Sphingobacterium sp. 21: Sph21_3264
Help
Entry
Sph21_3264 CDS
T01450
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug
Organism
shg
Sphingobacterium sp. 21
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
GD_AH_second
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ79805
UniProt:
F4C5J6
LinkDB
All DBs
Position
complement(4041644..4044913)
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MKRKLLLFFVGLFFVPALLLAQEKTVTGKVTSKVDKLPLPGVSVLIKETNQGTKTDENGR
YAISVSKGQTLIFSYIGFTPQEIAVGDGSLIDVVFQSGETSLDEVVVVGYGTQKRANLTG
AVSTIDVEKTIGQRPVSDVGRALQGAAPGLTVTTASGDLGRNPKIRLRGLSGSLNGEGAQ
PLILVDNVEVQNLQMVNPEDIENISVLKDAASASIYGARGAWGVILITTKSGKKNTPNRI
TYNNNFGWQTPTQTPEIAGAVEGAEMVLQAMRRQANNPNINQFTVLGMSYDELGIQKIRD
WVSAYGDGKGLDDEMVMGRDFEVRDNKLFFYRPWDVNERYMKTWTPQQRHNIGFTGGGEN
TSYNLNLGYQNQDGVLKVKPDKFDRYNFSVGVNSKINDWVDARGKVLFTSTNIETPFSFS
SATYGPWYYLYRWPATYPYGTYEGKPFRSALTETEQGQMNEDKEQFARISAGLTLHPFEG
FTIDFDYTYSSTNQHLKYIGGGTSAIDFWSGTLNYLENYQSPAYDYVQYNANWNNMNTGK
LFATYNKQINDHNFKFIVGGDVESFKEQEQLSKRMGIVDPNLPELGYATGDQFANGVNRH
WSTLGVFGRINYAYKDKYLLELNGRYDGSSRFPLNDQYGFFPSLSAGYVLSEEEFFKPLA
PYFTFLKLRGSYGSIGNQAVVRSSDPSSFYPFLPLMTPATSGWWMGDQNMLTVGTPSLVS
QTLTWETVTTMDFGVDSRFFDNSLGFSFDWYKRTTSDMLSAGITVPSTLGAGAPRRNYGE
LQTTGWELAIDWSHTFSNGLQLNLSGNLSDFQEKITKFANTTNGINSNYQGKTIGEIWGL
ETDRYFNEGDFNGQDENGKWVLKEGIPTQGPLNSVEDNATSWFQFGPGDIKYRDLNGDGK
IDVGSSTLDDHGDLKVIGNTTPRYQYGFRIGANWKGFDFDAFFQGVGKRDFWASGPLFIP
GYRIEAFYAHQTDYWTPENTDAFYPRIVNTQQSNNSFNFRTQTKYLLDLSYLRMKNITFG
YTLPKSLVQKIKLQNVRIYFSGENLFEFSNVGMPIDPEVDYTDEQTDQTSFGRVYPYRRT
ISFGLQVTL
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgaaaactacttttatttttcgtagggctattttttgtgccagccctcctcttg
gctcaagaaaaaacagtcacgggaaaggtcacgtcgaaggtcgacaaactaccgcttcct
ggtgtgtctgttcttattaaagagactaaccaagggactaaaacggatgaaaatggccgc
tatgcgatcagtgtttcaaaagggcaaaccctaatattctcttatatcgggttcacccct
caagagatcgcggttggtgatggcagcttaattgatgtggtcttccaatcgggcgaaacc
tccttggatgaagtcgtcgtagtaggatacggaacccaaaaacgtgccaacttgacggga
gctgtatcaaccattgacgttgagaaaacaattggtcaacgtccagtttcggatgtcggt
cgggctcttcaaggcgcggcaccaggcttaactgtaacaactgcgagcggtgatctcgga
agaaatccgaaaatacgcttgcggggactttcaggatcgctgaacggagaaggcgcccaa
ccattgattctagtggacaatgtggaggttcaaaacttacagatggtcaatccggaagat
attgagaatatatctgtattgaaagacgctgcttccgcttctatttatggagctagaggt
gcatggggtgtaattttaataaccacgaaatcgggaaaaaagaacacaccgaaccgtata
acttacaacaacaatttcggttggcaaacccctacgcaaacacccgagatcgcgggagct
gtggaaggagcggaaatggtcttacaggccatgcgtcgacaggcaaacaacccaaatatc
aatcaatttaccgttcttggtatgtcctacgatgaattgggcatacagaaaatcagggat
tgggtcagcgcgtacggagatggaaaaggtcttgatgacgaaatggtaatgggaagggac
tttgaagttcgggacaataaactattcttttaccgtccgtgggatgttaatgagcgatat
atgaaaacttggacacctcaacaaagacataatataggctttacgggaggcggagaaaac
actagttataacctaaatttaggctaccaaaaccaagatggggttttgaaagttaaacca
gataaatttgacagatacaatttttcagtgggggtaaactcaaaaatcaatgattgggta
gacgcaagaggaaaggtattattcaccagtacaaatatcgaaacccccttcagcttttct
tccgcaacctatggcccttggtattatttgtatagatggccagctacgtatccttatgga
acttatgaaggtaaaccatttagaagtgctttaacggaaacagagcaggggcaaatgaat
gaagacaaagaacaatttgcgagaatttcagcaggcttaacattacacccttttgaaggc
tttaccattgatttcgactacacatactcctctactaaccaacatctaaagtatatcggt
ggtggtacatcagcaatagatttctggtccggaacgcttaactatttggaaaactaccag
tcgcccgcttacgattatgtccagtacaacgctaactggaacaatatgaatactgggaag
ctattcgcaacctacaacaagcaaataaatgatcacaatttcaaatttatagtcggtggt
gacgtggagtcattcaaagagcaggaacaactgtcaaaacgaatgggaatagtggatcct
aatttacctgaactcggatacgcaacgggcgatcaatttgccaatggagtcaatcgtcat
tggtcaaccttaggtgtgtttggtcgaattaactatgcctataaagacaaatatcttttg
gaattaaatggaagatacgacggatcttcccggtttccgctaaatgatcaatacggcttt
ttcccctctttatcggcaggatacgtactttcagaagaggaatttttcaagccacttgcg
ccttatttcacgttcttaaaacttcgtggatcttatgggtcaatcggcaaccaagctgtt
gtaagaagcagtgatcccagttcattttaccccttcttacctttaatgacccctgctact
tcaggatggtggatgggagatcaaaatatgttaacagtaggcaccccatcccttgtatca
caaactctcacatgggaaactgttactacgatggattttggtgtcgattcacgctttttt
gataatagtctcggattctctttcgattggtacaagcggacaaccagtgacatgttaagc
gctggtatcacggttccaagtacactgggagcgggcgcacctcgacggaactatggtgaa
ctccaaacaactggctgggagctggctattgactggagtcatacgttcagcaatggttta
caattaaatttaagcggaaatttatccgattttcaggagaaaattaccaaatttgccaac
accacaaatgggataaactcgaactatcaaggaaaaactattggcgaaatttggggctta
gaaaccgatcgttattttaatgaaggcgactttaacggtcaagacgaaaacggaaaatgg
gtattaaaggaaggaattcctacacaaggtcccttaaatagtgtcgaagataatgccacg
tcttggttccaatttggaccaggcgatataaaatatagagatttaaatggtgacggcaaa
attgacgttggctcatccacgctagacgatcatggtgatttgaaagtaatcggtaatacc
actcccaggtaccaatatgggtttcgcattggtgctaactggaaaggtttcgattttgat
gctttctttcagggagttggcaaacgtgatttctgggcttcgggtccattattcatacca
ggctatcgcatagaagccttctatgctcaccaaactgattactggacccctgagaacacg
gacgccttctatcctcggattgtgaacacacaacaaagcaataattcattcaatttccgc
acacaaaccaaatacctgctagacctttcttatcttagaatgaagaatataaccttcggg
tatactttacccaaaagcttagtacaaaaaatcaagctgcaaaatgtaagaatttacttt
agcggcgaaaatttatttgagttttctaatgtaggaatgcctatcgatcccgaagttgat
tataccgacgagcaaaccgatcaaacttcattcggccgggtatatccctatcgtcggaca
atttcttttgggctacaagtcacattataa
DBGET
integrated database retrieval system