Runella sp. SP2: DTQ70_13745
Help
Entry
DTQ70_13745 CDS
T05690
Name
(GenBank) TIR domain-containing protein
Organism
rup
Runella sp. SP2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TIR_2
Roc
TIR
Ras
Arf
Gtr1_RagA
DUF4062
GTP_EFTU
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYQ33154
UniProt:
A0A3G3GRD0
LinkDB
All DBs
Position
3266555..3270163
Genome browser
AA seq
1202 aa
AA seq
DB search
MNELTSFLDTQGFTKAAKIDTLKVTLSPVKHEDDNVDIPSPDKRYYWDGKVFGLHVSNVE
WEASVWDTLIALLTKNKAKIEVLYLGNTDREGLSVASFPALHYLNLFANHRIKTLTLKDC
PQLASLRTYGCDVLQKIELRGTFLKLEKLDVSYCPSLDELIFPTHFPKLRFLHAIETKLE
NDYITLGGYFDGELREKISVVRRQNSITTLLKPLEQEIDVLLSENINYDEFGNIIFLDLG
HLGLSKLPESLFKIQTLEHLCLGSYYPQELNEFTNVTYVASKYSKEYPNRNNKFISESLK
NLAQFENIKSLFLNSIGLNNLDFLKGISALVSLDISGNTSLINFSSLLNLKELKLFHASS
IPSLTNENLKLPKHTINLSLSNCHLESMVFLNDLENPQIVFLDGNKIETKELIDFIWSEG
KLLEKNFNFITNTIPIYKGIYIQNNPIDEGFLRLFDETDNIKKTELIINYIKNYFKEDEE
IKVKFIKLILIGNTRAGKTTLYDIITQNTPAKSDEPSTHGVNIFQIDEEKEEERFIIKGY
DFGGQDYYHSTHWAYFSTNNTVYSLVFRSDWEDKFYIHDNELTYPLDYWLDSIRKISRIE
NNASTIDDIHVQLIQNKYGEAIQDLNVKSTKESFKELNIVYYKDNEHNLKDILKGSDSGY
REKFLQNLRGKAQIRGIQKKQLEFIKFLKEKTDLGILPRKIVFEYNEKLEWIEAALKNAH
NTYDIIDLKGNKNASEYQFLKDYIITDISKFNNYIFLILERGGDAYFTEDDARDKIENQP
TIEFQKKGLVSFLADVNYLKFVIEFIQLYKIAFKLPNENGKYLAPAFLSEKLSKPEELFI
KTFQKPIFEYRFRAFYHGNIFTEIVLEFIKELLKENKWMYLLKKNHVFLHDKNETRFLYV
NFGLDKKENFPILKIYNHSLYGVSDTFIEKTHKNLDKIMNFPIFPDNIESESEEEKRRIE
EEFEIKLKDFTIEKIVYNKYKEALGFKELICQKNMSENNKDSQSIYYQSKFFRKGDYKLF
LPKHKQIKYPMKKIFISYSKFDEKYKEELKSHLITLKRRDLIETFDDRDIESGDKFDHVI
KQKIKDCDVFICLISVNFLNVDYIIEQEIPLAISEGKTVLPIVIKPCDWYEMPLFKGIED
KSLNLGAFNAHDKATILTLRPEYKGKRDEQGNKQIKEFTETERDFMWFQVVEEIKKIIAR
TT
NT seq
3609 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgaattaacctcctttttagacactcaaggatttacaaaagcagcgaaaatcgac
acgctgaaagtaaccctttctcccgtcaaacatgaagatgataatgttgacattccaagc
cccgataaacggtattattgggatgggaaggtgtttgggttgcatgttagtaatgtagag
tgggaggctagcgtatgggatactctgatagcgttgctcactaaaaataaagccaagata
gaagttttatacttgggtaataccgatagagagggactaagtgtagcgtctttcccagca
cttcactacttaaacctttttgccaaccataggattaagacattaaccctcaaggattgc
ccccaattagcaagcctcagaacctatggttgtgacgttttacaaaaaatagaattaaga
ggtacttttctaaaattagaaaagttggatgtgtcgtactgcccaagccttgatgaactg
attttccctactcactttccaaaactccgttttcttcatgctatcgaaaccaaactggaa
aacgattacataactttgggggggtatttcgatggggagttgcgggaaaaaatttcagta
gttagaagacaaaacagtattacaacattattaaaacccttagagcaggaaattgacgta
ttactttctgagaatattaattacgatgaatttggcaatatcattttccttgatttaggg
catttggggttatctaaattacccgaatctttgttcaaaattcaaaccttagaacactta
tgtttaggctcttattatccacaggagttaaacgaattcaccaatgtaacctatgtagca
tcaaaatattctaaagaatatccaaacagaaacaataaatttatctccgagtctttaaaa
aacttagctcaatttgaaaatataaaaagtttattcttaaactcaattgggctaaacaat
ttagattttttaaaaggaatatccgccttagtaagtttagatatttcgggcaacacttca
ctaattaatttttcctctttattgaatctcaaagaattaaagttatttcacgcctcttca
attccatcactaactaatgagaatttaaaattaccaaagcatactattaatttatcatta
agtaattgtcatttagaatctatggtttttttaaatgatttggaaaaccctcaaatagtt
tttttagatggaaataaaatagaaaccaaagaattgattgattttatttggtcagagggt
aagcttctagaaaaaaattttaattttattacgaatactatccctatatataaaggcata
tatatccaaaacaatcctatcgatgaaggatttttgaggttatttgacgaaacagataac
attaagaagacagagttaataataaattatatcaaaaattattttaaagaagacgaggaa
ataaaagtaaaatttatcaagctcattctaattggaaacactcgtgcaggaaaaactaca
ctttacgatattatcactcaaaacacccctgctaaatcggacgagccttctactcatggt
gtaaatattttccaaatagatgaagagaaagaggaagaacgttttataattaaggggtac
gactttggtgggcaagactactatcatagtacgcattgggcttattttagcactaataac
acggtttacagcttagtttttcgcagtgattgggaggataaattttatattcatgacaat
gagttaacctatccacttgattattggttagattccattcgaaaaatttcaagaattgaa
aataatgcttctaccatcgatgatattcatgttcaactcattcaaaacaaatacggagaa
gcaattcaagacctaaatgtaaaatctactaaagagagtttcaaagagttaaatatcgtt
tattacaaagataacgagcataatcttaaagatattttgaaaggttccgattcagggtac
cgtgaaaaatttcttcaaaaccttagaggtaaagctcaaattagaggtattcagaaaaaa
caattagagtttataaagtttttgaaggagaaaaccgatttaggtattttacctcgaaag
atagtatttgaatataatgaaaaacttgaatggattgaggcagccttaaaaaatgctcat
aatacctatgatattattgatttgaaaggtaataaaaacgcaagtgaatatcaatttctg
aaggattatattatcacagatatttctaaatttaacaactatattttccttattttagaa
cgcggaggagacgcttatttcactgaagatgatgcaagagacaaaatagaaaaccaacca
acaattgaatttcagaaaaagggattagtttcatttcttgcagatgtaaactaccttaaa
tttgtaatagaatttatccaactatataaaattgcctttaaactgccaaatgaaaatggc
aaatacttagcccctgcatttttatcagaaaaactaagtaagccagaagagttatttatc
aaaaccttccaaaaaccaattttcgagtatagatttcgtgctttttaccatggaaatatc
tttactgagatagttttggagtttattaaagagttgctcaaagaaaataaatggatgtat
ttattgaagaaaaaccatgtatttctgcatgacaaaaacgaaacaagattcctgtacgta
aacttcggtttagacaaaaaagaaaattttcctattttgaaaatatataatcatagttta
tatggtgtgagtgacacctttatcgaaaaaacgcataaaaatttagataagataatgaat
tttcctattttccccgataatatagaatcagagtcagaggaagaaaagaggaggatagaa
gaggaatttgaaataaaattaaaagattttacgattgagaaaatcgtatataacaagtac
aaagaagctttagggtttaaggaacttatatgtcagaaaaacatgagtgaaaataacaaa
gacagtcaatctatttattatcaaagcaaattttttagaaagggagattataagcttttt
ttaccaaaacacaaacagataaaataccctatgaaaaagattttcatttcatactcaaaa
ttcgatgaaaaatacaaagaggagctaaagagtcacctgataacattaaaaagaagggat
ttaattgagacattcgatgatagagacattgaatcaggcgataagtttgaccatgttatc
aaacagaaaatcaaagattgtgatgtttttatctgtttgataagtgtcaattttttgaat
gtagattacatcatcgaacaggaaatacccctagccatttcagaaggaaaaactgttctc
cccattgttatcaagccatgtgattggtacgaaatgcctttatttaaagggattgaagat
aaaagcctaaatttaggtgctttcaatgcccatgacaaagccacgattttaacattaaga
cccgaatataaagggaaacgagatgagcaagggaataaacaaatcaaagaatttaccgaa
actgagcgtgatttcatgtggtttcaagtagttgaggaaataaaaaaaattatagcaaga
acaacttag
DBGET
integrated database retrieval system
