KEGG   Shewanella sp. MR-7: Shewmr7_1124
Entry
Shewmr7_1124      CDS       T00389                                 
Name
(GenBank) YD repeat protein
Organism
shm  Shewanella sp. MR-7
SSDB
Motif
Pfam: SpvB RHS_repeat FG-GAP_3 TcdB_toxin_midN DUF6443
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABI42123
UniProt: Q0HXN2
LinkDB
Position
1301496..1308701
AA seq 2401 aa
MLPLWTPHRHSSFAAFILLLGLSVGAPSEAALTKPDVEIDPILPSIPLPVAIPSLSGSRF
SSSVELRWSIDCSVTAVNIQESINNQSWTTIYTGLGQADNTAAYATFAVGGDVCSGDWSS
KRLLQLPNKTLPGYYYRINACKGSLCSAYSPSILVGTPSAPSTPSAPASISTPATNTTGA
FSVSWAGVSGATRYELQQRINGGVWVAKYSGTATSYALSGLASGTYQYQARACSTACSAW
KLSSNTQVSLPVLGSDWKNLSRVTVADAGGSDIEPAEVVDLNAAAVKGQAGVSGGQASYH
IPIDLPPGRNGVQPSISLSYNSQGGNGILGVGWSLNAGSSISRCGATFAQDGFTRAVTFN
ASTDRLCLDGQRLIVASGSYGASNAEYRTEMDSFVKVVQHGNINDSNSSFTVYKPDGSRA
TYGANANSRFVPSGLSTALSWKVTQESYSNGANTIDYQYDTSVAGEHLLSQILYTGSLGA
LGDRNITFYYQPRTDKRKSYLAGGLTTSTRLLSELKVNGAGGQSVHQYQFDYQLSPASGR
HLLRALAQCDALGHCTPQTQLTWRDSASTVKADELLIGGQAVFSGELDINKVTPHGDANG
DGSTDFPGYDSNAEQDMLGQNGFTHEKACYNDYVSDGWICVAFDADHDGKVDPFKSINNI
LHIQLSASGAASYVSTGIPFNPNRFPSPDRLMSATDLNGDGDVDLMVFTVVSGKGYWRAY
LNTGNASTPYSANSFQLIHETAIDPKLGSWPARPEVDVTMAGDIDGNGMVDFVVSSLGGS
GAANAPVPVLRSFILNNSTPQQWSVQWSSAPTYPFHTGDGFHFFQKLIDINGDELADIIS
WRMVNNDRVIGYELNQGRATFAPWVAFAGNLHLKERFHSVVVTAQEPMDVIYPQYFDSMQ
TADIDLDGIEEILLPGQRVITGCAYVMFPGGTSGSGIKRTLCGDALYGDLPVNSFNTVPS
KPITSSDFDDSIYQYDAIKFVLQVDGRWGLVKQSTPYYGSAHESRLVDTFGDGLVDMLTT
YGPRVPGTGQFNETWIQNPGSSMWGTRYGAYLSRNYGSGNGQTTNDYAATDYLQAVTDGL
GNRSEWRYRPLSTGEGSADQAKLYTTDHNEVGSGYVHFASSMYVVQSFKQSNGQSGENET
QYAYKGAMYNLQGRGFTGFNQIWEKDMQRDKTVHSVFKQKFPEVGLLMSQTVVAPNKNGV
KGTVVELKNTWVDNPQHKASLVRSKGVHHNIQTSSLQKSWDLDDGSLMSEIKQTVGTSPT
DVDEWGNIKKQTQKVTDYIKGQANTYTSVTETGFVPDVNNWWLNKFNWIKTSHNTAQRNW
GDDPVGTMDKAQWQLQTVNTWDSNHKLPTKVTYTGSNSSCNRVEETELNSYGLPRWTKTT
GQSSTCSAMTARQTSFTYTKDGTTQVDDGYLPYKVINAKGHITTTEYDMGLGLPTKVIAP
NNIVTQTEYDGIGRPVQVKQTGSPTRYLRYLLANEGNNPPQDNDNIPVMMTRTSGAGMPE
TEQYFDGQGRLLRTATQGFDGGYQYQDKHYDALGRLTRESTPYGNGTAADYTEFSNFDAL
DRPGRRTIPNGRSGGLESLYSYNGLTTDINVEGRLMSRTYGSQGWLYETVDAQNGTNRFA
YDSAGRPLVIRDANNCDIKATYNGFGHKTQVIDPNQGTTNFGYNSVGELDKQTDANGVVQ
TYVLDVLGRVTSKTTTGGSAPGTATFVWDTPKQGLLTSETENGVARTYAYTTALQLAQTT
VTVDGVSRTVKHQYDGFYGRPKALEYPNGLTLKYAYNDYGYLEQTSNAASGYLYRQVTAM
DEAGHTTGADLANRVMSESRSYYSEGTMASVAVDGPLGRIHAHYYDGYDDFMNLTSERDG
VTGLTKSYRYDTLNRLTEYQFSNTNPTFSATVNYGYDKVGNFLKKTDYSANSSTAYRYGG
SACGYKPNAVCQLDKLNGTTVSFQYDNRGNLRVGDGLTMTYNAMDKPLSVSGRGATTSFV
YGSDNMRAKQSRTVGSATTTTYYVDKYYEADSDGSWRAYLDDIAVLSYTSQRGHLLQFTL
KDRLGSATTLADQNGNIVSQRYFDPFGRTASTGGGHRTDIVNKNTLQSKLQDLDITNKNR
RGFTDHEHLNEQQLIHMNGRIYDYNLGRFMSVDPLIQSPTSTQSVNPYSYIMNNPLAGTD
PTGYAADYIAGVSFGYNAGLTTTQLELLNNAESCSYCTGEFAAGVNLGSDFKSAKREAGS
LFAGALFLAKAKLPALPNSGADSSIKTETGEAADIGSKPDSRVDSRPKFWASTNNDAVEE
SKDQDGVMRCSKCDTGLTGERQSNGKRDYQLGHPEDSPWVEQQDEWREKSKNGEDFTRRD
VTEKYQEGVKVECVGCNASHGGRLGNQRKSGSSGRGQSTGIKVVRVTGRLDSMKLDKLEK
K
NT seq 7206 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttgcctctgtggacaccgcaccgtcactcatcttttgccgcttttatattgctattg
gggttgtctgtgggggcaccgagtgaggcggcgctgacaaaacctgatgttgaaattgac
cctatattgccaagtattcctttacctgtagcaataccttctctttccggtagtcgtttt
tcgtcaagtgtcgaattacgctggagtattgattgctctgtcactgccgttaatatccaa
gaatccatcaataatcagtcttggacaacaatctatactggattaggtcaagcggataat
acagctgcctatgctacgtttgctgttgggggggatgtttgcagtggtgattggtcaagc
aaacgattattgcaactccctaataagaccctcccaggttattactaccgcatcaatgct
tgcaaaggttcattgtgtagcgcttatagcccttctattcttgttggcactccttctgcg
ccttctaccccctcggctccagcctctatctcgactcctgcaaccaatacaacaggggcg
tttagcgtttcttgggctggcgtcagtggcgctacgcgttatgagttacagcaacgcatt
aatggtggcgtatgggttgcgaaatattctggtacggccaccagttatgcattgtcggga
ctcgcttcgggcacctatcaatatcaagcgcgggcttgctcaacggcgtgcagtgcctgg
aagttatcaagtaatactcaggtcagtttgcccgtgcttggtagtgattggaaaaaccta
tcgcgggtgacggttgccgatgcgggcggtagtgatatcgagcccgctgaagttgttgat
ttaaatgcagcagcggttaaggggcaagctggcgtctcgggtggccaagcaagttatcac
attcctatcgatttaccgccaggacgtaatggtgttcagccttctatatcgcttagctat
aactcccaagggggtaatggcattttaggtgtgggttggtcactcaatgctggctcaagc
attagtcgctgtggtgcaacctttgcgcaggatggttttacccgtgcggtcacctttaat
gcctcaaccgataggttgtgtcttgacgggcagcgtttaattgttgcgagtggcagttat
ggggcaagcaatgctgaatatcgcactgagatggattccttcgttaaagtggtacagcac
ggcaacattaatgacagtaacagcagttttaccgtctataaacctgatggtagtcgagcc
acctatggcgcaaacgccaatagtcgctttgtgccaagcgggttaagcacagcactcagt
tggaaggtgacccaggagtcttattccaatggtgctaataccatcgattatcaatacgat
acgagcgtggcgggtgagcatcttcttagccagattttatatacaggtagtttgggcgca
ttaggtgataggaatatcacattttattatcagcctcggactgacaagcgtaaaagttat
ctggccggagggctaacaaccagtactcgtttgttatcagagcttaaggtcaatggtgca
ggaggacaatcagttcatcaatatcagtttgattatcaactgagtccggctagcgggcgc
cacttattacgagcgctagcgcagtgtgatgcattaggacactgcacaccgcaaactcaa
ctgacttggcgcgatagcgcatcgacagttaaggccgatgaactccttattggtgggcaa
gcggtattttcaggtgagttggacattaataaagtgaccccgcatggcgatgctaatggt
gatggttccaccgatttccctggatatgactcaaatgcagagcaggacatgctgggtcaa
aatgggtttactcatgagaaagcttgctataacgattatgtctccgatggttggatttgt
gttgcattcgatgcggaccatgacggtaaagtcgacccctttaaatccatcaacaacatc
ttacatattcaattatctgcatcaggggcagcttcgtatgtgtcaacgggcatccctttt
aatccgaatcgctttccaagccctgataggctaatgagcgcgactgacctcaacggagat
ggggatgttgacctgatggtctttactgttgtgagcggtaaaggctattggcgggcttat
ttaaatacgggtaacgcatcaacgccttattccgcgaattcctttcaattaatccatgag
accgcaatagaccctaaactgggaagttggccagcaagacctgaagttgatgtcactatg
gcgggtgatattgatggcaatgggatggtggattttgtggtgtcaagcttgggcggcagt
ggtgcggcgaatgcccctgtccccgtgttgcgaagtttcatcttaaataacagcacaccg
caacaatggagtgtgcaatggtcaagtgctccaacttatccattccatactggggatggt
tttcattttttccaaaagctgattgatattaatggtgatgaattagcggacattatttcc
tggcgcatggtaaataatgaccgcgtgattggttatgaacttaatcagggacgcgccacg
tttgccccttgggtggcttttgcgggcaatctacatttgaaagagcgtttccattcggtg
gtggtcacggcgcaagagcctatggatgtaatttacccgcaatactttgacagcatgcaa
acggctgacatcgatttagatggtattgaggagatattacttccaggtcagagggtgatt
acaggttgtgcctatgtgatgtttcccggtgggacttcgggcagcggcatcaaaaggaca
ctctgtggtgatgcgctctatggggatttgcctgtaaacagttttaatacggttcccagc
aaaccgattaccagttcagattttgatgattcgatttatcaatacgatgcaattaaattc
gtgttgcaagtcgatggccgctggggcttggtaaagcaatccaccccatattacggctct
gcccatgaatcccgcttggtggatacatttggggatggtctggttgatatgctcacaacc
tatgggccacgcgtgcctggcacgggacagtttaacgaaacgtggatacaaaacccgggt
tcaagcatgtggggcacgcgctatggcgcttacctcagccgtaactatggctctggtaac
ggacaaactaccaacgattatgctgctacagattacctgcaagccgttactgacggtcta
ggtaatcgtagcgaatggcgttatcgcccactgtcaaccggagaaggcagtgctgaccaa
gctaagctttatactacagaccataatgaggttggttccggttatgtccatttcgcctcc
agtatgtatgtggtgcagtcctttaagcaaagcaacggacagagtggcgaaaatgaaacc
caatatgcctataaaggcgcgatgtacaacctacaaggacgtggctttaccggatttaat
caaatctgggaaaaggatatgcagcgggataagacagtgcatagcgtcttcaagcagaag
tttcctgaggtgggattgcttatgtcacagacagtggtcgcaccgaacaaaaatggtgtc
aagggcactgtggttgagctgaaaaatacctgggtcgataacccgcagcataaggcaagc
ctagtgcgcagcaaaggtgtgcaccacaacattcagaccagctcgctgcagaagtcctgg
gatctggatgatgggagcctgatgtcagagataaagcagacggtaggaactagccctacc
gatgtggatgagtggggcaatattaaaaagcaaactcaaaaagtgactgattacataaag
ggtcaggcgaatacctataccagtgtgacggaaacaggttttgtgcccgatgttaataat
tggtggctcaataagtttaactggataaagacgagccacaatactgcgcagcgcaactgg
ggagatgacccggttggcacgatggataaggcgcagtggcaattgcaaacggtcaatacc
tgggatagcaatcataagttacccactaaagtgacttatactggcagtaatagtagttgc
aatcgcgtcgaagaaaccgaactaaacagttacggtctgccacggtggaccaaaaccaca
ggacaaagcagtacgtgtagtgccatgactgcaaggcaaacgagctttacctacaccaaa
gacggcacaactcaggttgacgatggctatctgccttacaaggttatcaatgccaagggc
catatcaccacaaccgaatacgatatggggctaggactccccaccaaagtgatagcgccc
aacaatatcgtcactcaaacagagtacgatggtatcggtcgtccggtgcaggtcaaacag
acaggcagtccaacccgctatttacgctatttactcgccaatgagggtaataatccgccc
caggacaacgacaatattcctgtgatgatgacccgcaccagtggtgccggtatgcctgaa
acggagcagtattttgacggccaaggtcgtttgctgcgcacggcaacccagggctttgat
ggggggtatcagtatcaggataaacattatgatgcgcttgggcgtttaacccgagaatcg
acgccctatggtaacggcacggcggcagactataccgagttcagtaattttgatgcgctc
gatagacccggcagacgcaccattcctaatgggcgctccggtgggctggagtccctatac
tcctataacgggttaaccacggatatcaatgtcgaaggacgcttgatgtcgcgcacctat
ggtagtcaaggctggttgtatgaaaccgtggatgcacaaaatggcaccaaccgctttgct
tacgatagtgccggtagaccgttagttatccgcgatgctaacaattgtgatatcaaagca
acttacaacggttttggccataaaacccaggtcattgaccctaaccaaggcaccaccaat
tttggttacaacagcgtaggcgaattggataagcaaaccgatgccaatggcgtggtacaa
acctacgtactcgatgtactggggcgcgttaccagtaaaaccaccacgggcggcagtgcg
ccaggtacggcaacttttgtgtgggacacgcccaaacaaggcctactcacctctgaaact
gaaaacggcgtcgctcgcacttatgcttacacaactgcactgcaattggcgcaaaccacg
gtgaccgttgatggtgtaagtcgtacggttaaacatcaatacgatggcttttatggtcgt
cctaaggcactcgaatacccgaacggcttaacactcaaatatgcctataacgattacggt
tatctcgagcagaccagcaatgctgcttctggctatctctatcgtcaagtcacagccatg
gatgaggcaggccataccactggcgctgaccttgctaaccgggtgatgtctgaatcacgc
agttattacagcgaaggcaccatggcaagtgttgcggtggatggcccgcttgggcgtatt
catgcgcactactatgatggttatgatgattttatgaatctcaccagtgagcgtgatggg
gtgacaggcctaactaagagctaccgttatgacacgcttaatcgcctaacggagtatcag
tttagcaataccaatccgacctttagcgccacggtcaactacggctatgacaaggtgggt
aacttccttaaaaagaccgactacagtgccaatagcagcactgcctaccgttatggcggc
agcgcctgtggctacaagccaaacgcagtgtgccagctagataaactcaatggcaccaca
gtgagttttcaatacgataatcgcggtaatttacgtgtgggtgatggtctcaccatgacc
tacaatgccatggataaaccactgagcgtctctggccgtggtgccaccacgagctttgtc
tatggcagcgataatatgcgcgccaagcaaagccgcacggtcggcagtgcaacgacaacc
acttattatgtcgataagtattatgaagcagacagtgatggtagctggcgtgcctacctt
gatgatatcgctgtactcagttatacctctcagcgtggtcatttgttgcaatttactctc
aaggaccgcctcggcagtgccaccaccctagccgaccaaaatggcaatattgttagtcaa
cgctactttgacccctttggacgaaccgcatcgacgggcggtgggcatcgtactgatata
gtgaataaaaatacgctgcaatcaaagttgcaggatttggatatcaccaataagaaccgc
cgcggttttaccgatcacgagcatctgaatgaacagcagttaattcatatgaacgggcgg
atttacgactataacctcggtcggtttatgagtgtggacccgttaattcagagtcccacc
tcgacccagagcgtgaacccgtattcctatatcatgaacaacccgctagcaggaacagat
ccaacggggtatgcagcagattatattgctggtgtatcgttcggatataatgctggctta
actactacgcagcttgagttgctaaacaacgctgaatcatgtagctactgtacaggggag
tttgctgctggtgtaaatttgggcagcgatttcaaatcggccaaaagagaagcgggctca
ttatttgcgggggcgttgtttttagccaaagccaagttaccagccttaccaaacagtggg
gctgatagtagtattaagactgaaactggcgaagccgcagatattggttcaaaacctgat
tctagggtagatagtagacccaagttttgggcgtcaacgaacaatgatgctgttgaggag
tccaaagaccaggacggcgttatgagatgttcgaaatgtgacaccggacttacaggagaa
aggcaatctaatggtaagcgagactatcaacttggtcatcctgaagactctccttgggtg
gagcaacaagacgagtggagggaaaaatctaagaatggagaagattttacgcgcagagat
gtaactgagaagtatcaggaaggcgtgaaagttgagtgtgttggatgtaatgcttctcat
ggtggacgtctgggcaaccaaagaaaatcaggttccagtggacgaggtcaatcaactggc
attaaagtggttcgagtgacagggcggctagatagtatgaaacttgataagttggaaaaa
aaataa

DBGET integrated database retrieval system