Sesamum indicum (sesame): 105171406
Help
Entry
105171406 CDS
T04135
Name
(RefSeq) mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A isoform X1
KO
K27472
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33
Organism
sind
Sesamum indicum (sesame)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sind00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
sind03021
]
105171406
Transcription machinery [BR:
sind03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
Other mediators
105171406
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Xpo1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105171406
NCBI-ProteinID:
XP_011090810
UniProt:
A0A6I9U062
LinkDB
All DBs
Position
LG10:complement(830247..839778)
Genome browser
AA seq
1326 aa
AA seq
DB search
MEVATQLNCNIWDRVLGQTKEAQEKGRDPLLWAIQVSSNLSSAGIPLPSLELANHLVSHI
CWDNNVPISWKFLEKALALKIVPPLLVLGLLSTRVISYRHSCPAAFRLYMELLKRHAFSL
KEHTNLPNYQKTMDSLDQVLHLSQIFGLQANEAGALLVMFVFSIVWQLVDASLDDEGLLE
LTENDPRWPVRPQAMQVDVHNMYEEKRKEYRERFLTINTIMAIQLLGQFLRNKVTSRILY
LARQNMYAHWKSFIQKMQLLVENSLALRNSKSITPEVLRQLISDSHSFKLQHFQASLLQE
FHPVVQSRPLVNPAGLCLGTSRSGLWLPLDMLLEDAMDGSQVNATSAVEIITGLVKSLQA
INATSWHEIFLGLWMAALRLVQRERDPIEGPVPRLDTRLSMLLSITTLVVADLVEEEESV
AADEFGYDLGNKNQVPGKRRMDLIFSLQNLHDYQSLLTPPQSAIPATNQAAAKAMMFVSG
INVGTAYFECMSTMDMPIDCSGNLYHLIVEACIARNLLDTSAYFWPGYVNGRINQLPHNV
PNQVPGWSSFMKGASLTPVMINALASIPASSFAEVQKVFEMAVKGSNEERIAAATILCGA
SLIRGWNIQEHTVYFITRLLSPSVPADYTGNESHLISYAPMLNVLLVGIAPVDCVQIFSL
HGLVPELAGSLMTICEVFGSCVPNISWTMPTGEEISAHAVFSNAFALLLKLWRFNHPPIE
YGVGDVPPVGSQLTPEYLLLVRNSHLVSSGNLLKDPNRRRLAKAASSSSPKPIFVDSFPK
LKVWYRQHLACIASPLTGLINGTPVHHTVDTLLNMMFRKISGGNQTVTTVTSGSSSSSGP
GSEDIYLRPKLPAWDILEAVPFVADAALTACAHGRLSPRELCTGLKDLADFLPATLATIV
SYFSAEVTRGVWKSVFMNGTDWPSPAANLSNVEGQIKKILAATGVDIPSLAAGGSSPASL
PLPLAAFVSLTITYKLDKASQRFLDLAGPALESLAAGCPWPCMPIVASLWTQKAKRWSDF
LVFSASRTVFLHSNDAVVQLLRSCFSATLGLNSSCCISDNGGVGALLGHGFGSHFNGGIA
PVAPGILYLRVYRSIRDIMFLREEIVSVLMQTVEDVTCSCLPKQSSEKLKKSKNGMKHGH
ASLAAALTKVKLAASLGASVIFLTGGLGLVQSLIKETLPSWFMSIHRSEHEGDRGKMVPM
LRGYALAYLAALCGAFVWGVDSSTAAASKRRPKILGCHMEFLASALDGKISLGCDLATWH
AYVSGFLSLMVRCTPTWIFELNVELLRRLSKGLRRWNEEELALALLGVGGLGTMSSAAEM
VIETEI
NT seq
3981 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggtggccactcagttgaactgcaacatatgggacagagttctggggcaaactaag
gaggcccaagaaaaaggcagggacccgttgttgtgggcaattcaagtttcttcgaatttg
agttctgctggaatccctttaccttctcttgagctagctaaccatttggtctcccatatt
tgctgggataacaatgtgcccatttcttggaagttcttagagaaagcgttggctctcaaa
attgtgcctcccttgcttgttcttggattgctgtcaacaagggtaatttcatatcggcat
tcttgtcctgcagcatttagactttatatggaactccttaagagacatgccttctcactg
aaagagcacacaaatttgccaaactatcaaaagaccatggattcattagaccaagttctc
catttatcacaaatatttggcttgcaagcaaatgaagctggtgctctgctggttatgttt
gttttttcaattgtctggcagttggttgacgcatcactagatgatgaaggattgcttgaa
cttacagagaatgaccccaggtggcctgtcagacctcaagctatgcaagtagacgttcat
aatatgtacgaagagaagaggaaagaatacagagaaagattccttactattaataccatc
atggccattcagttacttgggcagtttttgcgaaacaaagtaacttccaggattctttac
ttggcacgccaaaacatgtatgcacactggaaaagctttatccagaaaatgcagctgctt
gtagaaaattcattggctttgagaaactcaaaatctattacaccagaggttcttcggcag
ttaatatcagacagtcacagttttaagcttcagcatttccaggcaagcttattgcaggag
ttccatcctgtggtacaatccagacctcttgttaatcctgctggtctctgtcttgggact
agtcggtctggtctttggcttcctctggatatgctgctagaagatgcaatggatggttcc
caagttaatgcaacaagcgccgtagaaatcattactggtttagttaagtcccttcaggca
attaacgccacctcttggcatgaaatctttctaggactttggatggctgctctacgcctt
gttcaacgggagagggatcctattgagggacctgtgcctcgtctggacactcgtctgagc
atgttattgtcaattacaactcttgtagttgctgatcttgttgaggaagaggaaagtgtt
gccgcagatgagttcggatatgatttgggtaacaaaaatcaggttcctgggaaacgacgt
atggatttgatattcagtcttcagaatctgcatgattaccagagcttgctaactccacct
cagtcagcaattcctgctactaatcaggctgctgctaaagcaatgatgtttgtatctggc
atcaatgttggtactgcatactttgagtgcatgagcacaatggatatgccaattgactgc
tctggtaacctgtatcatttaattgttgaggcatgcatagccagaaatctgttggacaca
tctgcttatttctggccaggttatgtaaatgggcgcatcaaccaactaccccacaatgtt
cccaatcaagttcctgggtggtcatcatttatgaaaggggcatctctcacccctgtgatg
ataaatgctctagcatcaattcctgcttcaagcttcgcggaggtccagaaagtctttgag
atggcagtcaaaggatccaatgaggaaagaatagctgctgctactattctttgcggggcc
tccttgattcgtggatggaatattcaggaacacactgtttattttataactcggttgctg
tctccatcagtccctgctgactataccgggaacgaaagccatttgataagctatgctccc
atgctcaatgttctccttgtggggatagcaccagttgactgtgttcagattttctccctc
catggtttggttccagaacttgctggctcattaatgacaatatgcgaggtgtttggttca
tgtgtgcccaatatctcatggaccatgcccacaggagaagaaatttctgcccatgctgtg
ttttcaaatgcatttgctcttcttctaaagctatggaggttcaatcaccctcctattgaa
tatggagtaggagatgtacctccagtaggatcccaactcactcctgagtacctcttattg
gtaaggaattcacacctagtctcttcaggaaacttactcaaggatccaaatcgaaggaga
cttgcaaaagcagcaagttcttcgtctcccaaacccatatttgtggattcatttcccaaa
cttaaagtgtggtataggcagcatctcgcttgtattgcttcccccctcactggtcttatc
aatgggactccggtccatcatactgtggatacactacttaacatgatgttcagaaaaatc
agcggaggaaaccaaactgtgaccactgttacatctggtagtagcagttcctctggtcct
ggaagtgaagacatttatcttaggcctaaactacctgcttgggatatccttgaagccgtc
ccttttgtggcagatgctgctctaacagcatgtgctcatggaagattgtctcctcgtgaa
ctctgcacagggctgaaagatttggctgattttcttcctgcaactttggcgaccattgta
agttacttctcagccgaagtgacacgtggagtatggaagtcagtttttatgaatggaaca
gattggccgagtccagctgctaatctctccaatgttgagggacagataaagaaaatatta
gctgccactggtgtggatatccccagtcttgcagcaggtgggagttctccagcttcgctt
ccattgcccttggctgcatttgtgagtctcaccataacatataagcttgataaagcttca
caacgttttctggatctggccggcccagctttggagtcccttgctgctggctgcccttgg
ccatgcatgccaatagtggcttctttatggacccaaaaggcaaagcgttggagtgacttc
ctcgtcttttctgcttcccgcactgtcttccttcacagcaatgatgctgttgttcagctt
cttcgaagctgcttcagcgccacccttggtttgaacagtagttgctgtatctcagacaac
ggtggtgttggagcacttcttggtcatggatttggatctcatttcaatggtggtatcgct
ccagtcgcaccagggatcctatatctgcgagtctaccggtcgattagagacattatgttc
ttgagagaggagatagtttcagtgctcatgcagactgtggaagacgtaacctgcagttgc
cttccaaaacagagttcagaaaagctgaaaaagtccaaaaatgggatgaaacatgggcat
gcctcgcttgctgcagctttaactaaggtgaaactagctgcatctctgggagcttctgta
atcttcttaactggtggactggggctggtgcagtcgctaatcaaggaaactcttccgtct
tggtttatgtctattcatcggtctgagcacgaaggcgatagaggcaagatggttccaatg
ctcagagggtatgcactggcatatttggcggcactttgtggagcttttgtttggggtgta
gactcatcaacagcagcagcttcaaaaagacggcctaaaattcttggatgtcacatggaa
tttcttgctagtgccttagatggaaagatttcacttggctgtgatcttgctacttggcat
gcctatgtgtccggttttctgagcttgatggtaagatgcacaccaacttggatatttgag
ttgaacgtggagttgttgagacgactgagcaagggactaagacgatggaacgaggaggag
cttgctctggctttgcttggggttggcggacttggtaccatgagctcagcagccgaaatg
gtcattgaaactgagatataa
DBGET
integrated database retrieval system
