KEGG   Shewanella putrefaciens 200: Sput200_2134
Entry
Sput200_2134      CDS       T02015                                 
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)
Organism
shp  Shewanella putrefaciens 200
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF PAS_9 GAF PAS PAS_3 PAS_8 PAS_4
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADV54589
UniProt: E6XMK8
LinkDB
Position
complement(2421536..2423719)
AA seq 727 aa
MKRRQHQHLLESLVHSTAKQQGDFAKTAELATELLCQNLTVSSVSVWTFSPDQQSQSLVA
QFGAMMLQDIHRPKLLQACPRYLYELKTRRHIDAGNTLIDPRLSELSQVYFNPRQVFSCL
DVGIRINGHLEGVLCIERTQVTPHWHDSEIHLACQMADQLALTLATKHAYDKEERLSLFR
SATEQSQQMSMLINLHTEKVEYVNQAHGEITGLTREQSIGSHLRELTFFKQHPQLAEETL
AQIFRGEQAKGEVQFRRADGSYYWLKYVVSQFITERGNHYALVSGEESTDEHNYKIELER
LAWRCSLTGLHNRSHFNRVLERTSKGLLLLVDLVGFKRFNDTYGHEHGDSLLIEIARRLK
HFSEINKATEIARVGSDEFVVLLTDDNAVYDLDYFSTRLYQHLSAPMLIGREQIEPKPAL
AVVDIASVANLFAPLTCADIAVQYAKKKKGTSIQVFNSTLLSAFKEDALIERDLHSAIRG
RQFELYYQPLRDLGLQTYIGAEALIRWHHPKKGVLYPGAFIDIAEQSGMINAIGSWVLEA
ACRQLNLWQHHNADLTMHVNVSARQFFSGNLYEQVWQLLTRYRLKPKTLILEITETELMG
DIRHATLLCQELAELGVGLAIDDFGTGYSSMRYLKQFPISKLKIDRSFISDLTISRESRE
IVSAIIAMANALNISLTAEGVETIEQEAFLAKSCCHQAQGYLYSPALREPEFAQFLLSAN
RSSVLTH
NT seq 2184 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgaagcgacgtcagcatcagcatttattagagtctttagtgcattcaactgcaaaacag
cagggggattttgctaagaccgcagaattagcgacagagttattgtgtcagaatttaacg
gtttcttcagtttctgtatggacgttctctccagatcaacaaagtcaatctctcgtagca
caatttggcgctatgatgttgcaagatatccatagacctaaattattgcaggcgtgccct
cgttatttatatgaacttaaaacccgtcgtcatattgatgcgggtaacacgttgatcgat
ccgcgtctgagtgaactatcccaagtgtattttaatcctcggcaagtattttcctgcctt
gatgtgggaattcgcattaatggacatcttgaaggtgttctctgtattgaacgaacccaa
gttacaccccattggcatgacagtgagatacatttggcttgtcagatggccgatcagctt
gcattaacccttgccacaaaacacgcttatgataaagaagagcggctaagcctatttcgc
agtgcaacagaacaatcccaacaaatgagtatgttgatcaatttgcatactgaaaaagtg
gaatatgtgaatcaagcacacggtgagatcactgggctaacgcgtgagcaaagcattggt
agtcatttgcgagagttaaccttctttaagcaacatccccaactcgcagaggaaacgctc
gcacaaatctttaggggagagcaggcaaaaggtgaagtacaatttcgccgtgcagatggc
agttattattggcttaagtatgtggttagccaatttattactgaacgaggaaatcactac
gccttagtgtctggtgaagaaagcacggatgagcataattacaaaatagaactagagcgg
cttgcttggcgttgtagtttaacgggattacataaccgcagtcattttaatcgagtgcta
gagcgtaccagcaaagggctgctcttattggttgatcttgtcggctttaaacgctttaac
gatacctatggccatgaacatggtgatagtttattaattgaaattgcgcgccgtttgaaa
catttctctgagatcaataaagccacggaaattgcccgcgtagggagtgatgagtttgtg
gtgctgctgacggatgataatgccgtctatgatcttgattatttcagtacccgtttatat
caacatctatcagcaccaatgttaatcggtcgagagcaaatagaacctaaacctgcttta
gcggtggtggatattgcctccgttgccaatttatttgcgccacttacctgtgctgatatt
gcagtgcaatacgctaagaagaaaaaaggtacttcgattcaagtatttaatagcactttg
ctcagcgcttttaaggaagatgcactgatagagcgtgatttacacagtgccattcgtgga
cgtcaatttgaactttattaccaaccgcttagggatcttggattacaaacctatatcggt
gccgaagcgttgatccgttggcatcaccccaaaaaaggggttctatatcccggtgctttt
attgatattgctgagcagtcaggaatgatcaatgcgattggtagttgggtattggaggcc
gcttgtcggcaactcaatctttggcagcatcataatgccgatctgactatgcatgtaaac
gtctctgcacggcagttctttagcggtaatttatacgaacaagtatggcaattacttacc
cgttatcggttaaagcctaaaaccttaatcttagaaattactgaaacagagctgatgggg
gatatccgtcatgccacgttattatgtcaagagttagctgaattaggtgttggacttgct
attgatgattttgggacgggttatagctcgatgcgttatttaaagcaattccccattagt
aagttgaaaattgaccgttcctttatttccgatctcaccattagccgtgaaagtcgtgaa
attgtttcggcgattatcgctatggcgaatgcgttgaatatttctttaacggcagaaggg
gtcgaaactattgaacaagaagcctttttggcaaaaagttgctgccatcaggctcaggga
tatttatacagtcctgcactgagagaacctgaatttgctcaatttttactttcagcaaat
cgttcttctgtactgacacattga

DBGET integrated database retrieval system