Shewanella sp. ANA-3: Shewana3_0480
Help
Entry
Shewana3_0480 CDS
T00428
Name
(GenBank) putative PAS/PAC sensor protein
Organism
shn
Shewanella sp. ANA-3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_3
Response_reg
HATPase_c
Peripla_BP_4
HisKA
PAS_8
Hpt
PAS_9
PAS
PAS_4
Peripla_BP_1
Phosphonate-bd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABK46721
UniProt:
A0KSF2
LinkDB
All DBs
Position
557774..562834
Genome browser
AA seq
1686 aa
AA seq
DB search
MAVFGILSGRLDKAIRHIFTTIGGQRQSVKPSVRVISSLGYFACLLSLSASLLWLWPNTI
AANEMSLQEHRQALSQLTPAQKLAHSHRVSMILEADRPFWNQVAKFAKIAAMDLNIQLDI
VYGDGTPETLLALGHEAIDNAVAGIIFVPILGMGQDLLVEAKRNNIPVVTINSEFAQSSL
ALRTQNPNWVGKVTMNSSNLGQNLLEKMFEEEASSEQMNLLLLAGSKDNLDVQKRTAELK
NAVSRQFANAKFKVVNTDWSASAARAAYLKAIQQDPNINTVIAMNTTMAMAVTHEAEADT
SRPMPHIGSLSWNHQLAQGIQKGTVAAGVGGVEFQGAFGLVLLFDYLNGVDTRAKGFEFQ
VLPLIISPNNYNDYYELLDFDSLQPDFSRVSLALNTNLFLVDFRLGSLIPNMDVHRFMTQ
LSVEERAFINNNPIVKVGIDPHSAPIDFIDENGIHRGMMADYLAEISRVVPLIFQTYNEG
SWQQAIDEFKRHDVDMLSLASANAGREQWMLFTDAINQYPPVIVTHVDGEHPSSLEQLKG
KSVSVVSGDVTQTQLLEDYPEIVLIPFENLEQALMAVKQHQVDAAFVNFPSTAYLLQSPQ
FNRLQIVSASDYRFGISMGVRKDWPELQSILNKALAQIPQDKVREIQHRWVNVQYELGLK
KQQVFDWAVRIAVAVVLVLLMFSLRNRRLNKDIAQRIHTEEQLSLSMNKFQALFDSAVDA
CVITDRQGVIIECNSALLSLLKYQHKHQLIGRRTLVYYPPHLGETDSETLFEQRLQTVLE
QGQLRFEADFVTSMAEIVNVEVTLKRIELNGSLFVLGTYHDLSERKLMNALLERERDLLK
HVLGRSPIGVWICIEGVCRYVNEQITEMTGLQVGQSVYPIFAQPDDYRCHISELDLSQDS
TVFETQLFDCKGQRRDVLLTAYHTVQDGQNANLCWALDITDTKSIQDELAIAKDAAEAAN
RAKSDFLANMSHEIRTPMNAILGMSYLVLQTELSSKQRDYVGKVHQAAGSLLGILNDILD
FSKIEAEKMDIECAVFDLDDVLSNLANVVSYKVEEKNMAFIFDLPPELPRYYHGDGLRLG
QILINYCNNAVKFSHNDSNVVLSCESKVHGEQVELTFCVEDFGIGIPEQKQGVLFGSFEQ
VDASTSREYGGTGLGLAICKRLAHLMGGEVWCESELGVGSRFYVRLTLDCADTYDPNALF
DPLAGETAKLIGLHPRLDKLLTIHGVSANMQVESADVGTVIAQLKQSSTRQLLICDYSAF
VPELLEALAVNQASRMLLIGQLSDQDSLRQLIENNDRVISQTKPLTPIAIGNALLSLLGH
QSEDGRQVQQDHSLHALKTQLAGAEVLLVEDNQLNQELAVELLRQAGINVTVANHGLEAI
ERVEQQYFDCVLMDCQMPVLDGYEATRRIRELPQFANLPILAMTANAMSGDIEKALAVGM
NDQITKPVHVKDLYTVMARWITPKQRKSVPLVLKRSTHAQDLPQLEGLSIQNGLSHCDHN
ESLYSHLLGLFINTSKTLLGQQQRAWQEENADELRLSLHTLKGVAANVGAMEISRLASEL
ELQCLTAKRSFTVELHEQLLALQTELQCLVSGLEIWYQQNNSIKPEASFSDEALAAMWPQ
LEQSLLEYNTNALEWVNKLTHAPQLQGESGLLKQLKMDVELFDFEQALVRLLTLKQAQQA
RATTCS
NT seq
5061 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgtttttggcattctttcgggtcgtttagataaggccattcgacacatctttacg
accattggcggccagcgtcaaagcgtaaaacctagcgtgcgtgttatctcctcgctgggg
tattttgcctgtctcttgagtctgtcggcgtctttactgtggttatggccgaatacgatt
gcggccaatgagatgtcactgcaagaacatcgtcaggctttatcccaattgacgccggcg
caaaaactcgcccatagccatagggtgagtatgattttggaggcggatagacccttttgg
aatcaagtcgctaagtttgccaagattgcggccatggatcttaatatccagctcgacatc
gtctacggcgatggcacgccggaaaccttactcgctctgggacatgaggcgatagataac
gccgttgctgggattatttttgtccctatcttaggtatgggacaggacctcttagtggag
gccaaacgcaacaatatccccgtcgtgaccattaactccgaatttgcccaaagctcattg
gccttaagaacccaaaatcctaactgggttggtaaggtgacgatgaatagcagtaatctg
gggcaaaatctgctcgaaaaaatgtttgaggaggaagccagctccgagcagatgaacctg
ttgctactcgcgggaagtaaggacaatctcgatgtgcaaaagcgtaccgctgaactcaaa
aatgccgtgagcaggcaatttgccaatgccaaattcaaggtcgttaataccgattggagc
gcctcggcggcgcgtgccgcttaccttaaggcgatacagcaagatcctaatattaatacc
gtgattgcaatgaacaccactatggccatggcggtgacccatgaggccgaagccgatact
tcgcgccctatgccccatattggttcgctaagttggaatcatcaattggcacaagggatc
caaaagggcactgtcgctgcgggtgtcggcggggtggagtttcaaggcgcctttggcctt
gtgttgctatttgattatttaaacggggtggatactcgcgctaagggcttcgagtttcag
gtgttgcctttgatcatcagccccaataactataacgattactatgagttactcgatttt
gactcactgcaacctgacttttctcgggtgtctcttgcgctaaatacgaatctgtttttg
gtggattttcgcttaggcagcttgatccctaatatggatgttcaccgctttatgactcag
ctaagcgtggaggaaagggcctttatcaacaacaatcctatcgtcaaggttgggattgat
cctcattccgctcccattgattttattgatgaaaacggcatccaccgtggcatgatggcg
gattatctcgccgagatcagccgcgtcgtaccgctgatcttccagacctataacgaaggt
tcttggcagcaagccatcgatgaatttaagcggcacgatgtggatatgttatcgctggcc
tcggccaatgctggccgtgaacaatggatgttatttaccgatgccatcaatcaatatccg
cctgtgatagtcacccatgtcgatggagaacatcccagcagtttagagcagcttaagggc
aagtcagtcagtgtggtttcgggcgatgtgacacaaacgcaactgcttgaagattatcct
gaaatcgtccttatcccctttgaaaatcttgagcaagcgttaatggcggtgaagcaacac
caagtcgatgctgcctttgtgaatttcccgagcacagcttacttattgcaatcgccacag
tttaatcgactgcaaattgtgtctgccagtgactaccgctttggtatctctatgggggtg
cgtaaggattggcctgagctacagagcattttaaataaggctctggctcaaatcccccag
gataaagtacgtgaaattcagcaccgctgggtaaacgtgcaatatgaactgggactcaag
aagcagcaagtatttgactgggcggtgcgaattgccgtggccgtcgtgcttgttctgctg
atgtttagcttgcgaaacagaaggttaaataaagatatcgcacagcggatccacaccgag
gagcagctcagcctgagtatgaataaattccaagccttattcgactcggcggtcgacgcc
tgtgtgattaccgataggcaaggggtgattattgaatgtaactcagccctgttatcacta
cttaaatatcagcataaacatcagcttattggtcgtcgcactctagtttattatccaccg
cacttgggcgaaaccgacagcgagaccctgttcgagcaacgtctacagactgtgctggag
caggggcagttgcgattcgaagccgattttgtgacctcaatggcggaaattgtcaatgtt
gaggtcacgcttaagcgcatcgagctcaatggctcgctgtttgtattgggcacctatcac
gatctgtcggaacgaaagctgatgaatgccttgcttgaacgcgagcgggatctgctcaaa
cacgtgttaggtagaagcccgattggcgtttggatctgtatcgaaggcgtctgccgctat
gtgaacgagcaaattaccgagatgacagggttacaagtgggccaatccgtttacccgatt
tttgcgcagcccgatgactaccgttgccatattagtgaattggatttaagtcaagacagt
accgtctttgaaactcaactatttgattgcaaagggcagcgccgtgatgtgttgttaacg
gcgtaccacacagtgcaggatggccagaatgctaacctctgctgggccttggatattacc
gacactaagtcgattcaggatgagctggccatcgctaaggacgccgccgaggcggcaaac
cgtgctaagtctgactttttagcgaatatgtcccatgagatccgcacgccgatgaatgcg
atcctcggtatgtcgtatttggtgttgcagacagagttaagcagtaaacagcgggattat
gtgggcaaagtgcatcaggcggcgggctcgctgctgggtattctcaacgatattttggat
ttttccaaaattgaggccgagaagatggatatcgaatgcgctgtgttcgatctcgatgat
gtgctgtctaatttggccaatgtggtgagttataaggtcgaagagaagaacatggcgttt
atcttcgatctgccgcccgaattgccccgctactaccatggtgatggcctgcgcttgggg
cagatcctgatcaactactgcaataatgcggtcaaattctcccataacgacagcaatgtg
gtattgagctgcgagagtaaagtgcatggtgagcaggttgagctgaccttctgtgtggaa
gattttggcattggtattccggagcaaaaacaaggggttctttttggctccttcgagcag
gtggatgcctctacttctcgggaatatggcggcacaggcttaggtttagctatctgtaag
cgcctcgctcatctgatgggcggcgaggtctggtgtgagagcgaattaggcgtcggcagt
cgtttttatgtcagactcactctcgattgtgccgatacctacgatcctaatgctttgttt
gatcccttagcgggagaaaccgctaagctgatcggtttacaccctaggttagataaactg
ctgaccatacatggtgtttcggcaaacatgcaggtcgagagtgccgatgtgggtacagtg
atcgcccaacttaaacagtcgtccacaaggcaattgctgatctgcgattacagtgcattt
gtgcctgaattattggaagcattggcggttaatcaagcatcgcgaatgttactgattggt
cagctaagcgatcaggactctcttagacaactcattgaaaataatgacagagtcatatcg
cagactaaaccgcttacgccgattgccataggtaatgcgctgttatccctgctgggacat
cagagtgaggatggcaggcaagtacagcaggatcattcgctgcatgcccttaagacccaa
ctggcgggcgcagaggtgttgttagtggaggataaccagctcaatcaagagttggcggtg
gagctattacgtcaggcgggcatcaatgtcactgtggcaaatcatgggcttgaggccatt
gagagagttgagcagcagtacttcgattgcgtattaatggattgccagatgcctgtgctc
gatggttacgaggcgacgcgtcgcatccgcgaattgccccaatttgccaacttaccgatc
ttggcgatgacggccaatgccatgtccggcgatattgaaaaggcactggcggtggggatg
aatgatcagatcactaagcctgtgcatgtgaaggatctctacactgtgatggcgcgctgg
atcacacccaagcagcgaaaatcagtgcccttagtattgaaacgctcgacccatgctcag
gatttaccgcagctcgagggtttaagtattcaaaatggtttgtcgcactgtgatcacaac
gaatcactctatagccatttgttgggcttatttatcaacaccagtaagaccttattgggg
cagcagcaacgtgcctggcaggaggaaaacgccgatgagctgcgcttaagcttgcacacc
ttaaagggcgttgccgccaacgtcggggcgatggagatcagccgccttgccagtgaactc
gagctgcaatgcctgactgcgaagcggagttttacggtcgagctgcatgagcagttattg
gcgttacaaactgagttacagtgtttagtcagtggcttagagatctggtatcagcagaac
aatagcatcaagccggaagcctcgttcagcgatgaagcgctcgcggccatgtggccgcag
ttagagcaaagcctgctggaatacaacaccaatgccttggagtgggtgaataagctgacc
catgcgccgcagttacagggggagtcaggcctgctcaaacagttaaaaatggacgttgaa
ctgtttgattttgaacaggcattagtgcgactactaacccttaaacaggcgcaacaggcg
agggcgacgacatgcagttaa
DBGET
integrated database retrieval system