Streptococcus urinalis: NCTC13766_01392
Help
Entry
NCTC13766_01392 CDS
T07856
Symbol
lytC
Name
(GenBank) serotype determinant, cell wall hydrolase/autolysin
Organism
surn
Streptococcus urinalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GBS_Bsp-like
Amidase_3
KxYKxGKxW_sig
CATIP_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEF32284
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1294679..1297246)
Genome browser
AA seq
855 aa
AA seq
DB search
MYKSKKHWVIASVATVAILGTHQATILADSSDTTMINPTTTESSASTPSSEQTSTISSSQ
SDETAVTTDHSSEVTTSSEEMASVTSDSRETSTSSAESQSQTLTDSETANDDKVNLGANT
VTSETASSSAINSQTQSFVKARVLATSPQAQATEPVQAPVTATIEGDKTLHITYQKEMTA
GTDVIFAVWGDQNAQNDLVWYKASDLGAAYVDLTKHREYGLYHVNTYTRTNGQMTGVSAL
TLSFPKPQVSAEVTKLSDTQFQIDVTQVPSTITAVRIPVWTSQNNQDDLKWYQAIQVASG
HYQVTVNTADHHNEMGHYNIHIYGQSTITGSQVGLTVTGYDNVDTRPNAQVSIVDYAQDK
TSFTVQVTGTSSTKTITKVSIAAWSETDGQDDLKWYTPVLKNNQASQVINIADLSNTTDL
YRVHVYTQYSDGSQVGTNLGAYQITKPSLKTEVDTQMTDSGINVKVTSNMVTNYQKVKFA
VWSVVNGQDDLKWYQADATGKAFIPFTNHKGYGDYRIDTYSFENGSHGLKSSTVTRNVPQ
DATINLKNKVTTQNYQKSDGTIDVVVLQGENDKTINKVRVAAWSEEKQSNLYWYTSSVNQ
SGKVVITVNQANHYGIQGNYTIHTYLDYSDGTSSGTNLGQFLLNGPTATSASQGNYKAIN
KVIYLDAGHGGYDSGASYYNQYEKTLNLQIQKLVQSKLQALGYTVLATRQSDVFIDLLDR
SKEVNATNADIFVSIHINASTSSAANGIETYYYQYYSDYPSQINDVFDENPERLAKSAIL
ANAVQSALIANTGAQNNGVKREAFSVLRETTAPAILAELGFISNYSEMTKLTQSAYQEQL
ANGIVSGIQKYYASI
NT seq
2568 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataagtcaaaaaaacactgggtgattgccagtgttgcaacggttgcgatattagga
acacaccaagctactattttagctgacagtagtgatactacgatgattaatcccacaact
acagaatccagtgcaagtacaccaagtagcgagcagacttcaacgatttcatcaagtcaa
agtgatgaaacagctgtgacgacagatcattcttctgaagtgacaacaagttctgaagaa
atggcgagtgtcacttctgatagtagggaaacgtctacgagtagtgctgagagtcaatct
caaactcttactgattccgaaacggctaatgatgacaaggttaatttaggagctaacaca
gtcacttcagaaacagctagttctagtgctattaatagtcaaacgcaaagttttgtgaaa
gctcgtgtcttagcgacaagtcctcaagcacaagcgacagaaccagttcaagctccagtg
acggcaaccatagaaggtgataagacactacacatcacctaccaaaaggaaatgactgca
ggaaccgacgttatttttgcagtttggggagaccaaaatgctcaaaatgatttggtttgg
tataaagcctcagatttaggcgcagcttatgttgatttaactaagcatagagaatacggt
ctttatcatgttaatacttatacaaggaccaatggtcaaatgacaggtgtcagtgccttg
acacttagttttcccaaaccacaagtcagtgcagaggtgacgaaactatctgacacccaa
tttcaaattgatgtcactcaagttccttctactatcacagcagtccgtatccctgtttgg
acaagtcaaaataatcaagatgacctcaaatggtatcaagcgatacaagtagctagtggc
cattaccaagtaacagtcaatactgctgatcatcataatgaaatgggtcattacaatatt
catatctatggccaaagtacgataacaggcagtcaagttggtttaaccgtaactggttat
gataatgtggatacacgaccaaatgcacaagttagcattgttgactatgcacaagataag
acgagctttaccgtccaagtcacaggaacaagtagtaccaaaacaattaccaaagtgagt
atcgcagcttggtcagagactgatggtcaagatgatcttaaatggtacacaccagttctt
aagaataatcaagctagtcaagttattaatatagcagatttgagtaatactacagatctt
tatcgtgttcatgtctatacgcagtacagtgatggtagtcaagtaggaacaaatctaggt
gcctaccaaatcacaaaaccaagtcttaagactgaagtggatacacaaatgactgatagt
ggaataaatgttaaggtcacttcgaatatggtcaccaattatcaaaaggttaaatttgcc
gtgtggtcagttgtcaacggtcaggatgatcttaagtggtatcaggcagatgcgacaggt
aaggctttcattccatttaccaatcataaaggttatggcgattatcgcattgatacctat
agttttgaaaatggtagccatggcttaaagagtagtacagtgactagaaatgtaccccaa
gatgcaactataaacttaaaaaataaagtaacaactcaaaattatcagaaatctgatggg
acaattgatgttgtcgttttacaaggagaaaacgataaaaccataaataaagtcagagtg
gctgcatggtcagaagaaaagcagagtaacctttattggtatacctctagtgttaatcaa
tctggcaaggtagtgattactgttaatcaagctaatcattatggaattcaaggaaattat
acaatacatacttatttagattatagtgatggtacatcatctggaactaatctaggtcaa
tttcttttaaatggaccaacagcaacttcagcatcgcaaggcaattataaagctattaat
aaagtaatataccttgatgctggacatggtggttatgattcaggagcctcatattacaat
caatatgaaaaaacattaaatctacaaattcaaaaattggttcaatcaaaattacaggct
ttgggttatactgttcttgccacccgtcagtctgatgtttttattgatttattggaccgt
tcaaaagaggtcaatgcaacaaatgcagatatttttgtgagcatccatattaatgcgtct
acaagttctgctgcaaatggtatagaaacatattattatcaatattattcagattatcca
tcacaaataaatgatgtatttgatgaaaatcctgaaaggcttgccaaaagtgctatttta
gccaatgccgttcaaagtgcattaattgctaataccggtgctcaaaacaatggtgtcaaa
agagaagctttctcagtattaagagagacgactgctccagcaattttagctgaactaggt
tttatttctaactattcagagatgacaaaacttactcaatctgcctaccaagaacagtta
gcaaacggtattgtttcagggattcaaaaatattacgctagtatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
