Rickettsia felis: RF_0367
Help
Entry
RF_0367 CDS
T00252
Symbol
mfd
Name
(GenBank) Transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
rfe
Rickettsia felis
Pathway
rfe03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rfe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
RF_0367 (mfd)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
rfe03400
]
RF_0367 (mfd)
Enzymes [BR:
rfe01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
RF_0367 (mfd)
DNA repair and recombination proteins [BR:
rfe03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
RF_0367 (mfd)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
TRCF
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
UvrB_inter
ResIII
MFD_D3
RecG_dom3_C
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAY61218
UniProt:
Q4UMJ0
LinkDB
All DBs
Position
384963..388391
Genome browser
AA seq
1142 aa
AA seq
DB search
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IK
NT seq
3429 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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ataaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
