Streptomyces deccanensis: L3078_18900
Help
Entry
L3078_18900 CDS
T08215
Name
(GenBank) SUKH-4 family immunity protein
Organism
sdec
Streptomyces deccanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SUKH-4
XOO_2897-deam
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ULR51198
LinkDB
All DBs
Position
complement(4262092..4265166)
Genome browser
AA seq
1024 aa
AA seq
DB search
MVTFAQAQERAEEWINGDLPGYQHREVRVREFDLGFVVWAEDRADGPRSDGGAQRLVIAR
DSGEATLWPSLPVGEVIRRFEEEYGRTEAASAAAPAPPARVDLNQTSFLLTPPEWLQDAA
DRMGIPDHRAGAGAGAGAGSGSGAGASDGAGSRPAAVGAAAGDSGAGTGGSGSFGVNGVN
GASGGGGSLPETMAGPVGQSPSVGRGTPDAPADATPWPAAASAEDEVRDAVPPRDAVPQD
AVPAGATPWAGTDTNAEAEDDRSVPLPDTVFAPQLSEVSDTDDAPPPSALPEAKTALISG
GSQLPRTTVAPALGAPAPGPDAGAPGGPAQPSQQPPSGPGTPPPGAPQSYGYPQGPGAPQ
GPGAPSGPGTPPPGAPQSYGYPQGPGAPQGPGTPPPGAPSYGYPQGPGGPQGPGTPPPGP
SSAPHAGDIADAATSKAAPPPRRGGAAGAPPPPAPPGAPGTPGARPGATPPPQSGPGAPG
TPAGGYVPTQMVSSLGPDGPGGPGAPGQPGGPGGAGGPGGPGAPGAPGAPNPPGGTPAGG
VHHAATMLAGPAVGGPGAPLPPGPPGAPGRPGVPGAPGVPGAPGQPGVPGHQGGPHAPGA
PGVPGAPGAPNPPGGTPAGGVHHAATMLAGPAVVGPGAPGAPQPPGPPGMPPGAPHGMPG
QPMPGQPMPGQPGQPGPVPGQPGPPMGAPPAYGYPQPPAGQPTVGPGYQAVLRFRAPDGS
EQQVIRRSAPGTPHPEWQIFHELRGMNIPPEAVLELHTELESCELPGAYCARMIREQWPN
ARITSIAPYGKDHASRQQGMAQLLAHQGELHQVADGPARPAPVRAPLPPVQPAPPVPPEV
IGQELAAAFGPGVFRFDQQAVSRQGVPPIVAHTLVVAGLPVDMGPFFWAQAQPGRPVPTL
AELAQERGVQPAADAGSYLVMGSDFGKALCVQYGTANIVAVPVEAGPGGAPVPPQFVNTG
LPEFARCLALLGRMWRLRFGLNQEQAGRWTVDFQAQLAALDPAALASPESWWSVLLEQMW
DGLL
NT seq
3075 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgacgttcgctcaggcgcaggagcgcgccgaggagtggatcaacggcgatctgccg
ggctaccagcaccgtgaggtgcgggtgcgggagttcgacctcgggttcgtggtgtgggcg
gaggaccgggcggacggcccgcgttccgacggtggcgcgcagcggctggtcatcgcccgg
gacagcggggaggccacgctgtggccgtcgctgccggtgggtgaggtgatccgccggttc
gaggaggagtacggccgtacggaggcggcttcggccgccgcgccggcgcccccggcgcgg
gtggacctgaaccagacgtcgttcctgctgactccgccggagtggttgcaggacgcggcg
gacaggatgggtattccggaccaccgggcgggtgcgggtgcgggtgcgggggccgggtcc
ggctccggtgccggtgcgtccgacggtgccgggtcccgtccggctgccgtcggcgccgct
gccggcgattccggtgccggtacgggtggttccggctcgttcggggtcaacggggtcaac
ggggcgtccgggggcggcggttcgctgcccgagacgatggcggggccggtcgggcagtcg
ccctcggtcggccgtgggacgcccgacgcacccgccgacgccacgccgtggccggccgcc
gcctcggcggaggacgaggtgcgggacgcggtgccgccgagggacgccgtaccgcaggac
gcggtgcccgccggggcgacgccgtgggccgggacggacaccaacgccgaggccgaggac
gaccgttcggtaccgctgccggacaccgtgttcgcgccccagctgtccgaggtgagcgac
acggacgacgccccgccgcccagcgcgctgccggaggccaagaccgcgctgatctccggg
ggcagccagctcccgcgtacgacggtggcgccggcgctgggcgcccccgcccccggcccc
gacgcgggcgcaccgggtggccccgcgcagccgtcacagcaacctccgtccgggccgggg
accccgccgccgggtgcgccgcagtcgtacggctatccgcagggaccgggagctccgcag
gggcccggtgctccgtccggtccggggactccgccgccgggcgcgccgcagtcgtacggg
tacccgcaggggcccggcgctccgcagggcccggggactccgccgcccggtgcgccgtcg
tacgggtatccgcagggcccgggtgggccgcaggggcccggtacgccgcctcctgggcct
tcgtcggcgccccacgccggtgacatcgccgacgccgccacgagcaaggccgcgccgccg
ccgcgccggggcggggcggccggtgcgccgccgcctccggctccgcccggggccccgggg
acgccgggtgcccggccgggtgccacgcctccgccgcagtccggtcccggtgctccgggc
accccggcgggcggctatgtgccgacccagatggtctcctccctcggtccggacggcccc
gggggcccgggtgctcccggacagcccggtggacccggtggagccggtgggcccggcggt
cctggtgccccgggcgctcctggtgcgccgaatccgccggggggtacgcccgccggtggt
gtgcaccacgccgcgacgatgctggccggtcccgccgtgggcggaccgggtgcgccgctg
ccgccggggccccctggggctccgggtcggccgggtgttcctggcgcccccggtgtcccc
ggcgctccggggcagcccggcgtccccggtcaccagggcggtccgcacgcccctggtgct
cctggcgtcccgggtgctcccggtgcgccgaatccgcccgggggtacgcccgccggtggt
gtgcaccacgcggcgacgatgctggccggtcccgccgtggtcggacccggtgcgcccggg
gccccgcagccgcccggtccgcccgggatgccgccgggggctccccacgggatgcccgga
cagccgatgcccggacagccgatgcctggtcagccgggtcagcccggaccggttcccggt
cagcctgggccgccgatgggggctccgcccgcgtacggctatccgcagccgcccgccggg
cagccgaccgtgggccccggctaccaggccgtcctgcgcttccgtgctccggacgggtcc
gagcagcaggtgatccggcgttcggcgccgggcacgccgcacccggagtggcagatcttc
cacgagctgcgcgggatgaacatcccgccggaggccgtgctggagctgcacaccgagttg
gagtcgtgcgagctgccgggggcgtactgcgcgcggatgatccgtgagcagtggccgaac
gcgcgcatcacgtccatcgccccgtacggcaaggaccacgcgagccggcagcagggcatg
gcccaactgctcgcccatcagggcgagttgcaccaggtcgcggacggtcccgcgcggccc
gcgccggtgcgggcgccgttgccgccggtgcagccggcgccgccggtcccgccggaggtg
atcgggcaggagctggcggcggcgttcgggccgggggtgttccggttcgaccagcaggct
gtgtcgcggcagggcgttccgccgatcgtggcgcacacgctggtcgtcgccgggctgccg
gtggacatgggtcccttcttctgggcgcaggcccagccggggcgcccggtgccgacgctg
gcggagctggcgcaggagcgcggggtgcagccggcggccgacgcgggctcgtacctggtg
atgggcagcgacttcggcaaggcgctctgtgtgcagtacggcacggcgaacatcgtggcc
gtgccggtggaggcggggccgggcggtgcgcccgtgccgccacagttcgtgaacacgggg
ctgcccgagttcgcgcgctgcctggcgctgctcggccggatgtggcggctgcggttcggt
ctcaaccaggagcaggcggggcgttggaccgtcgacttccaggcgcagctcgccgccctc
gacccggcggcgctggcctcgccggagagctggtggtcggtgctgctggagcagatgtgg
gacgggttgctgtga
DBGET
integrated database retrieval system
