Staphylococcus capitis subsp. capitis: AYP1020_1892
Help
Entry
AYP1020_1892 CDS
T03970
Symbol
sraP
Name
(GenBank) serene threonine rich antigen
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
scap
Staphylococcus capitis subsp. capitis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scap00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scap02000
]
AYP1020_1892 (sraP)
Transporters [BR:
scap02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AYP1020_1892 (sraP)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Bact_lectin
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKL92983
LinkDB
All DBs
Position
complement(1939001..1944310)
Genome browser
AA seq
1769 aa
AA seq
DB search
MGVPFLSKNIKKESQTKDNKGSRFKKNAAKTTALVGGAFTFNMLQDHHALAASETPMTSE
ISSNSGTVANQNSTTIRNSQAKVANNTTSNSTQQSSEIKNSTTKTSSEVINKNESSSEKA
VESNQNSESIKKEASESTNKAQNSEQSKSSSEKSSISKSTVSNTSSTNNDKNSQQLKNTS
TSEKTSQESQQLKSISESSNNKKEGQSTLTQHSQTATQKNTSNNQASTHTSEKPTINKNS
QSASESTASKVSNLRTFSRMSVFKTLATTPAASTTTTASSVSSNSVVVTKDNFNDYMNVS
GSATFDKNTGIVTLTPDVNSVKGAISLNTRLDSNRSFRFTGKVNLGSRYEGHNEGTGDNA
IVGGDGIGFAFSPGNLGEIGKEGAAVGIGGLKNAFGFKLDTYHNTSQPKGDAKAKADPSN
VGGGGAFGAFVSTDTNGMATTEASTAAKLNVQPTDNSFQEIMIDYNGDTKVMTITYAGQT
WTKNMSDWIKRSGSTTFSLSMTASTGGARNLQQVQFGKFEYTQSATAQVRYVDAKTGKDI
IPPKTYAGEVDDSATIDKQIDAMKSKGYNYSGVDSTGAPNYTDSTGTVKLTNAGQTIIYK
FNDAQKPTISVSNPTIEVGKPTSSISVSVTDNSSDPVKTTVTGLPDGLSFDSTTNTITGT
PTHIGKTTVQVHSEDSTGNASDSSFVITVKDSTGPTITQISNQSSEVYNPINPITISATD
NSGAKVVNEVSGLPDGLTFDSNTNTISGTPSKMGSFSITITSKDETGNTSTSTFKYDVTR
NSTSDSISTSSSKSLSTSKSNSIANSESASTSKSNSESASTSKSGSESASTSKSGSESAS
TSKSGSESASTSKSGSESASTSKANSESASTSEANSESASTSTSDSQSKSTSESESNSIS
ESKSKSTSIADSQSKSESASTSKSIIESNSQKASESTSKSASTSVSDSESANTSTSTSDS
ISDSGSLSESTSLSNSRSASGSASTSTSTSDSISDSGSLSESTSLNNSRSASTSLSDSTS
GSISASESASTSLSTSESDSTSASTSESLSTSTSESESGSTSTSSSDSASTSTSTSTSES
ESTSISGSESESTSESTSESNSTSASTSESLSTSTSESESGSISARDSESTSTLTSASVS
DSESASTSLSDSTSDSTSESNSDSTSLSTSTLASESGSSSISESLSGSTSASTSTSVSTS
DSDITSTSISESIASASASESTSASTSASTSISDSASTSESLSDSSSASTSLSESTSEST
SDSTSTSLSNSDSTSISMSDSDSESKSLSGSTSTSGSTSVSASTSESLSTSTSDSLSTSQ
SDSSSESTSTSTSDSTSTSLSTSASTSTSMSASNSASESLSSSTSTSDSNSVSASTSKSL
STSTSGSLSTSQSDSSSESTSLSTSDSESTSTSLSTSASTSTSTSATNSESESLSGSTST
SNSTSVSASTSESLSTSTSDSLSTSQSDSSSESTSTSTSDSTSTSLSTSASTSTSTSATN
SESESLSGSTSTSGSTSVSASTSESLSTSTSDSLSTSQSDSSSASASISASASTSLSNSG
STSASMSTSNSASESLSDSTSISDSNSSSTSTSESLSTSTSDSTSISKSTSTSDSASNSL
STSTSTSDSDSTSMSTSTSESISTSTSTSNSDSSNHQGSLVDPSGFKPSHQNPGEQHLSG
SMDSSEFINSNQSNKESNFTSENEHNNNQVTQHGEKHSDQQNDKSLPNTGEDETNRGGLV
SLVLTMLAGLGLIRRSKKDKNKDRKNNED
NT seq
5310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagtgccttttttaagtaaaaatattaaaaaagaaagccaaactaaagataataaa
ggtagtagattcaagaagaatgctgctaagacaacggctctagtcggcggagcgttcaca
tttaatatgcttcaagatcatcatgcgttagctgcttctgagacgccaatgacttcagaa
atttcatctaatagcggaacagttgccaatcaaaactctactactataagaaattcgcaa
gcaaaggtagcgaataacacaacgtcaaattccacgcagcaaagtagtgaaatcaaaaat
tctactactaaaacatcatcagaagtgataaataaaaacgaatctagtagcgaaaaagct
gtagaaagcaatcaaaatagtgaaagcataaaaaaagaagctagtgaaagtacgaataaa
gcacaaaatagcgaacaatctaaatcatcttcagaaaaatcttctataagtaaatcaact
gtttcaaatacatcatccacgaataatgacaaaaattcccaacaacttaagaatacatcc
acatcagaaaaaacttctcaggaatctcaacaattaaaatcaatatcagaaagttcaaat
aataaaaaagagggtcaatctacacttactcaacatagccaaacagcaactcaaaaaaat
actagtaataaccaagcaagcactcatacttcagaaaagccgactattaataagaactct
caatcagcaagtgaatcaacggcctctaaagtaagtaacttgcgaacattcagtcgaatg
agtgtctttaaaacattggcaactacaccagctgcttctacaacaactactgcgtcaagc
gtatcttcaaattcagtagtagtaactaaagataactttaacgattatatgaatgtttca
ggttcagcgacttttgataaaaatacaggtattgtcacattaacgccagatgtgaatagt
gtgaaaggtgccattagtttaaatacacggttagattcaaatcgtagttttcgttttact
ggtaaggtcaaccttggtagtagatatgaaggacataatgaaggaacaggtgataatgct
atcgttgggggagacggtataggttttgccttttctcctggtaacctaggtgagattggt
aaagaaggtgcagctgtaggaataggtggattaaaaaatgcatttggtttcaaattggat
acttaccataatacctcacaacctaaaggggatgccaaagctaaagccgatccatctaat
gtaggtggcggaggcgcatttggtgcatttgtttcaacagatactaacggtatggcaact
actgaagctagcactgcagccaaattaaatgttcaaccaacagacaattctttccaagaa
attatgattgattataatggtgacacaaaagttatgaccattacatatgcaggtcaaacg
tggactaaaaacatgtccgactggattaaaagaagtggttctacgacgttttctttatca
atgactgcgtctacaggtggggctagaaatcttcaacaagttcaattcggtaaatttgaa
tatacacaatctgctacggcacaagtaagatacgtggatgctaaaacaggtaaagacatt
atccctcctaaaacatatgctggtgaagttgatgacagtgcgactattgataaacaaatc
gatgcaatgaagagtaaaggatataactattctggtgtggatagtactggcgcacctaat
tatacagacagtacaggtacagttaaattgactaatgccggtcaaactatcatttacaaa
tttaatgatgcacaaaaaccgacgattagtgtcagtaatccaactatagaagtagggaaa
cctacgtcatcaattagcgtttcagttacagataatagttcagatccggttaaaacgact
gtaacaggattgccagatggattatcatttgatagtactactaataccattacaggtaca
cctactcatataggtaaaacgactgtacaagtgcattctgaagattcaactggtaatgct
tcagatagcagctttgtcattacagttaaagattctactggaccaacgattacacagatt
agtaatcaatcatcagaagtttataatccaatcaatccaattactattagtgcaacagat
aatagcggtgctaaggtagttaacgaggtatcaggattgcctgatggtcttacatttgat
tcgaacacgaatacgattagtggtacgccaagtaaaatgggtagtttttccataactatt
acttcaaaggatgagactggaaatacatcaacgtctacatttaagtatgatgttactaga
aatagtactagtgattccatatctacttcttcaagtaagagcctttcaacatcaaaaagc
aatagtatagctaattcagaaagcgcatcaacaagtaagtcgaattcagagagtgcatca
acgagtaagtcgggttcagaaagtgcgtcaacgagtaagtcgggttcagaaagtgcatca
acgagtaagtcgggttcagaaagtgcgtcaacgagtaagtcgggttcagaaagtgcgtca
acaagtaaggcgaattcagaaagtgcatcaacaagtgaggcaaattcagagagtgcatca
acaagcacatcagattctcaaagcaaatcaacgtcggaaagtgagtcaaattcaatcagt
gagagtaaatcaaaaagtacaagtattgcagattcgcaaagtaaatcagaatctgctagt
acgtcaaaatcaataattgagagtaattcacaaaaagcatcagagagtacaagtaagtca
gcaagcactagcgtatcagatagtgaatcggctaatacaagtacatcaacaagtgactca
atatctgattcaggctcactaagtgaaagtacttccctaagtaactcaagaagtgcgagt
ggctcggcaagtacaagtacatcaacaagtgactcaatatctgattcaggctcactaagt
gaaagtacttccctaaataactcaagaagtgcgagtacttcattatctgacagtacttca
ggatcaataagtgcatcagaatctgctagtacgtcattatcaacaagtgagagtgattca
acaagcgcaagtacgtctgaatcactaagtacatcaacatcagaaagtgaatctgggtca
acaagcacatcaagtagtgactccgcaagtacaagtacatcaacaagcacgagtgaatca
gaaagcacgtcaataagtggttcagaatcagaaagtacatctgaatccacaagtgagagt
aattcaacaagcgcaagtacgtctgaatcactaagtacatcaacatcagaaagtgaatca
ggctcaataagcgcgagggattctgaaagcactagcacattaacttctgcaagtgtgagc
gattcagaaagtgcgagtacatcattatcagatagtacgtcagactcaacaagtgaatcc
aatagcgattcaactagccttagcacatcaactttagcaagcgagagtggctcaagtagt
ataagtgaatcgctaagtggatcaacaagtgcaagcacgtcaacatcagtgagcacgagt
gactcagatatcacaagcacgtcaataagtgaatccattgctagcgctagtgcatcagag
tcaacaagcgcaagtacgtcagcttctacgagcataagcgattcagccagtacaagtgaa
tcattaagtgactcaagcagtgcgagtacatcattatcagaaagtacatcagagtcaaca
agcgacagtacatcaacaagtttaagtaactcagatagtacaagtatttcgatgagtgat
tcagatagcgaaagcaagtcactaagtggctcaacaagtacctcaggtagtacttcagtt
agtgcaagtacgtcggaatcactaagtacatcaacatcagatagtttaagtacgtcacaa
agcgactcatcaagtgaaagcacatcaacatcaacaagcgacagtacatcaacaagtcta
agtacctcagccagtacaagtacttcgatgagtgcttcaaacagtgcaagcgagtcacta
agtagctcaacaagtacatcagatagtaattcagttagtgcaagtacgtcgaaatcacta
agtacatcaacatcaggtagtttaagtacgtcacaaagcgactcatcaagtgaaagcaca
tcattaagtacttccgattcagaaagcacatccacaagtctaagtacctcagccagtaca
agtacttcgacgagtgctacaaatagtgaaagcgagtcactaagtggctcaacaagtaca
tcaaatagtacttcagttagtgcaagtacgtcggaatcactaagtacatcaacatcagat
agtttaagtacgtcacaaagcgactcatcaagtgaaagcacatcaacatcaacaagcgac
agtacatccacaagtctaagtacctcagccagtacaagtacttcgacgagtgctacaaat
agtgaaagcgagtcactaagtggctcaacaagtacatcaggtagtacttcagttagcgca
agtacgtcggaatcactaagtacatcaacatcagatagtttaagtacgtcacaaagcgat
tcatcaagtgcaagcgcatcaataagcgccagtgcatcaacaagtctaagtaactcaggt
agtacaagtgcttcgatgagtacttcaaacagtgcaagcgagtcattaagtgactcaaca
agtatttcagatagtaactcaagtagcacaagtacgtcggaatcactaagtacatcaaca
tcagatagcacatcaataagtaaatcaacgtcaaccagcgatagcgcttctaatagttta
agtacatctacgagcacatccgactcagatagtacttcaatgagcacaagtacgtctgaa
tcaataagcacatcgacatctacaagcaactcggattcttcaaaccatcaaggttcgctt
gtggatcctagtggattcaaacctagtcaccaaaatccaggtgaacaacatcttagtggt
agtatggattcttcagaattcattaattctaatcagtcgaataaagaatctaatttcact
tctgaaaatgaacacaataataatcaagtgactcaacatggtgaaaaacattcagatcaa
caaaatgacaaatcattacctaatactggtgaagatgaaacaaatagaggcggattagtt
tcattagtattaacaatgttagctggtttaggattaattagaagatctaaaaaggataaa
aataaagatagaaaaaataatgaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system