Sphingobacterium sp. 21: Sph21_0313
Help
Entry
Sph21_0313 CDS
T01450
Name
(GenBank) malto-oligosyltrehalose synthase
Organism
shg
Sphingobacterium sp. 21
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_77
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ76895
UniProt:
F4C343
LinkDB
All DBs
Position
complement(337862..342088)
Genome browser
AA seq
1408 aa
AA seq
DB search
MYTVFNPVATYRVQFHKGFTFKDALQLVPYWQALGVKSLYASPIFEAVPGSTHGYDVINP
LTVNPEIGTLDELRTLTAKCKAHGLAWIQDIVPNHMAFHDANTWLMDVMEKGTNSPFANV
FDTGLGNVFFQGAIMVPFLGSTLEKAIDQKEIKLVWKKSKLWLAYYDQLYPVNLNAYRAI
MDRLLKRSPNEAKSAKSALDKAEQTRKGSASGFETSWLNFLDEWNKYTQAPGVQNRLKRL
LEQINHDQEALIAVCEQQYYRLCSWKETNLKINYRRFFTVNSLICTQVQRDDVFTLTHQF
IKQMVDEACFQGLRVDHIDGLFDPEKYLHDLRKLVGPEVYIVVEKILEDKEKLPAVWPIQ
GTSGYDYLALSNKLFTADRERAFNKIYNQVVGRHNDDICQQTIEKKSYILHQHMQGEAAN
LFEFFRRSKFLSDVELESLDVTLLKEAISSILIFCPVYRFYGNSFPLESSERKQLKALFQ
AIRANKPNLIAALDVLEELLLTVPKNNNKRFNERLLYFYQRLMQFSGPLMAKGVEDTLMY
TYNRFIGHNEVGSSLSTFGFSKKAFHMEMEERQRHWPLTMNGTATHDTKRGEDARARLQA
LSCLPKKWQTTVSNLENAVKSRQIVVPEVNDRYFIYQTLLATYPLIEEEREDYPTRLSAY
LEKALREGKVHSDWAEPDQEYEEKCINFALSMLDEEAGLWPLWAPLLEEVDRYGMLNSLG
QVLLKTTAPGVPDFYQGTEYQDLSFVDPDNRRKVDYKLRYRFLKSIEKKDIDLLTYWREH
PNGNIKMAMIVKLLHYRSQYAKLFEQGLYLPLKVRGRYRNHILAFCRRFGQQWSIAIIPL
YIAELCIDQACPIEDINWKDTRIDWPEDIPLDFVDVLNNENGQVERALHLADLFRNRLPL
TVLHIEEEEKTRAAGVLLSLTSLPSAFGIGDLGPQAQRFASQLSRAGQRLWQLLPLNPTG
AKEYYSPYSAYSVFAGNPILISPEVLVQKGLLTVKELADARLPMHSQVSYDEVSASKQKL
LHAAFLRFIEGKRNSYQEGFERFMRTERDWLDDFAMYLLLKKQQEGQPWYKWPDKLKLRD
RQTLVDFAKKYKMDLLELKWQQYEFFNEWKALKAQCEALSIQLLGDLPIYVNYDSVDVWT
NRHLFSLGENGNLRGVAGVPPDYFNAEGQLWGMPTFNWKAHEQEKYAWWLARFKKNLEWY
HSIRLDHFRAFYDYWEVPASKENAVEGTWKIGPREKLFKLVKEKLGAVALIAEDLGDISP
GVYELRDRLGLPGMRVLQFAFGEDAPYSLHIPHQYSINSVVYTGTHDNNTVVGWYQEELD
RAGKDRLQYYQGHKVKGANIHEEMIRMAYASVAKLAIIPMQDVLGLGKEARMNTPATTGI
NWKWRLLDNQFRSKHIKWLRELAKTYAR
NT seq
4227 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatactgtttttaatcctgtagctacttatcgtgttcagttccataaaggatttacc
ttcaaagatgcactgcaattagttccttattggcaagctttgggtgtaaaaagtctttat
gcatctcccattttcgaagcggtgcctggaagtacccatggatatgatgtcataaacccg
cttacagtaaatccggaaataggaacgctcgatgaattgcgaacactcacggcaaaatgt
aaagcgcatggacttgcgtggatacaagatattgttcctaatcatatggcttttcatgat
gcaaacacttggctaatggatgttatggaaaaggggactaactcgccctttgccaatgtg
tttgataccgggctcggtaatgttttttttcagggagctattatggtgcccttcttaggg
tcgactttagaaaaagccatcgatcaaaaggaaattaaattggtatggaagaaaagcaaa
ttatggttagcttactatgatcagctttatcctgtaaacttgaatgcctatcgagcaata
atggatcgtttactcaaacgcagtccaaatgaagcaaaatcagcgaaaagcgctttggat
aaagcagaacaaacaagaaaagggagtgcgtcggggttcgaaacatcatggctgaacttt
ttggatgaatggaataaatatacgcaagcgccgggagtgcaaaaccgattgaaacgttta
cttgagcagataaatcatgaccaggaggcactgatcgcggtttgtgagcagcaatactac
cgtctgtgcagctggaaggaaacgaatttaaaaattaattatcgtcgtttttttacagtt
aatagtttgatctgcacacaagtgcaaagagatgacgtatttacgctaacacatcaattc
ataaaacaaatggttgacgaggcctgctttcaaggcttgcgtgtagaccatattgacgga
cttttcgatccggaaaagtatttgcacgatttaagaaagcttgtaggacctgaggtatac
attgttgttgaaaagattcttgaagataaggagaagcttccggccgtctggcctatccaa
gggacttccggctacgattatttagccctttcaaacaaacttttcaccgcagacagggaa
cgtgctttcaataaaatttacaaccaagtggttggtcgtcataacgatgatatttgtcaa
cagacgatagaaaagaagtcttatattttgcaccaacatatgcagggtgaggccgccaat
ctatttgaattttttcgacggtctaagtttttatcggatgtggaactcgaatcgcttgat
gttaccctgctgaaagaagcgatctcttccatcctaattttttgtccagtctatagattt
tatggtaacagctttccattagagtcaagcgaaagaaagcaattaaaagcgctttttcag
gctattcgagctaacaagccaaatctcattgctgcgcttgacgttttggaagaactcctg
ttgacagtgccgaaaaacaataataaacgttttaacgagcggctattatatttttatcaa
cgactcatgcagttttccggccctttgatggcaaaaggtgtggaagatacgctgatgtat
acgtataaccgctttatcggccacaatgaagtggggagttcgttgtcaactttcgggttt
tcaaagaaagctttccatatggagatggaagaacggcagcgccattggccgctgaccatg
aacggaacagccacgcatgataccaagcgcggagaggatgcgcgggctagactgcaagca
ttgagctgtttgcccaaaaaatggcagaccacggtatcgaatctggagaatgcggtaaag
tcaaggcagatcgtcgttcctgaagtgaatgaccgctattttatttatcaaacgttattg
gcgacttatccactcattgaagaagaacgtgaggattatcctacaaggttatcagcctat
ctggaaaaggcactaagagaagggaaagtgcatagcgattgggcggaaccagatcaggaa
tacgaagaaaagtgtattaattttgctctttccatgctcgatgaggaagcaggtttatgg
ccgctatgggcaccgctattggaagaagtggataggtatggaatgcttaattcactggga
caggtattgttaaaaacaacagctcctggagtcccggatttttaccaaggtacggaatac
caagaccttagttttgttgatcccgacaacagacgcaaggttgactacaagctacgctac
cgatttttaaagtcgattgagaagaaagatattgatttgctcacatattggcgcgaacat
cccaatggcaatataaaaatggcgatgatcgtaaagttgctccattatcgatcacaatac
gctaagttgtttgagcaaggactttatttgccattgaaggttagagggcggtatcggaat
catatactagctttttgtcgtcgattcggccaacaatggagtattgctattattccttta
tatatcgctgagttatgtatagatcaagcttgtccaattgaggatattaattggaaagac
accaggatcgactggcctgaagatattcccctcgattttgttgatgtattaaataatgaa
aatggacaagtagagcgagcgctgcatttggctgatctgtttaggaaccgtttgccgcta
acagttttgcatatagaagaagaggagaagacgcgggccgcaggcgttttgttgtcactc
acttcgctcccttcggcatttggtataggagatttagggccacaggctcaacgctttgct
tcacagctttcgcgtgccggccaacgcctttggcaattacttccattaaaccctaccgga
gcgaaggaatattattctccttacagtgcttattctgtatttgcagggaacccgatttta
atcagcccggaagtattggttcaaaaaggcttactaacggttaaggaattggcagatgca
aggctacctatgcattcccaagtctcgtatgatgaagtttcagcaagcaaacaaaagctg
cttcatgcagcatttttacgctttattgaagggaagcgaaatagctatcaggaaggcttt
gagcgtttcatgcggactgagcgtgattggttagatgattttgcaatgtatctcttactg
aaaaaacagcaagagggacaaccttggtataagtggcccgataaattgaaattacgagat
agacaaaccctcgttgattttgcaaagaagtataagatggacctcttggagctgaaatgg
caacaatatgagttttttaacgagtggaaagctctgaaagcgcaatgcgaagcattgtca
atccaattgttgggtgatcttccgatatatgttaattacgattcagttgatgtttggacc
aaccggcacctgtttagtttaggcgagaacggaaacttgcgcggagttgccggcgtacct
cccgattactttaatgccgaaggacagctatggggaatgccaacctttaactggaaagcc
cacgagcaagagaagtatgcttggtggctagccagatttaaaaaaaatctcgagtggtat
cattccattcgtttagatcatttcagagctttctatgattattgggaagtcccggcatct
aaagaaaatgccgtggagggcacttggaaaatcgggccacgtgagaaactctttaaatta
gtgaaagaaaagcttggagccgttgcgttaatagctgaagacttgggcgatataagtcca
ggcgtctacgaactgcgagaccggcttggtctcccggggatgcgggttttacagttcgct
tttggagaggatgcgccttactcgcttcatattcctcatcagtattcgataaacagtgtt
gtttatacaggcacacacgataacaacacggtcgttggctggtaccaggaagagcttgat
cgagcaggaaaagatcgcttgcagtattatcaaggtcataaggttaagggcgctaacatc
catgaagaaatgatcagaatggcttatgcctctgtcgctaagctggctattatccctatg
caagatgtgcttggcttgggcaaagaggcaagaatgaatacaccggcaacaacaggaata
aattggaagtggcggcttttagacaatcaattccgctcaaagcatattaaatggctcaga
gaacttgctaaaacatacgcccggtaa
DBGET
integrated database retrieval system