Streptomyces cinnabarinus: STRCI_001819
Help
Entry
STRCI_001819 CDS
T08957
Name
(GenBank) lipopolysaccharide biosynthesis protein
Organism
scir
Streptomyces cinnabarinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_C
Gemini_mov
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAZ20685
LinkDB
All DBs
Position
2016925..2020605
Genome browser
AA seq
1226 aa
AA seq
DB search
MSDTTTTTEAAQPAAQAPEQSGRGSQLFRNAYALMLNTGISAVLGLGFWLAAARYYSESA
VGQGSAAIAAMKFLAGLTAVALTGALARFIPIAGRATGRLIFRTYAGSSVIVALAAGVFL
LTLDVWGPSYRFLDTPVAGVGFVVAVVAWNLLTLQDGVLTGLRSALWVPVGNTAFSAVKL
GLLVAFAAAVPTTGVFVSWVAAIAISVLPLGWLVFRRLVPRHVKSTAEHTKQPSLKEIGK
FLAGDYTGSLFSLAVVYLIPVIVAAQVSSEDNAYFYITATIGGTVNLLAINMGASLTVEG
SHDPSRLAANTRAALKRMAKIMVPVAAVLFFGAPWILGVFGAGYADAATPLLRWFAVGGL
LRVVMETYFAVLRAQSRTAGLAWLQGLLCALVLGLTLALLPRMGLTGAGVAEIVSLAVIV
AIAAPKLYRTVLTAPPEVPAGAAPDGDLADLGTKEGTTARRPAWALDSDTLGLGIHVDFD
HLERRPDVRPGPGTPPTGLPAVRRPTWAVGLPVEKREPEVDAPFEAEEKAVVPDVPEAVR
EEEPREPEEEPVAAGLLPTRLGVVLGCLLTAALLLYWVPALRLGEADLDEMGGLGLISVL
PMSTLIGAGLLVTVFASLLWLGREHRALLLVTLLATVVSLHALPALIETEPRFATAWQHL
GFLDHIDRTGSAVPDLDARWSWPGFFAVAAFVAQACGISDLTEVIRWWPLTMQLLYLVPM
FLLTRSMRASWRARWTGIWVFVLSGWVGQDYFSPQGFTYLLYLVFAAILLVWFRAPRVIW
TRVRPGELEVEPTNRRQRAVLLLVVIGLFAASVPAHQLTPFVMLGVLAGLVLVGRSELRG
LPILFGVLVISWIGFMAEPYWSGHFDELFGGVGGVGSNVSSSVSGRIEGGSSTHKLVLYT
RVLLAGGVMAMACWGWWRRRDHQYRERSLLVLTFVPFLGFGMQSYGGEMALRVFMFALPG
AALLAGLALFPRTGVTAKERDKDRVSLAPLAAFLAGLVLMGGFLVTRWGNEPFERVRPGE
VAAMEYVYAHDDPSLRLLWLSNDTVNVVTPSMPWGARDMEKVEYLPTLAPVDPVLVSGLV
KALKDAGPNSYLMINRSQVTYLRLDVGYSDSWEPRLIQNLDRRQELKKVFVNEDVTMYAL
RKQPAGEVPKADPGPIGPQVTWTPWSVVGALAALALIVLLTAREVVRVAVRPSVRQLRWL
QSTFWFSLPLLAVLLASLVQRFLTIE
NT seq
3681 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtctgacacgacgaccacgaccgaggccgcgcagcccgccgcccaggcgcccgagcag
tcggggcgcggcagtcagctgttccgcaacgcctacgccctgatgctcaacaccggtatc
tccgcggtgctcggtctcggtttctggctggccgcggcccgctactactccgagtcggcc
gtcggccagggctccgccgccatcgccgcgatgaagttcctcgcggggctgaccgcggtg
gccctgaccggcgcgctggcgcggttcatcccgatcgcgggccgcgccaccgggcggctg
atcttccgtacgtacgcgggcagttcggtgatcgtggcgctggcggcgggggtcttcctg
ctgacgctggacgtgtgggggccgtcgtaccgcttcctggacacgccggtggccggggtc
ggtttcgtggtcgccgtcgtcgcgtggaatctgctgacgctccaggacggggtgctgacc
gggctgcgcagcgcgctgtgggtgccggtcggcaacaccgcgttctcggcggtgaagctg
ggcctgctggtggcgttcgcggcggcggtcccgaccaccggggtgttcgtctcctgggtc
gcggccatcgcgatctcggtgctgccgctcggctggctggtgttccggcggctggtgcca
cggcatgtgaagtcgaccgcggagcacacgaaacagccgtccctgaaggagatcggcaag
ttcctcgcgggcgactacaccggctcgctgttctcgctcgccgtggtctacctgatcccc
gtgatcgtggccgcgcaggtcagctccgaggacaacgcctacttctacatcaccgccacc
ataggcggcacggtcaacctcctcgccatcaacatgggcgcctcgctcaccgtggagggc
tcgcacgacccgagccgactcgccgccaacacccgggccgcgttgaagcggatggcgaaa
atcatggtcccggtcgcggcggtcctgttcttcggggcgccgtggatcctcggtgtgttc
ggcgcgggctacgcggacgcggccaccccgctgctgcgctggttcgcggtcggcgggctg
ctgcgggtcgtgatggagacctacttcgcggtgctgcgggcgcagagccgcaccgccgga
ctggcctggctccagggcctgttgtgcgcgctggtgctgggtctgacgctggcgctcctg
ccgcggatggggctgaccggcgcgggtgtcgccgagatcgtctcgctcgcggtgatcgtg
gcgatcgccgcgcccaagctgtaccggacggtgctgaccgcgccgcccgaggtccccgcg
ggcgcggcgcccgacggtgacctcgcggacctggggacgaaggaggggacgaccgcgcgc
aggcccgcctgggcgctggactccgacaccctcggcctcggcatccatgtcgacttcgac
cacctggaacgccggcccgacgtccggccgggccccggcaccccgccgaccggactgccc
gcggtgcggcggcccacgtgggccgtgggactcccggtcgagaagcgcgagccggaggtg
gacgcaccgttcgaggcggaggagaaggcggtcgtaccggacgttccggaggcggtacgg
gaggaggagccgcgcgagcccgaggaggagcccgtggcggcggggctgctgccgacccgg
ctcggcgtggtcctcggctgtctgctgaccgccgcgctgctgctgtactgggtgcccgcg
ctccggctcggcgaggccgatctggacgagatgggcgggctcgggctgatctcggtgctg
cccatgtccacgctgatcggcgccgggctgctggtcaccgtgttcgcctcgctgctctgg
ctgggccgcgagcaccgggcgctgctgctggtgacgctgctggcgaccgtggtctcgctg
cacgccctgcccgcgctgatcgagaccgagccgcggttcgccacggcctggcagcatctg
ggcttcctggaccacatcgaccgcaccgggtccgccgtaccggacctggacgcgcgctgg
agctggccgggtttcttcgcggtggccgcgttcgtggcgcaggcgtgcgggatctcggat
ctgaccgaggtcatccgctggtggccgctgacgatgcaactgctgtacctggtcccgatg
ttcctgctgacccgttcgatgcgggcgagctggcgggcccgctggaccgggatctgggtg
ttcgtgctcagcggctgggtcgggcaggactacttctcgccgcagggcttcacctatctc
ctctatctggtgttcgcggcgatcctgctggtctggttccgggcgccgcgggtgatctgg
acgagggtgcggccgggcgagctggaggtggagccgacgaaccggcggcagcgggcggtg
ctgctgctggtcgtgatcgggctgttcgcggccagcgtcccggcccaccagctcactccg
ttcgtgatgctgggcgtgctggcggggctcgtgctcgtcggccgcagcgaactgcgcggg
ctgcccatcctgttcggggtgctggtgatctcctggatcggcttcatggcggagccgtac
tggtccgggcacttcgacgagctgttcggcggtgtcggcggcgtcggctccaatgtctcc
tcgtcggtctccggccggatcgagggcggcagctccacccacaagctggtgctgtacacc
cgggtgctgctggccggcggggtgatggcgatggcctgctggggctggtggcgccgccgc
gatcaccagtaccgcgaacgctccctgctggtcctcaccttcgtcccgttcctcggcttc
ggcatgcagagctacggcggcgagatggcgctgcgcgtcttcatgttcgcgctgccgggc
gcggctctgctggccgggctcgcgctgttcccgcgtaccggcgtcaccgcgaaggagcgc
gacaaggaccgggtgagcctcgctccgctggccgcgttcctggcgggcctggtcctcatg
ggcggcttcctggtgacccgttggggcaatgagccgttcgagcgggtcaggccgggcgag
gtcgcggccatggagtacgtctacgcccatgacgatccgagtctgcggctgctgtggctg
agcaacgacacggtcaacgtcgtgacgccgtcgatgccgtggggcgcgcgggacatggag
aaggtggagtatctgccgacactggcgccggtcgatccggtgctggtgtcaggcctggtc
aaggcgctcaaggacgcgggtccgaactcgtatctgatgatcaaccgcagtcaggtcacc
tatctgcggctcgatgtcggctactcggacagctgggagccgcggctgatccagaacctg
gaccggcgccaggagctgaagaaggtcttcgtcaacgaggacgtgacgatgtacgcgctg
cgcaagcagcccgccggcgaggtcccgaaggccgatcccgggccgatcgggccgcaggtg
acctggacgccgtggtcggtggtcggggcgctggcggcgctcgcgctgatcgtgctgctg
acggcgcgcgaggtggtgcgggtcgcggtccggccgagcgtgcgccaactgcggtggctt
cagagcacgttctggttctcgctgccgttgctggcggtgctgctggcgtcgctggtgcag
cggttcctgacgatcgagtag
DBGET
integrated database retrieval system
