Sinocyclocheilus rhinocerous: 107705843
Help
Entry
107705843 CDS
T04916
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
srx
Sinocyclocheilus rhinocerous
Pathway
srx04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
srx00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
107705843
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
srx00536
]
107705843
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
srx00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
107705843
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Tme5_EGF_like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107705843
NCBI-ProteinID:
XP_016364826
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2606 aa
AA seq
DB search
MVHRFGHYEDVDECKVVPDLCKGGKCINTVGSYQCQCPVGFQQHMSSLMCEDVDECSTVQ
RVCDGGRCINSAGSFSCVCPSGYLPSADRMRCLEQHTGVCFASVENGRCAQKISGRFSKI
QCCCNRGHCWSQSTAHEMCPVPGSDEYFRICLVGSALSGFSEEDPDLHPQHRSGFRPTAN
DRILRPLNDNGRITPQIHQIPGNVRMNETVNRCRLFPNLCLNGRCVPLGSDYRCDCNTGY
REDNRGECSDVDECAFEPCTNGNCINTAGSYYCRCHSGFLRFPGKQACIDVDECLQNGVL
CKNGRCLNTEGSFQCICNAGFKLTPDGRNCIDHDECASTNMCLNGMCINEDGSFKCVCKP
GFTLNSSGRYCTDMDECRRPGVCMNGRCVNSQGSFSCECFAGLTVGIDGRTCVDTHMHST
CFGVVKRGLCVRPFQRSLTKSQCCCANPDYGFGQPCRPCPGKNSVEFQALCASGVGFSAD
GKDINECALDPDICSNGVCENLRGSFRCICNSGYESDQTGRNCLDIDECVVNSLLCDNGL
CQNVPGSYSCTCPAGYTLRHDTETCDDVNECVSSPCVNGVCKNNAGSFSCECPLGSELDS
TELLCIDSLKGSCWVTLQDGRCEVNINGATLRSQCCATLGAAWGSPCEPCQSDPVCQRGF
TRPRGASCEDVNECEVFPGVCHNGHCVNTRGSFKCQCPESLTLDVTGRVCVDVRSEACFL
TYDEDVCMQPVPGRFRMDMCCCTVGLAWGKDCELCPEPGTSPFDALCPRGPGFANKGDML
TGRAVYKDINECKVFQSICIHGKCRNTIGSFRCRCDSGFALDANEQNCTDIDECVISPDV
CGHGTCVNTLGSFQCDCFPGYERGFMLMKNCLDIDECELNLSLCNGGTCENTDGSYRCVC
PPGHQLSVDGSACDDVNECELSSTLCLNGRCVNVVGTYQCSCNSGYRMTPDRKGCTDIDE
CTIENGGCEVYCSNSEGSYSCSCGQGYTLTPDQRTCADVNECEEHVDICEGGQCTNVPGE
YYCMCHEGFMTSVDMRTCIDVNECELNPNICVFGECENTKGSFICHCEMGYAVKKGTSGC
TDVNECEINTHNCDTHATCVNTPGHYRCTCSDGWSGDGVRCADMDECSDRTHVCSADAEC
VNTAGSYHCRCSDGFTGDGFTCSDMDECAEDVDLCENGQCLNVPGGYRCECEMGFTHTPN
SKTCQDIDECTFQNICVFGTCHNIPGMFHCVCDEGYELDRTGGNCTDVDECLDPVSCVNG
HCENTAGSYQCNCPIDFELNPTGIGCVDTRVGNCFLDVVYHGRGGLACSVELGFGVSRSS
CCCSLGRAWGNPCDLCSPLNTSEYNTLCPGGEGFKLNPITIILEDIDECQELPSLCQGGN
CINTFGSFQCDCLTGYILNMDSRMCEDIDECMLSSGVCGPGTCYNTLGNYTCVCPQDYMP
VNGGHSCMDMRKSLCYRNYSGSTCEHQLNFNTTQRLCCCAYNVGKAWSKPCQACPSPGTG
DYRSLCGSVTGFRIDIETGKPKDINECHEIPGVCAHGVCINQVGSFNCECPTGFIYSDLL
LVCEDIDECSSGELVCQRNADCINRPGSYQCECSDGYILTPNGACADRNECVEAPSMCRH
GDCVDFPGGYECVCHTGFTATQNRRMCVDVNECSHQPCGNGTCTNSIGSFNCICHQGFEL
ASNNYCTDIDECAVFHSQLCRNGRCVNNVGSFQCLCREGYELTRDGKSCIDVNECKLNRG
ICAPGTCVNLDGSFRCVCPDGYIVHNEHCVDVNECSEEPGICAYGSCFNSLGSFECVCKP
GFVLSEDRRRCYDTRESFCFTRFESGKCSVPQAFNTSKAKCCCSVMAKEGWGDPCELCPK
EQDAAFQDLCPFGHGIIPGVGNTRVDLNECVENPEICVNGHCIDMDGSFRCECPTGYMLN
YTGTRCDDINECSFGNPCGNGTCSNVIGGFECLCEEGFEPGPMMSCEDVNECSQNPLLCV
FRCINTLGAYECSCPSGYTLREDGHMCQDVDECANDLHNCDSRGMECNNLIGTFMCVCPA
GMIHRMNDDMCQDENECLTQPGVCENGRCVNTVGSYTCECGVGFKTDSTATQCLDYRQGF
CFTEVLHTMCQMSSSSRVPVSRSQCCCNRGLGWGDQCELCPLPATANYKKLCPYGHGYAT
DGTDIDECKLIPGVCANGICINIMGSYRCHCKPGYIASTAGTACVDVDECSMSPKPCNFI
CKNMEGSYVCSCPRGYMLQDDSRTCKDVDECQSRRHNCQFSCVNSIGGFTCKCPAGFSQH
HTACKDINECLSERGPCGQQGICQNSVGSFSCECPQGFILDSLGLSCDDVDECAPDHRCQ
FGCQNVAGGFRCSCPEGYTQHQQWNQCVDDNECLNPGSCGSASCFNTLGSFKCGCPSGFN
FDPVSTSCEDVDECVSFMSPCRYGCSNTQGGFMCGCPAGYYRAGQGHCVSAAGFGGGGLG
PEEENGLSPETCYGCKTNRHQKKSVRRGQTSNLTLEGVSLASVDVDQPLKLLLNRSQLKP
SEAILELLPAVRALSQRVMYTITAGKHDGFFQIRQRAGISYLHSTHRTPSMRRYRLQIRS
SALSKEMDRDERLAPNLHMTLHITLQ
NT seq
7821 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttcacaggtttggtcactatgaagatgttgatgaatgtaaggttgtgcctgacctg
tgtaaaggaggaaagtgcatcaacactgtgggctcatatcagtgccagtgtcccgtgggt
ttccagcagcacatgagttcgctgatgtgtgaggatgtggatgaatgctccaccgtccag
cgtgtgtgtgatggaggacgctgcattaattcagcgggcagtttctcctgtgtgtgtcct
tctggatacttgccatctgcagaccggatgcgctgcctcgagcagcacacaggtgtctgt
tttgcgtctgttgagaatggacgctgtgctcaaaaaatcagtggacgcttcagtaaaatc
cagtgctgctgtaaccgtggccactgctggagtcagagcacagctcatgaaatgtgtccc
gtaccaggatcagatgaatacttcaggatctgtctggtgggctctgctctcagtgggttt
agtgaagaggatcctgacctgcaccctcaacaccgcagcggcttccgacctaccgctaat
gaccggatacttcgcccacttaatgacaacggacgcatcacacctcagattcatcaaatc
ccagggaatgttcgtatgaatgagactgtgaacaggtgtcgtctgtttcctaatctgtgt
ctgaatggacgctgtgtacccttggggtctgactaccgctgtgactgtaacaccggatac
agagaggacaacagaggagagtgttcagatgtagatgagtgtgcgtttgagccctgcact
aatggaaactgtatcaacactgctggttcctactactgcagatgccactcaggctttctc
aggtttccaggcaaacaggcctgcattgatgttgacgaatgtcttcagaatggggtgctg
tgtaagaatggccgctgtctcaacacagaaggcagttttcagtgcatctgtaatgcagga
ttcaagctcacacctgatgggagaaactgcatagatcacgatgaatgtgccagcacaaac
atgtgtcttaacggcatgtgcattaatgaagacggcagctttaaatgtgtgtgtaaacct
ggattcaccctcaactccagcggacgctactgtacagatatggatgagtgccggaggcca
ggtgtgtgtatgaacggacggtgtgtaaactcacagggctctttcagttgtgagtgtttt
gcaggtcttaccgtaggaatagatgggcgcacatgtgtagacacacacatgcacagcacc
tgttttggggttgtaaaaagaggcctgtgtgtgcggccctttcagcgatctctcaccaag
tcacagtgctgctgtgccaaccctgactatggctttggtcaaccgtgccgtccctgccct
ggcaaaaactcagttgagtttcaggccttgtgtgcgagcggtgttggattttctgctgat
ggcaaagacattaatgagtgtgctctggatcctgatatctgctctaatggagtgtgtgag
aatctcagaggaagtttccgctgcatctgtaacagtggctatgaaagtgaccagactggc
agaaactgtctggatatcgatgaatgtgtagtaaacagtcttctctgtgataacggcctg
tgccagaatgttcctggcagctacagctgcacctgcccggctggatacaccttgagacac
gacacagagacgtgtgacgatgtgaatgagtgtgtgagcagcccgtgtgttaatggagtc
tgtaagaacaatgcaggctctttctcctgtgagtgcccactaggaagtgaactggactcc
actgaacttttatgtattgacagtctaaagggctcgtgctgggtaacccttcaggatggc
cgctgtgaagtgaacattaacggagctacactgaggtctcagtgctgtgcgacgctggga
gcggcctggggaagcccatgtgaaccatgtcaaagcgatcctgtatgtcaacgaggattt
actcggccaagaggggcttcgtgtgaagatgtgaatgagtgtgaggtgttccccggtgtg
tgtcataatggacactgtgtgaacactagaggttcttttaaatgtcagtgtccagagagt
ctcacactggatgtcactggacgtgtctgtgtggatgttcgttcagaggcctgttttctc
acctacgatgaagatgtgtgtatgcagccggtaccaggacgcttccgcatggacatgtgt
tgctgtacggtgggtttggcctggggcaaagattgtgaattgtgccctgagcctggcaca
agcccgtttgatgctctgtgcccgagaggaccaggctttgccaacaaaggggacatgctc
actggcagagctgtctataaagatatcaatgagtgtaaagttttccaaagcatctgtatt
catggaaaatgtcgaaacaccattggaagcttcagatgtcgttgtgacagtggctttgca
ctggatgccaatgagcaaaactgcacagatattgacgagtgcgtgatctctcctgatgtt
tgtggccatggcacgtgtgtgaacactctgggcagtttccagtgtgactgtttccctggc
tatgagaggggatttatgttgatgaagaactgcttggatattgacgaatgtgaactaaac
ctctcactgtgtaatggaggcacctgtgaaaatactgatggcagctataggtgtgtgtgt
ccacctggtcatcagctgtctgtggacggcagtgcctgtgatgatgtgaacgagtgtgag
ttgagcagcacattgtgtcttaatggcagatgtgtgaatgtggtggggacgtaccagtgc
tcctgtaactctggttaccggatgacacctgataggaaaggctgcacagatatagatgag
tgtacgatagagaatggaggatgtgaggtgtactgtagtaattcagaggggagttactcc
tgcagctgcggtcagggttacactctgacgccggaccaaaggacatgtgcagatgtgaat
gaatgtgaagagcatgttgacatctgtgaaggtggtcagtgcactaatgtccctggagaa
tattactgcatgtgtcatgaaggattcatgacttctgtggacatgaggacatgcattgat
gtgaatgagtgtgaactcaaccccaacatctgtgtgtttggggagtgtgagaacaccaag
ggttctttcatctgtcattgtgagatgggttacgccgtgaagaaaggaacttctggctgc
accgatgttaatgagtgtgagattaacactcacaactgtgacacacacgccacctgtgtc
aacacaccgggacattaccgctgcacctgcagtgacggatggtctggtgatggagtcaga
tgtgctgatatggatgagtgtagtgacaggactcacgtctgcagcgctgatgctgagtgt
gtgaacactgctggctcgtaccactgtcgatgttcagatggctttactggagacggattt
acctgctcagatatggacgagtgtgctgaagatgtggatctgtgtgaaaacggccagtgt
ctcaatgttcctggcggctatcgctgtgaatgtgagatgggcttcacacacactccaaac
agcaaaacatgtcaagatatagacgagtgcaccttccagaacatctgtgtgtttggcaca
tgtcataatattccagggatgtttcattgtgtatgtgatgagggctatgagctggacagg
acaggtggaaactgcacagatgtggatgagtgtctcgatcccgtcagctgtgttaatggt
cactgtgagaacacagccggctcataccagtgtaactgtcccattgactttgaactcaac
cccactggaatcggctgcgttgacacacgagtagggaactgttttctggatgtggtgtac
catggccgtggtgggctggcatgtagtgttgagttggggtttggagtcagtcgttcgtca
tgctgctgttctctgggacgagcgtggggtaacccatgtgacctttgctctccactcaac
acctcggagtataacacattgtgtcctggaggagaggggttcaaactcaaccccatcacc
atcatcctggaagatattgatgaatgtcaggagctgcccagcctgtgtcagggtggaaac
tgcatcaatacatttggaagtttccagtgtgactgtctgactggatatatcctcaacatg
gacagccgcatgtgtgaggatattgatgagtgtatgctcagttcaggcgtttgtggtccg
ggcacctgctacaacacactgggaaattacacatgtgtctgcccacaggactacatgcca
gtgaatggaggacacagctgcatggatatgagaaaaagtctgtgttaccgtaactacagt
ggtagtacctgtgaacaccagcttaatttcaacaccacacagagattgtgctgctgtgcc
tacaatgtgggcaaagcctggagcaaaccatgccaggcctgtccgagccctggcacaggt
gactatagaagtctttgtggcagtgtaaccggattcaggattgacattgaaactggaaag
ccgaaagatattaatgaatgtcatgaaatcccaggcgtctgtgctcatggtgtgtgtata
aaccaagtaggcagtttcaactgcgagtgtcccacaggcttcatttacagtgatctgctg
ctcgtctgtgaagacattgatgaatgcagcagtggagagcttgtgtgtcagagaaatgca
gactgcatcaaccggccgggaagctatcagtgtgaatgttctgatgggtatatactcaca
cctaacggagcctgtgctgaccgtaacgagtgtgtggaggcacccagcatgtgtcgtcat
ggtgattgtgtggactttccaggaggatacgagtgtgtgtgtcacaccggctttactgcg
acacaaaaccgcaggatgtgtgtagatgttaatgagtgttcacaccagccgtgtgggaat
ggcacatgtacaaactctattggctcatttaactgtatctgtcatcaaggatttgagcta
gccagtaataactactgtacagatattgacgagtgtgcagtttttcactctcagctctgc
aggaacggccgctgtgttaataatgtcggctccttccagtgcctctgtagagagggctat
gagctcactcgtgatggaaagagctgtatagatgttaatgagtgtaaattgaatcgtggg
atatgtgctcctggaacgtgtgtgaatctggatggttctttcagatgtgtctgtcctgat
gggtatattgtccacaatgagcactgtgtagatgtgaacgagtgttcggaggagcctggc
atctgtgcgtatggctcctgcttcaacagtctgggcagctttgagtgcgtgtgtaaacct
ggatttgtgctgtcagaagatagacgcagatgttacgacactagagagagcttctgtttc
acacgctttgagagcggcaagtgctctgtcccacaggcatttaacaccagcaaagccaag
tgttgctgtagcgtcatggccaaagagggctggggcgatccctgtgagctgtgccctaaa
gaacaggatgctgcgtttcaggatctgtgtccgtttggccatgggatcattcctggtgtt
ggaaacacacgtgtggacttaaatgagtgtgtggagaatccagagatctgtgtgaacggc
cactgcatcgacatggatggctccttccgctgcgagtgtcccacgggctacatgctcaac
tacacaggaacacgttgtgatgacattaatgaatgttcatttggaaacccctgtggaaac
ggcacatgctcaaatgtgatcggaggatttgagtgtctgtgtgaggagggatttgagcct
ggaccaatgatgagctgtgaagatgtgaacgagtgcagtcagaatcctctgctctgtgtg
tttcgctgcattaacactttgggggcgtatgaatgcagctgtccatctggttacactctg
cgagaggatggacacatgtgtcaggatgtagacgagtgtgcaaatgatcttcataactgt
gactccagaggaatggagtgtaacaatttaattggcaccttcatgtgtgtttgtccagcc
gggatgatccacaggatgaatgatgacatgtgtcaagatgaaaatgaatgtttgactcag
cctggggtttgtgagaatggtcgatgtgtgaacactgtgggcagctacacgtgtgaatgt
ggcgttggattcaaaactgactctacagccacacaatgtcttgattacaggcaaggcttt
tgtttcactgaagttctgcacaccatgtgtcagatgtcgtccagcagtcgtgtccctgtc
agcaggtctcagtgctgctgtaacagaggcctcgggtggggggaccagtgtgagctctgc
cctttgcctgctactgccaactacaagaaactctgtccatatggccatggctacgcaact
gacgggacagatatagatgagtgtaagctgattccaggtgtttgtgccaacggcatctgt
atcaacatcatgggctcgtacagatgccactgtaaaccaggatacatcgcatctactgca
ggaaccgcatgcgtcgatgttgatgaatgtagtatgtccccaaaaccctgtaacttcatc
tgtaagaacatggagggcagctatgtgtgttcctgtccccgcggttacatgctgcaggac
gacagcaggacgtgtaaagatgtggatgaatgtcagagcagacgacacaattgtcagttc
tcgtgtgtcaactccattggtggattcacctgcaagtgtccggcaggcttcagccagcat
cacacggcctgcaaagatattaatgaatgtttgtctgagcggggtccgtgcggtcagcag
ggcatctgtcagaattcagtgggcagcttcagctgtgagtgtccacagggcttcattctg
gactctctcggcctcagctgtgatgatgtagatgagtgtgcgcctgatcacaggtgtcaa
ttcggttgtcagaatgttgcgggtggtttccgctgcagctgtccagagggatacacacag
caccagcagtggaaccagtgtgtggatgacaatgagtgtttgaatccgggcagctgtggt
tcagcatcttgttttaacacattgggcagttttaagtgtggctgtccatctggcttcaac
tttgaccccgtttccactagctgtgaggatgtggacgagtgtgtgtccttcatgagcccc
tgcagatatggctgctcaaacacacagggtggattcatgtgtggatgtccggcaggatat
tacagagcaggacagggacactgtgtatctgctgctggttttggaggtggtgggcttgga
ccagaagaggaaaatggtctttctcctgaaacctgctatggctgcaaaacgaatagacac
caaaagaaaagtgtcaggagaggacagacttcaaacctcacactggaaggagttagtctg
gccagtgtggatgtggatcagccgctgaaattactcctcaatcgctcacaactcaaaccc
agtgaagccatactggagctgctgcctgctgtcagagcactttctcaacgtgtaatgtac
accatcacagctggaaaacatgatggattcttccagatcagacagcgggcgggtatcagt
tacctgcacagcacacacaggacgccctcaatgagacgctacagactgcagatcagaagt
tctgctctctctaaagaaatggacagagatgagcgacttgctccaaacctgcacatgaca
ctccacattacactccagtag
DBGET
integrated database retrieval system