Sulfurospirillum halorespirans: SHALO_0417
Help
Entry
SHALO_0417 CDS
T04475
Name
(GenBank) outer membrane calcium-binding protein
Organism
shal
Sulfurospirillum halorespirans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
HCBP_related
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOO64213
UniProt:
A0A1D7TGU5
LinkDB
All DBs
Position
417361..425247
Genome browser
AA seq
2628 aa
AA seq
DB search
MEKIEVGYRNIGSMGGIEFYHKFLIYTRSDGSQYTISGWATNSPTDGTPYGKIQVEANFP
YDQTNPDYPSAGQKQYRELITEGNNLTDIWNNMIDNAVSKNNVYPYDPLVQNSNTFADSV
LKDAGLPSPINDNIFSYNEHWAPASDKELSKDVVPVVPNETLDGIKDNLKRMLGGWLDDI
ADQLGKSVDDVLKDIMGILASMGNSHSSVNPYDFNLTNSYFFQRCEPLALDTNKDGFIAT
TSVTESETYFDLTGDGIKERTGWIKGEDALLVYDANEDGQIGGISEVFGNATTEGFDELR
DTIDSNYDNKIDRKDILFNRLQLWHDYDQDGSVDEGELKSLKEEGITSIDLNSVQTNIET
NGHLISEASHYTTSTGEKELVADIHLAYDARDTIIDLVQQKDFTIDPTTLSLPNLRGYGL
VVDSFIAYQTNENLATLAKQYANNAELISNDFDEYINEWSGYNAYKAEIAKKYNLSADVD
MSDLDRKIWIMEKFSGKEELTSRIESNYETHAKTVTGNNDVTVTSINGQNRLVLVADYIN
TQYNTMLHRTESEFAIQSVFEDVFTGVSYSVDTDALSVTDASKLQQSLTNYLNDASIDID
SKVFLAQTIWMLNTTKSLTIDATALLATITDSMSHDLIQQTLTSGIDFTGTKGDDNLEVT
GNTLVLGNSGNDIIQSHDSANQTYLFRKGDGSDILFDAGGNDTLRFDQGILKEDVILSKE
GFDLLLSLKDSIDSVRVKDWFLNANRVENIVLSDGTTLDVTTILQQFTVTENADVIDLDN
QDNTINALGGDDTVRSFGGNDTITAGSGNDSVYAGSGDDKLYGNEGDDLLDAGSGNDTLV
GGVGADTLYGGAGNDLYMYTKGDGKDILSDESGEDTLRFSEGITKDDLIAKASGNDLIIG
IKEEGKTFDQLTDTITIKNYLSGGKLEHLLLNDGTALALNELQQGSEANDYLAYGNEAST
VNGLGGNDTIITGSGADVIDGGSGDDIIDAGDGANDVDGGVGNDTINAGSGNDALMGGSG
NDSIVAGSGADVITGGLGDDTLNGGLGNDTYIFNRGDGKDTIDDAYRYGYNNQLSQYSGE
DTLKFGESITKDDLVVLSVGNDVIIGIKEEGKSFAELSDKITLKNYTDSNTRVENILFAD
GSNFLVSDLFSATEGADQLIYGDVNVNVDALGGNDTIISGNGNDVIEGGSGNDTITSNNG
NDTLNGGSGDDTLYAGSGEDILSGGTGVDDLQGGLGADTYLFGKGDGKDSIYDDYRYSGS
YQGNAGLDTLKFGEGVTKDDLVIRVSGNDLIIGIKEEGKNFDALSDTVTIKEYFNANNRI
EKLQLSDGTLVALEELQQGTDGDDVLVFNDDNTTINALGGNDKITTGAGNDVIDGGVGND
TIYSNAGNDIITAGSGNDSVYAGSGDDKLYGNEGDDLLDAGSGNDTLVGGVGADTLYGGA
GNDLYMYTKGDGKDILSDESGEDTLRFSEGITKDDLIAKASGNDLIIGIKEEGKTFDQLT
DTITIKNYLTSGKLEHLLLNDGTALALDELQQGSEANDYLVYSNEASTVNGLGGNDTIIT
GSGADVIDGGSGNDTITSGGGADKIIGGTGDDVLNAEGGDDVLIGNEGADILQAGTGEDT
LSGGTGDDSLYGGLGDDTYIFNKGDGKDKLSDEGGTDFISFGTGIAKENLIFKQVGYDLI
VAIKEDGKTFSTLSDKITIANYFKDTTTIETLKFADGTQMTNSEVAALFVNVNIEDTIFS
KQGAVLRGGNGDDVYVYNQGDFTVVIDDYYYKDALEVNAGKDTLQFATGINKSDVTIGVN
GTSLIIKINSSETYQELQDIVVIKDWKSENRGIEKIIFSNGEVLDISKTETFPTITFNNT
WTSKRYYVYGNDNDDIAGTTSADTIEAAGGADVITAGAGNDIIYGQDGEDIIDGGSGDDR
LIGGAGDDYIKDDAGNDTYVFNKGDGRDIIKDTAGTDVLFFGEGISKDDIVLRVFDNNLA
VGLKEGTTSFYRLSDRIILKDWYSTGGRIESFQFSDGTSMSVSDIIQSIGTDSNDLINGL
DDQNDILNGGIGNDTLDGKDGNDTLNGGVGADTLIGGNGNDTFDGGYGNDTISDISGDDT
YMFGKGMGKDTITDSAGLDSIVMASGILKSDVIWQQVGNDLVIGIKEDGKTFDQLNDTIT
VKNWYTGGITNRVEIIKFTDGSTISSNDILPGTEGVDNLIYGAEDNIIHALAGNDTILAG
AGNDTLYGDAGNDNLQGEAGNDTLYGGAGDDNLYGQLGDDVLDGGAGNDSLQGRSGNDTY
LFGRGDGKDTVRENDFEDWNNKGNDTLKFKEGITADDILIKQVGHNLVIGIKEEGKTFDQ
LSDTITFENWLATSTQYYESNWSFNAYYSVENIAFSDGTTWNKADIMAHVGTDDNETIFG
LDGSDTIHGGKGNDVLYGRPGNDTYIFDRGDGKDTIYDSYGTNQNGNNAGNDTLKFGEGI
SVDDLIIQKSGNDVIIGIKEDGKTLAELSDIITIKDWYNVNNRIEHVVLSDGTEIDTAFL
FDPTENDDNLTYGAEDNEVHALGGNDLIVAGAGNDTLYGDAGNDNLQGEAGNDTLYGGAG
DDNLYGQLGDDVLDGGAGNDSLQGRSGKIQSTIVMALIKMVTMLAMIP
NT seq
7887 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaattgaagtaggctacagaaatataggtagtatgggtgggatagagttttat
cataaatttttgatatatacaaggagcgatggaagccagtatacaattagtgggtgggcg
acaaactcccctactgatggtacgccatatgggaaaattcaagtcgaggcaaattttcct
tatgaccaaacaaatcctgattatccaagtgcaggtcaaaaacaatatcgtgagttaatc
acagaaggtaataatttgaccgatatttggaataatatgatagataatgcagtatcaaaa
aataatgtatatccttatgatccattagtgcaaaatagtaatacatttgccgatagcgtc
ttgaaagatgcggggttaccatcacctataaacgataatatttttagttataacgagcat
tgggcaccagcatcagataaagagttaagcaaagatgtggtacctgttgtccctaacgaa
actttagatggcattaaagacaacttaaaaagaatgctaggcggttggctagatgatata
gcagatcagttaggaaaaagtgtagatgatgtgctaaaagatattatgggtatcctcgct
tccatggggaactcccactcatccgtcaacccctacgacttcaacctgacaaactcctac
ttcttccaaagatgtgaacctctagccctagacaccaataaagatggcttcatagcaacc
accagtgtcacagaatcagaaacctacttcgacttaaccggtgatggtataaaagagcgt
acaggatggatcaaaggtgaagatgcactattggtttatgatgccaatgaagatggacaa
ataggtggtatttctgaagtatttggaaatgcaaccacagaaggcttcgatgaactacga
gacaccatcgactccaattatgacaataagatagatcgtaaagacattctctttaaccgc
ctccaactctggcatgactatgaccaagatggaagtgtcgatgaaggagagttaaaaagt
cttaaagaagaaggcatcacctccatagatttgaactctgtacaaaccaatatcgaaacc
aatggtcaccttatcagtgaagcttcacactatacaacctccacaggtgaaaaagaactc
gtagcagacatccacctagcctacgatgcacgagataccattatagacctcgtccaacaa
aaagactttaccatagacccaactaccttaagcctacctaaccttagagggtatggactt
gtggttgatagtttcatcgcttaccaaaccaatgagaacttagctacccttgccaagcaa
tatgcaaataatgcagagcttatatccaatgactttgatgagtatatcaatgaatggagt
ggctataacgcgtataaagcagagatagctaaaaaatacaacctaagtgcagatgtcgat
atgtctgatcttgatcgaaagatatggatcatggagaagttctcaggcaaagaagaactc
accagtcggatagagtcaaactatgaaacccacgctaaaacagtgacaggcaacaatgat
gtcaccgtaacttccatcaatggtcaaaacagactcgtcctagtagcagattatatcaat
acccaatacaacacaatgctccaccgaaccgaaagtgaatttgccatccaaagtgttttt
gaagatgtcttcacaggtgtaagctacagtgttgatactgatgctttaagtgtaacagat
gcaagtaaattgcaacaaagtttgaccaattatctgaatgatgcttctatcgatatagac
tctaaagtatttttagcacaaaccatttggatgctcaatactacgaagtcattaaccatc
gatgccacagcccttttagcaacaatcaccgatagcatgagccacgatctcatccaacaa
acgttgacttcaggcattgattttacaggaactaagggtgatgataatcttgaagttact
ggcaataccttagtccttggcaatagtggcaatgacatcatccaatcacacgatagtgcc
aaccaaacctatctttttagaaaaggtgatggctctgatatactctttgatgcaggtggc
aatgatactttgaggtttgatcaaggcatccttaaagaggatgtaattctttcaaaagag
gggtttgatcttttactttcacttaaagactccatcgatagtgtacgtgttaaagactgg
tttttaaatgccaatcgtgttgaaaatatcgtgttaagcgatggaacaacactggatgtt
acaaccattctacaacaattcaccgttactgaaaatgctgatgtcatagacttagataac
caagacaataccataaatgctttgggtggcgatgacaccgttcgctcgtttgggggaaat
gacaccatcaccgcaggaagcggaaacgatagcgtgtacgcaggtagtggagatgataaa
ctctatggcaatgaaggcgatgacttgctcgatgcaggaagtggaaatgacactctcgtc
ggaggagtaggtgcagatactctttatggaggagccggaaatgatctttacatgtacact
aaaggtgatggtaaagatattctcagtgatgagagtggtgaagataccttgcgttttagt
gaaggcatcactaaagatgatcttatcgccaaagccagtggcaatgacttaatcatcggc
attaaagaagagggaaaaacctttgatcaactaaccgatacgattaccattaaaaactac
cttagtggtggaaagttagaacatttacttttaaatgatggaacagctttagcgttaaat
gaactccaacaaggcagtgaagccaatgactatttagcctatggcaatgaagcctcaacg
gttaatggacttggtggcaatgataccatcatcacgggaagtggtgctgatgtcattgat
ggcggaagcggagatgacattatcgatgcaggagatggcgctaatgatgttgatggaggc
gttggcaacgatacaatcaatgcaggcagtggcaatgacgctcttatgggcggaagcggt
aacgatagcattgttgcaggatcaggtgcagatgtcatcacgggtggtttaggcgatgat
acgctaaatggtggacttggcaacgatacctacatctttaatcgtggtgatggcaaagat
accatcgatgatgcgtaccggtatggatataacaatcaactaagccagtattctggcgaa
gacacgcttaaatttggagaaagcatcaccaaagatgatcttgttgtgctgagtgttgga
aatgatgtcatcattggcatcaaagaagaaggtaaaagctttgcagaactaagcgataaa
atcacccttaaaaactacaccgattcaaacacccgcgttgaaaacatcctttttgcagat
ggttctaactttctcgtaagtgatctctttagtgcaaccgaaggggctgatcagctcatt
tatggcgatgtgaatgtcaatgttgatgcccttggaggaaatgacaccatcatttcagga
aatggcaatgacgtcatagaaggaggaagcggaaatgacactatcacttcaaacaatggc
aacgacacgctaaatggtggaagtggagacgataccctttatgcaggttcaggtgaagac
atactaagtggtggtacaggagtcgatgatcttcaaggtggactaggcgcagatacttac
ctctttggtaaaggcgatggcaaagatagcatctatgatgactaccgttatagtggcagt
taccaaggcaacgcaggactagataccttgaaatttggagaaggtgttaccaaagatgac
cttgttatccgagtcagtgggaatgaccttattatcggcattaaagaagagggtaaaaac
ttcgatgcactgagcgacaccgtcacgattaaagagtacttcaatgctaacaaccgtatc
gaaaagctacagttaagcgatggcactttagttgcacttgaagagctccaacaaggaacc
gatggagatgacgtccttgtctttaatgatgacaatacgactatcaatgctcttggtggc
aatgataaaatcaccacaggtgcaggtaatgatgtcatcgatggcggagtcggcaatgac
accatttatagcaacgcaggcaatgacatcatcaccgcaggaagcggaaacgatagcgta
tacgctggcagtggcgatgataaactctatggcaatgaaggcgatgacctgctcgatgca
ggaagtggcaatgacacgcttgtgggaggcgttggtgcagataccctttatggcggggca
ggaaatgatctttacatgtacactaaaggtgatggcaaagatatcctcagtgatgaaagt
ggtgaagataccttgcgttttagtgaaggcatcactaaagatgatcttatcgccaaagca
agtggcaatgatttaatcatcggcattaaagaagagggaaaaacctttgatcaactcact
gatacgattaccattaaaaactaccttaccagtggcaagttagaacatttactcttaaat
gatggtacagctctagcattagatgagcttcaacaaggcagtgaagccaatgattatctt
gtctatagcaatgaagcttcaacggtcaatggacttggtggtaacgatactatcatcaca
ggaagtggtgctgatgtcattgatggtggaagtggaaacgataccattacttcaggtgga
ggagcagataaaatcatcggtgggacaggagatgatgttcttaacgcagaaggtggcgat
gatgtactcatcggcaatgaaggcgctgacatccttcaagcaggtacaggagaagatacg
ctaagcggtggcacaggtgatgatagcctttatggaggactcggagatgacacctacatc
tttaacaaaggtgatggaaaagataaactaagcgatgaaggtggtaccgatttcattagc
ttcggtacaggcatcgcaaaagaaaatctcatctttaaacaagtaggatacgaccttatc
gtggcgatcaaagaggatggaaaaacctttagcacgcttagcgataagatcactatagcc
aattactttaaagacactacgaccattgaaacattgaagtttgctgatggaacccaaatg
accaacagcgaagtagccgccctctttgtcaatgtcaacatcgaagatacaatctttagt
aaacaaggtgctgtgcttcgtggtggcaatggtgatgatgtgtatgtttacaatcaaggt
gattttacggtggtcattgatgattattactacaaagacgcgcttgaggtcaatgcggga
aaagacaccctccaatttgctacaggcatcaacaaatctgatgtcaccattggtgttaat
ggaacaagtcttatcatcaaaatcaacagttctgaaacctaccaagagttgcaagatatc
gtggttatcaaagattggaagtctgaaaatcgaggcattgaaaagatcatctttagcaat
ggtgaagtgctagacatctctaaaaccgagacatttcctaccatcacgttcaataacact
tggacttcaaaacgctactacgtttatggcaatgacaacgatgatattgctggaaccacc
agtgccgataccatcgaagctgccggtggagccgatgtgattactgccggtgctggcaat
gacatcatttatggtcaagatggggaggatatcatcgatggcggatccggcgatgacagg
cttatcggtggagccggtgatgactatatcaaagatgatgcaggtaacgatacgtatgtc
tttaacaaaggcgatggtagagatatcatcaaagataccgctggaacagatgtactcttc
tttggagagggcatcagcaaagatgatatcgtccttcgtgtctttgataataaccttgcc
gttggactcaaagaaggcacgacctctttttacagacttagtgatcgcattatcctaaaa
gattggtacagtacaggcggacgcattgagtccttccagtttagtgatggcacatcgatg
agtgtcagtgacatcatccaaagtattggaacggatagcaatgatctcattaatggactt
gatgaccaaaatgacatcttaaatggtggcatcggtaatgatacacttgatggtaaagat
ggaaatgatacactaaatggtggtgttggtgcagatacactcatcggtggaaatggcaat
gatacctttgatggcggttatggaaatgacacgataagtgatatcagtggtgatgatacc
tatatgtttggtaaaggcatgggaaaagataccatcaccgatagtgcaggacttgatagc
attgttatggcaagcggcattctaaaaagtgatgtcatctggcaacaagtaggcaatgac
cttgtcattggcattaaagaagacggaaaaacatttgatcagcttaacgatacgattacg
gtcaagaattggtataccggtggaattactaatcgtgttgagataattaaatttacagat
ggaagtacgattagttcaaatgatattctccctggaactgaaggagtagacaacctaata
tatggcgcagaggacaacattattcatgcattggctggcaatgacactatcttagcagga
gctggcaatgacacactttatggtgatgcaggaaacgataacctccaaggcgaagcaggg
aatgatacgctctatggcggagctggagatgataacctctatggtcaattaggggatgat
gttcttgatggtggagctgggaatgatagcctgcaaggtcgaagtggaaacgatacctac
ctctttggtcgaggtgatggaaaagataccgtaagagagaatgacttcgaagattggaat
aataaaggtaacgatactcttaaatttaaagagggaattaccgctgatgatattctaatc
aagcaagtgggacataatcttgttattgggatcaaagaagaaggtaaaacctttgatcag
ctgagtgatacgattacatttgagaactggttagctacttctacacagtattatgaatct
aattggagttttaacgcttattatagtgttgagaatattgcttttagcgatggaacgaca
tggaataaagcggatattatggcgcatgttggaaccgatgataatgagacgattttcgga
cttgatggatccgataccattcatggtggtaaaggaaatgatgtactttatggaagacca
ggtaatgatacttacatctttgaccgaggagatggtaaagatacaatctacgatagttat
ggcactaatcaaaatggtaacaatgctggcaatgataccttgaagtttggagaaggcatt
agcgtggatgatctgattatccaaaaaagcggtaacgatgtcattattggtattaaagaa
gatggaaaaacattggcagagcttagcgatatcatcaccataaaagattggtataacgtt
aacaatcgaattgagcacgttgtactcagtgatggcactgagatagataccgcattctta
tttgacccaactgagaacgatgataacctaacgtatggcgcggaggataacgaagtccac
gcattaggagggaatgacttgatcgtagccggcgcagggaatgacacactttatggtgat
gcaggaaacgataacctccaaggcgaagcagggaatgatacgctctatggcggagctgga
gatgataacctctatggtcaattaggggatgatgttcttgatggtggagctgggaatgat
agcctgcaaggtcgaagtggaaagatacaatctacgatagttatggcactaatcaaaatg
gtaacaatgctggcaatgataccttga
DBGET
integrated database retrieval system
