KEGG   Shewanella psychropiezotolerans: FM037_23820
Entry
FM037_23820       CDS       T07745                                 
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
spsh  Shewanella psychropiezotolerans
SSDB
Motif
Pfam: Big_9 Cadherin_5 Cadherin_4 DUF4347 CshA_repeat OMP_b-brl He_PIG OmpA_membrane
Other DBs
NCBI-ProteinID: QDO85740
LinkDB
Position
complement(5434617..5443022)
AA seq 2801 aa
MKLDLIYPWILLLTRWVSRFFSPLFSDRHHFSKLISKLFFREGDKVTHLSGFLVLITCLL
VVQQAKAAQQETEDLFAGFPETELIIIDSAVHEPYMLYQALNAKFKQHLGQNNKTKIVFL
KPELEPLQQIRNAIKDTSDLSQLSIISHASNGAIFLAGKWIDKGYINQHEAMMSEIGSSL
KKGADLKLYGCNLASGVSGKSFVNRVAELTQLDVAASTDTTGGVKQGHNWELEYRVGDID
SRSVFFEALPTSYSSTLNHFRYGTMAVEPIAGESGKVRLKVQIGYTLDHYIMTKLVNSSV
GTVNCQMNYLAGFSWGDGQGQANICVQLLSKDSATNDALVEVVSIGSNGYEPGLVHKYQA
DGDYILSWNSYARSPAMSQNNSYWRAEATTSVVNGEITNASPVTAVSALVYVRDDHPFTM
QISGVDQNGDKIRYRWGKKKEFYSGNSNVEVEKPTGMQLSPEGLITWDLAGDLANGDLIT
YTDNANPSTVTSNRWQAAIVLEDLDINGVVKSKAPLDFVFIISDPDNASPGFNPGPEITA
TQYIQLHQTTTFTITATDVDENGDPDVPTISVLNPPSTDPAIWSTSIISQDSVTGTSVIE
VTFIPSDDMLGKAYVVIFSAKDSNGITSEASVNLVIVNEAPIAQDDSALTQQGQMVIVDV
LANDSDPDGDPLTITQFNAPNGTVVLNGDNTISYTPDASFSGLEIISYVISDGIGSVASA
NILVTVNGNPIAQDDLFTINEDTSSVFDVLANDSEPDGDALNMTLTTPSHGQLSLVNNIV
TYTPNAQFYGTDSFSYTISDGIGGSDTANVTVTVVSVNDLPVASNDSAELDEDQSISISV
LTNDSDPENDPLSVTTHQSLHGTTSVNSNQSLTYAPALNYFGQDQITYSISDGNGGESTA
TVAITVRPVNDAPTANDDSAALAEDTSVLLTPLSNDVDVEGDLLSYISVVASSGQVTVNP
DMSVLYTPTENYQGSVQINYLISDPSGLQSAAVISISVTEVNDAPKANADTATVDEDATL
TYAVLDNDIDIENHPLTVSVAQPSHGQASVEANGSITYVPDPDFNGSDSLIYTIDDGHGG
QDSALFNVMVNGVNDAPIAVDDSATLNEDANVTVPVLANDSDIDGDSLTVTVQPAANGVA
SVTALGLVQYTPNAHFNGADSLTYTISDGNGASASAVLSILVSSVNDHPIAINDAVSLDE
DTSVTIQVLENDSDLDKDLLVVTAQSPSHGDVTVGLDGNISYTPVQDFNGIDSLTYSIDD
GHGGTAQAQLTITINAINDQPVAVDDYAYVTEDGSVTFSVLSNDSDVDNDGLTVTLDTAS
HGSTVNHNDGSVSYTPDANFNGSDSVQYSVSDGQGGAAQAVIYLNVTAVNDAPVAEADLI
SMEEDTSFKFDLLLNDTDVEFALNPASTVLVDQPQHMSASVENGVVTLTPNADFNGSDSL
TYRVSDGDGAVSNTVAVTIVVAAVNDAPRPEPDFASVDEDIILDIEVLANDLDIDDSGDS
SLDIHSVVIVQAPLHGQLTHVDGVLSYLPDGNYVGPDSFSYTVADLMGAVSEATLVTLNV
QGINDAPIAEMDSLTADEDQSISFNVTANDTDIDSQIVPESVSVFSGPTHGVVSISVTGE
VTYTPNADYFGDDSFSYTVKDSEGAVSLPGTVSVSIASINDAPRLQDDIAQLMEDGVNDI
NVMGNDTDIDGGLVLASLMVTVMPEHGAVTILPGGLLRYTPDDNYYGPDSFSYSINDNDG
VTSEANVQISIDSINDHPLAQDYEAVLDEDSQITLYILTNDTDLDGVLDVNSVVIMSSPA
SGILEVNSDGSVLYIPDANFNGSDSFSYQVSDDAGDSSETALVSLDVTPVNDAPQISGSA
PETLLEGDPYQFTPTSLDIDNDTLAFTITGLPSWASFDPLTGTLSGVPAYEDVGSYGPMV
ISVSDGVIEVELEAFYIQVEVLDSDGDGIPDVIEIELGLDPFDATDAGQDADGDGLSNLD
EWLAGSNLYVDDVAPELIIPDDIWIDATGLFTGVSIGQAQAYDYVDGVRQTCCEDLSHTM
VSDLPQLKPGTHQVTWTAVDAAGNVSELVQNIFVRPLISLPQDQIVAQGNLVSVSVYLNG
LSPEYPLSVAYSVAGSAVEGLHHDLTSTMVTFESGQVVATIEFTALDMEQETLQDEVVSI
HLDDQLNLGSKKEHYVTITLDNLAPEIQLSSYQYEEQRTWVAKVDGAVEIQANYTDPNSL
NSHTLDWSLTDSELQDVQLFEEKGVIQKISPSGVSGMKLETWLFDPSGLAEGVYTVRVTV
TDDGKPNLSHFNELRIRVSELLPLLTQADSDGDGIADIEEGLGDSDGDGIPDYLDPIAAA
NVLPERIVNTESYLVECESGVGCRLGQYAMSGVYMGAQVAGSDIHANLQGIMPGDFVDVG
GVFNIEALDLSEQNQAVNIVIPQRNSIPEHAGYRHFIHDKGWFTFETNADNQLMSAPGAA
GYCPPPGSDEYSEGLNQGDWCLQLVIQDGGINDADEVVNGAVNITGCLIQEELDQPGSET
VEVEILTEGGGSSSGASMQIFILSLLAVIAFFRNGPLRSRWFRNGLLKNRQLRNISHRRQ
VHRLSVLLTIILLSLTAQVKADVAPQVMSEDVSLTGFFISGLFARAQSSDNTGDINQSLV
DAGLNAQVIELDESTSGWKLGAGYAFTPSWSVALEYIDLGEVSVRIKGVTDDPETFYATA
SQFYPDSVKGLGLNLGYRYQFIADVSALLHLGLFHWQADYTSYDIDSLQVVTSEDDGYSV
YGGLGVEYALTKNIRFSVQWSHFSLDEQSRDLIGVGVQYLF
NT seq 8406 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaacttgatctcatatatccatggattctcctgctaactcgatgggttagcagattc
ttctcaccgttattctctgacagacatcatttctctaaactcatttcgaaactctttttc
cgagaaggtgacaaggtcactcatttgagtggttttctggtgcttattacttgtctgctg
gtagtgcagcaggcgaaagcggcgcagcaagagactgaggatttgttcgcaggtttccct
gaaactgagttgatcatcatagattcagcggttcatgagccttacatgctttatcaagcg
ctaaacgccaaatttaagcagcatctaggtcagaacaataaaactaaaattgtcttcctc
aagccagaactggagccattgcaacagataagaaacgcgattaaagacacctctgattta
tctcagctgtctattatctcccatgcatctaatggtgcgattttccttgcgggtaaatgg
atagataagggttatattaatcagcatgaagctatgatgagtgagataggatctagcctg
aaaaagggagcggatcttaagttatatggttgtaatctagcgtcgggtgtatcgggtaaa
agtttcgttaacagggtggccgagttaactcaattggatgtggccgcctctaccgatacc
actggtggagttaaacagggccataactgggagcttgagtatcgggtgggagacatagat
tctcggtcggttttttttgaagcgctgccaacttcttactcatccacactgaatcacttt
cgttacggcaccatggcggtcgagcctatagcgggggagagtggcaaggttcgcctcaag
gtgcagattggctacactttagatcactacattatgactaagttggttaactcctcagtg
ggtacggtaaattgtcagatgaattatctggctggtttttcatggggagacggtcaaggt
caagctaacatttgtgtgcaactgctttcgaaagacagtgcaaccaatgacgcgcttgtc
gaggtggtgagtataggctcgaatggctatgagccgggtttagtacataaatatcaagcc
gatggtgattatattctctcttggaattcctacgccagaagccctgccatgagccagaac
aattcatactggcgcgcagaagcgacgacctctgtcgtaaatggtgaaattaccaatgcc
tcaccggtaaccgccgtatcggctctggtgtatgtcagagacgatcacccatttaccatg
caaatatctggggtggatcaaaatggcgataaaattcgatatcgttggggtaagaaaaaa
gagttttactcgggtaatagtaatgtagaggttgaaaaacctactgggatgcagctttct
cccgaaggactcattacctgggatctggctggggatctagctaatggggatttgattacc
tataccgacaatgctaatcccagcactgtaacgagtaatcgttggcaagctgccattgtc
ctggaagatctggatattaatggcgtggtaaagtctaaggcgcctctggatttcgtgttt
atcatcagtgatccagataatgcttctccaggtttcaatcccggcccagagatcaccgca
acccaatatatccagttacatcaaacaaccacttttactatcacggctactgatgtcgac
gagaatggcgatcccgatgtccccactataagtgtgttaaacccgccctcgacagatcct
gcgatatggagcaccagcatcataagccaagactctgtgaccgggactagcgtgattgaa
gtgacattcattccttccgatgacatgttaggtaaggcatatgtggtgatctttagtgcc
aaagatagcaatggcatcacctccgaggcttcagttaacttagttatcgtcaatgaggca
ccgattgcacaggatgactcggccttaacccaacaaggccagatggtgatagtcgatgtg
ttggcgaatgattcagaccccgatggggatcccttaaccattacccaattcaatgctccg
aatggcacagtagtgctcaatggtgataacaccatctcatatacgccggacgcgagtttt
agtggtttggaaatcatctcctatgtcatttctgacggtataggctctgtggcgagtgcc
aatatcttagtcacggttaatggcaaccccattgcgcaagatgaccttttcactataaat
gaagatacaagctcagtgttcgatgtgctggcgaacgatagtgagcctgatggtgacgcg
ttaaatatgacactcacaactccaagccatggacagctaagcctggttaataacatagtg
acctatacaccaaatgcgcagttttatggcacagattcattcagctataccattagtgat
gggatcggtggcagcgatacagcaaacgtgaccgtgactgtggtgagcgttaatgatctg
cctgtcgcgagtaatgactctgctgaactagatgaagatcagagcatttcaatttcagtt
ctgacaaatgatagcgatcctgaaaatgatccactttccgtgacgactcatcagtcacta
catgggacgacgtcggtcaattctaaccagagcctaacctacgccccagcattaaattac
tttggccaagatcagatcacttacagtattagtgatggcaatggcggcgagtcaacggct
actgtggctatcacggtcagacccgtcaatgatgcgcctactgctaatgatgattctgca
gcacttgcagaggatacaagtgtgctcttgacgcctcttagcaatgatgtggacgtagag
ggggatcttctctcttatatttccgttgtggcatcgagtggccaggtgacggtgaatccg
gatatgagtgtactttacactccgacagagaattaccagggcagtgtgcagataaattac
cttatttctgacccttcaggccttcaatctgccgctgtgatttcgattagtgttactgag
gttaacgatgcacctaaggctaatgcagatacggcaacagtagatgaagacgctacgctc
acatatgcagtgctagataacgatatagatatagaaaatcatcctctaacggtttcagtt
gctcagcctagccatggtcaagccagtgtcgaggcgaatggcagtatcacctatgtaccc
gatcccgatttcaatggcagtgatagcttaatctacaccatagacgatggtcatggcggg
caagactcggccttgtttaacgtgatggtgaatggtgtcaatgatgcgccgattgcggtc
gatgacagtgcgactctcaatgaagatgcgaatgttactgtccctgtgctagccaatgac
agtgatattgatggcgatagcctgacggtaaccgtgcaaccagcggccaatggtgtggca
tccgtaactgcgctaggtctggtgcagtatacgccgaacgcgcatttcaatggggccgac
agtctcacttacaccattagcgatggtaatggcgccagcgccagcgccgtactctctatt
ttggtgagcagtgttaatgatcaccccattgcgatcaatgatgcggtgagtctcgatgaa
gacaccagtgtgacgatccaggtgctggaaaatgacagcgatctggacaaggacctgctg
gtggtcacggctcaatctcctagccatggtgatgtcactgtagggctagatggcaatatt
agttacacgccagtgcaggacttcaatggcatcgacagtctgacttattcaatcgatgat
ggtcatggaggcacggctcaagctcagttaaccatcaccattaatgccatcaacgatcaa
cctgtggcggtggatgattatgcctatgtcaccgaggatggctcagtgactttctcagtg
ctgagtaatgacagcgatgtggataacgatgggttaacagtgaccctagacaccgccagt
cacggcagcacagtcaatcataatgatggcagcgtcagctacacgccggatgccaatttc
aatggcagcgacagcgtgcaatatagcgtgagtgatggccaaggcggtgcagcgcaggcg
gttatttacctcaatgtcacagcggtcaacgatgctcccgtggccgaggccgaccttatc
agcatggaggaagatacgtcgtttaagtttgacttgctgctcaatgacacagatgtcgag
tttgccctcaatccggcgagtactgtgttggttgaccagccacagcacatgagtgccagt
gtggaaaatggtgtggtgaccttaacccctaatgccgactttaacggcagcgatagcctg
acttatcgagtatccgatggtgacggtgcagtgtctaacacagttgcagtgactatagtg
gtggctgcggtgaacgatgcacccaggcctgaacccgattttgccagtgtcgatgaagac
atcatcttagacattgaagtgttggccaatgacttagatatcgatgatagcggtgattca
tctctggatattcattcggtggtgatagtacaggcgccgcttcatggtcagctgacccat
gttgacggtgtgctaagttacctgcctgatggtaactatgtcggtccagatagtttcagc
tataccgtggcggatttgatgggggcagttagtgaagccactctggttaccttaaacgtg
caaggcatcaatgatgcaccaattgccgaaatggatagcctgacagccgatgaagaccag
agcataagcttcaatgtgacggcgaatgacaccgacatagactcacagatagtgcccgag
tcggtgagtgtatttagcggcccaactcatggcgtggtgagtatttcagtaacgggagag
gtcacttacacgccaaatgccgattattttggcgatgacagcttcagctacacagtcaag
gacagtgaaggtgccgtgtccttgcctggtactgtgagtgtgagcatagcttctatcaac
gatgcccccaggttgcaggatgatatcgctcaactcatggaagatggcgtcaatgacatc
aatgtgatgggtaacgacacagatatcgacggtgggttagttttagctagcttgatggtg
acggttatgccagagcacggcgcagtcacaatattgccggggggattgttaagatacact
cctgacgataactattatggaccggacagctttagttactcgattaacgataatgatggc
gtgacgagtgaagctaatgttcagatcagcatagatagcatcaacgatcatcccttggcc
caagattatgaggctgtgctggatgaagatagccagataacactttatatcttgaccaat
gacaccgacttagatggagtcttggatgtaaacagtgtggtcatcatgagttcgcctgct
tcaggaatattggaagtcaattctgatggcagcgtgctctatataccagatgctaacttc
aacggcagtgatagttttagctaccaagtcagcgatgatgcgggtgatagctctgaaact
gcattggtcagtttagacgtaaccccagtcaatgatgcaccgcaaatttcgggtagtgca
cctgaaactctcctcgagggtgacccttaccaattcactcccactagcttagatatagac
aatgatactttggccttcactatcacaggcttaccctcatgggctagtttcgatcctctc
accggcaccttgagtggcgttcctgcttatgaagatgtcggtagctatggtcctatggtt
atttcagtgtcggatggggtcatagaggttgagttggaggcattttatatccaagttgaa
gtgcttgattcagatggtgatggtatcccggatgtcatcgaaattgaattaggtttagat
ccattcgatgccaccgatgccgggcaagatgccgatggcgatggcctaagtaatttggat
gaatggctagccggaagtaatctctatgttgacgatgtcgcgcctgagcttattattcct
gatgatatctggatcgatgccactggcttatttactggtgtgagcatagggcaagcccaa
gcttatgattatgtcgatggcgtaaggcagacttgctgtgaagacttaagtcacaccatg
gtaagtgacctgcctcagctaaagcccggaactcaccaggtgacatggaccgcagtcgat
gctgccggtaatgtcagtgagttggttcaaaatatctttgtgcgtccacttatctctcta
cctcaagatcaaatcgttgcccagggtaacctagtctcagtttctgtttatcttaacgga
ctctctcctgagtatcctctatcggtagcttacagtgtggcaggcagtgcggttgaggga
ctgcaccatgatctcactagcactatggtgacattcgaatcaggccaagtcgtggcgacg
attgagtttaccgccctggatatggaacaggagacgctgcaggacgaggtggtgtccatt
catctggatgatcaattaaatcttggcagtaagaaagagcactatgtcacgattacctta
gataacttggcaccagaaatacaactctcctcttatcaatatgaagagcagcgtacctgg
gtggcaaaagttgatggtgccgttgaaattcaggccaattataccgatcccaatagcctc
aatagtcatacgttggattggagtttgacagacagtgaacttcaggatgttcaactcttt
gaagagaaaggtgttatacaaaaaatatccccatcaggagttagtgggatgaagttagaa
acttggttgtttgatcccagtggcttagctgagggggtctatacggtgagagtcacagta
accgatgatggcaagcctaatttaagtcacttcaatgagttaaggattcgagtgtcggag
ctcttacctttgttgactcaggctgattccgatggagatggcattgctgatattgaggag
ggcttaggtgactcagacggtgatggtatcccagattacttagatcctatcgcggccgca
aacgtgctacccgagagaatcgtcaacactgaatcttatctggtggagtgtgagtcaggg
gtaggctgccgtttaggtcaatatgctatgtctggtgtgtatatgggagcccaagtagca
ggctcagatattcacgctaacctgcaaggcatcatgccaggtgattttgtcgatgttggc
ggcgtatttaacatagaggcactcgatttatccgagcagaaccaggccgtcaatatcgtt
attccacagcgtaactcaattcctgaacatgcaggctatcgtcattttattcatgataaa
ggttggtttacttttgaaacaaatgccgataaccaactcatgtcggcgccaggggccgca
ggttattgtccaccgccggggtcggatgagtattctgaggggcttaatcaaggggattgg
tgtttacagctggtcattcaggatggcggtatcaatgacgccgatgaagttgtgaatggg
gcggtaaacattaccggctgcttaattcaagaggagctagatcagccaggcagcgaaact
gtcgaggtggaaattttaactgagggaggtggttcctcatctggagcgagtatgcaaatc
tttatcttgtccctattggccgttattgccttcttcagaaatggaccgttgagaagccgc
tggtttagaaacggactattgaaaaataggcagcttaggaatataagccatagacgccaa
gttcatcgtttatctgtactcctgactataattttgctttcactgacggcccaggtcaaa
gccgacgttgctccacaagtgatgtctgaagatgtaagcctgacgggcttctttatttct
ggactcttcgcgcgggctcagagctcggacaacacgggggacatcaatcaatctctggtg
gatgcaggattaaatgctcaagtgattgagcttgatgaatcgacttctggctggaagctc
ggtgccggctatgcctttacaccaagttggtctgtggctttggaatatatcgacttagga
gaggtgagcgtgaggataaaaggagtgacggatgatccagagactttttatgccacggct
agccagttttatccggactctgtcaagggactaggattgaacctagggtaccgctatcaa
tttatcgctgatgtgagcgccttacttcatctgggtttgtttcattggcaagcagattac
acctcttatgatatcgattctctgcaggtagtgaccagcgaagatgatggctactcagtc
tatggggggctaggtgttgagtatgcattaacgaaaaatatccgtttctcagtacagtgg
agtcattttagcttagatgagcagagtcgtgacttgattggtgtcggagtacagtatctg
ttttaa

DBGET integrated database retrieval system