Shewanella putrefaciens 200: Sput200_2134
Help
Entry
Sput200_2134 CDS
T02015
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)
Organism
shp
Shewanella putrefaciens 200
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
GAF
PAS
PAS_3
PAS_8
PAS_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV54589
UniProt:
E6XMK8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2421536..2423719)
Genome browser
AA seq
727 aa
AA seq
DB search
MKRRQHQHLLESLVHSTAKQQGDFAKTAELATELLCQNLTVSSVSVWTFSPDQQSQSLVA
QFGAMMLQDIHRPKLLQACPRYLYELKTRRHIDAGNTLIDPRLSELSQVYFNPRQVFSCL
DVGIRINGHLEGVLCIERTQVTPHWHDSEIHLACQMADQLALTLATKHAYDKEERLSLFR
SATEQSQQMSMLINLHTEKVEYVNQAHGEITGLTREQSIGSHLRELTFFKQHPQLAEETL
AQIFRGEQAKGEVQFRRADGSYYWLKYVVSQFITERGNHYALVSGEESTDEHNYKIELER
LAWRCSLTGLHNRSHFNRVLERTSKGLLLLVDLVGFKRFNDTYGHEHGDSLLIEIARRLK
HFSEINKATEIARVGSDEFVVLLTDDNAVYDLDYFSTRLYQHLSAPMLIGREQIEPKPAL
AVVDIASVANLFAPLTCADIAVQYAKKKKGTSIQVFNSTLLSAFKEDALIERDLHSAIRG
RQFELYYQPLRDLGLQTYIGAEALIRWHHPKKGVLYPGAFIDIAEQSGMINAIGSWVLEA
ACRQLNLWQHHNADLTMHVNVSARQFFSGNLYEQVWQLLTRYRLKPKTLILEITETELMG
DIRHATLLCQELAELGVGLAIDDFGTGYSSMRYLKQFPISKLKIDRSFISDLTISRESRE
IVSAIIAMANALNISLTAEGVETIEQEAFLAKSCCHQAQGYLYSPALREPEFAQFLLSAN
RSSVLTH
NT seq
2184 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaagcgacgtcagcatcagcatttattagagtctttagtgcattcaactgcaaaacag
cagggggattttgctaagaccgcagaattagcgacagagttattgtgtcagaatttaacg
gtttcttcagtttctgtatggacgttctctccagatcaacaaagtcaatctctcgtagca
caatttggcgctatgatgttgcaagatatccatagacctaaattattgcaggcgtgccct
cgttatttatatgaacttaaaacccgtcgtcatattgatgcgggtaacacgttgatcgat
ccgcgtctgagtgaactatcccaagtgtattttaatcctcggcaagtattttcctgcctt
gatgtgggaattcgcattaatggacatcttgaaggtgttctctgtattgaacgaacccaa
gttacaccccattggcatgacagtgagatacatttggcttgtcagatggccgatcagctt
gcattaacccttgccacaaaacacgcttatgataaagaagagcggctaagcctatttcgc
agtgcaacagaacaatcccaacaaatgagtatgttgatcaatttgcatactgaaaaagtg
gaatatgtgaatcaagcacacggtgagatcactgggctaacgcgtgagcaaagcattggt
agtcatttgcgagagttaaccttctttaagcaacatccccaactcgcagaggaaacgctc
gcacaaatctttaggggagagcaggcaaaaggtgaagtacaatttcgccgtgcagatggc
agttattattggcttaagtatgtggttagccaatttattactgaacgaggaaatcactac
gccttagtgtctggtgaagaaagcacggatgagcataattacaaaatagaactagagcgg
cttgcttggcgttgtagtttaacgggattacataaccgcagtcattttaatcgagtgcta
gagcgtaccagcaaagggctgctcttattggttgatcttgtcggctttaaacgctttaac
gatacctatggccatgaacatggtgatagtttattaattgaaattgcgcgccgtttgaaa
catttctctgagatcaataaagccacggaaattgcccgcgtagggagtgatgagtttgtg
gtgctgctgacggatgataatgccgtctatgatcttgattatttcagtacccgtttatat
caacatctatcagcaccaatgttaatcggtcgagagcaaatagaacctaaacctgcttta
gcggtggtggatattgcctccgttgccaatttatttgcgccacttacctgtgctgatatt
gcagtgcaatacgctaagaagaaaaaaggtacttcgattcaagtatttaatagcactttg
ctcagcgcttttaaggaagatgcactgatagagcgtgatttacacagtgccattcgtgga
cgtcaatttgaactttattaccaaccgcttagggatcttggattacaaacctatatcggt
gccgaagcgttgatccgttggcatcaccccaaaaaaggggttctatatcccggtgctttt
attgatattgctgagcagtcaggaatgatcaatgcgattggtagttgggtattggaggcc
gcttgtcggcaactcaatctttggcagcatcataatgccgatctgactatgcatgtaaac
gtctctgcacggcagttctttagcggtaatttatacgaacaagtatggcaattacttacc
cgttatcggttaaagcctaaaaccttaatcttagaaattactgaaacagagctgatgggg
gatatccgtcatgccacgttattatgtcaagagttagctgaattaggtgttggacttgct
attgatgattttgggacgggttatagctcgatgcgttatttaaagcaattccccattagt
aagttgaaaattgaccgttcctttatttccgatctcaccattagccgtgaaagtcgtgaa
attgtttcggcgattatcgctatggcgaatgcgttgaatatttctttaacggcagaaggg
gtcgaaactattgaacaagaagcctttttggcaaaaagttgctgccatcaggctcaggga
tatttatacagtcctgcactgagagaacctgaatttgctcaatttttactttcagcaaat
cgttcttctgtactgacacattga
DBGET
integrated database retrieval system