Staphylococcus simiae: SAMEA4384339_1785
Help
Entry
SAMEA4384339_1785 CDS
T06955
Name
(GenBank) Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA
KO
K24708
ATP-binding cassette, subfamily B, putative efflux pump [EC:7.6.2.-]
Organism
ssim
Staphylococcus simiae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssim00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ssim02000
]
SAMEA4384339_1785
Transporters [BR:
ssim02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
SAMEA4384339_1785
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
ABC_ATPase
NTPase_1
ABC_membrane_3
AAA_29
AAA_22
MMR_HSR1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNV75895
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1871092..1872828)
Genome browser
AA seq
578 aa
AA seq
DB search
MIKRYLEFVKPYKYRIIATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALSSAEKINHLG
IAIGIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKRLYNHLQALSARYYANNQVGQV
ISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTFAALFIFPFYILTVYV
FFGRLRLLTRKRSQALAEVQGFLHERVQGISVIKSFAIEDNEAQNFDKKNSHFLTRALQH
TRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLRRLVAS
FTTLTQSFASMDRVFQLIDEDYDIKNGIGAQPIEIKQGRIDIEHVSFKYNDDESYILNDI
NLSIDKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTAGDILIDGHNVKDFLTGSLRNQIGLV
QQDNILFSDTVRENILLGRPTATDEEVIEAAKMANAHEFIMNLPQGYDTEVGERGVKLSG
GQKQRLSIARIFLNDPPILILDEATSALDLESESIIQEALDILSKDRTTLIVAHRLSTIT
HADKIVVIENGQIVEVGTHQELIAQQGSYEHLYSIQNL
NT seq
1737 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaagcgatatttggaatttgttaaaccatacaaatatcgtattattgcaacgatc
attgttggaataattaaatttggaataccgatgctaatacctttattaataaagtatgcc
attgatggtgtaattaataatcacgcattatcatctgcagaaaagattaatcatttaggt
attgctattggtatagcgttgtttatatttgtaatagttagaccacccattgagtttatt
agacaatacttagcacaatggactagtaataaaattttatatgatatacgtaaaagattg
tataatcatttgcaagcattaagcgcgagatattatgccaataatcaagtgggacaagtt
atctcaagggtgataaatgatgttgaacaaactaaagattttattttaacaggattaatg
aacatatggttagactgtatcactataatcattgccttatccattatgttcttcttagat
gtaaaattaacatttgcagcattatttatcttcccattttatattttgacagtttatgta
tttttcggaagattaagactgttaactagaaaaagatctcaagccctagctgaagtacaa
gggtttttacatgaacgtgtacaggggatatccgtaattaaaagttttgcgattgaagat
aatgaagctcaaaattttgataagaaaaatagccatttcttaactcgagcattacagcat
acaagatggaacgcatattcatttgcagcaataaatacagtaactgatattggtccaatc
attgtaattggcgtaggggcatatttagcaatatcaggttctattacggtaggtacatta
gcagcctttgttggttatttagaattattatttggccctttacgtcgtttagttgcatct
ttcacaacgttgacacaaagttttgcgtcaatggatagggtgtttcaattaatagatgaa
gattatgatattaaaaatggtatcggtgcacagccaattgaaatcaaacaagggcgtatt
gatattgaacatgttagttttaaatataatgatgatgaatcttacattttaaatgatatt
aatttaagtatagataaaggagaaactgttgcctttgttggtatgagtggtggcggtaaa
tctaccctcattaatttaatacctagattttatgatgttactgctggtgacatattaata
gatggtcataatgttaaagactttttaactggaagtttacgtaatcaaattggtttagtg
cagcaagataatatattgttctcagatactgtcagagaaaatattttactaggtagacca
actgctactgatgaagaagttatagaagcggctaagatggctaatgcacacgaatttatt
atgaatttacctcaaggttatgatactgaagttggtgaacgtggcgttaagttatctggt
ggacaaaaacaaagactttctattgcgagaattttcttaaatgatcctccaattttaata
cttgatgaagcaacaagtgcacttgatctagaaagtgaatccatcattcaagaagcgttg
gatatcttaagtaaagatcgaacaacattaattgttgcacatagattatctacgattaca
catgcagacaaaattgttgttattgaaaatggtcaaattgtagaggttggtacgcatcaa
gaacttattgctcaacaaggttcatatgaacatctatacagcattcaaaatttataa
DBGET
integrated database retrieval system