Strongylocentrotus purpuratus (purple sea urchin): 115918183
Help
Entry
115918183 CDS
T01019
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: flocculation protein FLO11-like
Organism
spu
Strongylocentrotus purpuratus (purple sea urchin)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
DUF6721
EGF_3
cEGF
EGF
hEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115918183
NCBI-ProteinID:
XP_030853188
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1676 aa
AA seq
DB search
MSMVTPTSESPSSMTSMPTTEPVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTSESRSSMTSMPTTES
VDATPMSTPSDASSTTMSMATPTPESHSSMTSMPATESVGATPMSTPSDASSTAMSMATP
TSESPSSMTSMPTTESVGATSMSTPSDSSSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVDATPM
STPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVDATPMSTPSDASSTTMSMATPTPESPS
SMTSMPATESVGATPMSTPSDASSTAMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATSMSTPSDS
SSTTMSTATPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTSMP
TTESVNATPMSTPSEASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVDATPMSTPSDASSTTMS
MATPTSESPSSMTFMPTTESIGATPMSTPSDSSSTTMSTATPSSESPSSMTSMPTTESVG
ATPMSTPSDASSTTMSMASPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDTSSTTMSMATPTS
ESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDSSSTTMSTATPTTESPSSMTSMPTTESVDATPMST
PSDSTSTTMSTATPTSESPSSMTSMPTTESVDATPMSTPSDASSTTMSTATPISESPSSM
TSMPTTESVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTEFVGATPMSTPSDASS
TAMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDASSTDMSMATPISESPSSMISMPTT
ESVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDASSTAMSMA
TPTSESPSSMTSLPTTESVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTTESPSSMTSMPTTESVGAT
PMSTPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTSES
PSSMTSMPTTESVGATLMSTPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPS
DASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTS
MPTTESVGATPMSTPSDASSTTMSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATLMSTPSDASSTT
MSMATPTSESPSSMTSMPTTESVGATPMSTPSDTSSNAMSTATPTPTSSSTEVATTSGPA
ATTSGPAATTSGPAATTSGPAATTSGPAATTSGPAATTSGPAATTSGPAATTSEPSATPM
PEIDPCSSSPCQNGGECSSNNAVYLCTCLDTHEGTNCETAKTGCSSNTGCPTRESCNSDT
NVCECNGNSVRNANGVCRVPRRTLSLSIVIVEFQSNTDFRDIVNNPTSVESMDVRQRLTI
IIFAIYRSRYGPVFIGVVIRGFSLGSLEVDADLMFDEPENATTIQPPTAAEAAQEFMDSL
ENGNSTGGFVLVPSRTTVTDINECSNSTLNDCSSYAECTNTQGSFSCACQEGFIDTTPAP
DRGRQCEDLNECSDASICAQYATCSNSVGSYSCSCFVGFTGDGRTCTPDGSAGLSDGALA
GIVIGCVVIVFLILFLLMVLYIKMRRMMSYERKLARSVSRFGPMDREREAMPFGNGNGNQ
RDSYPLADYPSDMELGHMRKPGYSNGAYTSHNEARGRKIXNLESNVHCNVQNNICN
NT seq
5031 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctatggtaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatctatgccaacaaca
gaacctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtct
atggcaactcctacatcagaatctcgttcatccatgacatctatgccaacaacagaatca
gtagatgcgactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtctatggca
actcctacaccagaatctcattcatccatgacatctatgccagcaacagaatctgtaggt
gcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactgccatgtctatggcaacccct
acatcagaatctccttcatccatgacatctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaact
tcaatgagcacaccctctgattcatcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatca
gaatctccttcatccatgacatctatgccaacaacagaatcagtagatgcgactccaatg
agcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatcagaatct
ccttcatccatgacatctatgccaacaacagaatcagtagatgcgactccaatgagtaca
ccttctgatgcatcatcaactaccatgtctatggcaactcctacaccagaatctccttca
tccatgacatctatgccagcaacagaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttct
gatgcatcatcaactgccatgtctatggcaacccctacatcagaatctccttcatccatg
acatctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaacttcaatgagcacaccctctgattca
tcatcaactaccatgtctacggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatct
atgccaacaacagaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatca
actaccatgtctatggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatctatgcca
acaacagaatcagtaaatgcgactccaatgagcacaccttctgaagcatcatcaactacc
atgtctatggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatctatgccaacaaca
gaatctgtagatgcgactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtct
atggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatttatgccaacaacagaatct
ataggtgcaactccaatgagcacaccctctgattcatcatcaactaccatgtctacggca
actccttcatcagaatctccttcatccatgacatctatgccaacaacagaatctgtaggt
gcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtctatggcatctcct
acatcagaatctccttcatccatgacatctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaact
ccaatgagcacaccttctgatacatcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatca
gaatctccttcatccatgacatctatgccaacaacagaatctgtaggtgctactccaatg
agcacaccctctgattcatcatcaactaccatgtctacggcaactcctacaacagaatct
ccttcatccatgacttctatgccaacaacagaatcagtagatgcgactccaatgagcaca
ccttctgattcaacatcaactaccatgtctacggcaactcctacatcagaatctccttca
tccatgacttctatgccaacaacagaatcagtagatgcaactccaatgagcacaccttct
gatgcatcatcaactaccatgtctacggcaactcctatatcagaatctccttcatccatg
acatctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgca
tcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatcagaatctccgtcatccatgacatct
atgccaacaacagaatttgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatca
actgccatgtctatggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatctatgcca
acaacagaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactgac
atgtctatggcaactcctatatcagaatctccttcatccatgatatctatgccaacaaca
gaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtct
atggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacgtctatgccaacaacagaatct
gtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactgccatgtctatggca
actcctacatcagaatctccttcatccatgacatctttgccaacaacagaatctgtaggt
gcaactccaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtctatggcaactcct
acaacagaatctccttcatccatgacatccatgccaacaacagaatctgtaggtgcaact
ccaatgagcacaccttctgatgcatcttcaactaccatgtctatggcaactcctacatca
gaatctccttcatccatgacatctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaactccaatg
agcacaccttctgatgcatcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatcagaatct
ccttcatccatgacttctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaactctaatgagcaca
ccttctgatgcatcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatcagaatctccttca
tccatgacatctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttct
gatgcatcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatcagaatctccttcatccatg
acatctatgccaacaacagaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatgca
tcatcaactaccatgtctatggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatcc
atgccaacgacagaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttccgatgcatcatca
actaccatgtctatggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacttctatgcca
acaacagaatctgtaggtgcaactctaatgagcacaccttctgatgcatcatcaactacc
atgtctatggcaactcctacatcagaatctccttcatccatgacatctatgccaacaaca
gaatctgtaggtgcaactccaatgagcacaccttctgatacatcgtcaaatgccatgtct
acggcaacacctacaccaacttcgtcatccactgaggtagcaaccacgagtgggcctgct
gcaaccacgagtgggccagctgcaaccacgagtgggcctgctgcaaccacgagtgggcct
gctgcaaccacgagtgggcctgctgcaaccacgagtgggcctgctgcaaccacgagtggg
ccagctgcaaccacgagtgggcctgctgcaaccacgagtgagccttctgcaaccccaatg
ccagagatcgacccatgttcatcatctccgtgccaaaatggaggcgaatgctcatcaaat
aatgctgtttatttatgtacatgtctggacactcacgagggaaccaattgtgaaacagcc
aagactggctgcagtagtaataccggatgccccacaagagagagctgcaattccgacact
aacgtgtgtgaatgtaacgggaattcggtgaggaatgctaacggtgtctgcagagttccc
cgccgtacattgtcgttgagcattgtgatcgtggaattccaaagcaacacagatttccga
gacatcgtcaacaatcctacctcggtagaatctatggacgttagacagcgccttactatc
atcatctttgctatataccgaagccgatatggacccgtcttcatcggcgtagtcatcaga
ggcttctctttagggagtctcgaagtcgacgccgatctcatgttcgatgaacccgaaaac
gccacgaccatacaaccccctactgcagctgaagcagcccaggagtttatggatagtctc
gagaatggaaactctactggaggatttgtcttggtcccatcaaggacaaccgttactgat
attaacgagtgctccaatagcacattgaacgactgtagctcgtatgcagagtgcactaac
acccagggtagtttttcatgtgcatgtcaagaggggttcatagacaccactcctgcacca
gatcgcggaagacaatgtgaagatttaaacgagtgtagtgatgcaagtatttgcgcccag
tatgctacttgttcgaactctgtgggcagctattcgtgttcatgtttcgtgggcttcacc
ggcgatggaagaacatgcactccagatgggtcagcaggcctcagcgacggagccctagcc
ggcattgtcatcgggtgtgtggtaatcgtcttcctcatattattcctcttgatggtgttg
tacatcaaaatgcgtcggatgatgtcttatgaaagaaaattagcaaggtcagtcagtcga
tttggaccaatggacagagagagagaagccatgccatttggaaacggcaacggcaatcag
agagacagttatccattggccgactacccgtccgacatggaactcggccacatgcgtaag
cccggctactccaatggtgcatacacgtcacataatgaagctcgggggagaaaaatttaa
aatttagaatcaaatgtgcactgtaatgtgcagaataatatatgcaattga
DBGET
integrated database retrieval system
