Rhincodon typus (whale shark): 109919181
Help
Entry
109919181 CDS
T06055
Name
(RefSeq) lactase/phlorizin hydrolase
Organism
rtp
Rhincodon typus (whale shark)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109919181
NCBI-ProteinID:
XP_048455197
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(67696517..67745348)
Genome browser
AA seq
1436 aa
AA seq
DB search
MELHRSIFFFIVFIGFSGAEIKLSSDFMVIAGPLTNVLVKNLAEDEKKDQKNNFSVEEEA
QYFCQDPLSRHLKDYLSNLHKKGVSHYKVILPWTKILPEGTSDKMDNDLIKCHSNLLNEI
IIANLKPLLVLHDSGMPHELIEKYGGWENEALVDLFVDYVRFAFATFGDKVETWITFDNP
SELIKSKHKLQHTGSLAIKNIIRAHEKVYGIYHNEMQYKEGTLSIVLNINDVISTDDMFQ
TFRQVINEGMVDLIAVAVLDDCLSNHKSINKHLQILIFSLDFSQCAVSAIGSTEYNRATF
TEVVKALNNNEVSMIGYDVSHFLDHLPLHYQRSNLDNESNFSPMEEGSEDELAEHNSDIQ
LHRTSRLSAYETVWEKFSVQSNAERDSFLIGTFPSTFLWSTATASFKIEGGWAEQGKGEN
IWDRFAHEGKVEKNQTADIACDSFHKIDYDVYLMRGLQINSYKFSLSWSRIFPTGNRTKQ
NQDGIDYYNKLIDSLLESNIQPMVTLYHWDLPQALQDIGGWQNEDIIKAFSDYADFCFAT
FGDRVKYWITFNEPWVVSYAGYGTGQHAPGISDPTNASYKVAQSIIKAHANAWHTYDKNY
RSQQHGQVGIALNSDWAEPSSPNKPEDVQTADRYLQFMLGWFAHPIFVNGDYPETLKAQI
KKYNQECPSAPVHFPSFTEKEKQYINGTSDFFGLSHYTSRLVKSTTNKICVSDYNRIGDF
SPQVDNSWHSTVSPWIYIVPWGLRRLLNFVTHEYTGTNIPIYITGHGIPTEYAGLDIVND
TIRIESIAAYINEALKAYKLDNVNLKGYAATSLLDSFEWVNGYTFQFGLHHVNFKDPNRQ
RTPKRSAHYYSEIIHGNGFPPQKEDEFIYGEFPKDFAWSAATAAYQIEGAWRADGKGLSI
WDTFSHTPLKVGNDDTGDIACDSYHKIDEDLAILKQLKVNHYRFSLSWSRILPKGTTRYV
NDVGLNYYIKFIDGLLAANIKPQVTLYHWDLPQALQDVGGWENSSTIDRFVEYANFCFQR
LGDKVKFWITLNEPYNTALLGYGYGTAAPGIGTRLGSAPYIVGHNLIKAHAEVWHLYNET
YRPQQGGLISITINSDWVEPRNPYKQEDVDAAKRHLMFYGGWFAYPIFKNGDYNEVMKAR
VREKSLAQGLPKSRLPEFTESEKQRIKGTYDYMGFNHYTTVLAFNVNFGNAIPMYDADRG
TGTTVDRSWLSSGSFWLKVTPWGFRRILNWIKKEFNNPPIYLTENGISEHGDKGLNDTWR
INYHKNYINEVLKAIKLDGINIRGYTAWSLMDNFEWAMGYADRFGLFYVNYSNPSLPRIP
KASSKYYSTIIHCNGFPDPALGPHECLQLEATSVKPSSAKPLPTTTPTNTGRVHFLGLQL
STVNATSALYTLFAILLVAVVLLALFSHKIWKTRKANIPKSPSYTNELSINHNTNF
NT seq
4311 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagctacacaggagtattttcttcttcatagtttttataggtttctctggtgcagaa
ataaaattatcgtctgattttatggtaatcgctggtccgttgacaaatgttctggtgaag
aatttagcagaagatgaaaagaaagaccagaagaacaacttcagtgtggaagaagaggca
cagtacttttgccaggaccctctttcaaggcaccttaaagattatctttccaatctacat
aaaaaaggagtttcccattacaaagtaatccttccctggactaaaattcttcctgaaggt
acatctgataaaatggataatgatttaataaaatgccattcaaatctcctaaatgagata
ataattgcaaatctcaaacctttgctggttctgcatgacagtggcatgcctcacgagctg
attgaaaagtatggtggctgggagaatgaagcacttgttgatttatttgtggactacgtg
cgatttgcatttgcaacttttggagataaagttgaaacctggataacatttgataaccct
tcagaattaataaaatccaaacataagctgcagcacactggatctttggcaatcaagaat
ataatccgtgcccatgaaaaggtttatggaatttatcacaatgagatgcaatacaaagaa
ggaacattgtccattgttttgaacattaacgacgtcatttctacagatgatatgttccag
acatttcggcaagttatcaatgagggaatggtggatttgattgctgttgctgtattagat
gattgcttatcaaatcacaagagcatcaacaaacatttacagattttgatctttagctta
gacttttcacaatgtgctgtgtcagccataggcagcacagagtataacagagctacgttc
actgaagttgtaaaagctctaaataataatgaagtgtcaatgattggctatgatgttagt
cacttcctggaccatttgccacttcattaccaaagaagcaacttggataatgaaagcaac
ttttctccaatggaagaaggaagtgaagatgagctggcagaacataacagtgatatccaa
cttcatagaacatctcgcctttcagcttatgagactgtttgggaaaagttttctgtacaa
tcaaacgcagagagggactccttcctaattggtacttttcccagtacttttctatggagc
acagctactgcctcatttaaaattgagggaggctgggcagaacaggggaaaggagaaaat
atttgggacaggtttgctcatgagggaaaagtagaaaaaaaccagacagcagatattgcc
tgtgatagcttccataaaattgattatgatgtttatttaatgagaggtttacaaattaac
tcttataagttctccttatcatggtctagaattttcccgacaggcaatcggactaaacag
aaccaagatggaatagactattacaacaaattaattgacagcctgttggagtccaatatt
cagccaatggtaactttatatcattgggatcttccccaagctctgcaagatattggtgga
tggcagaatgaggacatcataaaagcatttagtgattatgcagatttttgtttcgctacc
tttggagaccgtgtgaagtactggatcacatttaatgagccctgggtagttagttatgct
ggctatggcacaggacagcatgcacctggaatcagtgatccaactaatgcatcctataag
gtggcccaatctataatcaaggcccatgccaatgcttggcacacttacgacaaaaactac
cgttctcagcagcatggtcaagtaggaatagcattgaattcagactgggctgaacctagc
tcccctaataagccagaagatgttcaaacagctgatcgatacctgcagtttatgttgggc
tggtttgctcatccaatctttgttaatggtgactatccagaaaccttaaaagctcagata
aaaaaatataatcaggaatgtccttctgctcctgtccattttccgtcatttacagaaaag
gaaaaacaatacataaatggaacttcagatttttttggactcagtcactacacctctcga
ctagtcaagtctaccaccaacaaaatatgcgtttcggattacaaccgtattggagacttt
tctccacaggttgacaattcatggcactcaactgtatctccatggatatacatcgtgccc
tggggcttaagaaggttattaaattttgttacccatgagtatacgggtaccaacattcca
atttacataacagggcatggaattccaacagaatatgctggccttgatatcgtaaatgac
accataaggatagagagtattgctgcctacattaatgaagcactaaaggcttacaagttg
gataatgttaaccttaaaggatacgcagctacatcccttctggacagtttcgaatgggtc
aatggttatacttttcaatttggactgcatcatgtcaacttcaaagatcctaacagacaa
agaactcccaagaggtcagcacattattattcagaaataattcacggcaatggcttcccg
cctcagaaagaagatgagttcatttatggagaatttccaaaggattttgcatggagtgca
gctactgctgcctatcagattgaaggagcttggagagctgacggaaaaggacttagtata
tgggatacctttagtcatacgcccttgaaagtaggcaatgatgatactggagatatagcc
tgcgatagctatcacaagattgatgaagatttggctattctgaaacaactgaaagtcaac
cactatcgcttttccctatcctggtctcgcatccttccaaagggaaccacaagatatgta
aatgatgttggattaaattattatataaagtttatagatggtcttcttgcagccaacatt
aaacctcaggtcaccctttatcactgggatttacctcaggctctgcaagatgttggtggc
tgggaaaatagtagtaccattgaccgatttgtggaatatgcaaacttttgctttcaaaga
ttaggtgacaaggtcaagttctggataaccttgaatgagccttacaacacagcacttctt
ggttatggctatggcactgcagcaccaggtattggcacaagattaggcagtgcaccttat
atagttggtcacaatctaatcaaagcacatgctgaagtttggcacttgtacaatgaaact
tacagaccacaacagggagggctaatctccattactatcaactctgactgggttgagcca
aggaacccatataaacaggaagatgtagatgctgcaaaaaggcatttgatgttttatggt
ggttggtttgcatatccaattttcaaaaatggtgactacaatgaagtgatgaaagcacgt
gtgagagagaagagtttggctcaaggtttacctaaatctcgacttcctgaattcactgaa
tctgaaaaacagagaattaaaggaacatatgactatatgggatttaatcactacaccaca
gtcttggcttttaatgtcaattttggaaatgctatcccaatgtatgatgccgacagagga
acaggaaccacagtagaccgcagctggcttagttctggatcgttctggctgaaagtaact
ccttggggttttaggagaattcttaactggattaagaaagagttcaacaaccctcctatt
tatctaacagaaaatggaatttcagagcatggtgacaaaggcctcaatgatacctggagg
atcaattatcataaaaattatataaatgaagttttaaaagctattaaacttgacggcatc
aacatccgtggctacacagcatggtcactgatggataactttgaatgggccatgggatat
gcagacagatttggcttattttatgtcaattactccaacccttctttacctcgtattcct
aaagcttcaagtaaatattattctacaattattcattgtaatggctttcctgatcctgct
ttgggacctcatgaatgtctccaattagaagctaccagcgtgaaaccctcatcagcgaaa
cccctaccaacaaccacaccaacaaacactggaagggttcattttctgggattacagcta
tctactgtgaatgccacaagtgctttatatactttgttcgccattttactggttgctgtt
gttttgttggctctcttttcacataaaatttggaaaacaagaaaagcaaatatacctaaa
tcaccttcatacacaaatgagttatcaataaatcataacactaacttttga
DBGET
integrated database retrieval system