KEGG   Shewanella bicestrii: CF168_00865
Entry
CF168_00865       CDS       T05197                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
sbj  Shewanella bicestrii
Pathway
sbj02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sbj00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    CF168_00865
SSDB
Motif
Pfam: He_PIG Big_9 Cadherin_5 DUF4347 Cadherin_4 fn3 OMP_b-brl Cadherin_3 OmpA_membrane Big_5 PKD_4 MCM
Other DBs
NCBI-ProteinID: ASK67522
UniProt: A0A220UHZ2
LinkDB
Position
188650..197619
AA seq 2989 aa
MANKILTGLSSLLLPFGLYGAPVQLSSGYSRSYLSATAQGNLLPVSTAASSKVLRGLAPE
KANDLDIIGAYLVKELVVIDSAVPDKQLFYRGLKPGIDIVEIDSSQSGVRQLKTILAKYH
DLTAIHIVSHAQEGALLLGNSHITAENIKKEMEVFAALNGAVREGGDLLFYGCELAANAA
GEELLDIVQHNTHLDVAASNNLTGDARQHGDWNLEIQRGHIETELAFTEKALKDFSAVLG
QYTPLNFCPDGYSFNVPSVTSTDTHYTITTSPNRLYCARFGQVGYSIPMPSTHTITVTGS
NGVFNLSQLQIGGGTCPTNKVYGYNSNSLVASSTNNPPDPTNFKTDINMSAFSGIAIDKF
VIKLSSCAGSSGIASFTVPDPDNTPPTVNSVNSSVANATYKVGDVIGVRVNFSEVVNVIG
TPQLTLETGSTDRVVNYSSGTGTSALLFNYTVQAGDTTSDLDYVTTNPLSLNGGSIKDAA
ANNATLTLPSPGAANSLGANKNIVIDGVVPTVSSVTSSTSSGTYKAGDVISIQVNFSETV
NVTGTPQLTLENGSSNRTVNYSTGSGTSSLTFSYTVQAGDISSDLDYVATNSLAPNGGTI
KDAAGNNATLTLASPGAANSLGANTAIVIDAVTPSVTSIAPSGGAVSTDTSVDFTVNFSE
SVSNISTDDFSLVTTGGAMGTIASVSASTGSSVTVTVSGISGNGSIKLNLNGSTNISDAA
GNSGPAAYSSGTTHTVAIPTAPSAPTIGTATAGDGQANVTFTAPGSNGGSDITTYTATAN
PGGATGNCAGPAACTITVGSLTNGTAYTFTVTATNAIGTGLASGSSNAVTPKADQIITFA
QPANYNFGATPTLTATSNSGLTVSFSSSTSGVCTITSGGALTFVTAGTCTIDADQSGNAA
TNAAMTVTRSFAVNAVTPTAPTIGTAIAGNTQASVSFTAPVSNGGAAVTGYTVTSNPGGF
IGSGTSSPIAVTGLTNGVSYTFTVTATNSVGTGSASAASNSVTPVSPQTITFTNPGAQSF
GSSPTLVATSDSGLTTTFTSSTTGVCTITTGGTLTFVTAGSCTINADQVGNSSYLPATQV
SQTFTVNPALPSVPTSVTATAGNAQASVAFTAPVNTGGTSITGYTVTVSPADVAPINGSG
SPIVVSGLTNGQAYTFTVTANNSAGTGPASAASNSITPKATQIITFNNPGAQNFGSSPMF
SATSDSGLSPTFTSSTTGVCTITSLGAVTFVTAGTCTINVDQSGNASYLPATQVSRSFTV
NAVVPGAPVIGTATAGDAQASVSFTAPGFSGGTAVTGYTLVSTPGGITASGASSPITITG
LTNGTSYSFTVAATNSAGLGSASAASNTVKPNGAPVINGTPTLTVNQGALYNFAPVATDS
LGDSLTFSINQTISWLTFNSVTGALSGTPSNQDVGVINGIVISVSDGSLSASLPPFDLRV
INVNDAPTISSTALTSATQDAAYSYTLVATDSDVGDSLTLSAVTLPSWLSFNAATGVLSG
TPTNANVGSHAVVLRATDGDGLTFDQSFTIVVANVNDAPTISSTALTSATQDAAYSYTLV
ATDSDVGDSLTLSAVTLPSWLSFNAATGVLSGTPTNANVGNHAVLLRATDVDGLTADQSF
TIVVANVNDAPTISSTALTSATQDAAYSYTLVATDSDVGDSLTLSAVTLPSWLNFNAATG
VLSGTPTNANVGSYAVVLRATDGDGLTIDQSFTIVVANVNDAPTISSTAITSATQDAAYS
YTLVATDSDVGDNLTLSAVTLPSWLSFNAATGVLSGTPSNANVGNHAVLLRATDVDGLTA
DQSFTIVVANVNDAPTISSTALTSATQDAAYSYTLVATDSDVGDSLTLSAVTLPSWLNFN
AATGVLSGTPTNANVGSHAVVLRATDGDGLTIDQSFTIAVANVNDAPVATNQTVTLEEDS
SLMITLAAEDVDNDPLTYEITAQPTSGTLEQHGSVWLYTPEKDFNGTDSIGFIAKDAELS
SEPATVTVTVTPVNDDPQAVDDSYILTSTPNDTYSLAVLANDVDVDGDNLTIDGAAADIG
SVQITSDGLSFTAPEAYVGPVALRYTISDGNKGRATAKVNVLIEGADSANQPVITLPDDV
EVNATGLFTRVKLGFAKAVDRNGHPLPVSLVNKSLFFAPGNYLAYWQAVDGEGNKAIKAQ
KVKVNPLISLSKDQVVAEGNQVTVSVHLNGEAPSYPLSIPYTVSGSADSSDHDLVDGVVE
ITSGQMAEIHFTTLNDGVTEGNEEVLISLDSSLNLGSKQQTQVVITEANIAPQVSLAVTQ
AGQQQVIVAQNGGDVHIRATASDANEQDTLTLTWASGALSLQADATGMTFSPAPVSPGIY
PVSLTVTDDGSPVLSSTETVYIVVRPSLAALTSADTDGDLIPDDQEGYSDSDRDGIPDYL
DANNDCNVMPEGELQPVYFLAEGQAGVCLRLGNIALSRGQSGVQLQPEAVAEDALAANVG
GIFDFIATGLPQQGQSYSLVLPQRSPVPANAVYRKFNAQAGWRDFVIDANNIVASTEGER
GFCPPPGDSRWTPGLTEGHWCVQLTIEDGGPNDDDGVANRTIVDPSGVAVMLNGNHLPVA
NPDSAAIAWNQSIDVNVLANDTDSDGDSLSVTQVISEFGTVTVLADQRISYTPAADFIGT
DVLVYSITDGKGGTASSELTIVVNGNTAPVTVDDSAATDDRTSLLIDVLSNDTDVDVNTL
TLLSATAQQGTVTIEANKLRYIPKTGFDGVDTVTYRISDGQGGEATGQVLITVKAYQEVI
IDNKSGGGSMTLWALAFILACAMLRRRELQRLALGCLLLLSVTQQAQATDWYVEGFIGQA
QADKTLPELNTQVGEGQLLNVDDSDTAFGVSLGYQWTPTVALELGYADFGEGSARIKGAT
LTPEQYHELVKTVTPVLADGVTLGLRFTLLQHQGWRFEVPVGLFHWQADISSTMGNTTIK
TDLDGTDWYAGVRFSYQFSDAWSVGLGYQYIDIEPNDLLSYQLNLRYQF
NT seq 8970 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaaacaaaattcttaccgggttgtcttctctgttgcttccctttgggctttatggc
gcgcccgtgcagctttcttctggttattcacgttcgtatctttcggctacggctcaagga
aacctacttccagtaagcactgctgcatcttcaaaggtgctacgcggattagcgcctgaa
aaggctaacgacctagatataattggtgcctacctcgttaaggagttggtggttattgat
tctgctgtaccggacaaacaactcttttatcgtggccttaaacccgggattgatattgtt
gaaatcgattcgagccaatctggggtacgtcaactaaagactattctcgctaaatatcat
gaccttactgcaattcacattgtctcccatgcgcaagagggagccttgttactcggtaac
tctcatatcactgccgagaatatcaagaaagaaatggaggttttcgctgccttaaatggt
gcagtacgcgaaggtggtgacctgctgttttacggttgtgagttagcggcaaatgctgct
ggtgaggagttgctggatatagttcagcacaacactcatctggatgtggctgcatcaaac
aatttaactggagatgcacggcaacatggtgactggaacttagaaattcagcgcggtcat
attgagactgaactggcctttaccgaaaaagcgcttaaggatttttctgcggtcttaggc
cagtatacgcctttgaatttttgtccagacggatatagttttaatgtaccgagtgtcact
tctacagatacacactacactattacaacctctccaaatcgtttatattgtgcccgattc
ggacaagtgggttactcaattccaatgccatccacacacactattaccgtgactggcagt
aacggagtttttaatcttagccagcttcaaataggcggtgggacttgtccaactaacaag
gtctacggctataacagtaactcattagttgcttcgtcgactaacaatcctccagatcct
acgaactttaaaacagatattaatatgtccgcttttagcggaatagctatcgataagttt
gttattaaactctctagctgtgctggttcatcgggtatcgcctcatttaccgtgcccgat
ccggataatacgccgccaacagtaaattcagtaaattcgagtgtcgcaaatgctacgtac
aaagtgggtgatgtcattggtgttcgggtgaactttagtgaggttgtaaacgttattggc
actccacagttaacccttgaaactggttcaacagatagggtagtgaattattcaagtggt
acagggacaagtgcactgctctttaattatacggttcaggcaggggataccacgtccgac
ttggattatgtgacaacgaatcccctgtcactcaacggcggttctatcaaagatgctgcg
gccaataatgcaacactgacattaccatctccgggggctgccaactctctaggggccaat
aaaaacatcgtcatagatggcgtggtgcctactgtgtcctcggtcacgtcaagcacaagc
agtggcacttataaagctggtgatgtgattagtatccaggtgaatttcagtgaaacagtc
aatgtgaccggtacaccgcaactgacgctggaaaatggatcaagtaataggactgtgaac
tattcgactgggtcaggtactagttcgctcacattcagttacacagtacaagcgggagat
atctccagcgatctggattatgtggcaacaaattcccttgcacccaatgggggtacaatt
aaagatgctgcaggtaacaatgcgactttaactcttgcatcgcctggagcagcaaactcc
ttaggtgcgaatacagcgatagtgattgacgcggtgacaccttcggtgacgagtatcgcc
cccagtggtggagcagtatcaactgataccagtgtggatttcacggtgaacttcagtgag
tcggtgagcaatatttccaccgatgatttcagcttagtaacaactggcggtgcaatgggc
acaattgccagtgtgtccgctagtacaggttccagtgtgacagtgacggtcagtggtatc
agtgggaatggctcgatcaagctcaatctgaacggttcaacaaacatttcagatgccgca
ggtaattcaggtcctgctgcctatagcagcggtacaacccacacggtcgcaattcctact
gcaccaagtgcacctacgataggtacggcaacagcgggggatggtcaagcaaacgtgacc
ttcacagctcctggcagtaatggtggttcggatattaccacttacaccgcaacagctaat
cctggaggggcgacaggaaactgtgctggtcctgcagcctgcaccattacagttggatca
ttaactaacggtactgcctataccttcactgtaactgcgaccaatgctattggaactggc
ttggcatcagggagctcaaatgcagtaactccgaaagctgatcagatcattacttttgcg
caacctgccaattataactttggtgctacaccaacgctgacggcgacttctaattcagga
ctgacagtaagtttctcgtcgtcaacctcaggcgtttgtactatcacttccggtggcgcg
cttacctttgtcactgccggtacttgtactatagatgccgatcaatccggtaacgctgcg
actaatgccgctatgacggttacgcgttcgtttgctgttaatgcggtaacaccgacggca
ccaacaatcggtactgcaatcgcagggaatactcaagcatcggttagctttaccgctcct
gtaagtaatggcggtgcagcggttacgggttatacagttacctctaatcccggtggtttt
attggatcaggaaccagctcgccaattgctgttactggtttgacaaatggagtgtcctat
acatttaccgttaccgcgaccaactctgtcgggacaggttctgcttccgcagcgtccaat
tctgttactccagtgtcacctcagacaattacttttacgaatcctggtgcacagagtttt
ggttcctcgccaactttagtcgcgacatccgactcagggttaacaacgacttttacttca
tcaactacaggggtttgtactatcacaacgggcggaaccctgacgttcgttacggctggt
tcttgcaccattaacgctgaccaagtgggtaattcatcctacttgcctgcaactcaagtt
tcccaaacctttacagttaatcctgcattgcctagtgttcctacaagtgtaactgcgacg
gctgggaatgctcaggcaagtgtggcctttaccgctccggtcaatactggtggcacgagt
attacaggttatacagtaacagtcagccctgcggatgttgcaccaattaatggttcaggt
tcaccgatagtagtgtcgggtttaactaacgggcaggcttatacttttactgtcactgct
aataactcagcaggaactggtcctgcatcagcagcatccaactcgataacccccaaagcg
actcagatcattactttcaataaccccggtgcgcagaactttggttcgtcaccaatgttt
agtgcgacttctgattctggtttgtcaccgacctttacttcatccacaactggtgtctgt
acgatcacaagccttggtgctgttacattcgtcactgcgggaacttgtactattaatgta
gatcagtctggtaacgccagttatttaccagcgactcaagttagtcgttcctttacagtg
aatgctgttgttcctggtgcgccagtcattggcacggcgacagcgggtgatgctcaagcc
tcggtgagttttaccgctccaggatttagtggtggtacagcagttacgggatatacctta
gtctctactcctggtggtattaccgcatcgggtgcttcttcacccatcactattacggga
ttaaccaatggaacttcctattcatttactgtagctgcgacaaattcggctggtttaggt
agtgcttcagcggcaagtaacacagtaaaacccaatggcgcaccagtcattaatggcaca
ccaacgttaaccgttaaccaaggtgcgttatataacttcgcgccagtagcgactgattcc
cttggagatagtctaacgtttagtattaatcagactatttcatggctgacctttaatagc
gtaacgggagctttatctggcacaccttctaatcaagatgtgggtgtgattaacggtatt
gtgatcagtgtgtcagatggttcactgtctgccagtcttcctccctttgatctgagagtg
attaacgtcaacgatgcaccgaccatcagttcaacggcgttaacgagtgccactcaagat
gctgcctatagctacaccttggtggcgacggacagcgacgtgggcgacagtctcacctta
agcgccgtgacactgccaagctggctgagcttcaatgcggcgacgggcgtgctgagtggt
actccgactaacgctaatgtgggtagtcatgcagtagtgttacgcgccacagacggagat
ggtctgacgtttgaccagagctttacgattgtggtggcgaacgtcaacgatgcaccgacc
atcagttcaacggcgttaacgagtgccactcaagatgcggcctatagctacaccttggtg
gcgacggacagcgatgtgggcgacagcctcaccttaagcgccgtcacactgccaagctgg
ctgagcttcaatgcggcgacaggcgtgctgagtggtaccccaactaatgctaacgtgggt
aaccatgcggtattgctacgagcaacggatgttgatggcttaaccgcagaccagagcttt
acgattgtggtggcgaacgtcaatgatgcaccgaccatcagttcaaccgcactcaccagt
gccacccaagatgcggcctatagctacaccttggtggcgacggatagcgacgtgggcgac
agtctgaccttaagcgccgtgacactgccaagctggctgaacttcaatgcggcgacaggc
gtgctgagtggtaccccaactaatgctaacgtcggcagttatgcggtagtgttacgcgct
acggacggagatggtctgacgattgaccagagctttacgattgtggtggcaaacgtcaac
gatgcaccgaccatcagctcgacggcaataacgagtgccactcaagatgcagcctatagc
tacaccttagtggcgacggacagcgatgtaggcgacaatctcaccttaagcgccgtcaca
ctgccaagctggctgagcttcaatgcggcgacgggtgtgctgagtgggactccaagtaat
gctaacgttggtaaccatgcggtattgctacgagcaacggatgttgatggcttaaccgca
gaccagagctttacgattgtggtggcgaacgtcaatgatgcgccgactatcagttcaacg
gcgttaacgagtgccactcaagatgcagcctatagctacaccttggtggcaacggacagc
gatgtaggcgacagtctcaccttaagcgccgtcacactgccaagctggctgaacttcaat
gcggcgacgggcgtgctgagtggtactccaactaacgccaatgtcggcagtcatgcggtg
gtgctacgtgccacggacggggatggtctgacgattgaccagagctttacgattgcggtg
gcaaacgttaacgatgcaccagttgctaccaatcagacagtaacgctagaagaagatagt
tcgctgatgatcacgcttgccgctgaggatgtcgataatgatcctctgacctatgagatc
accgcgcaacctacctctggtaccttagagcaacatggtagtgtctggctctatacacct
gagaaggattttaatggtactgattctattggctttatcgctaaagatgcagagttaagc
tcagagccagcgactgtcacagttacggttacgccagtgaacgatgatcctcaagctgtc
gatgacagctatatcttaaccagtacccccaatgacacctattcgctggcggtgttggca
aacgatgtggatgtcgatggtgacaacttaaccattgatggtgctgctgcggatattggc
agtgtacaaatcacctcggatggactcagctttaccgcgcccgaggcttatgtggggcct
gttgcactgcgttataccattagcgatggaaacaaaggccgagcaaccgccaaagtgaat
gtgctgattgaaggcgctgactcagcgaatcaacctgtgatcaccctacctgatgatgtg
gaggtgaatgcgacaggtctgtttacgcgggtgaaactcggttttgccaaggcggttgac
cgtaatgggcatccattacctgtgtcgctggtgaataagagcttgttcttcgcccctggc
aactacttagcctattggcaggcagtggatggcgagggtaataaggcgattaaagcgcag
aaggtcaaagtcaatccattgatttcactgagcaaagatcaagttgttgctgaaggcaat
caagtgacagtgagtgttcacctcaatggtgaggcgccaagttatccactgagtattcca
tacacagtatccggttcagccgatagcagcgaccatgatttggttgatggtgttgtcgag
ataacctcgggtcaaatggcagaaatccactttactaccctgaacgatggtgtgaccgaa
gggaatgaagaggtgcttatcagcctagattcaagcctgaatcttggtagtaagcagcag
actcaagtggtgattaccgaagctaatattgcaccacaggtcagtttagcggtgactcaa
gctggccagcagcaagtcattgtcgcgcaaaatggcggtgatgtgcatattcgtgccact
gcctccgatgccaatgagcaagatacattgacgctgacgtgggcaagcggcgcgttaagc
ttgcaagcggatgcgacaggcatgacattctctccagccccggtgtcaccggggatttat
cctgtgagcctaacggtgaccgatgatggttcgcctgtgctgtcgagtaccgaaactgtg
tacatcgtagtgcgcccaagtttagctgcattgacgagtgccgatacggatggcgattta
attcccgatgatcaagaaggctatagcgacagcgatcgtgatggcatcccagattatttg
gatgcaaataacgactgtaatgtaatgcctgaaggtgaattgcagccagtctacttcttg
gccgaagggcaggcgggcgtctgtttacgtttggggaatattgccctaagccgtggacag
agcggcgtgcagctacagccagaagccgtggcagaagatgctttagccgcaaatgtgggc
ggtattttcgactttatcgccacgggcctaccacaacagggccaaagctatagcttagta
ttgccacaacgctcacctgttcctgcgaatgccgtctaccgcaagttcaatgctcaagcg
ggctggcgagactttgtgattgatgcaaacaacattgttgccagtaccgagggtgaacgt
ggtttctgcccgccacctggggatagccgttggacgccgggattaaccgaaggtcattgg
tgtgtgcagttgaccatcgaagatggcggccctaacgatgatgatggtgtggctaaccgt
actattgttgacccaagtggtgttgctgtgatgcttaatggtaaccacttgcctgtcgcc
aatcccgactcggcagcaattgcttggaaccagagtatcgatgtgaacgtgcttgccaat
gatacggatagcgatggggatagtttgagcgtcacacaagtgattagtgagtttggcact
gtcacagtgttagctgatcaacggatcagttacacaccggcggcagactttatcggcacc
gatgtgttggtgtatagcattaccgatggcaaaggtggtacggcaagtagtgagctgacg
atagtggtgaatggcaacacggcacctgtgactgtcgacgacagcgccgccaccgatgat
cgcaccagcctgcttatcgatgtgctgagtaatgacaccgatgtggatgttaatacgttg
accctgcttagtgcgacggctcaacaaggcactgtgactatcgaggcgaataaactgcgc
tatatccctaaaacaggattcgatggtgtggataccgtgacctataggattagcgacggc
caaggtggtgaagcgacggggcaagtgcttatcacagtgaaagcctatcaagaggtcatt
atcgataataagtcaggaggaggtagtatgaccttatgggcgttggcattcatcttggct
tgcgcgatgttgcgtcgccgtgagttacagcgattggccttaggctgcctgttattgctc
agtgtgacgcaacaggcacaggcaacagactggtatgttgagggttttattggccaagct
caggccgataaaacactgcctgagttgaatacccaagtgggggagggacagctcctcaac
gtcgatgactcggatactgcttttggggtgagtctgggttatcaatggacgccgaccgta
gcgttagaactgggctatgccgattttggtgaaggaagtgcgagaattaagggcgcaacg
ctaacgccggagcaataccatgagctggtgaaaaccgtcactccagtccttgccgatggt
gttacgttgggcttgagatttaccttgctgcagcatcaaggttggcgctttgaagtgccc
gttggcttgttccattggcaagccgatatcagtagtaccatgggcaataccacgatcaag
accgatttagatggcaccgattggtatgcgggagtgcgtttcagttaccaatttagtgat
gcttggtctgtaggcttaggttatcaatacattgatattgaaccgaatgacctattgagc
tatcaactcaatctgcgttatcagttttag

DBGET integrated database retrieval system