Pistacia vera (pistachio): 116119705
Help
Entry
116119705 CDS
T07386
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g52850, chloroplastic-like
Organism
pvy
Pistacia vera (pistachio)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
PPR_long
TPR_14
TPR_19
TPR_17
E_motif
TPR_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116119705
NCBI-ProteinID:
XP_031261515
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
794 aa
AA seq
DB search
MISKSVTNIVNRTEIYRLEETCSRLISLCNSKSFKEGICIHSPIIKLSLQDKLFLNNNLL
SLYVKCSRVENARHFFDEMPLKDVASWTGILSGYVKNKKHYEALDLFYCMMISGQYPNEF
TFSSVLRSCSALGEFNYGTRVQSYVIKYGFQSNPFSGSALIDLYSKWGFTNEAYKLFTCM
ENGDTVSWTTMISSFVKERKWSRALQFYVHMIEAGVHPNEFTFVKILAASCFLGLSYGRL
VHGHMIVRGVKMNVVLKTALVDMYSRCQRMEDAIKVSNLTPEYDVLLWTTIISGFTQNLK
FREAVAAFHDMEVCGVAPNNFTYSSILGACSSVLSLDLGRQIHSRVIMAGLEDDVSVGNA
LVDMYLKCSSMIESGLRAFRVISSPNVISWTSLIAGFVEHGFHQEAFQLFEEMQASGVQP
NSFTISSILGACSTVESVSQLSKIHGCAIKTEVDDDIVVGNALVDAYAGLGLVDDAWQVI
SKMSHRDAAAYTSLATRMNQMGHHEAALNIITHMYNDNVKMDGFSLASFIAASASLAGEE
IGKQLHCHSMKSGLVCWISVSNSLVDLYGKSGSLSDAHRVFREITEPDVVSWNTLISGLA
SNGYISFALSAFDDMRLAGIKPDYVTYLIVLSACSRGGLVDLGLEYFQSMEKVHYLLPQF
DHYVRLVDLLGRAGRLEEAMDVLQTMPFRPDALIYKTLLGACKMHKNVPLGEDIARRGLE
LDPSDPAFYVLLADLYNNTGHSDLAENTFQMMRERGLMNPEPSSMEYGNKIHLFIAGHAE
DGVHEENRLSYNRV
NT seq
2385 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatcaaaatcagtaaccaacattgtaaacagaactgaaatttaccgactcgaagaa
acttgttcgcggcttatttcattatgcaactccaagtctttcaaagaaggtatatgcatt
cacagcccaattatcaagttgagtcttcaggataaattattcttaaacaacaatttgctc
tcgctttacgtaaaatgctccagagtggaaaatgcacgccacttctttgatgaaatgcct
ctaaaagacgtcgcttcttggaccgggatcttgtctggttatgttaagaataaaaaacac
tacgaggcgcttgatttgttttattgtatgatgatttctggtcaatatcccaatgagttt
acgttttcgagtgtcttgagatcgtgttctgctcttggtgaattcaactatggaactcga
gttcagtcctatgttatcaaatatggatttcaatcaaatcctttttcgggcagtgctttg
attgatttatactccaaatggggtttcactaatgaagcttataagttatttacatgtatg
gaaaacggtgatactgtttcttggactacaatgatctcttcgtttgttaaagagcgaaaa
tggagccgggctttgcaattttacgttcatatgattgaggccggtgttcatccaaatgag
ttcacttttgtgaaaattttagctgcttcctgttttcttggtttaagttatggaagattg
gttcatggtcacatgattgttcggggagtcaagatgaatgtggtgttgaaaactgccctt
gttgatatgtattcgagatgccagaggatggaagatgctatcaaggtctcaaatttgacg
cctgaatatgatgtgttgttatggactactattatatctgggtttactcagaacttgaag
tttagagaggctgttgctgcatttcatgatatggaggtttgtggagtagcaccaaataac
ttcacgtattctagtatcttgggtgcatgctcatcagttctatctttggatctggggaga
cagattcattcacgagtgattatggctggattggaggatgatgtgtctgttggaaatgca
cttgttgacatgtacctaaagtgttccagcatgatagaaagtggcttgagagcttttaga
gtaataagctcaccaaatgtcatctcttggacctctttgattgctggttttgtcgaacat
ggttttcatcaagaagcttttcaacttttcgaggagatgcaggcttcaggagtgcaacca
aattcctttacaatctcgagtattcttggggcctgcagtacagtagaatctgtaagccaa
ctgtcgaaaatccatggatgtgctatcaaaacagaagtggatgatgatatagtcgttggg
aatgctttagtggatgcttatgctgggttgggattagtagatgatgcatggcaagtgatt
agcaagatgagtcaccgagatgctgccgcatacacaagtttagccacaagaatgaatcag
atgggtcatcatgaagcggcgttgaacatcataactcacatgtataatgacaatgtcaag
atggatggatttagcctggccagcttcatagctgcatcagcgagcttggctggggaggaa
attggaaagcaacttcactgccattccatgaaatctggattagtttgctggatttcagtt
tcaaatagcctagttgacctctatgggaaatctggatctttatctgatgcacacagagtt
tttagggaaataactgagccagacgttgtgtcatggaacacattgatatctggattggca
tcaaatgggtatatctcctttgctctctcagcttttgatgatatgaggttagcaggaatc
aagcccgattatgttacatatttgatagtgctttctgcttgtagtcgaggtggactggtt
gacttgggtcttgagtatttccagtctatggaaaaagtgcattatttattgccacagttt
gatcattatgttcgtttagttgatcttcttggacgagccggcaggctagaggaggcaatg
gatgtgctacaaactatgccttttaggccagatgctctgatctacaaaacattactgggt
gcctgcaagatgcataagaatgtacctctcggggaagatatagcaaggagagggctcgaa
cttgacccttcagatccagcattctatgtgctgcttgcagacctgtataataatactggc
cattctgatttagctgagaatactttccagatgatgagagaaagaggtttgatgaatcct
gaaccaagctcgatggaatatgggaacaagattcatctctttattgcgggacatgctgaa
gatggggttcatgaagaaaatagactgagctataacagagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
