Rickettsia canadensis CA410: RCA_01730
Help
Entry
RCA_01730 CDS
T01736
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
rcc
Rickettsia canadensis CA410
Pathway
rcc03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
RCA_01730
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
rcc03400
]
RCA_01730
Enzymes [BR:
rcc01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
RCA_01730
DNA repair and recombination proteins [BR:
rcc03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
RCA_01730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TRCF
DEAD
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
UvrB_inter
ResIII
RecG_dom3_C
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFB20923
LinkDB
All DBs
Position
405770..409129
Genome browser
AA seq
1119 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3360 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
