Pectobacterium parmentieri WPP163: Pecwa_0565
Help
Entry
Pecwa_0565 CDS
T01106
Name
(GenBank) Ig family protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
pwa
Pectobacterium parmentieri WPP163
Pathway
pwa02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pwa00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Pecwa_0565
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
He_PIG
Big_9
DUF4347
Cadherin_5
Cadherin_4
BACON
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACX86393
LinkDB
All DBs
Position
complement(601314..609776)
Genome browser
AA seq
2820 aa
AA seq
DB search
MQWRHFLSSCSKRDRTSSDTVTDLSTPLGYALEARMMFDGAVAATVNQADAGQTASDAAH
NTASATTNDTQKDQSSAQTDHRTGQDATDTQDATSDIAVAGDTARKEVVFIDTSLTDYQT
LVDNVPTGIEVVLLDGSKDGLSQLAEWAKTHSSYDAIHVLSHGGEGELQLGSLTLDSKTA
DARAADLATLGAALTESGDLLLYGCEVAQSSGQSFVSLLAQITGADIAASNDTTGLGGDW
DLEIQTGVIEAAALQIDSYQHALHVSNTEVTLWIDGIDYSTNPVGPGSEVFLDLRDEASS
EWYIDIDPVTSTITMTIRNGQGPYVGLESFDLVFNNITNGTLLAITSITKDNSVTTSEAK
LSASVIGTDKTITFHVDNDGTKGDGVLVWHFTSTNLGGSSDTLPSVSGSGTNPTYTENGT
DVGLFTNVIANTNDNGQTFTGATFTVTNVTDSTEYLNINGVKVSLINGNSVSLGSGYGSA
SVSLSAGTASISLSGAILSNADMGTLLSGMTYGNSSENPHTTARVVTLTQVTDSGASNNS
YSPGNIASTVTVVAVNDAPTDLALSNTTFGQSLGSNGIIGTLSATDVDSTTFTYSLVSGT
GSTDNALFTLSGSTLRAVNAATMAAGTYSVRIQVSDGQATYEKVVTLTVADDIAPTFDAT
PTITAPTVSGFTLNTDLNERGTIYYVVLSDGASAPSVTQVINGQNASGSLALAFGSQLAG
SAPYSQSLTLTGLAAATAYDVYVVARDSAGNATVSVVKLDVTTAASSTAPTLSATGSNPV
FIGGMAGAVDLFSGVSADTRDSGQTFNALTLTVSNVSDSGEFISVAGNTISLASNGSGTL
TGIGSYTVTRVGNTVTLQLSGMTASNTQFAGLVDGLRYGNSNSSVTAATRDVSLTAVSDS
GTSNNTTSLSLTSSVNVLASNSALYVTSGDDTGADASFGNSLQDDLNDGGGLSLREALHW
ANQTPGIDRIVFQTDVTLSSSILSPTETLLIDGQSFTLNGGGYSGFQITSSSLTFAIQNL
TLTHFTTINNLYSGGVLGINAGALDINFRLYNVDITGNTDDGWGNGMIDLSHIQQGAYIF
DLDQVNIHDNTQLGGTNEEGVIKLFVSGTQQTVSLSLTNSAIYNNNGANAANGLIGVAGL
YLASNGSTNAPNTHVTLMNTTITGQDAGIEFHFINHASSWAASVRNSIISGNTVDMVIHN
DTTTNGSYTLNGGNNLIGSSVDLMSSSDPRLAATASNAINQGDRFSVTGNGDARGLDRVR
QGAVDIGAYESQFTSGVSPQVDLNGAGSGSDYSATVSTGLSTGVPITDMLATLSQTDGDT
RLWTLTLALSGNTDGSNEYMTLSQQALLAAHAAGINVSGDGSQTLTLTGGATSEAFQTAL
RAIVYVNVATTPSGGARTISVTANDDASRSATSTLTVVVGNPPVVAAPIPAQNIAQNDGL
SFTVPAGTFTDPDVGDTLTLSATLADGSPLPGWITFNPVTGTFSGTPGNADVGSLSIRVT
ATDGSNASVYTDFSLTVTNVNDAPVVATPIPAQSVAQDDSLNFTVPVGTFTDPDVGDTLT
LSATLADGSPLPNWITFNPATGAFSGTPGNADVGTLSIKVTANDGDASVSTTFSLTVTNV
NDAPVVATPIPAQSVAQDGSLSFTVPAGTFTDPDGDTLSLSATLANGSPLPSWLTFNSAT
GTFSGTPGNADVGTLSIKVIANDGGASISTTFSLTVTNANDAPVVATPIPAQSVVQDGSL
NFIIPAGTFTDPDGDTLTLSATLANGSPLPSWLTFNTATGTFSGTPVNADVGSLSIRVTA
TDGSNASVYTDFSLTVTNVNDVPVVGTPIPAQSIAQDGSLNFTVPAGTFIDPDGDTLTLS
ATLANGSPLPGWITFNPTTGTFSGTPGNGDIGNLSIKVTANDGDASISTTFSLTVTPANQ
APVVSTPIPPQSVVQDGGFNFTVPAGTFSDPDGDTLTLSATLADGSPLPVWITFNPATGT
FSGTPGNADVGNLSIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTNVNDAPVVGTPIPAQSIAQDGSLN
FTVPAGTFIDPDGDTLTLSATLADGSPLPSWITFNPATGTFSGTPGNADVGNLSIRVTAT
DGSSAAAHTDFGLTVTNVNDVPVVGTPIPAQSIAQDGSLNFTVPAGTFIDPDGDTLTLSA
TLADGSPLPSWITFNPATGTFSGTPGNGDVGNLTIKVTANDGDASVSTTFSLTVTNVNDA
PVVGTPIPPQSVAQDGGFNFTVPAGTFTDPDGDTLTLSATLADGSPLPSWLHFDPTIGTF
SGTPGNGDVGMLVIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTNINDAPVVGTPIPPQSVAQDGGFNF
TVPAGTFTDPDGDTLTLSATLANGSPLPSWLHFDPTIGTFSGTPGNGDVGMLVIRVTATD
GSNTSISTSFGLTVTNVNEAPVVSTPIPPQSVAQDGGFNFTVPAGTFTDPDGDTLTLSAT
LANGSPLPSWLHFDPTIGTFSGTPGNGDIGTLVIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTNVNDA
PVVSTPIPPQSVAQDGGFNFTVPAGTFTDPDGDTLTLSATLANGSPLPSWLRFDPTIGTF
SGTPGNGDIGTLVIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTRSIVGGDPQFKANDGIGRTPSSSDA
RQLSTQDATTAPPTLNGLITNPSLGSFTVGNDGAPMSVMSAIFATGRQNTEGGTIPVSQV
AGTFGRGVASGIGINFDSTLGSFPSFSKDPALGGTSSLASAFSGIYLPSLMPMEVFSGGS
WKNIPIDSAGSTTNSTDDGTGRSVAFMPSLHQQLQQIGDSELQRLAAIEQALQESGQQQG
NT seq
8463 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatggcgccatttcttatcttcatgcagtaaacgcgatcgtaccagtagcgacacg
gtgacagatttatcgacaccgctagggtacgcccttgaagcacgcatgatgtttgatggc
gccgtcgccgccaccgtgaatcaagccgatgccgggcaaaccgccagcgatgcggcacac
aacaccgcctcagcaacaaccaatgacacccaaaaagatcaatccagtgctcaaaccgac
caccgcacagggcaggacgcaacggatacccaggatgcaaccagcgacatcgcggttgct
ggggatactgcccgcaaagaagtggtgtttatcgatacctcattaaccgattaccaaacg
ctggtcgacaacgtacctaccggtatcgaggtggtattgctggatggcagcaaagatggc
ctaagccaactggcagagtgggcaaaaacccacagcagttatgatgcaattcatgtactt
agccacggtggtgagggcgaactgcaattgggttcgttaacgctggacagcaagaccgcc
gacgcacgtgccgctgatttagccacgctgggcgcagcgctgacggaatcaggagattta
ctgttgtacggctgtgaagtcgcgcaaagctccgggcagagcttcgtttctctgctggca
caaatcacgggggccgatatcgcggcctctaacgataccacgggtctgggtggagattgg
gatcttgaaatacagactggggtgattgaagccgcagcgctacaaatagacagttaccag
catgccttgcacgtcagcaacactgaggtaacactgtggatagatggtatagattatagc
accaacccagtggggccaggcagcgaagtattcctagatttaagggatgaggccagttcc
gaatggtacattgatattgacccggtcacctcgaccatcaccatgaccatacgtaacggt
caagggccgtatgtggggcttgagtcgttcgacttggtgttcaataacatcactaacggc
acattactcgccatcacttcgatcaccaaggataacagcgtaaccaccagtgaggcgaag
ctttcagccagcgttatcggcaccgacaaaaccatcaccttccatgtcgacaacgacggt
acaaaaggcgatggggttttagtgtggcacttcacgtcgaccaatcttggcggtagcagt
gataccctaccaagcgtcagcggtagcggcaccaatccgacctacaccgaaaacggcacc
gacgtcggcttatttaccaacgtaatcgctaataccaacgacaatggacaaacctttacc
ggtgccacctttaccgtaaccaacgtaacagacagcaccgaatacctgaacatcaatggc
gttaaggtatcgctgatcaatggcaatagcgtctcactcggcagcggctacggttcggcc
agtgtctccctcagcgctggcacggcaagcatcagcctaagcggagcgatattaagcaat
gccgatatgggcaccttgctatctggcatgacctacggcaacagcagcgagaatccccat
accaccgcacgggtcgtgaccctgactcaggtcaccgattctggtgccagcaacaacagc
tacagccccggcaatatcgccagcaccgtcaccgtggttgccgtcaacgatgcaccaacg
gatttggcgctttccaacacgacattcggccagtctctgggcagcaacggtattatcggg
acgttatcggcaaccgacgtagactccaccacgtttacctacagtctggtgagtggcacc
ggcagtactgataatgcactctttaccctcagcggcagcacgctgagagcggttaatgcc
gccaccatggcagccggaacctattccgtgcgtatccaggtctccgacgggcaagcgacc
tatgagaaggtcgtcaccctaacggtggccgacgatatcgcgcctacatttgacgcgaca
ccgacgatcaccgcaccgacagtgagcggttttacccttaatactgacctcaacgagcgg
ggcaccatctattatgttgtgctctccgatggcgccagtgcaccgagcgtcactcaggtc
attaacgggcagaacgcctcaggtagcctggcactcgctttcggcagtcagttagccggc
agcgcgccctacagtcaatccctgaccctgacgggtttagccgccgccaccgcctatgat
gtgtatgtggtcgccagagacagcgccggtaatgccaccgtcagcgtcgtcaagcttgat
gtcacgaccgccgcaagcagcaccgcaccaaccctgtccgccacgggcagcaatccggta
tttattggcggtatggcgggtgctgtcgatctgttcagcggcgtcagcgccgacacgcgg
gacagcgggcagacctttaacgcactgactctgaccgtgtccaacgtcagcgacagcggt
gaatttatcagcgtggcgggcaacaccatcagcctggcgagcaatggcagcggcacactg
accggcatcggcagttatacggtaacgcgcgtcggcaatactgtgacgctacagttgagc
gggatgaccgccagcaacacgcaatttgccggtctggtggatggcttacgctacggcaat
agcaacagcagcgttacggcggccacacgggatgtgtccttaactgccgtcagcgatagc
gggaccagtaacaacaccacgtcgctaagccttacgtcgtcagtgaatgtattagccagc
aacagcgcgctgtatgttacctctggagacgataccggcgctgatgcgtctttcggcaat
agcttacaagacgatctcaatgatggcggcgggctcagcctgcgcgaagcgttgcattgg
gccaaccagacccccggcatcgatcgtatcgtatttcagaccgacgtgacgctgagcagc
tccattttgtcacccaccgagaccctgcttatcgacggtcagagtttcaccctgaacggt
ggcggttattctggctttcagatcaccagttcgtcgctgacgttcgccatccagaaccta
accctgacccatttcaccaccatcaacaacctgtactcgggtggtgtgctggggatcaat
gctggcgcattagatatcaacttcaggttgtacaacgttgatattacggggaacaccgac
gatggctggggcaatggcatgattgacctgagccatattcaacagggcgcctacatcttc
gatctcgatcaggtcaatatccatgataatacccagttgggcggcacgaatgaagaaggc
gtgatcaagttgttcgtgtccggcacccagcaaaccgtctcgctgtcactcaccaattca
gccatctacaacaataatggtgccaatgcggccaatgggttgattggcgtggcaggtctc
tacttggcgtcaaacggcagcaccaacgcccccaacacccatgtcaccttgatgaacacc
accatcaccggtcaggatgccggtattgagtttcacttcatcaaccatgcctctagctgg
gcggccagtgtgcgcaactcgattatatctggcaatactgtcgatatggtcatccataac
gacaccaccactaacggttcctataccctaaatggcggtaataacctgatcggcagtagt
gtggatctgatgtcatcgtcagatcctcggctggctgctacagccagcaatgccattaat
cagggtgatcgtttctctgttaccggcaatggtgatgcgcgcggtctggatcgtgtgcga
caaggggctgtcgacatcggtgcttacgaatcacagtttacttcgggtgtgagtccacaa
gtggacctgaacggtgcaggctctggcagtgactatagcgctaccgtctctaccggtctg
agtacaggcgtgcctataaccgatatgctggcaacgctgtcacaaactgatggcgatact
cgtctgtggacactgacgctcgcgctgtctggcaacaccgatggcagtaacgaatatatg
acgctatcgcagcaggctctgttggcagctcatgcagcaggcatcaacgtctccggggat
ggcagccaaaccctgactctcactggcggcgctacgtcagaagccttccagaccgcacta
cgcgctatcgtgtatgtcaatgtggccacgacccctagcggcggtgcacgtaccatttcg
gttaccgccaatgacgatgccagccgcagcgcgacctcgacgttgacggtggtcgttggc
aatccccctgtggttgccgcaccgatccccgcacaaaatatcgcccagaatgacggcctg
agtttcaccgtaccggcaggcaccttcaccgatccggatgtcggtgatacattgaccctc
agcgccacgctggcagatggttcgccgctgccaggctggatcacctttaatccggtcacc
ggcaccttctccggtacgccgggtaacgccgatgtcggtagcctgtctatccgcgtcacc
gctaccgacggcagcaacgcctcggtatatacggatttcagcctgaccgtcaccaacgtt
aacgacgcgccggtggtggcgacgccgataccggcacaaagcgtggcacaagatgacagc
ctgaacttcaccgtaccggtaggtaccttcaccgatccggatgtcggcgataccctgacc
ctcagcgccacgctggccgatggttcaccgctgccgaactggattacctttaatccggcc
acgggcgccttctccggcacgccaggcaatgcagatgtcggtaccctgagcattaaggtc
accgccaacgatggcgatgcgtccgtcagcaccacgtttagtttgacggtcaccaacgtc
aacgacgctccggtggtcgcgacgccgataccggcgcaaagtgtggcacaggatggcagt
ctgagcttcaccgtacccgcaggcaccttcacggatccggatggcgatactctctctctg
agcgccacgctggccaacggttcaccgctgccaagctggctcacctttaattcggccacc
ggcaccttctccggcacaccgggcaatgcagatgtcggcaccctaagcattaaggtcatc
gccaacgatggtggggcatcgatcagcaccacctttagcctaaccgtcaccaacgccaac
gacgctccggtggtcgcgacgccgataccggcgcaaagtgtggtacaagatggcagtctg
aatttcatcattcccgcgggtactttcaccgatccggatggcgataccctgaccctgagc
gccacgctagctaacggctccccgttgccaagctggctcacctttaacacagccactggc
accttctccggcacaccggttaatgcggatgttggtagcctgtctatccgcgtcaccgcc
accgatggcagcaacgcctcggtatatacggatttcagcctgaccgtcaccaacgtcaac
gatgtgccagtggttggcacaccgataccggcacagagtatcgcgcaggatggtagcctg
aatttcaccgttcccgctggcacgtttatcgatcccgatggcgacactctgaccttgagc
gccacgctggctaacggctcaccgctaccgggctggattacctttaatccgactactggc
accttctctggcacgccaggcaatggcgatatcggcaatctgagcattaaggtcaccgcc
aacgatggtgatgcctcgatcagtaccaccttcagtctgacagttacgccagcgaaccag
gctcccgtagtatccacaccaatcccgccgcaaagtgtagtgcaggatggcggcttcaac
tttaccgtgcctgcgggcaccttcagcgatcccgatggcgataccctgacgctcagcgcc
accctcgctgacgggtcgccgctgccagtctggatcacctttaatccggccaccggcacg
ttctccggcacgccgggcaacgccgatgtcggtaatctgagcatccgcgtcaccgccacc
gacggcagtaatacctcaattagcaccagttttggcctgacggtgaccaacgttaatgat
gcgccagtggttggcacaccgataccggcacagagtatcgcgcaggatggtagcctgaat
ttcaccgttcccgctggcacgtttatcgatcccgatggcgataccctgacactgagcgcc
acgctggcagacggttcaccgctgccaagctggatcacctttaatccggccactggcacc
ttctccggcacaccgggcaacgccgatgtcggtaatctgagcatccgcgtcaccgccacc
gacggcagcagcgcggcggcacatacggatttcggcctgaccgtcaccaacgtcaacgat
gtgccagtggttggcacaccgataccggcacagagtatcgcgcaggatggtagcctgaat
ttcactgttcccgctggcacgtttatcgatcccgatggcgacactctgaccctgagcgcc
acgctggcagacggttcaccgctgccaagctggatcacctttaatccggccactggtacc
ttctccggcacgccgggcaatggtgatgtaggcaacctgacgatcaaagtcaccgccaac
gacggtgatgcctcggtcagcaccacctttagcctgacggtcactaacgttaacgatgct
ccagtggttggcaccccaatcccaccacaaagcgtggcgcaggatggtggctttaacttc
accgtaccggcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccacc
ctcgctgacgggtcaccgctgccgagctggctgcacttcgatcccaccatcggtaccttc
tccggcacgccgggcaatggtgatgtcggtatgctggtgatccgagtaacggccaccgac
ggcagcaatacgtccatcagcaccagctttggtctgacagtcactaacatcaacgatgcc
ccagtggttggcaccccaatcccaccacaaagcgtggcgcaggatggtggctttaacttt
accgtacccgcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccacc
cttgccaacgggtcaccgctgccgagctggctgcacttcgatcccaccatcggcaccttc
tccggcacgccgggcaatggtgatgtcggtatgctggtgatcagggtaacggccaccgac
ggcagcaatacgtccatcagcaccagctttggtctgacagtcactaacgttaatgaagct
cctgtggtatccacccctattccaccgcaaagcgtggcgcaggatggtggctttaacttt
accgtacccgcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccacc
ctcgccaacgggtcaccgctgccgagctggctgcacttcgatcccaccatcggcaccttc
tccggtacgccgggcaatggcgatatcggtacgttggtgatcagggtaacggccaccgac
ggcagcaatacgtccatcagcaccagctttggtctgacggtgaccaacgttaacgatgcg
ccagtggtgtccaccccgatcccgccgcaaagcgtggcgcaggatggtggctttaacttt
accgtacccgcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccacc
ctcgccaacgggtcaccgctgccgagctggctgcgcttcgatcccaccatcggcaccttc
tccggtacgccgggcaatggcgatatcggtacgttggtgatcagggtaacggccactgac
ggcagcaatacgtccattagcaccagctttggtctgacggtgacgcgcagcattgtaggc
ggcgatccgcagttcaaagccaacgacggtattggccggacgccgtcatcaagcgatgcg
cgccagttgtctacgcaggatgccacgacggcaccgccgacgttgaatggcctgattacc
aacccgtcgctcggcagtttcaccgtgggtaacgacggtgcaccaatgtcagtgatgtct
gccattttcgctaccggacgccagaacacagagggaggcaccataccggtcagccaggtt
gcgggcactttcggacgcggagtcgccagcggcattggcattaacttcgacagcacccta
ggctccttccccagctttagtaaagatcccgcactaggcggcacctcatcgctggctagc
gcattctcggggatctatctgccttcactgatgccaatggaggtcttctccggcggtagt
tggaagaacattccgatcgatagcgcgggcagcacaacgaatagcaccgatgacggcact
gggcgttccgtggcatttatgccctcgctgcatcagcaattacaacagataggtgactcg
gaactgcaacgtctggcagccattgagcaagcattgcaggaaagtggtcagcagcaaggg
taa
DBGET
integrated database retrieval system