Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_014370
Help
Entry
EHE19_014370 CDS
T07161
Symbol
pelA
Name
(GenBank) pectate lyase
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pec_lyase
Pectinesterase
Dockerin_1
C5-epim_C
SQHop_cyclase_C
DUF5680
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU66057
UniProt:
A0A4U7JHA2
LinkDB
All DBs
Position
complement(3583053..3586088)
Genome browser
AA seq
1011 aa
AA seq
DB search
MLRDGRKSALNLLGAIMLVFIFSSVVLAPKGVFASTPDWGSVLKNPDTWFGSSDGIKLAD
SIVQYQLSDGGWRKDMTESTSGSWGKSTIDNDTTTSQIIVLAKTYKQTNNSKYLNSCQRG
IDLLLNGQYSNGGWPQVFNDPGTYHAHITYNDNAMIHVMNLLTDVANKTGDFTFIDSNRA
SRASTAIQKGIQCILNTQITVNGVKTAWCQQHDEYSLKPTTGRAYEVPSISASESVGIVN
YLKTIKNPSAEITNAINSAIAWMAKVQIYGIKVVTTSNDRYIVNDPTAGPIWARFYEINT
NRPIFVDRDGSIHYQMSEISQERRAGYAWYGTWPSKLVKEANIYDIVVAKDGTGNYTTVQ
AAINSVPNNSAKRTTIYIKNGTYKEKMNIGSSKINITLIGQSKEGTILTYNDAASTPNSS
GGTLGTTGSASITVAGSGFQAENITFENSYDEARNGSSQAVAMLAKADKMIFKNCSFKGN
QDTLYANSGRQYYYNCYIEGDVDFIFGAATAVFYNCEVYSLNRSGGCVTAPSTKADQKGY
LFYKCKLTSSSATPKNISLGRPWIPSSDPNSITPKVLFRECELGNHISSAGWTSMSGNNP
ENYEMWEYLNTGAGSNPNRKQLPSSRASEYTMEKFLAGTDGWDPNITEEIEQPILEGKYI
KSLVVNDSPNAADWSVQSNLRVGDLVYGDRTVKFISMPDYLLGSEWIRTACDSKMFTTTE
ATFTPSTDIICYIGLDTRITSIPSWFSSWTNTGETFDNDGAVTFRIYKKSFPRGATVELG
TNGASSSVVNYVVIVQPQPISEGEYIKSLLVNDSTNAADWSIQSNLQVGDLVFGDRTVKF
ISMPDFLIGSEWIRTACDSKMFTSTEATFVPNIPITCYVGLDTRITSIPSWLSGWTNIGE
TFDNDGAVTFQIYMKSFPGGTIVELGTNGASSSVVNYVVIVKPDYPPMIIPGDVVPDGQI
DALDFAYIKKHLLGIELLTGDSYKAADIDNSGTVDAIDLALLKKALLEGIH
NT seq
3036 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaagagatggtagaaaatcagctttaaatctattaggagctataatgcttgtattt
attttttcttcagtagtactagctcctaaaggagtatttgcttctactcccgattggggc
agtgtcttaaaaaatcctgatacttggtttggtagtagcgatggaattaagttagcagac
agtatagttcagtatcagctttcagatggcggctggagaaaagacatgactgaaagcact
agtggttcatggggaaagtctacaatagataatgacacaaccacatctcaaattattgtt
ttagctaagacatacaaacaaaccaacaattcaaaatatcttaattcatgtcaaaggggt
attgatcttcttttaaacggtcaatattcaaatggtggttggccgcaggttttcaatgat
ccaggaacttatcatgcacatattacctataatgataatgctatgatacatgtcatgaat
ttactaacagatgtggcaaacaaaacaggggattttacttttattgattcaaatagagct
tcacgtgcaagtactgcaattcaaaaaggtatacaatgcatattaaatacacaaataact
gttaatggagtcaaaacagcatggtgtcagcagcatgatgaatactccttgaagccaaca
actggcagggcatatgaagtaccttccatttctgcaagtgaaagtgttggaattgtaaat
tacttaaaaacaataaaaaatccaagtgctgagataacaaacgccattaactccgctatt
gcatggatggcaaaagttcagatttacggaattaaagtggttactacaagtaatgacaga
tacattgtgaacgatccaactgcaggaccaatctgggcacgtttttatgaaatcaataca
aacagaccaatatttgtcgacagagatggttctatacattatcaaatgtcagaaatcagt
caggaaagaagagctggctatgcatggtatgggacttggccttctaagctagttaaagaa
gctaatatttatgatatagtagttgcaaaggatggaactggaaattatactactgttcag
gcggctataaatagcgtacctaataatagtgcaaaaagaacaacaatatacataaagaat
ggtacctacaaagagaaaatgaacataggctcctcaaaaataaatattacattaattggt
caaagtaaagaggggacaatattaacctacaatgatgctgcaagtactccaaattcttca
ggtggtacattaggaacaactggaagtgcaagtattacagtagcaggtagtggattccag
gcagaaaatataacttttgaaaattcctatgatgaagcgagaaatggcagcagtcaagca
gtagcaatgcttgctaaagccgataaaatgatatttaaaaattgttctttcaagggtaat
caagacaccttgtatgcaaatagcggcagacaatattactacaattgttatattgaggga
gatgtagattttatatttggagcagcaactgcagtattttataattgtgaagtttattct
ctaaataggagtggaggatgtgtcacagctccaagtacaaaagctgatcaaaagggttat
ctattttataaatgcaaattgacaagcagtagtgctacgccgaagaacatttctttggga
agaccgtggataccaagctcagatcctaacagtattactccaaaagtattatttagagaa
tgtgaactaggtaaccatatttcttcagctggttggactagtatgtcaggtaataatcct
gaaaattatgaaatgtgggaatacctcaatactggggctggctcaaatccaaatagaaag
caattaccttcatcaagagcgtctgaatatacaatggaaaagttccttgcaggtacagat
ggctgggatccaaacataactgaagaaatagagcagcctatattggaaggaaaatatatt
aagtccttagtagtaaacgattcaccaaacgcagctgactggtcagtacaatcaaattta
cgggttggggatttggtttatggagataggacagtaaaattcattagcatgccagattac
ctattagggtcagaatggattagaacagcttgtgattcaaaaatgtttacaacaacagag
gcaacctttactccaagcacagatataatttgttatattggattggatacaagaataaca
tctattccaagctggtttagcagttggaccaatacaggtgaaacctttgataatgatgga
gcagttacatttagaatatataagaagagcttccctcgtggcgcaacagttgaacttgga
acaaatggggcatcaagtagtgttgtaaattatgtagtcatcgttcaaccgcagcctata
tcggaaggagaatatattaagtccttattagtaaacgattcaacaaatgcagccgactgg
tcaattcaatcaaatttacaggttggggatttggtttttggagataggacagtaaaattc
attagcatgccagatttcctaatagggtcggagtggataagaacagcctgtgattctaaa
atgtttacatcaacagaggcgacctttgttccaaacatacctataacctgttatgttggg
ttggatacaagaataacatctattccaagctggcttagtggttggactaatataggtgaa
acctttgataatgatggagcagttactttccaaatatatatgaagagctttcctggcgga
acaattgttgaacttggaacaaatggggcatcaagcagtgtggtgaattatgtcgttata
gttaaaccagattatccaccaatgattatacctggtgatgtagttccagatggacaaata
gatgcactggatttcgcttatataaagaagcatcttcttggaattgaacttttgacaggt
gattcatacaaggccgctgatattgataatagcggtactgtagatgcaattgatttagcg
ttgctcaagaaggcgttattagagggaatacattga
DBGET
integrated database retrieval system
