Shewanella mesophila: K0I73_01460
Help
Entry
K0I73_01460 CDS
T09171
Name
(GenBank) retention module-containing protein
Organism
smes
Shewanella mesophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
Big_9
Big_11
Cadherin_5
VWA
VWA_2
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYJ86454
LinkDB
All DBs
Position
complement(312110..320983)
Genome browser
AA seq
2957 aa
AA seq
DB search
MGASITTQDAVVVNLVGQLKVKDEQGNIRDVKIGDVIRSGEQLIFSPQAKFNLEYEDGTL
TTQANLLEQTPSQETASNSGDTDSANQLTDVPVALDPEIAALQAQILAGDDPTQGLPETA
AGAGTAGNEGGSDFVTLGRTGDETLAGAGWDTAGFTLAADTPPETVIIPEQTFAAPTLTS
ASFSIFEANLPQGSDPSSLLTKLAANIQANAEAGIASLTINGIDIINNGQFAGPIVINTE
NGVLTITGFDSSTGQFVYDYTLNSSVDHSASDQLQFVFNIELVDGAGNVANGSITVNVID
DQPEGFADTNSVTEDSPAQIAGNLLANDTLGADSAEVTAITNAQGTSVAVSTSNTIQGEF
GLLTIFTDGSYTYQLNNDSSDVQSLALGEQVIESFNYLLTDNDGDSVLVPLTITITGTND
IPIITPPSGGEGNQDYDAGTVIEAGNEDDGTVVSGIATVSGILEATDADIGAVLSWSFTP
EITNTTDYGIFSINADTGEWIYTLDNALADSLAEGQSAEETFLVTVTDEFGATDTQVVTI
TIQGTNDSPILFLDESDSASGTVIEAGNADNGNVINGVNSISGTLSVSDVDVKVSGDPSW
SFAPEVTNSTNYGTFSIDANTGEWTYTLDNALANSLAEGQSAVETFLVTVTDEFGAIDTQ
VVTITIQGTNDAPETYDLVASGPEDTSVVIPELSGSDLDGSVVSFVIDSLPDNGILMLNG
EAVTLGMTILVADANVITFIPNEDWNGQTTFTYHAIDNDGLADSTPATVTITVTPVNDGP
FAEDDSFSINEGALAQGNVITHNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDF
TIDGGTLRIKADGTFEYQHDGSDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAE
DDSFSINEGALAQGNVITHNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTID
GGTLRIKADGTFEYQHDGSDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDS
FSINEGALAQGNVITHNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGT
LRIKADGTFEYQHDGSDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDSFSI
NEGALAQGNVITHNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGTLRI
KADGTFEYQHDGSDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDSFSINEG
ALAQGNVITHNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGTLRIKAD
GTFEYQHDGSDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDSFSINEGALA
QGNVITHNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGTLRIKADGTF
EYQHDGSDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDSFSINEGALAQGN
VITHNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGTLRIKADGTFEYQ
HDGSDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDSFSINEGALAQGNVIT
HNDGDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGTLRIKADGTFEYQHDG
SDPTQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDSFSINEGALAQGNVITHND
GDNLVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGTLRIKADGTFEYQHDGSDP
TQTPPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDGPFAEDDSFSINEGALAQGNVITHNDGDN
LVDSDGGDGGTLVVTEVNGIALVFDVDGWSQDFTIDGGTLRIKADGTFEYQHDGSDPTQT
PPSFEYTLSDGTDTDTATVTITVTPVNDLPVINAGSTVVSEEGLSAGIIDNIGDPSDETD
LKTNDGVITFTDPDATDSSAFAISLSGPSIGVYSDGQLVSWSWNSQTNTLTGSVDNTAIM
TIVLGSVTGDTSGYSVAYTVNLLGPVDHALNSIEDIMQLNFGVTINDDSADVSTTFSVTV
EDDSGVDEVDESLVHDISHSIGSTVTADLFNPGADDFGSVNFELITTGLQHDGYDLVYTM
NGNTLTATANGVDVFTLTAVLDADGHYDYQFVLLQEVDQEAVIDYNIGSAPAGNNLTYYV
DFDGSIYAQNGQATSVISTITGYTNGISSQINSNSHGIGVGPQTSISENESIKIEYGVDG
TSLLAIDLGTNNNGNHTGSANIQYIITYSDNSTKVVDITTTNGVFLIEELEHNGLSIMSI
EIFHVSGEDFQINGLSSSGVVFNTPIDLEFAYTATDNDGDAIPFTNDNNGHFYITLTPDN
YVPNAIDNAYKVDSGGIISSNVITDDTGSGSDTDANGDNLKVTHINGAELTFVNGVATVN
VAGGVLTIQEDGSYTYQHNGNSSAPVRFTYEISDGNGGTDSAAVDIEIFNHQTLNPGDDT
HQGSDGNDLIVSDTTSIIPGENYNIAFLIDTSGSMGNSGVNTARSQILSVIEQLITNANL
PNSGSVNVLLVDFASSAQTLISIDLTANDALAQISTAMASMSSGGQTNYYAAFNEVYDWF
ATGLASQNSGSNLTYFITDGRPTSDGGIPGSSYQNGLAAFNLLSALSIIQAIGLGNNINT
NILEDFDSDGQVLNNVDVSNLADAILQSSLLPGNDVITAGEGHDIVFGDLAQFTGISTQG
YDALKEYVATQTNIDINDISDVEIHGYISEHTEEFDISGADDGSDTIYGGNGNDILFGQG
DNDILIGGVGSDILIGGTGSDTMDAGVDTDRDTFVWNLGSADGSTDTLVNFDVNYDALDL
SSILIDEETGNFSLDEYLEFNFSGGNTGISVDANHDGLTDLIIIVENVDLTANNSLSDNQ
VISNLLNNENLIIDTIP
NT seq
8874 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtgcatcaatcacaacacaggacgcggtagttgttaatcttgtcggtcaactcaag
gttaaagatgaacagggaaatatcagagatgtcaaaattggcgacgttatccgatctggt
gaacagctgattttttccccacaagctaaattcaacttagagtatgaagatggcacatta
acaactcaggcaaatctacttgagcaaactccatctcaagaaacagccagcaattcaggc
gataccgattcggcaaatcagctaactgatgtgcccgttgctctcgatcccgaaattgca
gcgttacaagcgcaaattctagctggagatgatccaactcaaggattaccagaaaccgcg
gctggtgctggtaccgctggtaacgaaggcggctctgactttgtcaccttagggcgtact
ggagatgagactctcgcaggcgcgggttgggacacggctggttttactctagcggcagat
accccaccagaaacagtaattataccggaacaaacgttcgcggcaccgacattgacctct
gcaagcttttccatttttgaagcgaacctcccacaaggtagcgatccatcgtcattattg
acgaaactcgcagcaaacattcaggcgaatgcagaagctggtatcgccagcctaacgatc
aatggaatcgatattatcaacaatggccaatttgcaggccccatcgttattaataccgaa
aatggcgtgttgaccattaccggatttgacagttcaacaggtcagtttgtctatgattac
acgctcaattcgagtgtcgatcatagtgctagtgaccaactgcaatttgtattcaatatc
gaattggttgacggtgcaggtaatgtggccaacggtagcattaccgttaatgttattgac
gaccagcccgaaggtttcgccgacaccaacagtgtaacagaagatagtccggcacaaatt
gcaggaaatttactggctaatgacaccttaggtgccgattcggcagaagttaccgcaatc
actaacgcacaaggcacatctgtcgccgtttcaacatcgaataccattcaaggtgaattc
ggtttactaacgatttttaccgatggtagctatacctatcagctaaacaatgactcttct
gatgtccagtcattagccttaggtgagcaagtcattgaaagctttaactacctactaacc
gacaatgacggcgactcagtactagttccactaacgatcactattactggcactaatgat
atccccatcatcacaccgccatcaggcggagaaggaaatcaagattatgatgcaggaaca
gttatcgaagcgggtaatgaagatgatggaactgttgtgtcaggtatcgcaacagttagc
ggaatcctagaagccacagatgccgatatcggcgcagtgctaagctggagcttcacgcct
gaaatcactaacaccaccgactatggtatctttagtattaatgccgatactggagagtgg
atctacaccttagataatgccttagccgacagcttagctgaaggtcagagcgccgaagaa
accttcttagtcaccgtcaccgatgaattcggggctaccgatacgcaagtggtgacaatt
accattcaaggcactaacgacagtccaatcttattccttgatgaaagtgacagtgctagc
ggcactgtgattgaggcaggtaatgccgataatggaaacgtaattaacggtgtgaacagc
atctccggtaccttgtcggtcagtgatgtcgatgtcaaagtcagtggtgaccccagctgg
agcttcgcaccagaagtaactaactccactaactacggtaccttcagtattgatgccaat
actggggagtggacctacaccttagataatgccttagccaacagtttggctgaaggtcag
agcgccgtagaaacattcttagtcaccgtaaccgatgaattcggggctatcgatacgcaa
gtggtgacaattaccattcaaggcaccaacgatgcgccagaaacctatgacctcgtcgcc
tctggcccggaagataccagcgttgttatacctgaattaagcggtagtgacctcgatggt
tcagtggtcagctttgtaattgatagcttacctgataacggcatactcatgcttaacggc
gaagccgttaccttaggcatgactattttggttgcagatgccaatgtaatcacctttatc
cctaatgaagattggaatggccaaaccacctttacctatcatgctatcgacaacgatggt
ttagccgacagtacaccagctaccgtgaccattactgtaaccccagttaacgatgggcct
tttgctgaagatgacagcttcagtattaatgaaggcgccttagcgcaagggaatgttatt
acccataacgatggcgataatctggtcgacagcgatggcggcgacggcggaacactcgtt
gtcaccgaagtgaatggcattgcgcttgtctttgacgttgacggatggagtcaagacttc
acgattgatggcggtaccttgcgcatcaaagcagacggtacctttgaatatcaacacgat
ggctcggatcctactcaaacaccgccaagttttgagtacaccttaagcgatggcaccgat
actgataccgctaccgtgaccattaccgtaaccccagttaacgatgggccttttgctgaa
gatgacagcttcagtattaatgaaggcgccttagcgcaagggaatgttattacccataac
gatggcgataatttggtcgacagcgatggcggcgacggcggaacactcgttgtcaccgaa
gtgaatggcattgcgcttgtctttgacgttgacggatggagtcaagacttcacgattgat
ggcggtaccttgcgcatcaaagcagacggtacctttgaatatcaacacgatggctcggac
cctactcaaacaccgccaagttttgagtacaccttaagcgatggcaccgatactgatacc
gctaccgtgaccattaccgtaaccccagttaacgatgggccttttgctgaagatgacagc
ttcagtattaatgaaggcgccttagcgcaagggaatgttattacccataacgatggcgat
aatttggtcgacagcgatggcggcgacggcggaacactcgttgtcaccgaagtgaatggc
attgcgcttgtctttgacgttgacggatggagtcaagacttcacgattgatggcggtacc
ttgcgcatcaaagcagacggtacctttgaatatcaacacgatggctcggaccctactcaa
acaccgccaagttttgagtacaccttaagcgatggcaccgatactgataccgctaccgtg
accattaccgtaaccccagttaacgatgggccttttgctgaagatgacagcttcagtatt
aatgaaggcgccttagcgcaagggaatgttattacccataacgatggcgataatttggtc
gacagcgatggcggcgacggcggaacactcgttgtcaccgaagtgaatggcattgcgctt
gtctttgacgttgacggatggagtcaagacttcacgattgatggcggtaccttgcgcatc
aaagcagacggtacctttgaatatcaacacgatggctcggaccctactcaaacaccgcca
agttttgagtacaccttaagcgatggcaccgatactgataccgctaccgtgaccattacc
gtaaccccagttaacgatgggccttttgctgaagatgacagcttcagtattaatgaaggc
gccttagcgcaagggaatgttattacccataacgatggcgataatttggtcgacagcgat
ggcggcgacggcggaacactcgttgtcaccgaagtgaatggcattgcgcttgtctttgac
gttgacggatggagtcaagacttcacgattgatggcggtaccttgcgcatcaaagcagac
ggtacctttgaatatcaacacgatggctcggaccctactcaaacaccgccaagttttgag
tacaccttaagcgatggcaccgatactgataccgctaccgtgaccattaccgtaacccca
gttaacgatgggccttttgctgaagatgacagcttcagtattaatgaaggcgccttagcg
caagggaatgttattacccataacgatggcgataatttggtcgacagcgatggcggcgac
ggcggaacactcgttgtcaccgaagtgaatggcattgcgcttgtctttgacgttgacgga
tggagtcaagacttcacgattgatggcggtaccttgcgcatcaaagcagacggtaccttt
gaatatcaacacgatggctcggaccctactcaaacaccgccaagttttgagtacacctta
agcgatggcaccgatactgataccgctaccgtgaccattaccgtaaccccagttaacgat
gggccttttgctgaagatgacagcttcagtattaatgaaggcgccttagcgcaagggaat
gttattacccataacgatggcgataatttggtcgacagcgatggcggcgacggcggaaca
ctcgttgtcaccgaagtgaatggcattgcgcttgtctttgacgttgacggatggagtcaa
gacttcacgattgatggcggtaccttgcgcatcaaagcagacggtacctttgaatatcaa
cacgatggctcggaccctactcaaacaccgccaagttttgagtacaccttaagcgatggc
accgatactgataccgctaccgtgaccattaccgtaaccccagttaacgatgggcctttt
gctgaagatgacagcttcagtattaatgaaggcgccttagcgcaagggaatgttattacc
cataacgatggcgataatttggtcgacagcgatggcggcgacggcggaacactcgttgtc
accgaagtgaatggcattgcgcttgtctttgacgttgacggatggagtcaagacttcacg
attgatggcggtaccttgcgcatcaaagcagacggtacctttgaatatcaacacgatggc
tcggaccctactcaaacaccgccaagttttgagtacaccttaagcgatggcaccgatact
gataccgctaccgtgaccattaccgtaaccccagttaacgatgggccttttgctgaagat
gacagcttcagtattaatgaaggcgccttagcgcaagggaatgttattacccataacgat
ggcgataatttggtcgacagcgatggcggcgacggcggaacactcgttgtcaccgaagtg
aatggcattgcgcttgtctttgacgttgacggatggagtcaagacttcacgattgatggc
ggtaccttgcgcatcaaagcagacggtacctttgaatatcaacacgatggctcggaccct
actcaaacaccgccaagttttgagtacaccttaagcgatggcaccgatactgataccgct
accgtgaccattaccgtaaccccagttaacgatgggccttttgctgaagatgacagcttc
agtattaatgaaggcgccttagcgcaagggaatgttattacccataacgatggcgataat
ttggtcgacagcgatggcggcgacggcggaacactcgttgtcaccgaagtgaatggcatt
gcgcttgtctttgacgttgacggatggagtcaagacttcacgattgatggcggtaccttg
cgcatcaaagcagacggtacctttgaatatcaacacgatggctcggaccctactcaaaca
ccgccaagttttgagtacaccttaagcgatggcaccgatactgataccgctaccgtgacc
attaccgtaaccccagttaacgacctgcccgtaattaacgcaggttcaacagttgtatct
gaagaaggcttatcggctggcattatagataatatcggcgatccttctgatgaaactgat
ctaaaaaccaatgacggcgtgattacctttacagatcctgatgccactgacagcagtgct
tttgccatttcattgtcaggcccaagcataggtgtgtattccgatggacagttagtcagt
tggagttggaatagtcaaaccaacactctcactggctcagttgataacactgcgatcatg
actatagtgcttggctctgtaactggggatacatctggttatagtgtggcttatacagtt
aaccttttaggtcctgtagatcatgcacttaacagcattgaagatattatgcagttaaac
tttggggtcacaattaatgatgattcagctgatgtatcaacaacctttagtgtcactgtt
gaagatgactcgggagtagacgaagttgacgaatcattagtacatgatatttcccatagc
ataggtagtactgtcacagcagacctatttaaccctggtgctgatgatttcggaagtgtc
aatttcgaactcattacgactggtttacagcacgacggttacgatcttgtttacacaatg
aatggcaacacattgactgctactgctaacggtgtggatgtatttacgttaactgctgta
ttagatgctgatggtcattacgactatcagtttgtactacttcaggaagtagaccaagaa
gcggtaattgactacaacataggttcggcgccagcaggtaataacctaacttattatgtt
gattttgacggttcaatttatgctcaaaatggacaggctactagtgttatctcaacaatt
acaggatacacgaacggtatttcttctcaaattaactctaatagtcacggcattggagtg
gggccgcagacctccatcagcgaaaatgagtcaattaaaattgaatatggtgtagatggt
acctctttattagccattgatttgggaactaataacaacggtaaccatacaggatcagct
aacattcaatacataattacttattcagacaactcaacaaaagtcgtcgatataacaact
accaacggtgtgtttttaattgaagaattagagcacaatggtttgtcaattatgtcgatt
gagatcttccacgttagtggagaagatttccaaatcaacggattatcctcttctggcgta
gtattcaatactcctatcgaccttgagtttgcatacactgccactgataatgatggcgat
gcaataccatttactaatgacaataacggccatttttacatcacacttactcctgataac
tacgtacctaacgcaatcgacaatgcatacaaggtcgatagcggaggaataattagctcc
aatgtaataactgatgacacaggatcaggctctgataccgatgctaatggagataacctc
aaagttacccatatcaatggtgcagaactcacgtttgttaatggggttgccactgttaat
gttgcaggaggagtgttaactattcaagaagatggtagctatacctatcagcataatggt
aatagctcagccccagttagatttacttatgaaataagtgatggcaatggtggaacagat
tctgccgctgttgatattgaaatattcaatcaccagacattaaatcctggcgatgataca
catcagggcagtgacggtaatgatctgattgttagcgacaccacaagcattatcccaggt
gaaaactacaatatcgcttttctcatagatacctctggtagcatggggaattcaggtgtg
aatactgcaagatcacaaatactcagcgttatcgaacaattaattacgaatgcgaatctg
cctaattcaggaagcgtaaatgttttattagttgatttcgccagttcggctcaaacactt
atctctatagacttaacggcaaatgatgccttagcgcagataagcaccgcaatggcttcg
atgagcagtggagggcaaactaattactatgccgcctttaacgaggtttacgattggttt
gcaactggattggcatctcaaaatagcggcagcaacctcacgtacttcattactgatgga
agaccaacttccgatggaggtatacctggtagcagctaccagaacgggttagctgcattc
aacttgctaagtgcattatcaatcatacaagcaatcggacttggcaataacatcaatact
aacatacttgaagacttcgactctgatgggcaagtcctaaataatgttgacgtgagtaac
ttagccgatgcaattcttcaatctagccttcttcctggtaatgatgtcatcacagctggt
gaggggcacgatatagtatttggtgacttagctcaatttacaggaattagcactcaagga
tacgatgccttaaaagaatatgtggcaactcaaacgaatattgatatcaatgatattagc
gacgttgagatacacggctacatatctgagcatactgaagagtttgatatatcaggagca
gacgatggcagcgatactatctatggaggtaacggtaacgacatcttatttggacaaggt
gacaacgatattcttattggtggtgtaggtagcgacatactaattggtggtactggcagc
gatacgatggatgccggagtcgatacagacagagacacttttgtgtggaatctcgggtca
gctgatggcagcaccgatacccttgttaattttgacgtaaattacgacgctttagatctt
tcaagtatcctaattgatgaggagacaggcaactttagtctggatgaatatctagaattt
aactttagcggtggtaatacaggaatttctgttgatgcaaatcacgacggtttaaccgac
ttgatcatcattgtagagaacgttgacctgacagcaaataactcacttagtgataatcag
gtcattagtaacttacttaacaatgaaaatctaattatagatacaataccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
