KEGG   Solanum tuberosum (potato): 102581600
Entry
102581600         CDS       T02981                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
sot  Solanum tuberosum (potato)
Pathway
sot03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sot00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    102581600
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:sot03019]
    102581600
   03041 Spliceosome [BR:sot03041]
    102581600
Messenger RNA biogenesis [BR:sot03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     102581600
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     102581600
Spliceosome [BR:sot03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    102581600
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 Nup35_RRM_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 102581600
NCBI-ProteinID: XP_006343133
UniProt: M0ZRR5
LinkDB
Position
Un
AA seq 386 aa
MDYVAEQNVSEEQERNDGSAGHELKHSLDDSSAGKLFVGGIAWETREESFRKYFSRFGEI
TDCVIMMDKVSGRPRGFGFVTFADPEAANKVLEEEHIIDGRTVEVKRTVPKEDMQVKGSP
KTKKIFVGGLPLTLTEDELKEYFSSYGHVLEQQIMLDRESGRSRGFGFITFDSENAVEKV
LNNGRMHEIHGKQVEIKRAEPKRAGAENAIESRQHRGGSGSRSYNNFGGSEGGYGGGYGR
GYGGYGGYGGGTGYGGGGGGAAGYGGAGAGAGYGGYGNIGGSYGGGGAGYFSGYGGYGYG
FGFSGPMYGAAGYGGTSYGAPGSYGGAAGYASGRGYTSSDDGSWYGGARSSASFNAKGYD
TGGSTGGAKAYGNGGAAGGRFHPYRN
NT seq 1161 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggattatgtagctgaacaaaatgtctcagaagagcaggaacgaaacgatggtagtgca
ggacatgaattaaagcattcactcgatgattcttctgcaggaaagcttttcgtcggaggc
attgcttgggagaccagagaagaatcttttaggaagtatttcagcaggtttggagagata
acagattgtgtaataatgatggataaggtctctggaaggccacggggatttggctttgta
acatttgcggacccagaagctgcaaataaggttttagaggaagagcacatcatagacggt
agaacggtggaagtgaagaggacagtacctaaggaggacatgcaagttaaaggatctccg
aaaacaaagaaaatttttgtcggcggtcttccattaactttaactgaagatgagttgaag
gaatatttttcttcttatggccatgttctggagcaacaaatcatgctggaccgtgagagt
ggtcgatcccgaggctttggcttcattacttttgatagtgaaaatgccgttgaaaaagtt
ttaaacaatggccgtatgcatgaaatccatggcaaacaagttgaaattaagagggctgag
ccaaaaagagctggtgctgaaaatgcaattgagagcaggcagcatcgtggtggcagtggt
tcgagatcgtataataactttggtgggtctgaaggagggtatggtggtggatacggtaga
gggtatggtggatatggaggctatggcggtggcactggttatggtggtggcggcggcggc
gccgctggttatggcggtgccggcgctggcgctggctatggtggttatggaaacattgga
ggaagttatggcggaggtggtgcaggatatttctctggatatggtggatatggttatgga
tttgggtttagtggacctatgtatggggcagctggatacggaggcactagctatggtgct
cctggtagctatggtggtgctgctgggtatgctagcggtagaggatacacaagcagtgat
gatggtagctggtatggtggggctagaagctctgcatctttcaatgctaaagggtatgac
accgggggtagcactggaggtgctaaagcatatggtaatggtggtgctgcaggtggaagg
tttcatccttacaggaattga

DBGET integrated database retrieval system