KEGG   Spiroplasma sabaudiense: SSABA_v1c06870
Entry
SSABA_v1c06870    CDS       T03048                                 
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
ssab  Spiroplasma sabaudiense
Pathway
ssab03030  DNA replication
ssab03430  Mismatch repair
ssab03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ssab00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SSABA_v1c06870 (dnaE)
   03430 Mismatch repair
    SSABA_v1c06870 (dnaE)
   03440 Homologous recombination
    SSABA_v1c06870 (dnaE)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:ssab03032]
    SSABA_v1c06870 (dnaE)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ssab03400]
    SSABA_v1c06870 (dnaE)
Enzymes [BR:ssab01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SSABA_v1c06870 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:ssab03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SSABA_v1c06870 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:ssab03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SSABA_v1c06870 (dnaE)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger PHP HHH_6 tRNA_anti-codon
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHI54089
UniProt: W6AK35
LinkDB
Position
complement(790586..793612)
AA seq 1008 aa
MFSPQINVRSCFNFQDSLITIEDYINFASLQEFDFAFYSDIETMYGAADFVKAALQKNIK
PIIGLTIDFKKYDLDFRLTLFAKNLLGYQIICKLSSLIMCQELKQTNEIIIETIISLLDK
NLVGIISFFNNFNEQIAQRIQNQLLAENLFFGIDRHALKIPVEFQARQVFAQDVKYFEKA
DFFAFKVLQAIKNNELLKDQSLVDDLNYFYSNDQIAEIIDLKTHKDNIVKIASMCNFNMF
ENKKNHLMKYPNSKNIPSNNFLRLICEQSLNGYFKNAKKMSGIPKIYIDRLEQELETITS
MGFADYFLVVYDFVKKAKELEIFVGPGRGSAVGSLVAFLLKITTVDPLEYNLIFERFLNS
ERINLPDIDIDFQDDRREEVIEYIFEKYGRYNVATITTFQTIGTKNSIRDCGRVFGIDAE
DLNKITKPIGNEYLRDLDGAVKNFPALENFINQNPQIYQVAKKIIGLPRQTGTHAAGLVF
CDVDLREVVPLKVGYNGINQTQYSMNYLEELGLIKIDLLGLRNLTTLKNIIQHIEESRKI
KINLQKIPLSDFDTFASLQKGETTGIFQLESPGMTNVIQKMKVASIEDIAVASALFRPGP
QENIPLYIERKSKKTSYELINHELAEILDPTYGIIIYQEQVIQILQKVAKLSLAQSDIVR
RAMGKKDFDLMTQEHEIFLQGAVKNGYSQKEAQEIWSWILKFASYGFNKSHAIAYSLIGY
WLAYLKQHFPSEFYCELLSSAIGNEYKTNRYIEESKLMGIKIISPTIKNPRSNYFGNELG
IHLPLILINKIGMEFTKGLQELKNNNPKIYSDLFIFVAKAFKNGLNNQVFSNLAKSGALD
CFGINRETILANKEKLLLFGDLNQDVKEISPFTYPKLEFLPDNPIQRGFDEIEVLGFYLS
NHPLTVIKEKINNKDLLKPINQVNKPDLKSPVLFIVESIRSHQDKNGNEMLFLEISDETG
KFDLTVFASTVKSLTSPLEVGQIMVGEIKTQAYNNKITGILNKILKVY
NT seq 3027 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttctcgccacaaataaatgttcgcagttgctttaattttcaagactcactaataacc
attgaagattatattaattttgcaagtttacaagaatttgatttcgcattttattctgat
atagaaaccatgtatggtgccgctgactttgttaaagcagccttacaaaaaaatataaaa
ccgattattggattaacaattgattttaaaaaatatgatcttgatttccgcttaacgcta
tttgccaaaaaccttttaggttatcaaataatttgcaaattaagttcattaataatgtgt
caggagttaaaacaaacaaatgaaataattattgagacgataattagcttgctggataaa
aacctcgtaggaattatttctttttttaataattttaacgaacagatcgcccaacgtatt
caaaatcaattgctggctgaaaatcttttttttggaatagatcgccacgctcttaaaatt
cctgtagaatttcaggcaagacaagtttttgctcaagatgtaaaatattttgaaaaagct
gatttttttgcttttaaagttttgcaagcaattaaaaataatgaacttttaaaagaccaa
agtttagtggatgatttaaattatttttattcaaatgatcaaattgctgaaataatagat
ttaaaaacccataaagataatattgtcaaaattgcaagtatgtgcaattttaatatgttt
gaaaataaaaaaaatcatttaatgaaatatccaaactcaaaaaatattccttcaaataat
tttttaagattgatttgtgagcaaagtttgaacggttattttaaaaatgcaaaaaaaatg
tcaggcattccaaaaatttacattgatcgtttagaacaagagttagaaacaatcacttca
atgggttttgctgactattttttagttgtttacgattttgttaaaaaagctaaagaatta
gaaatttttgtgggccctggaagaggaagtgcagtgggatctttggtggcgtttttgtta
aaaatcacaaccgttgacccattagaatataatttaatttttgaaagatttttgaattca
gaaagaataaatttaccagatattgatattgactttcaagatgatcgtcgtgaagaagta
atcgaatatatttttgaaaaatatggtcgctacaacgttgccacaattacaacctttcaa
acaataggaaccaagaattctattagagattgtggacgtgtatttggaattgatgcagag
gatttaaataaaataactaagccaattggtaatgagtatctgcgggatttagatggtgca
gttaaaaattttccagccttagaaaattttattaatcagaaccctcaaatttatcaagtt
gctaaaaaaattattgggcttccacgtcaaacaggtacccatgcagcaggattagttttt
tgtgatgttgacttacgtgaagtagtaccattgaaagttggttataacgggataaatcaa
actcaatattcaatgaattacttagaggaattgggattaattaaaatcgatttattagga
cttcgcaacttaacaactttaaaaaatattattcagcatattgaagaatctcgtaaaatt
aaaataaatctacaaaaaattcctttatctgattttgatacttttgcaagtttgcaaaag
ggggaaaccactgggatttttcaattagagtctccaggaatgacaaatgtgattcaaaaa
atgaaggttgcatcaattgaggatatcgcagttgcatctgctttatttcgtccaggtccg
caagaaaacattcccttatacattgaaagaaagtcaaaaaaaacttcatatgaacttatt
aatcatgaattagcagaaattttagatccaacttatggaataattatttatcaagaacag
gtaattcaaattttacagaaggttgctaagctgtctttggcacaatcagatattgtcaga
agagcaatgggaaaaaaagattttgatttaatgactcaagagcatgaaatttttttacaa
ggcgctgttaaaaatggctattctcaaaaagaggcacaagaaatttgaagttgaattttg
aaatttgcaagttatggattcaataaatctcatgcaattgcctactcattaattggttat
tgattggcatatttaaaacaacactttccctcagaattttattgtgaattgttgagttca
gcaattggtaatgaatacaagacaaaccgctatattgaagagtctaaattaatgggtatt
aaaattataagcccaacaatcaaaaacccacgaagtaattattttggaaatgaattggga
attcatttacctttaattttgattaacaaaattggtatggaatttactaagggccttcaa
gaacttaaaaataataatccaaaaatttatagtgacttatttatttttgtagcaaaagcc
tttaaaaatggtttaaacaatcaggttttttctaacttagctaagagtggtgctttggat
tgttttggaattaatcgcgaaacaattctggccaacaaagaaaagttattgctttttgga
gatttaaaccaagacgttaaagaaatcagcccttttacttatccgaaattggaattctta
cctgataatccaattcaaagaggatttgatgaaattgaagttttgggattttatttatca
aaccatcctcttacagtaattaaagaaaaaattaataacaaagatcttttaaagcctatt
aatcaagtaaataaacctgatttaaaaagtccagttttatttattgtggaatcaattcgc
tcccatcaagacaaaaatggtaatgaaatgttatttttagaaatcagtgacgaaaccggc
aaatttgatttaactgtttttgcatcaactgtaaaaagtttgacatcaccacttgaagtt
ggccaaataatggttggtgaaatcaaaacacaagcttacaacaataaaattacaggaatt
ctaaataaaattttgaaggtttattaa

DBGET integrated database retrieval system