatgtc
ttgccggttctggccgctctcggcctggcatttgtctacttgctggcgccgatgttcttt
ttcgcccatggcacgtcaatcagttgggcaatggccgggctgctgactttgttcgtcggt
ctgcacctgcgctcggctacattcctgctgagcgcgtttgtcgttcagttgctgggcgcc
gtgctgttcctggtggctgaacctctggtcagcgaaggcgtgcggccgttggctcatgct
ggcttctggtcaccgctgatgctgggcctggtcgcattgatcggggcgtggcgtttgcaa
gtcggctttgctgtcacggtgatcgatggtgtgaacctgcagcgtttgtcgcgggtgttg
ctggcgtggggagcagggtggtgggcgctggcctgggtcagtgaagtgctgctgtttgca
ccgttgcccctgcaggcgacattgctgctggcagccgcggcaaccagtgtggcgctgtgg
gccatgttggcgctgcgcctggcgtggcccgcgctgggcgtgctctgcaccttgctgatc
ccggctgccggcctggtgttgctcgccgcttggcatccgcgctttcatccggccgccaac
gccggctggctgctgtgggccgtggtgttcatcgtgcatttcctgtccttgcgacgcttg
gcgccgatcctgccgagcgctgccctgagcagcgctcacgtactcggttgttggttgctg
atcggtgtgctggccctggagctgcgttatggcttgctgctgttgtccgagcactacaac
gcctggcgctggctgggctgggcgctgctgccgagcttatacctggtgctgatggcggca
ccgcgtgcctggccctggccggtgtcggtctacgctcgcgaataccgtgtgtatgccgcc
gcgcctttggcattgttgatgctgggctggttctggctggccaatacggtcagtgatggc
aaggctgatcccttgccctatttaccgctggtcaacccgctggaattgggcctgctgttt
gcgttgttcggtgtctacgcctggtcccgcagtgaggcagcgcaacaggtgattcccggg
agctacagcgctgctgtggcggccgctgtgcaagcgatcgtcggcgcttcgctgttcacg
ttcttcactgccctggtgatgcgcacggctcaccattggggcggcgtaccgttcgagctg
cccgccttgctcgagtcgatgcgggtccaggccggcctgtccatcgtctggaccttgatg
gcgctgggtttgatgattggtggccatttgcgtcatcggcgtgaagtctggttgatcggt
gcggccctgattggcgtggtggtagcgaaactgttcttcgtcgaattgagcaaccgtggc
gggttggcgcggatcgtgtcgtttatcggcgtgggcgtgctgctgctggtagtgggctat
ttcgccccgttgccacccaggcgcgtcgaaactgccggggcccccgaaaagccggcgccg
caaaccgaaggagtgtcgtcttga
DBGET
integrated database retrieval system
