Shewanella putrefaciens CN-32: Sputcn32_2027
Help
Entry
Sputcn32_2027 CDS
T00513
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF839
KO
K07093
uncharacterized protein
Organism
spc
Shewanella putrefaciens CN-32
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spc00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
Sputcn32_2027
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PhoX
TAT_signal
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABP75748
UniProt:
A4Y715
LinkDB
All DBs
Position
2310441..2312498
Genome browser
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MSKATFDPTLYNKSNNEPFNQVLDKHLSRRNFVKSGLGLGAMTAFAGIGLTGCGSDSSPA
PTPVDPVPTLPPTKSSAKLNFTSVAGARLDAVVIPEGYTAQVLAPWGTPLNSKAASWKSD
GSNTADDQANSVGMHHDGMHFFPLNGAGNDGLLCINHEYIDEDALHPAGPTVDATTGLRT
IVDEIRKEINAHGVTVVRIKLVNNQWEVVLNDSHNRRFTGATVMDMAGPLAYTSLLETRY
SPDGSQARGTLNNCGNGYTPWGTYLTCEENWPEYFANRGTLKPDQSRIGISKTSTRYGWD
HLAGHDEERLDEFARFDITPKGANAQDDYRNEANGHGYIVEIDPFNPASRAVKRTALGRF
RHEGCTFGKLTEGKPVVFYSGHDARFEYLYKFVSAAAWDAKDANSSNRIQTGNKYMDEGT
LYVAKFNENGGGVWLPLTLDSQTSDGKTLGDTFASLADIILNTAGAADLVGATPMDRPEW
CAVDPFTGSVYLTLTNNSKRTEAHPANPRLKNNFGHIIRWDEGDKVTEFTWDIFVFGSPS
DGNAETNLSGLTDLNQFASPDGLAFDQRGILWVQTDNGAKEVAEETNDQMLAIVPSTLVD
SQDKQLTVTANNQMELKRFFVGPNDCEVTGFAVSPDYTSMFINIQHPGNWPYSANAAEQT
PAGTTLRPRSATVLIRKQDGKQVGV
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaaggccacctttgatcctacactttataataaaagtaataatgagccgtttaac
caagtgttggataagcatttatctcgccgaaattttgtcaaaagcggattgggccttggt
gccatgaccgcttttgcaggaataggactaacaggttgtggttcggatagctcaccagca
ccgacaccagttgatccagttcccacattaccccccacaaaaagcagcgccaaattaaac
tttacatctgtggcaggtgctcgactggatgccgttgtgataccggaaggttacaccgca
caggtactcgctccttggggaacaccgttaaattcaaaagccgcatcatggaaaagtgat
ggcagtaacactgcagacgatcaagccaattcagttgggatgcatcacgatggtatgcat
tttttcccattaaatggtgctggtaatgatggcttactctgtataaaccatgaatatatt
gatgaagatgcattgcacccagccggaccgaccgtagatgccaccacaggtttacgcacc
attgtcgatgaaattcgcaaagaaattaatgcccatggtgtcactgtcgtgcgaatcaaa
ctggttaataatcagtgggaagtcgttctaaatgacagccataatcgtcgtttcacgggc
gcaacagtaatggatatggcaggccctctggcttatacctctctgctcgaaactcgttat
tcacccgatggcagtcaagcccgcggtaccttaaataactgcggcaatggttatactcca
tggggaacttatctcacttgtgaagaaaactggcctgagtattttgcaaaccgcggtact
ttgaaacccgatcaaagccgcattggtatcagcaaaaccagtacacgttatggttgggac
catcttgctggccatgatgaagaacgcctcgatgaatttgcacgttttgatatcactccc
aagggtgcaaatgctcaagatgattaccgcaacgaagcaaacggtcatggttatattgta
gaaatagatccgttcaatcctgcatcacgcgcagtaaaacgtaccgcattaggacgtttt
cgccatgaaggttgtacttttggaaaattaactgaaggtaaacctgtggtgttttattcg
ggtcatgatgctcgttttgaatacctctataaatttgtttcagcggctgcttgggatgca
aaagatgccaatagtagcaatcgtatacaaacgggcaataagtacatggatgaagggact
ttatatgttgctaaattcaacgaaaatggcggtggtgtttggttaccgttaaccttagat
agccaaacctcagacggtaaaacactcggtgatactttcgccagcttggctgatattatt
ctcaatactgcaggagccgccgatcttgttggcgcaacaccgatggatcgtcctgaatgg
tgtgctgttgatccctttacaggttcagtctatttaaccttgaccaacaactcgaaaaga
accgaagcacatcctgcaaacccaagacttaaaaataactttggtcatattattcgttgg
gacgaaggtgataaagtcacagagttcacatgggatatttttgtatttggttcaccaagt
gatggtaatgccgagacaaacttatcaggtttaacggatttgaatcaatttgcgagtccc
gatggtttagcttttgaccaacggggtattctgtgggtgcagacagacaacggtgctaag
gaagtcgcggaagaaactaacgatcagatgttagcaattgtgccttctaccttggttgat
agccaagacaaacaactgacagtcacagcaaataaccaaatggaattaaaacgcttcttt
gttggccctaatgattgcgaagtgacaggatttgcagttagccctgattacacatcaatg
tttattaatatccaacatccgggtaattggccctactctgccaatgctgcagagcaaact
ccagcgggaaccactcttcgccctcgttctgcaacagtgcttatccgtaagcaagatggt
aaacaagttggggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
