KEGG   Shewanella eurypsychrophilus: FM038_019550
Entry
FM038_019550      CDS       T07746                                 
Name
(GenBank) winged helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
seur  Shewanella eurypsychrophilus
SSDB
Motif
Pfam: nSTAND1 Trans_reg_C AAA_16 TPR_2 ABC_tran AAA_29 nSTAND3 TPR_1 AAA_23 SHNi-TPR ATPase_2 RsgA_GTPase AAA_22
Other DBs
NCBI-ProteinID: QPG59332
UniProt: A0A550AHA7
LinkDB
Position
complement(4587896..4591174)
AA seq 1092 aa
MSFSTFYFGDWQIEPSSNSLRLGSKVKQLEPKAMDVLSLLCERDGDVVSTEEIVSHCWPD
MFMGDNPLHKVINQLRRALGDSATSPQYIETIRKRGYRTLAKISFPKGHAAAAESQQWQS
GSPFPGLQAYSAEHADVFFGRSEQVSTLLNRITLQVKYGRAFCLILGPSGSGKTSLINAG
VMPNLMSAKGYNGIEVISYSDIDLADVVDNPPLVDLASAMLDWEYQDKPVFDGYSAEQLA
NTLTEAPEKAIQCCKLALKGHKAQHAFFTLFVDRLEVLLSSPQFTDAQRQEFFDVIECLA
QSGHILILSACRNDFYPDLVQYPNLMSGKSRGAHFDLSPPTRQELLQMIRLPAVAAKLTW
QLDSETAVPLDEMLCADAASNPDALPMLQYTLQALYLNRDDKDQLLVSEYQKLGGLEGAI
GKNAEEVLTSLTDAETAAVPKILSLLVTLKEDDKSITSRTARWSQLSSSSESETNLVKAM
VDSRLFVSHLQNDEACFSIAHEALLRRWPRATKWIEAHSESLGIKSRLLNQSRRWLAESK
TQAYLLSEGKPLQEAQLLSQNPLFTLESAEQALISASAKRVNSRRWRRRLTTGALVALTM
LSVLMSFRSIEAEQRALDKRLAAENLLGFMVGDFADKLRGIGRMDLLDGISNKALEYFSD
ESNTHDASNYSFEARFQHAQTLEAIGEVAYSRGKLEEANAGLLGAKTKLEALLAEQSENL
ELLKTAGANAFWLGQLEYDKSDWTAAQPWYERYLSYSQTMYRIAPDDADALMELSYAHNT
LGSLYMEQQKFKDARGEFKESLRLKLLAVQKQPQNILLKVEVADTRSWIASAELSNGELQ
ASIETHIANLDMLESLEFNQNNAYLQKILALSNHFLSRQFLAVGKHNQARDSAVKSYNIL
LSMVEVDPSNQMWQTELLKLKLFMLHILPHDDSGEIKLTNLHSSLELELSKQSDPLKLSP
QFREFIVLFHRNSAYLYQRASLWQKSMVHIELANKEVGLLMNDFPNALEYKYLFAEISLL
DARVKREADDLVGMRESCNISKNNLVQINKFNQSAKYLIPFADSLRCLGEIEFYPSVQKL
LARERIVFSYIH
NT seq 3279 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagttttagcacattttattttggtgattggcagattgagcccagctccaactccctg
cgtttaggtagcaaagttaaacaacttgagcctaaggcgatggatgtgctgtcactctta
tgtgaacgtgacggtgatgtggtgagcaccgaagagatagtcagccattgttggcccgat
atgtttatgggtgacaatccgctgcacaaagtcatcaatcaattgcgccgcgccttgggc
gatagcgcgacctcaccccaatatatcgaaaccattcgtaaacgcggttaccgcacctta
gctaagataagttttcccaaaggtcatgctgcagcggccgaatcacaacaatggcaatct
ggctcaccttttcctggtttacaagcttatagtgccgagcatgccgatgtgttctttggc
cgcagtgagcaagtctccaccttactgaatcgtattaccctgcaagttaaatatggccgc
gctttctgtcttattttaggccccagcggtagcggtaaaacctctttaatcaatgcgggt
gtgatgccaaacctcatgtccgccaagggatacaatggcattgaggttatctcatacagt
gatatcgacttggccgatgtggttgataacccgccattagtggatctggctagtgccatg
ttggattgggagtatcaggataaacctgtattcgatggttacagtgcagaacagctggca
aatacgctcactgaagcgccagaaaaggcgattcaatgctgcaaattagcgttaaaaggc
cataaggcgcagcatgcctttttcacgctgtttgtcgatagattagaggtgctactgtcc
tcacctcagtttacggatgcgcagagacaagaatttttcgatgttatcgagtgtctggca
caatctggtcatattcttattttatctgcttgtcgcaatgatttttatccagacctagtg
caataccctaacttgatgtcaggtaaatctcggggggcacattttgatttgtcaccgcct
acgcgccaagagctattgcagatgatccgcttgcctgctgtcgctgccaaattaacctgg
cagctagacagtgaaaccgcagtaccgctcgatgagatgctctgcgccgatgccgcgtcc
aaccccgatgccttgccaatgctgcaatataccttgcaagcgctgtacttaaatagagat
gacaaagaccagctgttagtctcagagtatcaaaaacttggtgggctcgagggcgcgata
ggtaaaaatgccgaagaggtactcactagcctgacagatgcagaaacagcggctgtgcct
aagattttatcactgttagttaccctaaaagaggatgataaatccattaccagccgcaca
gcgcgctggtcacagctaagctctagctcagaatctgaaaccaaccttgtaaaagccatg
gtggatagccgtctatttgtctcccacctgcaaaatgatgaagcctgtttcagtattgcc
cacgaagctctgctcaggcgttggcccagagcgaccaagtggatagaagcacacagcgaa
agcttaggcattaagagtcgcctactcaatcaatcccgtcgctggttagccgagtctaaa
acccaagcttatctgctttcagaaggtaagccgctacaggaagcgcagcttctctctcaa
aatccactgtttactttggaatccgcagagcaagccttgatttcggcatcggcaaagcgt
gtcaattcccgtcgttggcgtcgacgactgaccacaggtgcactcgtcgccctcaccatg
ctatctgtgttgatgagttttcgcagtatcgaggccgagcagcgcgcattagacaagcgc
ctcgcggcagagaacctacttggatttatggtgggagattttgccgacaagctgcgcggt
atcggccgtatggatctgctcgatggcatcagtaataaggcgctggagtatttcagcgat
gaatcgaatacccatgatgccagcaactacagctttgaagcccgttttcagcacgctcag
accttagaggccataggtgaagtagcttattcccgtggcaagctagaagaagctaacgca
ggcttactaggagcaaaaactaaactcgaagccttgttagccgagcaatctgagaacctc
gagctactaaaaaccgctggagccaatgcgttttggctagggcagttggaatacgataaa
agtgactggactgctgctcagccttggtatgaacggtatcttagctatagccaaactatg
tatcgtatagcccctgatgatgccgatgccttgatggaactgtcttatgcccataatacc
ttgggctcgctttatatggagcaacaaaagtttaaagatgcgaggggagaatttaaagaa
tcattgcgacttaagttgttggctgttcaaaaacaacctcaaaatattctcctgaaagtt
gaggtagccgacactcgttcttggatcgcaagtgcagaactttctaatggtgagttacaa
gctagtatagagactcatatagctaatttagatatgttagaaagccttgagttcaatcag
aacaacgcttatttacaaaaaatattagcattaagtaatcactttttatctagacagttt
ttagctgtaggtaagcataatcaagctcgtgatagtgctgtaaaaagctataacatttta
cttagtatggtagaagtcgatcctagcaatcaaatgtggcaaacagaattgcttaagctc
aaattatttatgttacacatactccctcatgatgatagtggggagattaaattgactaat
cttcatagttctctggagctagaattaagcaagcaaagtgatccattaaaattgagccct
caatttcgagaatttatcgttttgtttcatagaaattcagcttatttgtatcaaagagca
tcattatggcaaaagagtatggtgcatattgagctagctaataaagaggtagggctcctg
atgaatgattttcctaatgctcttgaatataaatatctctttgctgaaatttcattgtta
gatgctagagtaaaaagagaagctgatgatcttgttggaatgagggagtcctgtaacatt
tcaaagaataatttagttcaaattaataagtttaatcagtcagctaaatacttgattcct
tttgctgactctttgcggtgcttaggagagatagagttctatccaagtgtgcaaaagtta
ctagctagggagaggattgtgtttagttatatccattaa

DBGET integrated database retrieval system