KEGG   Shewanella japonica: SJ2017_1833
Entry
SJ2017_1833       CDS       T04959                                 
Name
(GenBank) multidrug transporter AcrB
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
sja  Shewanella japonica
Pathway
sja01501  beta-Lactam resistance
sja01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sja00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    SJ2017_1833
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    SJ2017_1833
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:sja02000]
    SJ2017_1833
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:sja01504]
    SJ2017_1833
Transporters [BR:sja02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   SJ2017_1833
Antimicrobial resistance genes [BR:sja01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    SJ2017_1833
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL DUF6286
Other DBs
NCBI-ProteinID: ARD22141
LinkDB
Position
2194573..2197665
AA seq 1030 aa
MILTDISVKRPVLASVISILIIILGLVSFEKLPLREYPNIDPPVVSIDTRYRGASATVVE
SRITQLIEDRISGVEGIKHVSSTSRDGRSSVTLEFDVGRDIEAAANDVRDRISGLLDNLP
EEADPPEVEKANGGDEVIMWLNLVSDQMTTLQLTDYARRYLVDRFSVVDGVANIRLGGGK
VYAMRIWIDRQALASRNLTVADVESALRSENVELPAGSIESKERHFTVRVDRSFRTEQDF
ANLVITQGDDGYLVKLGDVAKVAIGSEEERIMFRGNTESMIGLGVSKQSTSNTLEVARAA
NALVDVINPTLPAGMEIKRSYDSSVFIEASIKEVYQTLFIAMILVIIVIYLFLGSVRAML
IPALTVPVSLMGTFIVLYSLGYTINLLTLLAMILAIGMVVDDAIVMLENIHRRIELGDSP
LKAAYLGGREVAFAVVATTLVLIAVFMPISFLDGDLGKLFKEFAVTMSAAVIFSSLVALT
LSPMMCSKLLKPAGESSWLVKKVDALMDYLSSIYQSNLNSAIKQPYLIGLIVVVAFAVSG
YLLNKIPQEFAPSEDRGSMFLVVNGPQGASFEYIEKYMDEIEGRLMPLVESGDIKRLLIR
APRGFGTAADFSNGMAIIVLEDWSVRRPANEIIVDIRSRISDLAGVRAFPIMRQAFGRGV
GKPVQFVLGGPSYEELALWRDMLLEKASENQMLVGLDHDYKETKPQLRVAIDKDRAADLG
VSISHIGRTLESMLGSRLVTTFMRDGEEYDVIIEGNRDNQNTASDLENIYVRSDRTSELV
PLSNLVKVEEYADASSLNRYNRMRAITIEANLADGYSLGEALDYLNDIAHTYLPAEAVIS
YKGQSLDYQSSGNSMYFVFVLALGIVFLVLAAQFESYVHPMVIMLTVPLATLGALIGLWF
TGQSINIYSQIGIIMLVGLAAKNGILIVEFANQLRDKGIAFDEAIVQASAQRLRPILMTG
ITTAAGAIPLVLSSGAGAETRFVIGVVVLSGILLATFFTLLVIPVAYSIFARNSSSPEAI
AKLLDEELKN
NT seq 3093 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatattaactgatatttcagtaaaaagaccggtattagcctctgtaattagtattttg
attatcattttgggtttagtgtcttttgaaaagctacccttacgagaatatcccaatatt
gacccgccagttgtgtctattgatacccgttatcgtggtgcgagtgccacggtagttgag
agtcgtattacccaacttattgaagataggattagtggggttgaagggattaagcatgtt
agctcaacaagccgtgacggtcgctcttcagtgacgttagagttcgatgttgggcgagat
attgaagctgcagctaacgatgtacgagatcgaatctctggattgttagacaatttacct
gaagaagccgatccgccagaggttgaaaaagctaacggtggtgatgaagtgatcatgtgg
ctaaaccttgtctctgatcaaatgacaacgttgcagctcaccgattacgcacgtcgatat
ttagttgatcgcttttctgtcgtagacggtgtcgccaatattcgtttaggtggcggtaaa
gtgtatgccatgcgaatttggattgatcgccaagcattggcatctcgaaacttgacggta
gcggatgttgaatcagcgcttcgctcagaaaacgttgaattgcctgctggttctattgaa
tcaaaagagcgtcactttacagtgcgagttgatagaagttttagaaccgaacaggacttt
gccaatttagtgattacccaaggtgacgatggttacttagttaagctgggtgatgtcgcc
aaggttgcgatcggctctgaagaagagcgtattatgttccgtggtaacactgaatcaatg
attggactcggtgtatctaaacagtcaacatctaacacgttagaagtggcgcgtgcggct
aatgcactagtggatgtgattaatccaactctacctgctggaatggaaattaaacgctca
tacgatagctcagtgtttatcgaagcttcaattaaagaggtttatcagacactctttatt
gctatgatcttagtcattatcgtgatctatctgttcttgggtagcgtgcgggctatgtta
atcccagcgctaaccgtgcctgtatcgctcatgggaacatttattgttctttacagtctt
ggctacacaattaatctgttaacgctgttagcgatgatccttgcgattggtatggtggtt
gatgatgccatcgtgatgcttgaaaacattcaccgccgtattgaacttggcgactcaccg
ttgaaggcggcttaccttggtggtcgagaagttgcgtttgctgttgtcgctacaacactt
gttttgattgctgtatttatgccaataagctttttggacggtgatttaggcaaactattt
aaagagtttgctgtgacgatgagcgcagcggtcatattttcgagtttagtggcattaacc
ttaagcccaatgatgtgctctaaattattaaagcctgctggtgagagctcatggttagtt
aaaaaagttgatgccttaatggattatctgtcatcaatttatcagtcaaaccttaactcc
gcgattaagcagccgtatttaattggtctgattgtggtcgttgcctttgctgtcagtggt
tatttgcttaataaaattccacaagaatttgcaccaagtgaagataggggctcaatgttc
ctagtcgttaacggccctcaaggtgcaagctttgagtatattgaaaagtacatggatgaa
attgaaggtaggttgatgcctttagttgagtctggtgatattaagcgtctgttaattcgt
gcaccaaggggctttggaaccgcggctgacttttctaatggcatggcgattattgtttta
gaagattggtctgttaggcgacctgcgaatgaaattattgtcgatatccgtagtcgaatt
tctgatttagctggggtgagagcattcccgatcatgagacaagcgtttgggcgtggtgtc
ggtaaacctgtgcaatttgtattaggtggcccaagttacgaagagcttgcgctttggcga
gatatgttattagaaaaagcctctgaaaatcagatgctcgttggacttgaccatgattat
aaagaaaccaaaccgcagttaagagtggcgatagataaagatcgtgctgcagatttaggc
gtgtctatttcacatattggtcgtactttagagtcaatgctagggtcacgtttggtgaca
acctttatgcgtgacggtgaagagtatgatgtcattattgaaggtaatcgcgacaatcaa
aatacagcctctgatcttgaaaatatctatgttcgctcggatagaaccagtgagttagtg
ccgttatctaacctagttaaggtcgaagaatatgctgatgcaagttcgttaaatcgatat
aaccgaatgcgagcaatcaccattgaagcgaatttagcggatggttacagcttaggcgaa
gcgttagattacttaaacgatattgcccatacttatcttccagctgaagctgtcatcagc
tacaaaggacaatcgttagattatcaaagttctggtaattctatgtactttgtatttgtt
ttagcactcggtattgtgttccttgtattagcggcgcaatttgaaagctatgtgcatcca
atggtgattatgttaactgtgccattagctaccttaggggcgttaatcggtttatggttt
acaggtcaaagcatcaatatctacagtcagattggtattattatgctggtgggactggca
gctaaaaatggtattttgattgttgagtttgctaaccaattgcgagataaagggattgct
tttgatgaagcgatagttcaagcctcggcccagcgtctaagacctattttaatgacgggt
attaccacagctgcaggcgcaattcctttggtgttatcaagtggtgcaggagctgaaact
cgttttgtgattggtgttgttgtgctttcaggcattttattagccactttcttcacctta
ttggtgatacctgttgcttatagtatttttgctcgaaacagtagctcacctgaagctatc
gctaaactgttagatgaagaattaaaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system