Shewanella glacialimarina: FJ709_08165
Help
Entry
FJ709_08165 CDS
T07885
Name
(GenBank) lipid-transfer protein
Organism
sgla
Shewanella glacialimarina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Thiolase_N
Thiolase_C
Ketoacyl-synt_C
ketoacyl-synt
ACP_syn_III
SpoVAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCX04476
LinkDB
All DBs
Position
1901297..1902466
Genome browser
AA seq
389 aa
AA seq
DB search
MSSIVIAGVGMTPFCKPGQHQPYRVMAANAIKLALADAGINAKQIQQAFGAYIYGDSTCA
QHAFYDVIQSGIPVINVNNNCSSGSTALYLARQAVMSGEVECALAFGFEEMQPGALGSNW
QDRESPFTRIAPVLNQFNAPDGPIALRAFGAAGRHYMDKYNVTAELFAKVAVKSRRHAMN
NPYALLKMPLCAEQVLADKVIYDGYLTRLMACPPTCGAAAVIVCSDKFAKQHGISSKVKI
LAQAMATDTQDSWQDPINAVGQSMTQMAAKKVYNAAGISPQDLDVIELHDCFTPNEVITY
EALGLCAEGEAEKFIKQGNNTYGGQFVIGPSGGLMSKGHPIGATGLAQCAELVWHLRDQA
GDRQVQGARLALQHNVGLGGAVVVTLYGK
NT seq
1170 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagcattgttattgctggcgtaggtatgacgcctttttgtaagccaggacagcat
cagccttatcgtgtgatggctgccaatgcaattaagttagctttggccgatgccggtatt
aatgctaagcaaatacaacaggcatttggtgcatatatttatggtgatagtacctgtgcg
caacatgctttttatgatgttattcaaagtggtatccctgttattaacgtcaataataat
tgctctagtggttctaccgcgttgtacttagccaggcaggctgtgatgtctggcgaagtt
gagtgtgcattagcctttgggttcgaagaaatgcagccaggtgccctagggtcaaattgg
caagacagagaaagcccatttactcgaatagcaccggtgttaaatcagtttaatgcaccc
gatggtccaatcgcattacgggcttttggagctgcgggccgccattacatggataaatat
aatgtcactgctgaattatttgccaaggttgcagtaaagtcccgtcgccatgcgatgaac
aacccttatgctttattgaaaatgccattatgtgcggagcaagtattggctgataaggtg
atttacgatggctatttaactcgccttatggcgtgtcctcccacttgtggtgcggcagct
gtcattgtatgcagtgataaatttgctaaacagcatggtataagctccaaggttaaaatt
cttgctcaagctatggcaaccgatacccaagattcttggcaagatcctattaatgcagtg
ggccagagcatgactcaaatggcggcgaaaaaagtgtataacgctgcaggtatatcgcca
caggatttagatgtgattgagctacatgactgctttacgcctaatgaagtcatcacctat
gaggctttggggttatgcgcagagggggaggctgaaaaatttattaagcagggaaacaat
acctatggtggccagtttgttattggcccttcaggtggcttaatgtctaaaggtcatccg
attggtgctacaggattagcgcaatgcgcagaacttgtttggcatttacgcgatcaagca
ggtgatcgtcaggtgcaaggagctcgcttagcattacaacataatgtgggtttaggtggt
gctgttgtggtgactttatacggtaaatga
DBGET
integrated database retrieval system