KEGG   Spiroplasma diminutum: SDIMI_v3c06960
Entry
SDIMI_v3c06960    CDS       T02741                                 
Name
(GenBank) metallo-beta-lactamase family protein
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
sdi  Spiroplasma diminutum
Pathway
sdi03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sdi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    SDIMI_v3c06960
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:sdi03019]
    SDIMI_v3c06960
Messenger RNA biogenesis [BR:sdi03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     SDIMI_v3c06960
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_C Lactamase_B Lactamase_B_2 RMMBL DUF4453
Other DBs
NCBI-GeneID: 16854485
NCBI-ProteinID: AGR42400
UniProt: S5MK96
LinkDB
Position
774052..775851
AA seq 599 aa
MEDKKNTSLQQVKSVVADLEKKIEIKKMADNLNPPKKKLPQAPFPTKVYALGGLEEVGKN
TYCIEYNDEIIMIDAGVKFPDATQLGVSAVIPDFTYLVENNSKLKGLFITHGHEDHIGGI
PYLLQQVEVPVIYAPALAAALIRDRLKEYKLQNKTVVKEYVESDVYSTKNFTIQFAAVNH
SIPDAFGIHVQTPNGAIFSTGDYKFDWTPLGHDANVQRLASWGNDGIELLMADSTNAEVE
GYTIGERKVIQNIDTHFLKSKGRIIIASFASNVHRLQHIIELANKYGRRIVVIGRSIERI
IKIIRQMGHLNINDKMFIKPNEIDNFPKNQIMILCTGSQGEPMAALSRISRMEHQTIKII
PGDNVIMSSSPIPGNRADVENVINKLTRIGANVIENSADNKIHTSGHASQEEQKLLFTLL
KPRCFMPMHGEYRMLKIHGETATKVNVKPHNVFVVANGDQIELHNGTGKVGKRVPAEAVF
IDGKDMTGKASNVIRERNILSKDGLMAVIISIDSQANKLSAPPRIVSRGSFYVRDSGNVI
AESINIVTNAVQEILNSQKPTFGAIKNAIKESLSPFIFRYKRRNPLIIPVILNKKVEVK
NT seq 1800 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaagacaaaaaaaacacgtctctacaacaggttaaaagcgtagttgcagatttagag
aaaaaaattgaaattaaaaaaatggctgacaatttaaatccgccaaagaaaaaattacca
caagcaccctttccaactaaagtttatgctttaggtggattagaagaagttggtaaaaat
acatattgtatagaatataacgatgaaattattatgatcgatgcaggagttaaattccct
gacgctactcaattaggagtaagtgctgtaataccagactttacttatttagtagaaaat
aattcaaaattaaaaggattatttattactcacggtcatgaagatcatattggaggtatt
ccctatttacttcagcaagttgaagtaccagttatttatgccccagctttagctgcagca
ttaataagagatagattaaaggaatataaattacaaaataaaacagttgttaaagaatac
gttgaaagtgatgtttattcaacaaaaaactttacaatacagtttgcagctgtaaatcac
tcaatacctgatgcatttggaatccatgtacaaacacctaatggtgcaatcttttcaaca
ggagattacaagtttgactgaacaccattagggcatgatgctaatgttcaaaggttagca
tcatggggaaacgacggaattgaactattaatggcagattcaacaaatgctgaagttgag
ggttatacaattggtgaaagaaaagttattcaaaatattgatacacatttcttaaaatca
aaaggaagaattattattgcttcttttgcatcaaatgtacatagacttcaacatattatt
gaattagcaaataaatatggaagaagaattgttgttattggtagaagtattgaaagaatt
attaaaataattagacaaatgggtcacttgaatatcaatgataaaatgtttattaaacca
aatgaaattgataacttcccaaaaaatcaaattatgattttatgtacaggaagtcaagga
gaaccaatggctgctctttctagaatatctagaatggaacaccaaactattaaaataatt
cctggagataatgtaattatgtcttcatcacctattccaggtaatagagctgatgtagaa
aatgttatcaataaattaacaagaattggcgcaaatgtaattgaaaatagtgctgataat
aaaatccatacttctggacacgctagtcaagaagaacaaaaactactattcactttatta
aaacctagatgttttatgcctatgcacggtgaatatagaatgttaaaaattcatggggaa
acagcaacaaaagttaatgttaaacctcataacgtatttgtagttgcaaatggagatcaa
attgaattacataatggtacaggtaaagttggaaaaagagttcctgctgaagctgtattt
attgatggaaaagatatgactggtaaagcaagtaatgttataagagagagaaacatttta
agtaaggatggtctaatggctgtaattatttcaattgactctcaagcaaataaactatct
gctcctcctagaattgtttctagaggaagtttctatgtaagagatagtggaaatgttatt
gctgaatcaattaatattgttacaaatgcggttcaagaaattcttaattcccaaaagcct
actttcggtgcaattaagaacgctattaaggaatcattatcacctttcatctttagatat
aaaagaagaaatcctttaattattcctgttattttaaacaaaaaggtagaggttaaataa

DBGET integrated database retrieval system